MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008268	ACG	2	6	39999	40004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017055
1003	NC_008268	CCG	2	6	40100	40105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017055
1004	NC_008268	CTT	2	6	40168	40173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017055
1005	NC_008268	GTGC	2	8	40251	40258	0 %	25 %	50 %	25 %	111017055
1006	NC_008268	GCA	2	6	40272	40277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017055
1007	NC_008268	CGC	2	6	40296	40301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017055
1008	NC_008268	CAG	2	6	40306	40311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017055
1009	NC_008268	CGC	2	6	40313	40318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017055
1010	NC_008268	CGT	3	9	40329	40337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017055
1011	NC_008268	GGA	2	6	40455	40460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017055
1012	NC_008268	GAA	2	6	40468	40473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017055
1013	NC_008268	GGC	2	6	40478	40483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017055
1014	NC_008268	CTCCC	2	10	40514	40523	0 %	20 %	0 %	80 %	111017055
1015	NC_008268	GC	3	6	40568	40573	0 %	0 %	50 %	50 %	111017055
1016	NC_008268	CCTTC	2	10	40606	40615	0 %	40 %	0 %	60 %	111017056
1017	NC_008268	GCC	2	6	40626	40631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017056
1018	NC_008268	GGT	2	6	40721	40726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017056
1019	NC_008268	AGC	2	6	40735	40740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017056
1020	NC_008268	GC	3	6	40771	40776	0 %	0 %	50 %	50 %	111017056
1021	NC_008268	CA	3	6	40829	40834	50 %	0 %	0 %	50 %	111017056
1022	NC_008268	CGC	2	6	40845	40850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017056
1023	NC_008268	GCC	2	6	40888	40893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017056
1024	NC_008268	TGA	2	6	40912	40917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017056
1025	NC_008268	GAG	2	6	40922	40927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017056
1026	NC_008268	ACC	2	6	41034	41039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017056
1027	NC_008268	TCG	2	6	41049	41054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017056
1028	NC_008268	GCC	2	6	41084	41089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017056
1029	NC_008268	CG	3	6	41141	41146	0 %	0 %	50 %	50 %	111017056
1030	NC_008268	CGG	2	6	41161	41166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017056
1031	NC_008268	GTG	2	6	41169	41174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017056
1032	NC_008268	AGC	2	6	41271	41276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017056
1033	NC_008268	AGG	2	6	41317	41322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017056
1034	NC_008268	GTTTGG	2	12	41341	41352	0 %	50 %	50 %	0 %	111017056
1035	NC_008268	GGT	2	6	41358	41363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017056
1036	NC_008268	TCA	2	6	41368	41373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017056
1037	NC_008268	CGG	2	6	41400	41405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017057
1038	NC_008268	CGA	2	6	41415	41420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017057
1039	NC_008268	CAG	3	9	41437	41445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017057
1040	NC_008268	GTTCC	2	10	41491	41500	0 %	40 %	20 %	40 %	111017057
1041	NC_008268	GTC	2	6	41515	41520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017057
1042	NC_008268	CGG	2	6	41531	41536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017057
1043	NC_008268	CAT	2	6	41563	41568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017057
1044	NC_008268	CAG	2	6	41584	41589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017057
1045	NC_008268	GGT	2	6	41593	41598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017057
1046	NC_008268	CGA	3	9	41766	41774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017057
1047	NC_008268	CGG	2	6	41783	41788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017057
1048	NC_008268	CG	3	6	41798	41803	0 %	0 %	50 %	50 %	111017057
1049	NC_008268	GCG	2	6	41810	41815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017057
1050	NC_008268	CAC	2	6	41818	41823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017057
1051	NC_008268	GCG	2	6	41832	41837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017057
1052	NC_008268	CCCG	2	8	41901	41908	0 %	0 %	25 %	75 %	111017057
1053	NC_008268	GAT	2	6	41926	41931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017057
1054	NC_008268	CG	3	6	41937	41942	0 %	0 %	50 %	50 %	111017057
1055	NC_008268	CGT	2	6	41946	41951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017057
1056	NC_008268	TCCG	2	8	42001	42008	0 %	25 %	25 %	50 %	111017057
1057	NC_008268	CCGAGA	2	12	42024	42035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017057
1058	NC_008268	ACA	2	6	42063	42068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017057
