MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 82664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008209	ACG	2	6	150082	150087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677562
3002	NC_008209	CGGT	2	8	150245	150252	0 %	25 %	50 %	25 %	110677562
3003	NC_008209	CGT	2	6	150279	150284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677562
3004	NC_008209	CTCTT	2	10	150302	150311	0 %	60 %	0 %	40 %	110677562
3005	NC_008209	GC	3	6	150313	150318	0 %	0 %	50 %	50 %	110677562
3006	NC_008209	GGC	2	6	150319	150324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677562
3007	NC_008209	TGA	2	6	150585	150590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677562
3008	NC_008209	ACGC	2	8	150653	150660	25 %	0 %	25 %	50 %	110677562
3009	NC_008209	ACGA	2	8	150862	150869	50 %	0 %	25 %	25 %	110677562
3010	NC_008209	GC	3	6	150889	150894	0 %	0 %	50 %	50 %	110677562
3011	NC_008209	GCT	2	6	150922	150927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677562
3012	NC_008209	CTG	2	6	150976	150981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677562
3013	NC_008209	GCC	2	6	151004	151009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677562
3014	NC_008209	CG	3	6	151068	151073	0 %	0 %	50 %	50 %	110677562
3015	NC_008209	GC	3	6	151216	151221	0 %	0 %	50 %	50 %	110677562
3016	NC_008209	CCA	2	6	151402	151407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677562
3017	NC_008209	CAA	2	6	151416	151421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677562
3018	NC_008209	GCC	2	6	151502	151507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677562
3019	NC_008209	GC	3	6	151527	151532	0 %	0 %	50 %	50 %	110677562
3020	NC_008209	CAA	2	6	151542	151547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677562
3021	NC_008209	GAA	2	6	151564	151569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677562
3022	NC_008209	GC	3	6	151582	151587	0 %	0 %	50 %	50 %	110677562
3023	NC_008209	GTC	2	6	151603	151608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677562
3024	NC_008209	CCGC	2	8	151735	151742	0 %	0 %	25 %	75 %	110677563
3025	NC_008209	ATC	2	6	151797	151802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677563
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3027	NC_008209	GGCC	2	8	152030	152037	0 %	0 %	50 %	50 %	110677563
3028	NC_008209	GCC	2	6	152106	152111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677563
3029	NC_008209	TCG	2	6	152257	152262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677563
3030	NC_008209	TGGG	2	8	152281	152288	0 %	25 %	75 %	0 %	110677563
3031	NC_008209	AT	3	6	152315	152320	50 %	50 %	0 %	0 %	110677563
3032	NC_008209	GC	3	6	152385	152390	0 %	0 %	50 %	50 %	110677564
3033	NC_008209	CTG	2	6	152435	152440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677564
3034	NC_008209	A	7	7	152449	152455	100 %	0 %	0 %	0 %	110677564
3035	NC_008209	GCC	2	6	152489	152494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677564
3036	NC_008209	CTT	2	6	152519	152524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677564
3037	NC_008209	TTG	2	6	152543	152548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677564
3038	NC_008209	CGA	2	6	152559	152564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677564
3039	NC_008209	CGC	2	6	152598	152603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677564
3040	NC_008209	T	6	6	152606	152611	0 %	100 %	0 %	0 %	110677564
3041	NC_008209	GTT	2	6	152710	152715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677564
3042	NC_008209	ATT	2	6	152815	152820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677564
3043	NC_008209	ATC	2	6	152883	152888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677564
3044	NC_008209	CGC	2	6	152905	152910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677564
3045	NC_008209	CGC	2	6	152922	152927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677564
3046	NC_008209	CTG	2	6	152942	152947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677564
3047	NC_008209	TGT	2	6	152977	152982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677564
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3051	NC_008209	CTGG	2	8	153140	153147	0 %	25 %	50 %	25 %	110677564
3052	NC_008209	CGC	3	9	153169	153177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677564
3053	NC_008209	AC	3	6	153200	153205	50 %	0 %	0 %	50 %	110677564
3054	NC_008209	TG	3	6	153254	153259	0 %	50 %	50 %	0 %	110677564
3055	NC_008209	CGG	2	6	153339	153344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677564
3056	NC_008209	CGG	2	6	153411	153416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677564
3057	NC_008209	AGCA	2	8	153469	153476	50 %	0 %	25 %	25 %	110677564
3058	NC_008209	ACA	2	6	153492	153497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677565
3059	NC_008209	CAG	2	6	153550	153555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677565
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3061	NC_008209	GC	4	8	153567	153574	0 %	0 %	50 %	50 %	110677565
3062	NC_008209	A	6	6	153580	153585	100 %	0 %	0 %	0 %	110677565
3063	NC_008209	GCA	2	6	153677	153682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677565
3064	NC_008209	A	6	6	153682	153687	100 %	0 %	0 %	0 %	110677565
3065	NC_008209	GCT	2	6	153732	153737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677565
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3067	NC_008209	GCA	2	6	153841	153846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677565
