MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008269	GCC	2	6	229414	229419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025018
5502	NC_008269	CTT	2	6	229425	229430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025018
5503	NC_008269	GCC	2	6	229438	229443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025018
5504	NC_008269	CCG	2	6	229448	229453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025018
5505	NC_008269	GCC	2	6	229465	229470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025018
5506	NC_008269	CGC	2	6	229491	229496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025018
5507	NC_008269	TCG	2	6	229505	229510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025018
5508	NC_008269	CTT	2	6	229518	229523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025018
5509	NC_008269	CCTT	2	8	229532	229539	0 %	50 %	0 %	50 %	111025018
5510	NC_008269	CGC	2	6	229554	229559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025018
5511	NC_008269	CTT	2	6	229608	229613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025018
5512	NC_008269	TCT	2	6	229622	229627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025018
5513	NC_008269	CGT	2	6	229667	229672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025018
5514	NC_008269	GGA	2	6	229710	229715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025018
5515	NC_008269	GCCC	2	8	229725	229732	0 %	0 %	25 %	75 %	111025018
5516	NC_008269	CACG	2	8	229741	229748	25 %	0 %	25 %	50 %	111025018
5517	NC_008269	GTC	2	6	229759	229764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025018
5518	NC_008269	TTC	2	6	229765	229770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025018
5519	NC_008269	TCG	2	6	229799	229804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025018
5520	NC_008269	CTT	2	6	229824	229829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025018
5521	NC_008269	TGC	2	6	229830	229835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025018
5522	NC_008269	CTT	2	6	229839	229844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025018
5523	NC_008269	CGT	3	9	229848	229856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025018
5524	NC_008269	TCT	2	6	229868	229873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025018
5525	NC_008269	AGCCGG	2	12	229905	229916	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111025018
5526	NC_008269	GGA	2	6	229971	229976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025018
5527	NC_008269	GCCC	2	8	229986	229993	0 %	0 %	25 %	75 %	111025018
5528	NC_008269	GTC	2	6	230020	230025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025018
5529	NC_008269	AC	3	6	230099	230104	50 %	0 %	0 %	50 %	111025018
5530	NC_008269	CGC	2	6	230127	230132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025018
5531	NC_008269	GTC	2	6	230202	230207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025018
5532	NC_008269	CA	3	6	230217	230222	50 %	0 %	0 %	50 %	111025018
5533	NC_008269	GAC	2	6	230247	230252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_008269	TCT	2	6	230284	230289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_008269	GA	4	8	230300	230307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_008269	CGA	2	6	230338	230343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_008269	ACG	2	6	230397	230402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_008269	GAG	2	6	230462	230467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_008269	GA	3	6	230471	230476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_008269	CCCACA	2	12	230617	230628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025019
5541	NC_008269	GTG	2	6	230637	230642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025019
5542	NC_008269	ACC	2	6	230662	230667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025019
5543	NC_008269	TCG	2	6	230668	230673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025019
5544	NC_008269	GGTC	2	8	230684	230691	0 %	25 %	50 %	25 %	111025019
5545	NC_008269	CGG	2	6	230745	230750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025019
5546	NC_008269	GCA	2	6	230751	230756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025019
5547	NC_008269	CGG	2	6	230769	230774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025019
5548	NC_008269	GGT	2	6	230775	230780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025019
5549	NC_008269	GCG	3	9	230816	230824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025019
5550	NC_008269	TCGC	2	8	230860	230867	0 %	25 %	25 %	50 %	111025019
5551	NC_008269	CGA	2	6	230930	230935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025019
5552	NC_008269	CTG	2	6	230945	230950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025019
5553	NC_008269	GCCG	2	8	231041	231048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_008269	CAC	2	6	231074	231079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_008269	CGC	2	6	231181	231186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025020
5556	NC_008269	ACA	2	6	231348	231353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025020
5557	NC_008269	ACC	2	6	231493	231498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025021
5558	NC_008269	CG	3	6	231527	231532	0 %	0 %	50 %	50 %	111025021
5559	NC_008269	CAC	2	6	231562	231567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025021
5560	NC_008269	GC	3	6	231597	231602	0 %	0 %	50 %	50 %	111025021
5561	NC_008269	TCG	2	6	231616	231621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025021
5562	NC_008269	AGC	3	9	231724	231732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025021
5563	NC_008269	CCG	3	9	231740	231748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025021
5564	NC_008269	C	6	6	231753	231758	0 %	0 %	0 %	100 %	111025021
5565	NC_008269	ACCG	2	8	231776	231783	25 %	0 %	25 %	50 %	111025021
5566	NC_008269	AGCG	2	8	231794	231801	25 %	0 %	50 %	25 %	111025021
5567	NC_008269	TCGG	2	8	231812	231819	0 %	25 %	50 %	25 %	111025021
5568	NC_008269	TCG	2	6	231823	231828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025021