1059	NC_008268	GGC	2	6	42115	42120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017057
1060	NC_008268	GTC	2	6	42199	42204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017057
1061	NC_008268	GCAGT	2	10	42207	42216	20 %	20 %	40 %	20 %	111017057
1062	NC_008268	CGC	2	6	42224	42229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017058
1063	NC_008268	GAG	2	6	42246	42251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017058
1064	NC_008268	CG	4	8	42253	42260	0 %	0 %	50 %	50 %	111017058
1065	NC_008268	CG	3	6	42297	42302	0 %	0 %	50 %	50 %	111017058
1066	NC_008268	GGC	2	6	42326	42331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017058
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1068	NC_008268	GGT	2	6	42378	42383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017058
1069	NC_008268	CGT	2	6	42384	42389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017058
1070	NC_008268	CCG	2	6	42451	42456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017058
1071	NC_008268	GTG	2	6	42499	42504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017058
1072	NC_008268	GAC	2	6	42507	42512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017058
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1079	NC_008268	AGGC	2	8	42706	42713	25 %	0 %	50 %	25 %	111017059
1080	NC_008268	CG	3	6	42729	42734	0 %	0 %	50 %	50 %	111017059
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1082	NC_008268	ACG	2	6	42919	42924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017059
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1109	NC_008268	TCG	2	6	44105	44110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017060
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1112	NC_008268	GCG	2	6	44173	44178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_008268	ACC	2	6	44235	44240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017061
1114	NC_008268	GA	3	6	44294	44299	50 %	0 %	50 %	0 %	111017061
1115	NC_008268	CGGCA	2	10	44321	44330	20 %	0 %	40 %	40 %	111017061
1116	NC_008268	GCA	2	6	44354	44359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017061
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1124	NC_008268	CAG	2	6	44780	44785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017061
1125	NC_008268	CAG	2	6	44788	44793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017061
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1245	NC_008268	ATC	2	6	49329	49334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017066
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1247	NC_008268	CCA	2	6	49400	49405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1248	NC_008268	GATC	2	8	49437	49444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1249	NC_008268	CG	3	6	49497	49502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1250	NC_008268	CGTC	2	8	49524	49531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1251	NC_008268	TCT	2	6	49562	49567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_008268	CGC	2	6	49656	49661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_008268	CGAC	2	8	49662	49669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1254	NC_008268	GTC	2	6	49696	49701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_008268	GGC	2	6	49716	49721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_008268	GGCGG	2	10	49733	49742	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1257	NC_008268	CCG	2	6	49773	49778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1258	NC_008268	CGA	2	6	49782	49787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_008268	GCGA	2	8	49846	49853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1260	NC_008268	CTC	2	6	49909	49914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1261	NC_008268	CGA	2	6	50010	50015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1262	NC_008268	AC	3	6	50029	50034	50 %	0 %	0 %	50 %	111017067
1263	NC_008268	GGTC	2	8	50088	50095	0 %	25 %	50 %	25 %	111017067
1264	NC_008268	TAC	2	6	50155	50160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017067
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1268	NC_008268	GAA	2	6	50259	50264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017067
1269	NC_008268	CGA	2	6	50310	50315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1270	NC_008268	GTC	2	6	50317	50322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1271	NC_008268	CCA	2	6	50342	50347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017067
1272	NC_008268	GTC	2	6	50386	50391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1273	NC_008268	ACG	2	6	50456	50461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1274	NC_008268	CGA	2	6	50502	50507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017067
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1277	NC_008268	GCA	2	6	50555	50560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017067
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1279	NC_008268	CTG	2	6	50626	50631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1280	NC_008268	ACG	2	6	50702	50707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1281	NC_008268	CGGC	2	8	50798	50805	0 %	0 %	50 %	50 %	111017067
