MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008268	GA	3	6	695	700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008268	GC	3	6	1086	1091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008268	GC	3	6	1531	1536	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
4	NC_008268	CG	3	6	1650	1655	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
5	NC_008268	CG	3	6	2288	2293	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
6	NC_008268	GC	3	6	2425	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
7	NC_008268	CG	4	8	2513	2520	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
8	NC_008268	GC	3	6	3103	3108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008268	CG	3	6	3390	3395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008268	TC	3	6	3448	3453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008268	CA	3	6	5821	5826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008268	CG	3	6	6044	6049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008268	GA	3	6	6052	6057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008268	TC	3	6	6639	6644	0 %	50 %	0 %	50 %	111017026
15	NC_008268	AC	3	6	6707	6712	50 %	0 %	0 %	50 %	111017026
16	NC_008268	CG	3	6	7513	7518	0 %	0 %	50 %	50 %	111017027
17	NC_008268	CG	3	6	7720	7725	0 %	0 %	50 %	50 %	111017027
18	NC_008268	TG	3	6	8335	8340	0 %	50 %	50 %	0 %	111017027
19	NC_008268	CG	3	6	8891	8896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008268	CG	3	6	9467	9472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008268	AC	3	6	10438	10443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008268	GA	3	6	11314	11319	50 %	0 %	50 %	0 %	111017028
23	NC_008268	CG	3	6	11439	11444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008268	CG	3	6	12063	12068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008268	GC	3	6	12350	12355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008268	GC	3	6	12374	12379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008268	GC	3	6	12548	12553	0 %	0 %	50 %	50 %	111017029
28	NC_008268	CG	3	6	12734	12739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008268	CG	3	6	12852	12857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008268	GT	3	6	12875	12880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008268	GC	3	6	13243	13248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008268	CG	3	6	13728	13733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008268	CA	3	6	13997	14002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008268	TC	4	8	14524	14531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008268	GC	3	6	15205	15210	0 %	0 %	50 %	50 %	111017030
36	NC_008268	CG	3	6	16429	16434	0 %	0 %	50 %	50 %	111017032
37	NC_008268	CG	3	6	16952	16957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008268	GC	3	6	17923	17928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008268	GC	3	6	19388	19393	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
40	NC_008268	CG	3	6	20023	20028	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
41	NC_008268	GC	3	6	20053	20058	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
