MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008268	CGG	2	6	134726	134731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017154
3502	NC_008268	ACG	2	6	134753	134758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017154
3503	NC_008268	GCTC	2	8	134783	134790	0 %	25 %	25 %	50 %	111017154
3504	NC_008268	GC	3	6	134793	134798	0 %	0 %	50 %	50 %	111017154
3505	NC_008268	GCC	2	6	134811	134816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017154
3506	NC_008268	GTG	2	6	134842	134847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017154
3507	NC_008268	CCT	2	6	134862	134867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017154
3508	NC_008268	CGT	2	6	134889	134894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017154
3509	NC_008268	GTC	2	6	134947	134952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017154
3510	NC_008268	TCACC	2	10	134964	134973	20 %	20 %	0 %	60 %	111017154
3511	NC_008268	GCG	2	6	135057	135062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017154
3512	NC_008268	GAA	2	6	135205	135210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_008268	CCA	2	6	135214	135219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_008268	CGTG	2	8	135226	135233	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_008268	ACG	2	6	135416	135421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017155
3516	NC_008268	ACC	2	6	135441	135446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017155
3517	NC_008268	GAA	2	6	135463	135468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017155
3518	NC_008268	TCC	2	6	135504	135509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017155
3519	NC_008268	CAC	2	6	135554	135559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017155
3520	NC_008268	CGT	2	6	135568	135573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017155
3521	NC_008268	TGC	2	6	135603	135608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017155
3522	NC_008268	CAG	2	6	135617	135622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017155
3523	NC_008268	TCG	2	6	135627	135632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017155
3524	NC_008268	GGAC	2	8	135637	135644	25 %	0 %	50 %	25 %	111017155
3525	NC_008268	CGA	2	6	135697	135702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017155
3526	NC_008268	CGA	3	9	135763	135771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017155
3527	NC_008268	GCG	2	6	135807	135812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017155
3528	NC_008268	CAGG	2	8	135838	135845	25 %	0 %	50 %	25 %	111017155
3529	NC_008268	CGG	2	6	135846	135851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017155
3530	NC_008268	CGT	2	6	135929	135934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017156
3531	NC_008268	CGG	2	6	135942	135947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017156
3532	NC_008268	TCG	2	6	135956	135961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017156
3533	NC_008268	CG	3	6	135981	135986	0 %	0 %	50 %	50 %	111017156
3534	NC_008268	TCG	2	6	135998	136003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017156
3535	NC_008268	CGT	2	6	136029	136034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017156
3536	NC_008268	CGG	2	6	136047	136052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017156
3537	NC_008268	GGC	2	6	136065	136070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017156
3538	NC_008268	CGC	2	6	136089	136094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017156
3539	NC_008268	ACG	2	6	136097	136102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017156
3540	NC_008268	CG	3	6	136130	136135	0 %	0 %	50 %	50 %	111017156
3541	NC_008268	CTC	2	6	136138	136143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017156
3542	NC_008268	CGG	2	6	136181	136186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017156
3543	NC_008268	ACG	2	6	136231	136236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017156
3544	NC_008268	CAA	2	6	136242	136247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017156
3545	NC_008268	CGG	2	6	136278	136283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017156
3546	NC_008268	GTG	3	9	136381	136389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017156
3547	NC_008268	CGC	2	6	136511	136516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017156
3548	NC_008268	CCT	2	6	136559	136564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017156
3549	NC_008268	GTG	2	6	136576	136581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017156
3550	NC_008268	GCC	2	6	136588	136593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017156
3551	NC_008268	GAG	2	6	136681	136686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017156
3552	NC_008268	TCG	2	6	136691	136696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017156
3553	NC_008268	CGC	2	6	136700	136705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017156
3554	NC_008268	CGG	2	6	136795	136800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017156
3555	NC_008268	GAG	2	6	136831	136836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017156
3556	NC_008268	GC	3	6	136837	136842	0 %	0 %	50 %	50 %	111017156
3557	NC_008268	TCG	2	6	136852	136857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017157
3558	NC_008268	CCG	2	6	136879	136884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017157
3559	NC_008268	CGA	2	6	136978	136983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017157
3560	NC_008268	GGT	2	6	137153	137158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017157
3561	NC_008268	CGCC	2	8	137177	137184	0 %	0 %	25 %	75 %	111017157
3562	NC_008268	ACG	2	6	137212	137217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017157
3563	NC_008268	TTCCG	2	10	137238	137247	0 %	40 %	20 %	40 %	111017157
3564	NC_008268	CGAC	2	8	137293	137300	25 %	0 %	25 %	50 %	111017157
3565	NC_008268	CCG	3	9	137332	137340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017157