1282	NC_008268	CGA	2	6	50856	50861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017067
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1284	NC_008268	GGGC	2	8	50937	50944	0 %	0 %	75 %	25 %	111017067
1285	NC_008268	TCGACG	2	12	50951	50962	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1286	NC_008268	CCG	2	6	51018	51023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017067
1287	NC_008268	ACG	2	6	51052	51057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1288	NC_008268	TCG	2	6	51077	51082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017067
1289	NC_008268	GT	3	6	51100	51105	0 %	50 %	50 %	0 %	111017067
1290	NC_008268	GAC	2	6	51114	51119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017067
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1292	NC_008268	TCG	2	6	51191	51196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017067
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1296	NC_008268	CGG	2	6	51254	51259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017067
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1310	NC_008268	CG	3	6	51843	51848	0 %	0 %	50 %	50 %	111017067
1311	NC_008268	GGC	2	6	51849	51854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017067
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1313	NC_008268	CGGTC	2	10	51934	51943	0 %	20 %	40 %	40 %	111017067
1314	NC_008268	CAC	2	6	51973	51978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017067
1315	NC_008268	ACT	2	6	52010	52015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017067
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1320	NC_008268	CGCAC	2	10	52179	52188	20 %	0 %	20 %	60 %	111017067
1321	NC_008268	ACA	2	6	52199	52204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017067
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1325	NC_008268	GTTC	2	8	52356	52363	0 %	50 %	25 %	25 %	111017067
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1327	NC_008268	ACTGG	2	10	52416	52425	20 %	20 %	40 %	20 %	111017067
1328	NC_008268	GGAG	2	8	52482	52489	25 %	0 %	75 %	0 %	111017067
1329	NC_008268	CTG	2	6	52546	52551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017067
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1333	NC_008268	GGT	2	6	52671	52676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017067
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1340	NC_008268	TCGT	2	8	53024	53031	0 %	50 %	25 %	25 %	111017067
1341	NC_008268	GTCG	2	8	53098	53105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1342	NC_008268	CAG	2	6	53206	53211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017068
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1347	NC_008268	CGC	2	6	53340	53345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017068
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1350	NC_008268	ACC	3	9	53459	53467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017068
1351	NC_008268	ATC	2	6	53476	53481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017068
1352	NC_008268	CGG	2	6	53490	53495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017068
1353	NC_008268	CGC	3	9	53566	53574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017068
1354	NC_008268	GAC	2	6	53593	53598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017068
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1356	NC_008268	CGGT	2	8	53633	53640	0 %	25 %	50 %	25 %	111017068
1357	NC_008268	CCA	2	6	53680	53685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017068
1358	NC_008268	TCA	2	6	53706	53711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017068
1359	NC_008268	CCT	2	6	53715	53720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1360	NC_008268	TCC	3	9	53728	53736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1361	NC_008268	TCC	2	6	53738	53743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1362	NC_008268	GAG	2	6	53766	53771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1363	NC_008268	GTC	2	6	53840	53845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1364	NC_008268	ACA	2	6	53865	53870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1365	NC_008268	GTG	2	6	53876	53881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1366	NC_008268	GC	4	8	53900	53907	0 %	0 %	50 %	50 %	111017069
1367	NC_008268	CAT	2	6	53975	53980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017069
1368	NC_008268	GCCAC	2	10	53989	53998	20 %	0 %	20 %	60 %	111017069
1369	NC_008268	CGA	2	6	54011	54016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017069
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1372	NC_008268	GAG	2	6	54042	54047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017069
1373	NC_008268	CCG	2	6	54064	54069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017069
1374	NC_008268	GTG	2	6	54084	54089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017069
1375	NC_008268	GCC	2	6	54102	54107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017069
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