42	NC_008268	AC	3	6	20725	20730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008268	CA	3	6	21182	21187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008268	CG	3	6	21542	21547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008268	TG	3	6	21936	21941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008268	CG	3	6	21982	21987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008268	TG	3	6	22050	22055	0 %	50 %	50 %	0 %	111017035
48	NC_008268	GC	3	6	22238	22243	0 %	0 %	50 %	50 %	111017035
49	NC_008268	AC	3	6	22525	22530	50 %	0 %	0 %	50 %	111017035
50	NC_008268	CA	3	6	23406	23411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008268	GA	3	6	23791	23796	50 %	0 %	50 %	0 %	111017036
52	NC_008268	CG	3	6	24995	25000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008268	CG	3	6	26413	26418	0 %	0 %	50 %	50 %	111017038
54	NC_008268	CG	3	6	27070	27075	0 %	0 %	50 %	50 %	111017039
55	NC_008268	GA	3	6	28815	28820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008268	CG	3	6	30283	30288	0 %	0 %	50 %	50 %	111017045
57	NC_008268	CG	4	8	30767	30774	0 %	0 %	50 %	50 %	111017046
58	NC_008268	GT	4	8	32512	32519	0 %	50 %	50 %	0 %	111017047
59	NC_008268	CG	3	6	34155	34160	0 %	0 %	50 %	50 %	111017049
60	NC_008268	GT	3	6	34409	34414	0 %	50 %	50 %	0 %	111017049
61	NC_008268	GC	3	6	34751	34756	0 %	0 %	50 %	50 %	111017049
62	NC_008268	CG	4	8	34812	34819	0 %	0 %	50 %	50 %	111017049
63	NC_008268	CA	3	6	35185	35190	50 %	0 %	0 %	50 %	111017050
64	NC_008268	TC	3	6	35232	35237	0 %	50 %	0 %	50 %	111017050
65	NC_008268	CG	3	6	35467	35472	0 %	0 %	50 %	50 %	111017050
66	NC_008268	GC	3	6	35860	35865	0 %	0 %	50 %	50 %	111017050
67	NC_008268	GA	3	6	35914	35919	50 %	0 %	50 %	0 %	111017050
68	NC_008268	AG	3	6	37380	37385	50 %	0 %	50 %	0 %	111017052
69	NC_008268	CG	3	6	39243	39248	0 %	0 %	50 %	50 %	111017054
70	NC_008268	CG	3	6	39436	39441	0 %	0 %	50 %	50 %	111017055
71	NC_008268	GC	3	6	39714	39719	0 %	0 %	50 %	50 %	111017055
72	NC_008268	GC	3	6	40568	40573	0 %	0 %	50 %	50 %	111017055
73	NC_008268	GC	3	6	40771	40776	0 %	0 %	50 %	50 %	111017056
74	NC_008268	CA	3	6	40829	40834	50 %	0 %	0 %	50 %	111017056
75	NC_008268	CG	3	6	41141	41146	0 %	0 %	50 %	50 %	111017056
76	NC_008268	CG	3	6	41798	41803	0 %	0 %	50 %	50 %	111017057
77	NC_008268	CG	3	6	41937	41942	0 %	0 %	50 %	50 %	111017057
78	NC_008268	CG	4	8	42253	42260	0 %	0 %	50 %	50 %	111017058
79	NC_008268	CG	3	6	42297	42302	0 %	0 %	50 %	50 %	111017058
80	NC_008268	CG	3	6	42729	42734	0 %	0 %	50 %	50 %	111017059
81	NC_008268	CG	4	8	43066	43073	0 %	0 %	50 %	50 %	111017059
82	NC_008268	GA	3	6	44294	44299	50 %	0 %	50 %	0 %	111017061
83	NC_008268	GA	3	6	45209	45214	50 %	0 %	50 %	0 %	111017061
84	NC_008268	CG	3	6	45321	45326	0 %	0 %	50 %	50 %	111017061
85	NC_008268	GC	3	6	45869	45874	0 %	0 %	50 %	50 %	111017062
86	NC_008268	TC	3	6	45912	45917	0 %	50 %	0 %	50 %	111017062
87	NC_008268	GC	3	6	46237	46242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008268	CG	4	8	46532	46539	0 %	0 %	50 %	50 %	111017063
89	NC_008268	GC	3	6	47515	47520	0 %	0 %	50 %	50 %	111017063
90	NC_008268	GC	3	6	48131	48136	0 %	0 %	50 %	50 %	111017064
91	NC_008268	AC	4	8	48614	48621	50 %	0 %	0 %	50 %	111017065
92	NC_008268	GC	3	6	48693	48698	0 %	0 %	50 %	50 %	111017065
93	NC_008268	GC	3	6	48709	48714	0 %	0 %	50 %	50 %	111017065
94	NC_008268	AG	3	6	49221	49226	50 %	0 %	50 %	0 %	111017066