5569	NC_008269	CGG	2	6	231860	231865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025021
5570	NC_008269	TCA	2	6	231869	231874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025021
5571	NC_008269	GCC	3	9	231879	231887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025021
5572	NC_008269	TCG	2	6	231912	231917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025021
5573	NC_008269	GCC	2	6	231968	231973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025021
5574	NC_008269	CGG	2	6	231978	231983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025021
5575	NC_008269	CCA	3	9	232072	232080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_008269	CTC	2	6	232105	232110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_008269	GCC	2	6	232111	232116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5578	NC_008269	GCC	2	6	232139	232144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5579	NC_008269	ACG	2	6	232173	232178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_008269	CA	3	6	232181	232186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_008269	GTG	2	6	232243	232248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_008269	GAC	2	6	232262	232267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_008269	GCCGC	2	10	232359	232368	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5584	NC_008269	ACA	2	6	232377	232382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_008269	CACCG	2	10	232467	232476	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5586	NC_008269	CGGT	2	8	232527	232534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_008269	CG	3	6	232706	232711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_008269	CCG	2	6	232776	232781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_008269	CTG	2	6	232817	232822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025022
5590	NC_008269	ATC	2	6	232829	232834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025022
5591	NC_008269	CCA	2	6	232836	232841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025022
5592	NC_008269	GCA	2	6	232860	232865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025022
5593	NC_008269	CACCGA	2	12	232884	232895	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111025022
5594	NC_008269	TTC	2	6	232900	232905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025022
5595	NC_008269	GC	3	6	232947	232952	0 %	0 %	50 %	50 %	111025022
5596	NC_008269	CAAA	2	8	232956	232963	75 %	0 %	0 %	25 %	111025022
5597	NC_008269	CG	3	6	232996	233001	0 %	0 %	50 %	50 %	111025022
5598	NC_008269	CGCC	2	8	233061	233068	0 %	0 %	25 %	75 %	111025022
5599	NC_008269	CGC	2	6	233083	233088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025022
5600	NC_008269	CGTGT	2	10	233107	233116	0 %	40 %	40 %	20 %	111025022
5601	NC_008269	ACG	2	6	233187	233192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025023
5602	NC_008269	CAC	2	6	233193	233198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025023
5603	NC_008269	CGA	2	6	233212	233217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025023
5604	NC_008269	CCTC	2	8	233226	233233	0 %	25 %	0 %	75 %	111025023
5605	NC_008269	CGT	2	6	233272	233277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025023
5606	NC_008269	GACACC	2	12	233288	233299	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111025023
5607	NC_008269	GAA	2	6	233339	233344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025023
5608	NC_008269	CCGT	2	8	233349	233356	0 %	25 %	25 %	50 %	111025023
5609	NC_008269	GTT	2	6	233394	233399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025023
5610	NC_008269	CCA	2	6	233407	233412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025023
5611	NC_008269	GCC	2	6	233418	233423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025023
5612	NC_008269	CAA	2	6	233438	233443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025023
5613	NC_008269	CCG	2	6	233535	233540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_008269	CGG	2	6	233579	233584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_008269	GCGG	2	8	233594	233601	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_008269	CAC	2	6	233671	233676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_008269	TGC	2	6	233714	233719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_008269	CGG	2	6	233733	233738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_008269	CCA	2	6	233775	233780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025024
5620	NC_008269	GAA	2	6	233888	233893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025024
5621	NC_008269	GCG	3	9	233904	233912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025024
5622	NC_008269	TGG	2	6	233979	233984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025025
5623	NC_008269	GGTCGA	2	12	234034	234045	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111025025
5624	NC_008269	CGA	2	6	234055	234060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025025
5625	NC_008269	TGTC	2	8	234124	234131	0 %	50 %	25 %	25 %	111025025
5626	NC_008269	TGG	2	6	234133	234138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025025
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5628	NC_008269	CGG	2	6	234243	234248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025025
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5874	NC_008269	CGT	2	6	245435	245440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5882	NC_008269	CT	3	6	245837	245842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5883	NC_008269	ACC	2	6	245934	245939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5885	NC_008269	GAC	2	6	245998	246003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5998	NC_008269	GCG	2	6	250992	250997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025044
5999	NC_008269	ACA	2	6	251003	251008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025044
6000	NC_008269	GGC	2	6	251111	251116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025044

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