3068	NC_008209	AGTG	2	8	153889	153896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008209	T	6	6	153909	153914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008209	GGC	2	6	153949	153954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_008209	TTTC	2	8	154043	154050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3072	NC_008209	CTG	2	6	154075	154080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_008209	AGGC	2	8	154107	154114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_008209	TGG	2	6	154147	154152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008209	TG	3	6	154170	154175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_008209	TCC	2	6	154197	154202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_008209	AAT	2	6	154210	154215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677566
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3079	NC_008209	CGTT	2	8	154254	154261	0 %	50 %	25 %	25 %	110677566
3080	NC_008209	GCA	2	6	154264	154269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677566
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3082	NC_008209	CG	3	6	154498	154503	0 %	0 %	50 %	50 %	110677566
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3086	NC_008209	TCA	2	6	154846	154851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_008209	CTT	2	6	154863	154868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_008209	GTCA	2	8	154893	154900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_008209	GGC	2	6	154994	154999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_008209	AGT	2	6	155016	155021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677567
3091	NC_008209	T	6	6	155021	155026	0 %	100 %	0 %	0 %	110677567
3092	NC_008209	CTT	2	6	155116	155121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677567
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3094	NC_008209	CT	3	6	155311	155316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_008209	TCA	3	9	155411	155419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677568
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3098	NC_008209	CCG	2	6	155552	155557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677568
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3100	NC_008209	CGA	2	6	155704	155709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677568
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3103	NC_008209	GCA	2	6	155937	155942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677568
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3107	NC_008209	GA	3	6	156281	156286	50 %	0 %	50 %	0 %	110677568
3108	NC_008209	GAG	2	6	156360	156365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110677568
3109	NC_008209	GGC	2	6	156508	156513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677569
3110	NC_008209	CGG	2	6	156532	156537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677569
3111	NC_008209	GAA	2	6	156570	156575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677569
3112	NC_008209	GAT	2	6	156591	156596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677569
3113	NC_008209	A	6	6	156627	156632	100 %	0 %	0 %	0 %	110677569
3114	NC_008209	GAG	2	6	156650	156655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008209	GATC	2	8	156722	156729	25 %	25 %	25 %	25 %	162139376
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3117	NC_008209	GCG	2	6	156806	156811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139376
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3119	NC_008209	GAA	2	6	156897	156902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139376
3120	NC_008209	GGGC	2	8	156923	156930	0 %	0 %	75 %	25 %	162139376
3121	NC_008209	GGA	2	6	157019	157024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162139376
3122	NC_008209	TGG	2	6	157087	157092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139376
3123	NC_008209	CATC	2	8	157096	157103	25 %	25 %	0 %	50 %	162139376
3124	NC_008209	ATCGC	2	10	157132	157141	20 %	20 %	20 %	40 %	162139376
3125	NC_008209	TGG	2	6	157165	157170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139376
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3134	NC_008209	GGCG	2	8	157733	157740	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3142	NC_008209	CTAG	2	8	158215	158222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3143	NC_008209	CTT	2	6	158234	158239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3167	NC_008209	GGC	2	6	159474	159479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3220	NC_008209	GAA	2	6	162189	162194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_008209	GACAA	2	10	163588	163597	60 %	0 %	20 %	20 %	110677576
3248	NC_008209	GCT	2	6	163625	163630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677576
3249	NC_008209	TCT	2	6	163634	163639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677576
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3251	NC_008209	TCC	2	6	163709	163714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677576
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3370	NC_008209	CA	3	6	169542	169547	50 %	0 %	0 %	50 %	110677581
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3372	NC_008209	GCGCTG	2	12	169734	169745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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3496	NC_008209	CCG	2	6	175649	175654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677587
3497	NC_008209	GAA	2	6	175761	175766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677587
3498	NC_008209	CAT	2	6	175812	175817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677587
3499	NC_008209	GTT	2	6	175818	175823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677587
3500	NC_008209	CGTGG	2	10	175884	175893	0 %	20 %	60 %	20 %	110677587

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