MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_008148	CGG	2	6	129689	129694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
4003	NC_008148	ACG	2	6	129700	129705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802979
4004	NC_008148	CGT	2	6	129707	129712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802979
4005	NC_008148	GC	3	6	129717	129722	0 %	0 %	50 %	50 %	108802979
4006	NC_008148	GGC	2	6	129723	129728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
4007	NC_008148	GC	3	6	129727	129732	0 %	0 %	50 %	50 %	108802979
4008	NC_008148	CGAGCG	2	12	129734	129745	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108802979
4009	NC_008148	CGA	2	6	129755	129760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802979
4010	NC_008148	GCC	3	9	129771	129779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802979
4011	NC_008148	CCG	2	6	129797	129802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802979
4012	NC_008148	GC	3	6	129805	129810	0 %	0 %	50 %	50 %	108802979
4013	NC_008148	TCC	2	6	129829	129834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802979
4014	NC_008148	GCC	2	6	129858	129863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802979
4015	NC_008148	CGC	2	6	129870	129875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802979
4016	NC_008148	GC	3	6	129896	129901	0 %	0 %	50 %	50 %	108802979
4017	NC_008148	GGC	2	6	129940	129945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
4018	NC_008148	GCG	3	9	129961	129969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
4019	NC_008148	AGG	2	6	129970	129975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802979
4020	NC_008148	GCG	2	6	129982	129987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
4021	NC_008148	GCCCC	2	10	129989	129998	0 %	0 %	20 %	80 %	108802979
4022	NC_008148	GCC	2	6	130023	130028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802979
4023	NC_008148	CGCGCC	2	12	130029	130040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802979
4024	NC_008148	CAG	2	6	130083	130088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802979
4025	NC_008148	GGCGAG	2	12	130095	130106	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	108802979
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4028	NC_008148	GGC	3	9	130140	130148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
4029	NC_008148	GGC	2	6	130183	130188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
4030	NC_008148	GGCGAG	2	12	130194	130205	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	108802979
4031	NC_008148	CGGG	2	8	130236	130243	0 %	0 %	75 %	25 %	108802979
4032	NC_008148	CGCCC	2	10	130246	130255	0 %	0 %	20 %	80 %	108802979
4033	NC_008148	GC	3	6	130319	130324	0 %	0 %	50 %	50 %	108802979
4034	NC_008148	GCG	2	6	130342	130347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
4035	NC_008148	GGC	2	6	130359	130364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
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4040	NC_008148	AGC	2	6	130474	130479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802979
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4043	NC_008148	CGG	2	6	130517	130522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
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4051	NC_008148	G	6	6	130643	130648	0 %	0 %	100 %	0 %	108802979
4052	NC_008148	GAG	2	6	130677	130682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802979
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4054	NC_008148	CGC	2	6	130701	130706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802979
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4056	NC_008148	CGA	2	6	130757	130762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802979
4057	NC_008148	CGC	2	6	130773	130778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802979
4058	NC_008148	CGG	2	6	130793	130798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
4059	NC_008148	AGG	2	6	130867	130872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802979
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4061	NC_008148	GGC	2	6	130899	130904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802979
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4088	NC_008148	CT	3	6	131606	131611	0 %	50 %	0 %	50 %	108802981
4089	NC_008148	GGC	2	6	131626	131631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802981
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4104	NC_008148	GCC	2	6	131975	131980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802981
4105	NC_008148	AGC	2	6	131990	131995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802981
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4108	NC_008148	CCG	2	6	132051	132056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802981
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4110	NC_008148	CACT	2	8	132090	132097	25 %	25 %	0 %	50 %	108802981
4111	NC_008148	CCA	2	6	132101	132106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802982
4112	NC_008148	GCA	2	6	132107	132112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802982
4113	NC_008148	CCCA	2	8	132118	132125	25 %	0 %	0 %	75 %	108802982
4114	NC_008148	CCA	3	9	132162	132170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802982
4115	NC_008148	AGC	2	6	132217	132222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802982
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4117	NC_008148	GGC	2	6	132268	132273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802982
4118	NC_008148	AGA	2	6	132302	132307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802982
4119	NC_008148	CCG	3	9	132314	132322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802982
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4121	NC_008148	CCCG	2	8	132396	132403	0 %	0 %	25 %	75 %	108802982
4122	NC_008148	GGC	2	6	132436	132441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802982
4123	NC_008148	CGC	2	6	132459	132464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802982
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4125	NC_008148	GGC	2	6	132513	132518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802982
4126	NC_008148	GC	3	6	132556	132561	0 %	0 %	50 %	50 %	108802982
4127	NC_008148	ATGGCG	2	12	132562	132573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108802982
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4130	NC_008148	GAG	2	6	132675	132680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802982
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4231	NC_008148	CT	3	6	135505	135510	0 %	50 %	0 %	50 %	108802986
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4241	NC_008148	CGA	2	6	135799	135804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802987
4242	NC_008148	CTGC	2	8	135865	135872	0 %	25 %	25 %	50 %	108802987
4243	NC_008148	CGT	2	6	135886	135891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802987
4244	NC_008148	CCA	2	6	135904	135909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802987
4245	NC_008148	CTC	2	6	135926	135931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4246	NC_008148	CCG	2	6	136018	136023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802987