95	NC_008268	GC	3	6	49335	49340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008268	CG	3	6	49497	49502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008268	AC	3	6	50029	50034	50 %	0 %	0 %	50 %	111017067
98	NC_008268	GT	3	6	51100	51105	0 %	50 %	50 %	0 %	111017067
99	NC_008268	GC	3	6	51245	51250	0 %	0 %	50 %	50 %	111017067
100	NC_008268	CG	3	6	51843	51848	0 %	0 %	50 %	50 %	111017067
101	NC_008268	CG	3	6	52638	52643	0 %	0 %	50 %	50 %	111017067
102	NC_008268	CG	3	6	52850	52855	0 %	0 %	50 %	50 %	111017067
103	NC_008268	CG	3	6	52993	52998	0 %	0 %	50 %	50 %	111017067
104	NC_008268	GC	3	6	53446	53451	0 %	0 %	50 %	50 %	111017068
105	NC_008268	GC	4	8	53900	53907	0 %	0 %	50 %	50 %	111017069
106	NC_008268	CA	3	6	54339	54344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008268	CG	3	6	54777	54782	0 %	0 %	50 %	50 %	111017070
108	NC_008268	GC	3	6	55327	55332	0 %	0 %	50 %	50 %	111017071
109	NC_008268	CG	3	6	55644	55649	0 %	0 %	50 %	50 %	111017071
110	NC_008268	GC	3	6	56250	56255	0 %	0 %	50 %	50 %	111017071
111	NC_008268	CG	3	6	56911	56916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008268	GC	3	6	58101	58106	0 %	0 %	50 %	50 %	111017073
113	NC_008268	GT	3	6	58137	58142	0 %	50 %	50 %	0 %	111017073
114	NC_008268	GC	3	6	58317	58322	0 %	0 %	50 %	50 %	111017073
115	NC_008268	GC	3	6	58561	58566	0 %	0 %	50 %	50 %	111017073
116	NC_008268	GC	3	6	59031	59036	0 %	0 %	50 %	50 %	111017074
117	NC_008268	TG	3	6	59452	59457	0 %	50 %	50 %	0 %	111017075
118	NC_008268	GC	3	6	59604	59609	0 %	0 %	50 %	50 %	111017075
119	NC_008268	GA	3	6	60855	60860	50 %	0 %	50 %	0 %	111017077
120	NC_008268	CG	3	6	61017	61022	0 %	0 %	50 %	50 %	111017077
121	NC_008268	CG	3	6	61743	61748	0 %	0 %	50 %	50 %	111017077
122	NC_008268	GC	3	6	61796	61801	0 %	0 %	50 %	50 %	111017077
123	NC_008268	GC	3	6	62021	62026	0 %	0 %	50 %	50 %	111017077
124	NC_008268	GC	3	6	62096	62101	0 %	0 %	50 %	50 %	111017077
125	NC_008268	CG	3	6	63830	63835	0 %	0 %	50 %	50 %	111017079
126	NC_008268	GT	3	6	64770	64775	0 %	50 %	50 %	0 %	111017080
127	NC_008268	GA	3	6	65200	65205	50 %	0 %	50 %	0 %	111017080
128	NC_008268	GC	3	6	65225	65230	0 %	0 %	50 %	50 %	111017080
129	NC_008268	GT	3	6	65384	65389	0 %	50 %	50 %	0 %	111017080
130	NC_008268	GC	3	6	67064	67069	0 %	0 %	50 %	50 %	111017083
131	NC_008268	CT	3	6	67282	67287	0 %	50 %	0 %	50 %	111017083
132	NC_008268	GA	3	6	67418	67423	50 %	0 %	50 %	0 %	111017083
133	NC_008268	CG	3	6	70310	70315	0 %	0 %	50 %	50 %	111017087
134	NC_008268	CG	3	6	71287	71292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008268	GT	3	6	71329	71334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008268	CG	3	6	71655	71660	0 %	0 %	50 %	50 %	111017088
137	NC_008268	GC	4	8	72167	72174	0 %	0 %	50 %	50 %	111017089
138	NC_008268	GC	3	6	72344	72349	0 %	0 %	50 %	50 %	111017089
139	NC_008268	CT	3	6	72376	72381	0 %	50 %	0 %	50 %	111017089
140	NC_008268	CG	3	6	72533	72538	0 %	0 %	50 %	50 %	111017089
141	NC_008268	CG	3	6	72955	72960	0 %	0 %	50 %	50 %	111017090
142	NC_008268	CG	3	6	73139	73144	0 %	0 %	50 %	50 %	111017090
143	NC_008268	TC	3	6	73246	73251	0 %	50 %	0 %	50 %	111017090
144	NC_008268	CG	3	6	73275	73280	0 %	0 %	50 %	50 %	111017090
145	NC_008268	GA	3	6	73435	73440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008268	GC	3	6	73585	73590	0 %	0 %	50 %	50 %	111017091
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