MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 82664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008209	CGC	2	6	24879	24884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677442
502	NC_008209	T	6	6	24893	24898	0 %	100 %	0 %	0 %	110677442
503	NC_008209	ACCG	2	8	24936	24943	25 %	0 %	25 %	50 %	110677443
504	NC_008209	TCG	2	6	24962	24967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677443
505	NC_008209	GCT	2	6	24984	24989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677443
506	NC_008209	CG	3	6	25043	25048	0 %	0 %	50 %	50 %	110677443
507	NC_008209	GCA	2	6	25059	25064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677443
508	NC_008209	CG	3	6	25140	25145	0 %	0 %	50 %	50 %	110677443
509	NC_008209	CGC	2	6	25167	25172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677443
510	NC_008209	CAGTC	2	10	25257	25266	20 %	20 %	20 %	40 %	110677443
511	NC_008209	TC	3	6	25329	25334	0 %	50 %	0 %	50 %	110677443
512	NC_008209	TGTT	2	8	25412	25419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008209	AACAA	2	10	25420	25429	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
514	NC_008209	TCGCC	2	10	25461	25470	0 %	20 %	20 %	60 %	110677444
515	NC_008209	C	8	8	25469	25476	0 %	0 %	0 %	100 %	110677444
516	NC_008209	CG	3	6	25547	25552	0 %	0 %	50 %	50 %	110677444
517	NC_008209	CCG	2	6	25589	25594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677444
518	NC_008209	CATG	2	8	25629	25636	25 %	25 %	25 %	25 %	110677444
519	NC_008209	GGC	2	6	25726	25731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677444
520	NC_008209	AAAC	2	8	25750	25757	75 %	0 %	0 %	25 %	110677444
521	NC_008209	CAA	2	6	25785	25790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677444
522	NC_008209	GC	3	6	25792	25797	0 %	0 %	50 %	50 %	110677444
523	NC_008209	CG	3	6	25799	25804	0 %	0 %	50 %	50 %	110677444
524	NC_008209	T	6	6	25811	25816	0 %	100 %	0 %	0 %	110677444
525	NC_008209	GCC	2	6	25850	25855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677444
526	NC_008209	CGC	2	6	25882	25887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677444
527	NC_008209	GCC	2	6	25897	25902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677444
528	NC_008209	TGC	2	6	25945	25950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677444
529	NC_008209	CG	3	6	26053	26058	0 %	0 %	50 %	50 %	110677444
530	NC_008209	CTGAA	2	10	26099	26108	40 %	20 %	20 %	20 %	110677444
531	NC_008209	GCC	2	6	26145	26150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677444
532	NC_008209	ATCA	2	8	26191	26198	50 %	25 %	0 %	25 %	110677444
533	NC_008209	CG	3	6	26216	26221	0 %	0 %	50 %	50 %	110677444
534	NC_008209	GCA	2	6	26238	26243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677444
535	NC_008209	CCCG	2	8	26272	26279	0 %	0 %	25 %	75 %	110677444
536	NC_008209	CA	3	6	26349	26354	50 %	0 %	0 %	50 %	110677444
537	NC_008209	GTG	2	6	26366	26371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677444
538	NC_008209	GCCGG	2	10	26412	26421	0 %	0 %	60 %	40 %	110677444
539	NC_008209	TGCC	2	8	26422	26429	0 %	25 %	25 %	50 %	110677444
540	NC_008209	CCG	2	6	26436	26441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677444
541	NC_008209	TCA	2	6	26465	26470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677444
542	NC_008209	GC	3	6	26547	26552	0 %	0 %	50 %	50 %	110677444
543	NC_008209	ACCC	2	8	26559	26566	25 %	0 %	0 %	75 %	110677444
544	NC_008209	GC	3	6	26575	26580	0 %	0 %	50 %	50 %	110677444
545	NC_008209	GCAA	2	8	26699	26706	50 %	0 %	25 %	25 %	110677445
546	NC_008209	AGA	2	6	26710	26715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677445
547	NC_008209	TGC	2	6	26755	26760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677445
548	NC_008209	TGA	2	6	26800	26805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677445
549	NC_008209	GT	3	6	26946	26951	0 %	50 %	50 %	0 %	110677445
550	NC_008209	AAC	2	6	27065	27070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677446
551	NC_008209	GCA	2	6	27109	27114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677446
552	NC_008209	GAA	2	6	27169	27174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677446
553	NC_008209	AAC	2	6	27211	27216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677446
554	NC_008209	CCG	2	6	27235	27240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677446
555	NC_008209	ACC	2	6	27464	27469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677446
556	NC_008209	T	6	6	27573	27578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008209	CCCA	2	8	27639	27646	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
558	NC_008209	TG	3	6	27816	27821	0 %	50 %	50 %	0 %	110677447
559	NC_008209	CACAT	2	10	27823	27832	40 %	20 %	0 %	40 %	110677447
560	NC_008209	GCTG	2	8	27835	27842	0 %	25 %	50 %	25 %	110677447
561	NC_008209	CAA	2	6	27866	27871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677447
562	NC_008209	GGC	2	6	27872	27877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677447
563	NC_008209	GATG	2	8	27883	27890	25 %	25 %	50 %	0 %	110677447
564	NC_008209	CTG	2	6	27911	27916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677447
565	NC_008209	TGATCG	2	12	27973	27984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110677447
566	NC_008209	TGCG	2	8	27993	28000	0 %	25 %	50 %	25 %	110677447
567	NC_008209	CG	3	6	28016	28021	0 %	0 %	50 %	50 %	110677447