3566	NC_008268	ACA	2	6	137380	137385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017157
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3568	NC_008268	GGC	2	6	137427	137432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017157
3569	NC_008268	CGG	3	9	137549	137557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017157
3570	NC_008268	CGCACG	2	12	137578	137589	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017157
3571	NC_008268	GTG	2	6	137598	137603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017157
3572	NC_008268	GGC	2	6	137606	137611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017157
3573	NC_008268	GGCC	2	8	137625	137632	0 %	0 %	50 %	50 %	111017157
3574	NC_008268	GCA	2	6	137654	137659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017157
3575	NC_008268	GCA	2	6	137696	137701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017157
3576	NC_008268	GACG	2	8	137724	137731	25 %	0 %	50 %	25 %	111017157
3577	NC_008268	GGC	2	6	137795	137800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017157
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3579	NC_008268	GCCC	2	8	137870	137877	0 %	0 %	25 %	75 %	111017157
3580	NC_008268	CCT	2	6	137878	137883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017157
3581	NC_008268	GCC	2	6	138016	138021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017157
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3583	NC_008268	CGCGA	2	10	138087	138096	20 %	0 %	40 %	40 %	111017157
3584	NC_008268	GCGTC	2	10	138139	138148	0 %	20 %	40 %	40 %	111017157
3585	NC_008268	GTCG	2	8	138233	138240	0 %	25 %	50 %	25 %	111017157
3586	NC_008268	CGC	2	6	138278	138283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017157
3587	NC_008268	GGC	2	6	138360	138365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017157
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3589	NC_008268	CGG	2	6	138403	138408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017157
3590	NC_008268	CG	3	6	138411	138416	0 %	0 %	50 %	50 %	111017157
3591	NC_008268	GCACG	2	10	138428	138437	20 %	0 %	40 %	40 %	111017157
3592	NC_008268	TTCG	2	8	138509	138516	0 %	50 %	25 %	25 %	111017157
3593	NC_008268	CTC	2	6	138633	138638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017157
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3599	NC_008268	TCG	2	6	138841	138846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017157
3600	NC_008268	GCCGCG	2	12	138849	138860	0 %	0 %	50 %	50 %	111017157
3601	NC_008268	GAC	2	6	138921	138926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017157
3602	NC_008268	TCT	2	6	139011	139016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017158
3603	NC_008268	CGG	2	6	139070	139075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017158
3604	NC_008268	CAG	2	6	139093	139098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017158
3605	NC_008268	CCG	2	6	139101	139106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017158
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3609	NC_008268	GTC	2	6	139265	139270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017158
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3612	NC_008268	TCG	2	6	139414	139419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017159
3613	NC_008268	CGA	2	6	139424	139429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017159
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3615	NC_008268	TTCAC	2	10	139468	139477	20 %	40 %	0 %	40 %	111017159
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3621	NC_008268	CCGT	2	8	139654	139661	0 %	25 %	25 %	50 %	111017159
3622	NC_008268	CAC	2	6	139694	139699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017159
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3743	NC_008268	CGG	2	6	144307	144312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017162
3744	NC_008268	CGA	2	6	144346	144351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017162
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3747	NC_008268	GCCC	2	8	144467	144474	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3981	NC_008268	CAC	2	6	153422	153427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3982	NC_008268	CGA	2	6	153482	153487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3983	NC_008268	CCG	2	6	153540	153545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3984	NC_008268	CGT	2	6	153550	153555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3985	NC_008268	GAC	2	6	153566	153571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3986	NC_008268	AGC	2	6	153597	153602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3987	NC_008268	GC	3	6	153698	153703	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3988	NC_008268	GCCCG	2	10	153772	153781	0 %	0 %	40 %	60 %	111017163
3989	NC_008268	GGACGT	2	12	153868	153879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111017163
3990	NC_008268	CGT	2	6	153965	153970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3991	NC_008268	GTC	2	6	154010	154015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3992	NC_008268	CAC	2	6	154060	154065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3993	NC_008268	GCC	2	6	154092	154097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3994	NC_008268	TCGG	2	8	154124	154131	0 %	25 %	50 %	25 %	111017163
3995	NC_008268	GTA	2	6	154229	154234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
3996	NC_008268	CGA	4	12	154237	154248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3997	NC_008268	GCC	2	6	154253	154258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3998	NC_008268	AGC	2	6	154263	154268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3999	NC_008268	CGT	2	6	154327	154332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
4000	NC_008268	TCG	2	6	154335	154340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163

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