MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 200614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_008268	CGC	2	6	194536	194541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
5003	NC_008268	GAA	2	6	194549	194554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017166
5004	NC_008268	GTC	2	6	194573	194578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
5005	NC_008268	TCC	2	6	194616	194621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017166
5006	NC_008268	TCGA	2	8	194642	194649	25 %	25 %	25 %	25 %	111017166
5007	NC_008268	GGCA	2	8	194672	194679	25 %	0 %	50 %	25 %	111017166
5008	NC_008268	CGA	2	6	194821	194826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
5009	NC_008268	CCA	2	6	194833	194838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
5010	NC_008268	TCGC	2	8	194844	194851	0 %	25 %	25 %	50 %	111017166
5011	NC_008268	CCG	2	6	194893	194898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
5012	NC_008268	CCGG	2	8	194990	194997	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
5013	NC_008268	CCGGT	2	10	195015	195024	0 %	20 %	40 %	40 %	111017166
5014	NC_008268	CGG	2	6	195070	195075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
5015	NC_008268	GGT	2	6	195248	195253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
5016	NC_008268	GGC	2	6	195257	195262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
5017	NC_008268	CCG	2	6	195320	195325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
5018	NC_008268	CGC	2	6	195349	195354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
5019	NC_008268	CGA	2	6	195355	195360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
5020	NC_008268	CGA	2	6	195374	195379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
5021	NC_008268	GTCC	2	8	195493	195500	0 %	25 %	25 %	50 %	111017166
5022	NC_008268	ACG	2	6	195513	195518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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5029	NC_008268	TCGA	2	8	195972	195979	25 %	25 %	25 %	25 %	111017166
5030	NC_008268	CGG	2	6	195981	195986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
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5040	NC_008268	GC	3	6	196659	196664	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
5041	NC_008268	CGA	2	6	196690	196695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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5043	NC_008268	AGCGG	2	10	196817	196826	20 %	0 %	60 %	20 %	111017166
5044	NC_008268	TCG	2	6	196894	196899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
5045	NC_008268	CGGG	2	8	196907	196914	0 %	0 %	75 %	25 %	111017166
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5053	NC_008268	CGG	2	6	197152	197157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
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5059	NC_008268	TGT	2	6	197476	197481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017166
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5062	NC_008268	GC	3	6	197556	197561	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
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5065	NC_008268	GTC	2	6	197589	197594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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5122	NC_008268	GTC	2	6	200189	200194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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5244	NC_008268	GAC	2	6	204582	204587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017167
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5282	NC_008268	CGC	2	6	206257	206262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017168
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5350	NC_008268	CGC	2	6	208577	208582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017170
5351	NC_008268	ACG	2	6	208604	208609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017170
5352	NC_008268	CAG	3	9	208625	208633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017170
5353	NC_008268	AGG	2	6	208656	208661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017170
5354	NC_008268	GACC	2	8	208690	208697	25 %	0 %	25 %	50 %	111017170
5355	NC_008268	GCG	2	6	208707	208712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017170
5356	NC_008268	CCA	2	6	208717	208722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017170
5357	NC_008268	ACA	2	6	208729	208734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017170
5358	NC_008268	GCG	2	6	208743	208748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017170
5359	NC_008268	CCGG	2	8	208839	208846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5360	NC_008268	ATG	2	6	208901	208906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5361	NC_008268	GAG	2	6	208947	208952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5362	NC_008268	CCG	2	6	208978	208983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017171
5363	NC_008268	GCC	2	6	209009	209014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017171
5364	NC_008268	GCA	2	6	209045	209050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017171
5365	NC_008268	GCC	2	6	209075	209080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017171
5366	NC_008268	CGC	2	6	209113	209118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017171
5367	NC_008268	CCG	3	9	209121	209129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017171
5368	NC_008268	CAC	2	6	209188	209193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017171
5369	NC_008268	GCG	2	6	209232	209237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017171
5370	NC_008268	GTC	2	6	209359	209364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017171
5371	NC_008268	CGA	2	6	209422	209427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017171
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5375	NC_008268	CCG	2	6	209595	209600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5387	NC_008268	CGA	2	6	210169	210174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017172
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5390	NC_008268	GCCCG	2	10	210295	210304	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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5393	NC_008268	CGG	2	6	210400	210405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5394	NC_008268	GTG	2	6	210478	210483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017173
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5413	NC_008268	CGC	2	6	211229	211234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5414	NC_008268	GAT	2	6	211235	211240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5415	NC_008268	GTC	3	9	211251	211259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5417	NC_008268	ACG	2	6	211325	211330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017175
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5420	NC_008268	ACG	2	6	211376	211381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017175
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5455	NC_008268	GCGCC	2	10	212824	212833	0 %	0 %	40 %	60 %	111017176
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5483	NC_008268	GCC	2	6	213891	213896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017177
5484	NC_008268	ATCG	2	8	213974	213981	25 %	25 %	25 %	25 %	111017177
5485	NC_008268	GAT	2	6	213991	213996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017177
5486	NC_008268	GCG	3	9	214024	214032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017177
5487	NC_008268	GAG	2	6	214033	214038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017177
5488	NC_008268	TGC	2	6	214100	214105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017177
5489	NC_008268	GAC	3	9	214146	214154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017177
5490	NC_008268	CGA	2	6	214177	214182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017177
5491	NC_008268	GT	3	6	214185	214190	0 %	50 %	50 %	0 %	111017177
5492	NC_008268	TC	3	6	214226	214231	0 %	50 %	0 %	50 %	111017177
5493	NC_008268	TCG	2	6	214268	214273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017177
5494	NC_008268	GGTT	2	8	214330	214337	0 %	50 %	50 %	0 %	111017177
5495	NC_008268	CG	3	6	214347	214352	0 %	0 %	50 %	50 %	111017177
5496	NC_008268	CG	3	6	214366	214371	0 %	0 %	50 %	50 %	111017177
5497	NC_008268	CGA	2	6	214377	214382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017177
5498	NC_008268	CG	3	6	214460	214465	0 %	0 %	50 %	50 %	111017177
5499	NC_008268	TCG	3	9	214512	214520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_008268	GC	5	10	214640	214649	0 %	0 %	50 %	50 %	111017178

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