MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_008268	CGA	2	6	214701	214706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017178
5503	NC_008268	GGCA	2	8	214744	214751	25 %	0 %	50 %	25 %	111017178
5504	NC_008268	CGT	2	6	214797	214802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017178
5505	NC_008268	GCG	2	6	214832	214837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017178
5506	NC_008268	CGA	2	6	214854	214859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017178
5507	NC_008268	CG	3	6	214861	214866	0 %	0 %	50 %	50 %	111017178
5508	NC_008268	GCC	2	6	214982	214987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017178
5509	NC_008268	CCA	2	6	215044	215049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017178
5510	NC_008268	TCG	2	6	215093	215098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017178
5511	NC_008268	GTC	2	6	215116	215121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017178
5512	NC_008268	CGG	2	6	215180	215185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017178
5513	NC_008268	GTG	2	6	215206	215211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017178
5514	NC_008268	AGC	2	6	215216	215221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017178
5515	NC_008268	GCT	2	6	215244	215249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017178
5516	NC_008268	GA	3	6	215252	215257	50 %	0 %	50 %	0 %	111017178
5517	NC_008268	TCG	2	6	215271	215276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017178
5518	NC_008268	ACC	2	6	215306	215311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017178
5519	NC_008268	ACGGTG	2	12	215375	215386	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5520	NC_008268	CAGG	2	8	215397	215404	25 %	0 %	50 %	25 %	111017179
5521	NC_008268	ACCGG	2	10	215435	215444	20 %	0 %	40 %	40 %	111017179
5522	NC_008268	CA	3	6	215488	215493	50 %	0 %	0 %	50 %	111017179
5523	NC_008268	AGT	2	6	215498	215503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017179
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5525	NC_008268	CGC	2	6	215579	215584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017179
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5527	NC_008268	CGA	2	6	215599	215604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017179
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5529	NC_008268	TGC	2	6	215665	215670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017179
5530	NC_008268	TGGG	2	8	215757	215764	0 %	25 %	75 %	0 %	111017179
5531	NC_008268	TCG	2	6	215812	215817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017179
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5534	NC_008268	GCTC	2	8	215909	215916	0 %	25 %	25 %	50 %	111017179
5535	NC_008268	CGA	2	6	215941	215946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017179
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5539	NC_008268	CGT	2	6	216044	216049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017179
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5541	NC_008268	CGT	2	6	216130	216135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017179
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5546	NC_008268	CGGTG	2	10	216287	216296	0 %	20 %	60 %	20 %	111017179
5547	NC_008268	GTG	2	6	216402	216407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017179
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5553	NC_008268	GCT	2	6	216584	216589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017179
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5555	NC_008268	CGC	2	6	216683	216688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017179
5556	NC_008268	GGGA	2	8	216727	216734	25 %	0 %	75 %	0 %	111017179
5557	NC_008268	GC	3	6	216737	216742	0 %	0 %	50 %	50 %	111017179
5558	NC_008268	GGC	2	6	216786	216791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017179
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5562	NC_008268	GCT	2	6	216860	216865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017179
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5567	NC_008268	ACC	2	6	217046	217051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5612	NC_008268	CGG	2	6	218782	218787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_008268	CGT	2	6	218790	218795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5621	NC_008268	CGA	3	9	219088	219096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017181
5622	NC_008268	CG	3	6	219146	219151	0 %	0 %	50 %	50 %	111017181
5623	NC_008268	CGGT	2	8	219176	219183	0 %	25 %	50 %	25 %	111017181
5624	NC_008268	TCC	2	6	219189	219194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017181
5625	NC_008268	GGA	2	6	219229	219234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017181
5626	NC_008268	AGC	2	6	219235	219240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017181
5627	NC_008268	TCC	2	6	219274	219279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017182
5628	NC_008268	GTCT	2	8	219318	219325	0 %	50 %	25 %	25 %	111017182
