MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 8611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008148	GGGC	2	8	247	254	0 %	0 %	75 %	25 %	108802857
2	NC_008148	CGCT	2	8	329	336	0 %	25 %	25 %	50 %	108802857
3	NC_008148	GCGG	2	8	487	494	0 %	0 %	75 %	25 %	108802857
4	NC_008148	GGAG	2	8	949	956	25 %	0 %	75 %	0 %	108802857
5	NC_008148	CCTC	2	8	981	988	0 %	25 %	0 %	75 %	108802857
6	NC_008148	CGGC	2	8	991	998	0 %	0 %	50 %	50 %	108802857
7	NC_008148	GCTG	2	8	1012	1019	0 %	25 %	50 %	25 %	108802857
8	NC_008148	TCCC	2	8	1205	1212	0 %	25 %	0 %	75 %	108802857
9	NC_008148	CAAC	2	8	1263	1270	50 %	0 %	0 %	50 %	108802857
10	NC_008148	CCCG	2	8	2692	2699	0 %	0 %	25 %	75 %	108802858
11	NC_008148	TCCC	2	8	2965	2972	0 %	25 %	0 %	75 %	108802858
12	NC_008148	CGGC	2	8	2990	2997	0 %	0 %	50 %	50 %	108802859
13	NC_008148	GCGG	2	8	3521	3528	0 %	0 %	75 %	25 %	108802860
14	NC_008148	CGGC	2	8	3615	3622	0 %	0 %	50 %	50 %	108802860
15	NC_008148	GAGC	2	8	4109	4116	25 %	0 %	50 %	25 %	108802860
16	NC_008148	TCCA	2	8	4509	4516	25 %	25 %	0 %	50 %	108802861
17	NC_008148	GCAC	2	8	5326	5333	25 %	0 %	25 %	50 %	108802861
18	NC_008148	GAGC	2	8	5738	5745	25 %	0 %	50 %	25 %	108802861
19	NC_008148	TCCT	2	8	6445	6452	0 %	50 %	0 %	50 %	108802862
20	NC_008148	GCCG	2	8	8910	8917	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
21	NC_008148	ACCG	2	8	9116	9123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008148	CCGC	2	8	9641	9648	0 %	0 %	25 %	75 %	108802863
23	NC_008148	GCGG	2	8	9981	9988	0 %	0 %	75 %	25 %	108802863
24	NC_008148	GACG	2	8	10233	10240	25 %	0 %	50 %	25 %	108802863
25	NC_008148	AGGG	2	8	10246	10253	25 %	0 %	75 %	0 %	108802863
26	NC_008148	GCAG	2	8	10526	10533	25 %	0 %	50 %	25 %	108802863
27	NC_008148	GTTG	2	8	10894	10901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008148	AGCG	2	8	11038	11045	25 %	0 %	50 %	25 %	108802865
29	NC_008148	GGCC	2	8	11604	11611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008148	GATG	2	8	11717	11724	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008148	GGAG	2	8	12332	12339	25 %	0 %	75 %	0 %	108802866
32	NC_008148	CTGG	2	8	12368	12375	0 %	25 %	50 %	25 %	108802866
33	NC_008148	GCGG	2	8	12716	12723	0 %	0 %	75 %	25 %	108802867
34	NC_008148	CACC	2	8	13586	13593	25 %	0 %	0 %	75 %	108802867
35	NC_008148	CTCG	2	8	13823	13830	0 %	25 %	25 %	50 %	108802867
36	NC_008148	GGCC	2	8	13963	13970	0 %	0 %	50 %	50 %	108802867
37	NC_008148	CTCC	2	8	14057	14064	0 %	25 %	0 %	75 %	108802867
38	NC_008148	GCAC	2	8	14919	14926	25 %	0 %	25 %	50 %	108802868
39	NC_008148	GCTG	2	8	15159	15166	0 %	25 %	50 %	25 %	108802868
40	NC_008148	CGGG	2	8	15216	15223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008148	CTGC	2	8	16430	16437	0 %	25 %	25 %	50 %	108802870
42	NC_008148	GGGC	2	8	16472	16479	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008148	GCCG	2	8	16772	16779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008148	CGGC	2	8	17580	17587	0 %	0 %	50 %	50 %	108802872
45	NC_008148	CGGG	2	8	18004	18011	0 %	0 %	75 %	25 %	108802873
46	NC_008148	CCGC	2	8	18516	18523	0 %	0 %	25 %	75 %	108802874
