MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 82664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008209	GGC	2	6	101159	101164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677515
2003	NC_008209	CAG	2	6	101219	101224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677515
2004	NC_008209	TGG	2	6	101368	101373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677515
2005	NC_008209	GCC	3	9	101403	101411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677515
2006	NC_008209	CG	3	6	101539	101544	0 %	0 %	50 %	50 %	110677515
2007	NC_008209	GC	3	6	101575	101580	0 %	0 %	50 %	50 %	110677515
2008	NC_008209	CCG	2	6	101581	101586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677515
2009	NC_008209	GCG	2	6	101619	101624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677515
2010	NC_008209	CAC	2	6	101630	101635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677515
2011	NC_008209	CCCG	2	8	101709	101716	0 %	0 %	25 %	75 %	110677515
2012	NC_008209	CAT	2	6	101755	101760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677515
2013	NC_008209	CGC	2	6	101828	101833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677515
2014	NC_008209	CGG	2	6	101839	101844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677515
2015	NC_008209	CGC	2	6	101939	101944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677515
2016	NC_008209	CGA	2	6	101953	101958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677515
2017	NC_008209	CGGA	2	8	101959	101966	25 %	0 %	50 %	25 %	110677515
2018	NC_008209	CGG	2	6	102004	102009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677515
2019	NC_008209	GCCTTG	2	12	102027	102038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677515
2020	NC_008209	CTG	2	6	102088	102093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677515
2021	NC_008209	CGG	2	6	102100	102105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677515
2022	NC_008209	GCCCTT	2	12	102113	102124	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	110677515
2023	NC_008209	CAG	2	6	102132	102137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677515
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2034	NC_008209	GCGCC	2	10	102625	102634	0 %	0 %	40 %	60 %	110677515
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2041	NC_008209	GCC	2	6	103191	103196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2042	NC_008209	CAG	2	6	103414	103419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677516
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2051	NC_008209	GCGCC	2	10	103864	103873	0 %	0 %	40 %	60 %	110677516
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2063	NC_008209	ATGC	2	8	104649	104656	25 %	25 %	25 %	25 %	110677517
2064	NC_008209	CAG	2	6	104661	104666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677517
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2094	NC_008209	GCGG	2	8	105759	105766	0 %	0 %	75 %	25 %	110677518
2095	NC_008209	GAT	2	6	105790	105795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677518
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2110	NC_008209	TCT	2	6	106170	106175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677518
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2112	NC_008209	GCC	2	6	106387	106392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2122	NC_008209	CGC	2	6	106747	106752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2123	NC_008209	C	6	6	106783	106788	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2124	NC_008209	CA	3	6	106842	106847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2125	NC_008209	ATC	2	6	106917	106922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677522
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2128	NC_008209	GCAT	2	8	106995	107002	25 %	25 %	25 %	25 %	110677522
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2131	NC_008209	GGT	2	6	107120	107125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677522
2132	NC_008209	CAT	2	6	107129	107134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677522
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2366	NC_008209	GGTATC	2	12	117799	117810	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110677531
2367	NC_008209	ACG	2	6	117823	117828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677531
2368	NC_008209	ATG	2	6	117829	117834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677531
2369	NC_008209	GCG	2	6	117921	117926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677532
2370	NC_008209	GC	3	6	117931	117936	0 %	0 %	50 %	50 %	110677532
2371	NC_008209	CCA	2	6	117952	117957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677532
2372	NC_008209	CAGAT	2	10	117992	118001	40 %	20 %	20 %	20 %	110677532
2373	NC_008209	GAT	2	6	118048	118053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677532
2374	NC_008209	AAC	2	6	118084	118089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677532
2375	NC_008209	GTT	2	6	118186	118191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677532
2376	NC_008209	CGGG	2	8	118269	118276	0 %	0 %	75 %	25 %	110677532
2377	NC_008209	CGGG	2	8	118314	118321	0 %	0 %	75 %	25 %	110677532
2378	NC_008209	AAC	2	6	118322	118327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677532
2379	NC_008209	AAAC	2	8	118363	118370	75 %	0 %	0 %	25 %	110677532
2380	NC_008209	GC	3	6	118446	118451	0 %	0 %	50 %	50 %	110677533
2381	NC_008209	GCG	2	6	118499	118504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677533
2382	NC_008209	CCA	2	6	118523	118528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677533
2383	NC_008209	GC	3	6	118647	118652	0 %	0 %	50 %	50 %	110677533
2384	NC_008209	CG	3	6	118654	118659	0 %	0 %	50 %	50 %	110677533
2385	NC_008209	CG	3	6	118717	118722	0 %	0 %	50 %	50 %	110677533
2386	NC_008209	GAC	2	6	118736	118741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677533
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2388	NC_008209	CGC	2	6	118912	118917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677533
2389	NC_008209	CAT	2	6	119028	119033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677533
2390	NC_008209	CG	3	6	119056	119061	0 %	0 %	50 %	50 %	110677533
2391	NC_008209	GC	3	6	119144	119149	0 %	0 %	50 %	50 %	110677533
2392	NC_008209	TCC	2	6	119164	119169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677533
2393	NC_008209	GCC	2	6	119210	119215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677533
2394	NC_008209	TCA	2	6	119287	119292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677533