5629	NC_008268	CCCGA	2	10	219391	219400	20 %	0 %	20 %	60 %	111017182
5630	NC_008268	CGA	2	6	219440	219445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5631	NC_008268	CGC	3	9	219460	219468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017182
5632	NC_008268	CG	4	8	219480	219487	0 %	0 %	50 %	50 %	111017182
5633	NC_008268	GCA	2	6	219506	219511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5634	NC_008268	GTC	2	6	219570	219575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5635	NC_008268	CAT	2	6	219621	219626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017182
5636	NC_008268	GGCC	2	8	219644	219651	0 %	0 %	50 %	50 %	111017182
5637	NC_008268	GTC	2	6	219669	219674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5638	NC_008268	GCA	2	6	219692	219697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5639	NC_008268	CCCG	2	8	219731	219738	0 %	0 %	25 %	75 %	111017182
5640	NC_008268	ACG	2	6	219797	219802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5641	NC_008268	ATC	2	6	219820	219825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017182
5642	NC_008268	CGT	2	6	219848	219853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5643	NC_008268	GCC	2	6	219883	219888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017182
5644	NC_008268	CGGCG	2	10	219899	219908	0 %	0 %	60 %	40 %	111017182
5645	NC_008268	CGA	3	9	219926	219934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5646	NC_008268	GC	3	6	219936	219941	0 %	0 %	50 %	50 %	111017182
5647	NC_008268	CCT	2	6	219947	219952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017182
5648	NC_008268	CGT	2	6	219953	219958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5649	NC_008268	CCG	2	6	219963	219968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017182
5650	NC_008268	CCG	2	6	219983	219988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017182
5651	NC_008268	CGG	2	6	220028	220033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017182
5652	NC_008268	CCA	2	6	220034	220039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017182
5653	NC_008268	CGA	3	9	220076	220084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5654	NC_008268	CGG	2	6	220103	220108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017182
5655	NC_008268	TGC	2	6	220109	220114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5656	NC_008268	CGA	2	6	220127	220132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5657	NC_008268	CAG	2	6	220158	220163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5658	NC_008268	TGA	2	6	220202	220207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017182
5659	NC_008268	GTGATC	2	12	220210	220221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	111017182
5660	NC_008268	GCC	3	9	220243	220251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017182
5661	NC_008268	GGCA	2	8	220279	220286	25 %	0 %	50 %	25 %	111017182
5662	NC_008268	CAG	2	6	220287	220292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017182
5663	NC_008268	GAACAC	2	12	220341	220352	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	111017182
5664	NC_008268	CGC	2	6	220371	220376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017182
5665	NC_008268	GGGT	2	8	220455	220462	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5666	NC_008268	CTT	2	6	220501	220506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017183
5667	NC_008268	CCG	2	6	220511	220516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017183
5668	NC_008268	GCC	2	6	220522	220527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017183
5669	NC_008268	GGGT	2	8	220528	220535	0 %	25 %	75 %	0 %	111017183
5670	NC_008268	CGT	2	6	220542	220547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017183
5671	NC_008268	CGG	4	12	220548	220559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017183
5672	NC_008268	TCG	2	6	220586	220591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017183
5673	NC_008268	CGC	2	6	220604	220609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017183
5674	NC_008268	GGC	2	6	220611	220616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017183
5675	NC_008268	CCA	2	6	220622	220627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017183
5676	NC_008268	CCG	3	9	220655	220663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017183
5677	NC_008268	CG	3	6	220674	220679	0 %	0 %	50 %	50 %	111017183
5678	NC_008268	CGG	2	6	220727	220732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017183
5679	NC_008268	TCA	2	6	220793	220798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017183
5680	NC_008268	TCG	2	6	220808	220813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017183
5681	NC_008268	TCCG	2	8	220835	220842	0 %	25 %	25 %	50 %	111017183
5682	NC_008268	CCG	2	6	220870	220875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017183
5683	NC_008268	CGG	2	6	220879	220884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017183