47	NC_008148	GCTC	2	8	19077	19084	0 %	25 %	25 %	50 %	108802875
48	NC_008148	CCCG	2	8	19962	19969	0 %	0 %	25 %	75 %	108802875
49	NC_008148	CGGG	2	8	20077	20084	0 %	0 %	75 %	25 %	108802875
50	NC_008148	CGGA	2	8	20093	20100	25 %	0 %	50 %	25 %	108802875
51	NC_008148	GCCG	2	8	20120	20127	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
52	NC_008148	CGGC	2	8	20128	20135	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
53	NC_008148	CGCT	2	8	20606	20613	0 %	25 %	25 %	50 %	108802875
54	NC_008148	TCCC	2	8	21322	21329	0 %	25 %	0 %	75 %	108802876
55	NC_008148	GCCG	2	8	21587	21594	0 %	0 %	50 %	50 %	108802876
56	NC_008148	CCCT	2	8	21762	21769	0 %	25 %	0 %	75 %	108802877
57	NC_008148	CGGG	2	8	21813	21820	0 %	0 %	75 %	25 %	108802877
58	NC_008148	CCGG	2	8	21824	21831	0 %	0 %	50 %	50 %	108802877
59	NC_008148	TCCC	2	8	22740	22747	0 %	25 %	0 %	75 %	108802877
60	NC_008148	CCCG	2	8	22787	22794	0 %	0 %	25 %	75 %	108802877
61	NC_008148	CCTC	2	8	24115	24122	0 %	25 %	0 %	75 %	108802878
62	NC_008148	GCCG	2	8	25209	25216	0 %	0 %	50 %	50 %	108802879
63	NC_008148	AGGT	2	8	25691	25698	25 %	25 %	50 %	0 %	108802879
64	NC_008148	CGAG	2	8	25836	25843	25 %	0 %	50 %	25 %	108802879
65	NC_008148	CGGG	2	8	26809	26816	0 %	0 %	75 %	25 %	108802880
66	NC_008148	GTCC	2	8	26932	26939	0 %	25 %	25 %	50 %	108802880
67	NC_008148	GTGG	2	8	28681	28688	0 %	25 %	75 %	0 %	108802882
68	NC_008148	GCCC	2	8	28877	28884	0 %	0 %	25 %	75 %	108802882
69	NC_008148	GGAG	2	8	29034	29041	25 %	0 %	75 %	0 %	108802883
70	NC_008148	TCCA	2	8	29207	29214	25 %	25 %	0 %	50 %	108802883
71	NC_008148	GCCC	2	8	29389	29396	0 %	0 %	25 %	75 %	108802883
72	NC_008148	CGCC	2	8	29664	29671	0 %	0 %	25 %	75 %	108802883
73	NC_008148	CTCC	2	8	29749	29756	0 %	25 %	0 %	75 %	108802883
74	NC_008148	CGGA	2	8	29783	29790	25 %	0 %	50 %	25 %	108802883
75	NC_008148	GCGG	2	8	30226	30233	0 %	0 %	75 %	25 %	108802883
76	NC_008148	CGGG	2	8	30445	30452	0 %	0 %	75 %	25 %	108802883
77	NC_008148	GGCG	2	8	31412	31419	0 %	0 %	75 %	25 %	108802884
78	NC_008148	GGGC	2	8	32148	32155	0 %	0 %	75 %	25 %	108802886
79	NC_008148	CTGC	2	8	32221	32228	0 %	25 %	25 %	50 %	108802886
80	NC_008148	CCTC	2	8	33325	33332	0 %	25 %	0 %	75 %	108802887
81	NC_008148	TGGA	2	8	33956	33963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008148	CGGG	2	8	34082	34089	0 %	0 %	75 %	25 %	108802888
83	NC_008148	GCTC	2	8	35083	35090	0 %	25 %	25 %	50 %	108802889
84	NC_008148	CGCC	2	8	35251	35258	0 %	0 %	25 %	75 %	108802889
85	NC_008148	CGGA	2	8	35274	35281	25 %	0 %	50 %	25 %	108802889
86	NC_008148	AGCG	2	8	35593	35600	25 %	0 %	50 %	25 %	108802890
87	NC_008148	CGGC	2	8	35900	35907	0 %	0 %	50 %	50 %	108802890
88	NC_008148	CCGC	2	8	35954	35961	0 %	0 %	25 %	75 %	108802890
89	NC_008148	CGGG	2	8	36046	36053	0 %	0 %	75 %	25 %	108802890
90	NC_008148	CACC	2	8	36297	36304	25 %	0 %	0 %	75 %	108802890
91	NC_008148	GTGG	2	8	36657	36664	0 %	25 %	75 %	0 %	108802890
92	NC_008148	ACCG	2	8	36820	36827	25 %	0 %	25 %	50 %	108802890
93	NC_008148	GGCG	2	8	36860	36867	0 %	0 %	75 %	25 %	108802890
94	NC_008148	GGAG	2	8	37346	37353	25 %	0 %	75 %	0 %	108802891
95	NC_008148	GCCC	2	8	37421	37428	0 %	0 %	25 %	75 %	108802891