2395	NC_008209	GCA	2	6	119348	119353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677533
2396	NC_008209	CGC	2	6	119361	119366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677533
2397	NC_008209	AAGGAC	2	12	119371	119382	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	110677533
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2399	NC_008209	GCGG	2	8	119563	119570	0 %	0 %	75 %	25 %	110677534
2400	NC_008209	GAC	2	6	119660	119665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677534
2401	NC_008209	GCA	2	6	119695	119700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677534
2402	NC_008209	ATC	2	6	119813	119818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677534
2403	NC_008209	GTC	2	6	119876	119881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677534
2404	NC_008209	CG	3	6	119974	119979	0 %	0 %	50 %	50 %	110677534
2405	NC_008209	T	6	6	120030	120035	0 %	100 %	0 %	0 %	110677534
2406	NC_008209	ACC	2	6	120114	120119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677534
2407	NC_008209	CAC	2	6	120179	120184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677534
2408	NC_008209	TCA	2	6	120205	120210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677534
2409	NC_008209	CG	3	6	120440	120445	0 %	0 %	50 %	50 %	110677534
2410	NC_008209	CAG	2	6	120446	120451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677534
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2413	NC_008209	CCA	2	6	120547	120552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677534
2414	NC_008209	TCG	2	6	120760	120765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677534
2415	NC_008209	CGCC	2	8	120810	120817	0 %	0 %	25 %	75 %	110677534
2416	NC_008209	CGC	3	9	120875	120883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677534
2417	NC_008209	CCG	2	6	120888	120893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677534
2418	NC_008209	CG	3	6	120926	120931	0 %	0 %	50 %	50 %	110677534
2419	NC_008209	TCA	2	6	120970	120975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677534
2420	NC_008209	TTGAC	2	10	121000	121009	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2421	NC_008209	ATG	2	6	121157	121162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677535
2422	NC_008209	GGGC	2	8	121163	121170	0 %	0 %	75 %	25 %	110677535
2423	NC_008209	GC	3	6	121169	121174	0 %	0 %	50 %	50 %	110677535
2424	NC_008209	C	6	6	121245	121250	0 %	0 %	0 %	100 %	110677535
2425	NC_008209	CCG	2	6	121260	121265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677535
2426	NC_008209	ACC	2	6	121344	121349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677535
2427	NC_008209	GCC	2	6	121460	121465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677535
2428	NC_008209	CCCT	2	8	121487	121494	0 %	25 %	0 %	75 %	110677535
2429	NC_008209	GAT	2	6	121534	121539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677535
2430	NC_008209	CTG	2	6	121589	121594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677535
2431	NC_008209	GCC	2	6	121637	121642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677535
2432	NC_008209	GCC	3	9	121667	121675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677535
2433	NC_008209	CGA	2	6	121690	121695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677535
2434	NC_008209	GAA	2	6	121709	121714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677535
2435	NC_008209	CATG	2	8	121790	121797	25 %	25 %	25 %	25 %	110677535
2436	NC_008209	CCCTT	2	10	121804	121813	0 %	40 %	0 %	60 %	110677536
2437	NC_008209	CCG	2	6	121862	121867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677536
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2439	NC_008209	CGTG	2	8	121929	121936	0 %	25 %	50 %	25 %	110677536
2440	NC_008209	GCC	2	6	121953	121958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677536
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2442	NC_008209	A	6	6	122035	122040	100 %	0 %	0 %	0 %	110677536
2443	NC_008209	GC	3	6	122105	122110	0 %	0 %	50 %	50 %	110677536
2444	NC_008209	GCG	2	6	122135	122140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677536
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2446	NC_008209	CGA	2	6	122196	122201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677536
2447	NC_008209	CTG	2	6	122209	122214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677536
2448	NC_008209	TCG	2	6	122225	122230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677536
2449	NC_008209	CTG	2	6	122233	122238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677536
2450	NC_008209	CTG	2	6	122359	122364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677536
2451	NC_008209	TCA	2	6	122426	122431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677536
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2464	NC_008209	CTG	2	6	123066	123071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677537
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2472	NC_008209	CCCG	2	8	123527	123534	0 %	0 %	25 %	75 %	110677537
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2485	NC_008209	CCAC	2	8	124059	124066	25 %	0 %	0 %	75 %	110677537
2486	NC_008209	CAAA	2	8	124080	124087	75 %	0 %	0 %	25 %	110677537
2487	NC_008209	CGG	4	12	124109	124120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677537
2488	NC_008209	GCA	2	6	124163	124168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677537
2489	NC_008209	GTC	2	6	124197	124202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677537
2490	NC_008209	GACG	2	8	124208	124215	25 %	0 %	50 %	25 %	110677537
2491	NC_008209	GCA	2	6	124257	124262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677537
2492	NC_008209	CGC	2	6	124310	124315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677537
2493	NC_008209	CG	3	6	124367	124372	0 %	0 %	50 %	50 %	110677537
2494	NC_008209	GC	3	6	124378	124383	0 %	0 %	50 %	50 %	110677537
2495	NC_008209	GCA	2	6	124437	124442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677537
2496	NC_008209	GCC	3	9	124463	124471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677538
2497	NC_008209	GGC	2	6	124581	124586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677538
2498	NC_008209	ACC	2	6	124630	124635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677538
2499	NC_008209	TGG	2	6	124639	124644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677538
2500	NC_008209	AGG	2	6	124741	124746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110677538

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