5684	NC_008268	GTC	2	6	220888	220893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017183
5685	NC_008268	GTC	2	6	220897	220902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017183
5686	NC_008268	CTG	2	6	220903	220908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017183
5687	NC_008268	CTC	2	6	220918	220923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017183
5688	NC_008268	ACG	2	6	220931	220936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017183
5689	NC_008268	CGGGC	2	10	220944	220953	0 %	0 %	60 %	40 %	111017183
5690	NC_008268	TCA	3	9	220967	220975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017183
5691	NC_008268	GCG	2	6	221014	221019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017183
5692	NC_008268	TTC	2	6	221065	221070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017183
5693	NC_008268	GCC	2	6	221071	221076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017183
5694	NC_008268	CTG	2	6	221191	221196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017183
5695	NC_008268	GTG	2	6	221200	221205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017183
5696	NC_008268	GGTTG	2	10	221222	221231	0 %	40 %	60 %	0 %	111017183
5697	NC_008268	GCA	2	6	221232	221237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017183
5698	NC_008268	CGAC	2	8	221249	221256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5699	NC_008268	GGT	2	6	221260	221265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5700	NC_008268	CGC	2	6	221341	221346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017184
5701	NC_008268	CG	3	6	221351	221356	0 %	0 %	50 %	50 %	111017184
5702	NC_008268	CCAG	2	8	221397	221404	25 %	0 %	25 %	50 %	111017184
5703	NC_008268	GCTGCG	2	12	221407	221418	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111017184
5704	NC_008268	CGG	2	6	221436	221441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017184
5705	NC_008268	GTC	3	9	221474	221482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5706	NC_008268	CCG	3	9	221529	221537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017184
5707	NC_008268	CGG	2	6	221541	221546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017184
5708	NC_008268	CGC	2	6	221605	221610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017184
5709	NC_008268	ACG	2	6	221649	221654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5710	NC_008268	GCT	2	6	221692	221697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5711	NC_008268	CTC	2	6	221717	221722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017184
5712	NC_008268	GCA	2	6	221812	221817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5713	NC_008268	CCA	2	6	221847	221852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017184
5714	NC_008268	GT	3	6	221871	221876	0 %	50 %	50 %	0 %	111017184
5715	NC_008268	CGA	2	6	221956	221961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5716	NC_008268	CTG	2	6	221981	221986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5717	NC_008268	CGACC	2	10	222040	222049	20 %	0 %	20 %	60 %	111017184
5718	NC_008268	CGT	2	6	222135	222140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5719	NC_008268	CGGAC	2	10	222201	222210	20 %	0 %	40 %	40 %	111017184
5720	NC_008268	ACG	3	9	222240	222248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5721	NC_008268	TCG	2	6	222294	222299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5722	NC_008268	GCT	2	6	222354	222359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5723	NC_008268	CGC	2	6	222372	222377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017184
5724	NC_008268	CCCGAC	2	12	222419	222430	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111017184
5725	NC_008268	GCA	2	6	222438	222443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5726	NC_008268	CGA	2	6	222445	222450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5727	NC_008268	GGA	2	6	222466	222471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017184
5728	NC_008268	TCGA	2	8	222503	222510	25 %	25 %	25 %	25 %	111017184
5729	NC_008268	CGG	2	6	222562	222567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017184
5730	NC_008268	CGA	2	6	222606	222611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017184
5731	NC_008268	CGG	2	6	222643	222648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017184
5732	NC_008268	CGG	2	6	222667	222672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017184
5733	NC_008268	GGC	2	6	222779	222784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017184
5734	NC_008268	GAT	2	6	222786	222791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017184
5735	NC_008268	GCA	2	6	222798	222803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017185
5736	NC_008268	TCG	2	6	222806	222811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017185
5737	NC_008268	GGCA	2	8	222888	222895	25 %	0 %	50 %	25 %	111017185
5738	NC_008268	ACC	2	6	222904	222909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017185