96	NC_008148	GGGT	2	8	37912	37919	0 %	25 %	75 %	0 %	108802892
97	NC_008148	GGGA	2	8	38175	38182	25 %	0 %	75 %	0 %	108802892
98	NC_008148	GAGG	2	8	38375	38382	25 %	0 %	75 %	0 %	108802892
99	NC_008148	GGCC	2	8	38672	38679	0 %	0 %	50 %	50 %	108802892
100	NC_008148	CGAG	2	8	38959	38966	25 %	0 %	50 %	25 %	108802892
101	NC_008148	GAGC	2	8	39090	39097	25 %	0 %	50 %	25 %	108802893
102	NC_008148	GGCC	2	8	40032	40039	0 %	0 %	50 %	50 %	108802894
103	NC_008148	CCAC	2	8	40373	40380	25 %	0 %	0 %	75 %	108802894
104	NC_008148	CCCG	2	8	40466	40473	0 %	0 %	25 %	75 %	108802894
105	NC_008148	GTGG	2	8	40986	40993	0 %	25 %	75 %	0 %	108802895
106	NC_008148	TCGC	2	8	41476	41483	0 %	25 %	25 %	50 %	108802895
107	NC_008148	CCAG	2	8	42062	42069	25 %	0 %	25 %	50 %	108802895
108	NC_008148	CGGG	2	8	42070	42077	0 %	0 %	75 %	25 %	108802895
109	NC_008148	CCCG	2	8	42581	42588	0 %	0 %	25 %	75 %	108802896
110	NC_008148	AGCG	2	8	42752	42759	25 %	0 %	50 %	25 %	108802896
111	NC_008148	GTGG	2	8	43064	43071	0 %	25 %	75 %	0 %	108802897
112	NC_008148	CCCG	2	8	43076	43083	0 %	0 %	25 %	75 %	108802897
113	NC_008148	CCCT	2	8	43440	43447	0 %	25 %	0 %	75 %	108802897
114	NC_008148	TGGA	2	8	43521	43528	25 %	25 %	50 %	0 %	108802897
115	NC_008148	CGGC	2	8	44886	44893	0 %	0 %	50 %	50 %	108802899
116	NC_008148	CCCG	2	8	45043	45050	0 %	0 %	25 %	75 %	108802899
117	NC_008148	GCTC	2	8	45163	45170	0 %	25 %	25 %	50 %	108802899
118	NC_008148	GCGG	2	8	45609	45616	0 %	0 %	75 %	25 %	108802900
119	NC_008148	GGCG	2	8	45780	45787	0 %	0 %	75 %	25 %	108802900
120	NC_008148	GCGG	2	8	45899	45906	0 %	0 %	75 %	25 %	108802900
121	NC_008148	GACC	2	8	45978	45985	25 %	0 %	25 %	50 %	108802900
122	NC_008148	GGCC	2	8	46076	46083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008148	AGCC	2	8	46584	46591	25 %	0 %	25 %	50 %	108802902
124	NC_008148	GTCC	2	8	46714	46721	0 %	25 %	25 %	50 %	108802902
125	NC_008148	GGCG	2	8	46809	46816	0 %	0 %	75 %	25 %	108802902
126	NC_008148	GAGG	2	8	46924	46931	25 %	0 %	75 %	0 %	108802902
127	NC_008148	GCCA	2	8	46943	46950	25 %	0 %	25 %	50 %	108802902
128	NC_008148	CGTG	2	8	47883	47890	0 %	25 %	50 %	25 %	108802903
129	NC_008148	AGGG	2	8	48820	48827	25 %	0 %	75 %	0 %	108802904
130	NC_008148	GGTG	2	8	49863	49870	0 %	25 %	75 %	0 %	108802905
131	NC_008148	GCTC	2	8	49884	49891	0 %	25 %	25 %	50 %	108802905
132	NC_008148	TCCT	2	8	50267	50274	0 %	50 %	0 %	50 %	108802905
133	NC_008148	GCTG	2	8	52067	52074	0 %	25 %	50 %	25 %	108802906
134	NC_008148	CGCC	2	8	52389	52396	0 %	0 %	25 %	75 %	108802907
135	NC_008148	GCCG	2	8	52400	52407	0 %	0 %	50 %	50 %	108802907
136	NC_008148	GCTC	2	8	52567	52574	0 %	25 %	25 %	50 %	108802907
137	NC_008148	CGGG	2	8	52709	52716	0 %	0 %	75 %	25 %	108802907
138	NC_008148	CCCT	2	8	52755	52762	0 %	25 %	0 %	75 %	108802907
139	NC_008148	GGCT	2	8	54566	54573	0 %	25 %	50 %	25 %	108802908
140	NC_008148	CGGG	2	8	55094	55101	0 %	0 %	75 %	25 %	108802909
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142	NC_008148	GTAG	2	8	55694	55701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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