568	NC_008209	ACC	2	6	28064	28069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677447
569	NC_008209	GCT	2	6	28165	28170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677447
570	NC_008209	TGG	2	6	28404	28409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677447
571	NC_008209	GCGG	2	8	28424	28431	0 %	0 %	75 %	25 %	110677447
572	NC_008209	CA	3	6	28436	28441	50 %	0 %	0 %	50 %	110677447
573	NC_008209	GAT	2	6	28445	28450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677447
574	NC_008209	GACATC	2	12	28502	28513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110677447
575	NC_008209	C	6	6	28523	28528	0 %	0 %	0 %	100 %	110677447
576	NC_008209	GGC	2	6	28633	28638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677447
577	NC_008209	ATG	2	6	28650	28655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677447
578	NC_008209	A	6	6	28727	28732	100 %	0 %	0 %	0 %	110677447
579	NC_008209	GAT	2	6	28741	28746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677447
580	NC_008209	GCC	2	6	28772	28777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677447
581	NC_008209	GGC	2	6	28970	28975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677447
582	NC_008209	TGC	2	6	29007	29012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677447
583	NC_008209	AACC	2	8	29089	29096	50 %	0 %	0 %	50 %	110677447
584	NC_008209	CG	3	6	29139	29144	0 %	0 %	50 %	50 %	110677447
585	NC_008209	CGG	2	6	29251	29256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677447
586	NC_008209	ATG	2	6	29270	29275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677447
587	NC_008209	AAT	2	6	29439	29444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677448
588	NC_008209	CAG	2	6	29503	29508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677448
589	NC_008209	ATA	2	6	29512	29517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110677448
590	NC_008209	GCT	2	6	29520	29525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677448
591	NC_008209	TTC	2	6	29566	29571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677448
592	NC_008209	GC	3	6	29660	29665	0 %	0 %	50 %	50 %	110677448
593	NC_008209	TAG	2	6	29701	29706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008209	CA	3	6	29869	29874	50 %	0 %	0 %	50 %	110677449
595	NC_008209	CCTG	2	8	29898	29905	0 %	25 %	25 %	50 %	110677449
596	NC_008209	AGA	2	6	29941	29946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677449
597	NC_008209	GCC	2	6	29966	29971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677449
598	NC_008209	CGT	2	6	29986	29991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677449
599	NC_008209	CAT	2	6	30133	30138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677449
600	NC_008209	CAT	2	6	30148	30153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677449
601	NC_008209	TCG	2	6	30186	30191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677449
602	NC_008209	GGT	2	6	30214	30219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677449
603	NC_008209	TCA	2	6	30342	30347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677449
604	NC_008209	G	7	7	30379	30385	0 %	0 %	100 %	0 %	110677449
605	NC_008209	GC	3	6	30391	30396	0 %	0 %	50 %	50 %	110677449
606	NC_008209	TGC	2	6	30607	30612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677449
607	NC_008209	TGT	2	6	30636	30641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110677449
608	NC_008209	A	6	6	30686	30691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008209	CCT	2	6	30757	30762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677450
610	NC_008209	G	7	7	30765	30771	0 %	0 %	100 %	0 %	110677450
611	NC_008209	GCA	2	6	30808	30813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677450
612	NC_008209	TGCG	2	8	30838	30845	0 %	25 %	50 %	25 %	110677450
613	NC_008209	CGC	2	6	30937	30942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677450
614	NC_008209	GC	3	6	31034	31039	0 %	0 %	50 %	50 %	110677450
615	NC_008209	GC	3	6	31056	31061	0 %	0 %	50 %	50 %	110677450
616	NC_008209	CAGC	2	8	31112	31119	25 %	0 %	25 %	50 %	110677450
617	NC_008209	ATG	2	6	31141	31146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677450
618	NC_008209	CA	3	6	31179	31184	50 %	0 %	0 %	50 %	110677450
619	NC_008209	GC	4	8	31248	31255	0 %	0 %	50 %	50 %	110677450
620	NC_008209	AG	3	6	31341	31346	50 %	0 %	50 %	0 %	110677451
621	NC_008209	CAT	2	6	31408	31413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677451
622	NC_008209	CGG	2	6	31495	31500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677451
623	NC_008209	TCG	2	6	31507	31512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677451
624	NC_008209	GC	3	6	31526	31531	0 %	0 %	50 %	50 %	110677451
625	NC_008209	CAG	2	6	31577	31582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677451
626	NC_008209	GCG	2	6	31588	31593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677451
627	NC_008209	GGTT	2	8	31620	31627	0 %	50 %	50 %	0 %	110677451
628	NC_008209	CAC	2	6	31646	31651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677451
629	NC_008209	GCC	2	6	31659	31664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677451
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631	NC_008209	GCG	2	6	31718	31723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677451
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