5739	NC_008268	CGC	2	6	223005	223010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017185
5740	NC_008268	CGC	2	6	223044	223049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017185
5741	NC_008268	GAC	2	6	223117	223122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017185
5742	NC_008268	CGG	2	6	223124	223129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017185
5743	NC_008268	CAC	2	6	223216	223221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017185
5744	NC_008268	CAC	2	6	223230	223235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017185
5745	NC_008268	TGGG	2	8	223327	223334	0 %	25 %	75 %	0 %	111017185
5746	NC_008268	GCC	2	6	223455	223460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017185
5747	NC_008268	GGGCC	2	10	223506	223515	0 %	0 %	60 %	40 %	111017185
5748	NC_008268	GAA	2	6	223519	223524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017185
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5750	NC_008268	GTC	3	9	223650	223658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017185
5751	NC_008268	GCG	2	6	223753	223758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017185
5752	NC_008268	CGG	2	6	223812	223817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017185
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5756	NC_008268	CTG	2	6	223909	223914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017185
5757	NC_008268	TCG	2	6	223946	223951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017185
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5761	NC_008268	CGC	2	6	224254	224259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5762	NC_008268	AGG	2	6	224357	224362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5763	NC_008268	ACC	3	9	224379	224387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017186
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5767	NC_008268	CGC	3	9	224510	224518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017186
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5775	NC_008268	GACG	2	8	224678	224685	25 %	0 %	50 %	25 %	111017187
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5800	NC_008268	CAA	2	6	225582	225587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5801	NC_008268	GCA	2	6	225653	225658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017190
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5821	NC_008268	CGC	2	6	226584	226589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5857	NC_008268	CTC	2	6	228021	228026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017193
5858	NC_008268	CAC	2	6	228048	228053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017193
5859	NC_008268	GCG	2	6	228054	228059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017193
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5861	NC_008268	GTC	2	6	228114	228119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017193
5862	NC_008268	ACGGC	2	10	228251	228260	20 %	0 %	40 %	40 %	111017193
5863	NC_008268	GCG	2	6	228320	228325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017193
5864	NC_008268	CGG	2	6	228338	228343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017193
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5887	NC_008268	CTG	2	6	228846	228851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017193
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5980	NC_008268	GCA	2	6	232442	232447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017195
5981	NC_008268	CGT	2	6	232461	232466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017195
5982	NC_008268	CTG	2	6	232501	232506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017195
5983	NC_008268	CGC	2	6	232536	232541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017195
5984	NC_008268	CGGTC	2	10	232551	232560	0 %	20 %	40 %	40 %	111017195
5985	NC_008268	GAAG	2	8	232584	232591	50 %	0 %	50 %	0 %	111017195
5986	NC_008268	TGG	2	6	232625	232630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017195
5987	NC_008268	GCC	2	6	232637	232642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017195
5988	NC_008268	GCG	2	6	232666	232671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017195
5989	NC_008268	GCGA	2	8	232684	232691	25 %	0 %	50 %	25 %	111017195
5990	NC_008268	CG	3	6	232781	232786	0 %	0 %	50 %	50 %	111017196
5991	NC_008268	TGG	2	6	232807	232812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017196
5992	NC_008268	CGGCA	2	10	232827	232836	20 %	0 %	40 %	40 %	111017196
5993	NC_008268	CG	3	6	232848	232853	0 %	0 %	50 %	50 %	111017196
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5997	NC_008268	GAG	2	6	232968	232973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017196
5998	NC_008268	CGC	2	6	232988	232993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017196
5999	NC_008268	GCCG	2	8	233004	233011	0 %	0 %	50 %	50 %	111017196
6000	NC_008268	CTC	2	6	233022	233027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017196

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