4247	NC_008148	TCA	3	9	136042	136050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802987
4248	NC_008148	AGC	2	6	136074	136079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802987
4249	NC_008148	CCT	2	6	136096	136101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4250	NC_008148	CGGC	2	8	136132	136139	0 %	0 %	50 %	50 %	108802987
4251	NC_008148	GC	3	6	136194	136199	0 %	0 %	50 %	50 %	108802987
4252	NC_008148	TCC	2	6	136212	136217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4253	NC_008148	CGA	2	6	136252	136257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802987
4254	NC_008148	GAGGG	2	10	136323	136332	20 %	0 %	80 %	0 %	108802987
4255	NC_008148	CCA	2	6	136357	136362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802987
4256	NC_008148	CGG	2	6	136396	136401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802987
4257	NC_008148	CTC	2	6	136421	136426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
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4260	NC_008148	CCT	2	6	136525	136530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
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4262	NC_008148	GAT	2	6	136634	136639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802987
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4265	NC_008148	ACG	2	6	136734	136739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802987
4266	NC_008148	CGC	2	6	136750	136755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802987
4267	NC_008148	CCT	2	6	136801	136806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
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4270	NC_008148	CAC	2	6	136982	136987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802987
4271	NC_008148	ACC	2	6	137019	137024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802987
4272	NC_008148	CCT	2	6	137044	137049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4273	NC_008148	TCC	2	6	137067	137072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4274	NC_008148	CCG	2	6	137073	137078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802987
4275	NC_008148	CAC	2	6	137081	137086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802987
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4278	NC_008148	CTCG	2	8	137129	137136	0 %	25 %	25 %	50 %	108802987
4279	NC_008148	TCC	2	6	137137	137142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
4280	NC_008148	CCCGCG	2	12	137143	137154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802987
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4287	NC_008148	C	6	6	137341	137346	0 %	0 %	0 %	100 %	108802987
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4292	NC_008148	TCC	2	6	137547	137552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802987
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4297	NC_008148	CCT	2	6	137776	137781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4298	NC_008148	C	6	6	137813	137818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4299	NC_008148	GGA	2	6	137837	137842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4300	NC_008148	CCGG	2	8	137851	137858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4301	NC_008148	CTT	2	6	137867	137872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4302	NC_008148	GGA	2	6	137881	137886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4303	NC_008148	GGCG	2	8	137921	137928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4304	NC_008148	GAC	2	6	138014	138019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4312	NC_008148	CCT	2	6	138335	138340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802988
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4323	NC_008148	ACG	2	6	138775	138780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802988
4324	NC_008148	CCG	2	6	138878	138883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802988
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4328	NC_008148	CCCG	2	8	139096	139103	0 %	0 %	25 %	75 %	108802989
4329	NC_008148	CAC	2	6	139110	139115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802989
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4332	NC_008148	CAG	2	6	139221	139226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802989
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4342	NC_008148	CAG	2	6	139581	139586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802989
4343	NC_008148	CCT	2	6	139595	139600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802989
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4349	NC_008148	TGC	2	6	139808	139813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802989
4350	NC_008148	CTC	2	6	139834	139839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4351	NC_008148	TCAG	2	8	139848	139855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4352	NC_008148	GCC	2	6	139900	139905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4353	NC_008148	GCC	2	6	139927	139932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802990
4354	NC_008148	CTT	2	6	139949	139954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802990
4355	NC_008148	TCTCG	2	10	139958	139967	0 %	40 %	20 %	40 %	108802990
4356	NC_008148	GGC	2	6	139974	139979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802990
4357	NC_008148	CGG	2	6	140034	140039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802990
4358	NC_008148	GCG	2	6	140056	140061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802990
4359	NC_008148	GTC	2	6	140082	140087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802990
4360	NC_008148	CGGC	2	8	140129	140136	0 %	0 %	50 %	50 %	108802990
4361	NC_008148	GCCG	2	8	140147	140154	0 %	0 %	50 %	50 %	108802990
4362	NC_008148	GC	3	6	140166	140171	0 %	0 %	50 %	50 %	108802990
4363	NC_008148	CGA	2	6	140177	140182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802990
4364	NC_008148	CCT	2	6	140186	140191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802990
4365	NC_008148	G	6	6	140284	140289	0 %	0 %	100 %	0 %	108802990
4366	NC_008148	GCG	3	9	140311	140319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802990
4367	NC_008148	AGCCG	2	10	140354	140363	20 %	0 %	40 %	40 %	108802990
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4489	NC_008148	TCC	2	6	144487	144492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802993
4490	NC_008148	CCG	2	6	144499	144504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802993
4491	NC_008148	CGG	2	6	144532	144537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802993
4492	NC_008148	TGA	2	6	144538	144543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802993
4493	NC_008148	CAG	2	6	144551	144556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802993
4494	NC_008148	TGC	2	6	144625	144630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802993
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4496	NC_008148	GCACGG	2	12	144710	144721	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108802993
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4499	NC_008148	GGC	2	6	144821	144826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802993
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