MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008148	GGC	2	6	49035	49040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802904
1502	NC_008148	GCC	2	6	49061	49066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802904
1503	NC_008148	TCT	2	6	49112	49117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802904
1504	NC_008148	CCG	2	6	49145	49150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802904
1505	NC_008148	CCTCCA	2	12	49178	49189	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	108802904
1506	NC_008148	GAA	2	6	49191	49196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802904
1507	NC_008148	GAG	2	6	49225	49230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802904
1508	NC_008148	TCG	2	6	49232	49237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802904
1509	NC_008148	CCA	2	6	49280	49285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802904
1510	NC_008148	GAG	2	6	49315	49320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802904
1511	NC_008148	AGG	2	6	49328	49333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802904
1512	NC_008148	ACG	2	6	49376	49381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802904
1513	NC_008148	GAG	3	9	49399	49407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802904
1514	NC_008148	TC	3	6	49508	49513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_008148	AGA	2	6	49536	49541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802905
1516	NC_008148	ACC	2	6	49553	49558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802905
1517	NC_008148	GCA	2	6	49573	49578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802905
1518	NC_008148	CG	3	6	49598	49603	0 %	0 %	50 %	50 %	108802905
1519	NC_008148	CAC	2	6	49606	49611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802905
1520	NC_008148	CCACC	2	10	49624	49633	20 %	0 %	0 %	80 %	108802905
1521	NC_008148	TCC	2	6	49634	49639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802905
1522	NC_008148	CGG	2	6	49647	49652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802905
1523	NC_008148	GC	3	6	49673	49678	0 %	0 %	50 %	50 %	108802905
1524	NC_008148	CGA	2	6	49696	49701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802905
1525	NC_008148	TCT	2	6	49731	49736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802905
1526	NC_008148	CGC	2	6	49752	49757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802905
1527	NC_008148	GGC	2	6	49777	49782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802905
1528	NC_008148	GAG	2	6	49799	49804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802905
1529	NC_008148	GGTG	2	8	49863	49870	0 %	25 %	75 %	0 %	108802905
1530	NC_008148	GCTC	2	8	49884	49891	0 %	25 %	25 %	50 %	108802905
1531	NC_008148	GCTCGC	2	12	49918	49929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108802905
1532	NC_008148	CGC	2	6	50023	50028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802905
1533	NC_008148	TCG	2	6	50049	50054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802905
1534	NC_008148	CGGGCC	2	12	50129	50140	0 %	0 %	50 %	50 %	108802905
1535	NC_008148	ACG	2	6	50172	50177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802905
1536	NC_008148	GGA	2	6	50179	50184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802905
1537	NC_008148	TCCT	2	8	50267	50274	0 %	50 %	0 %	50 %	108802905
1538	NC_008148	GCC	2	6	50308	50313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802905
1539	NC_008148	CGG	2	6	50344	50349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802905
1540	NC_008148	GCA	2	6	50355	50360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802905
1541	NC_008148	C	6	6	50399	50404	0 %	0 %	0 %	100 %	108802905
1542	NC_008148	GCC	2	6	50507	50512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802905
1543	NC_008148	GTG	2	6	50522	50527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802905
1544	NC_008148	AGC	2	6	50616	50621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802905
1545	NC_008148	CCG	2	6	50634	50639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802905
1546	NC_008148	CGC	2	6	50683	50688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802905
1547	NC_008148	GCC	2	6	50723	50728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802905
1548	NC_008148	GAT	2	6	50821	50826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802905
1549	NC_008148	ACC	2	6	50930	50935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802905
1550	NC_008148	CGA	2	6	50965	50970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802905
1551	NC_008148	GCA	2	6	50988	50993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802905
1552	NC_008148	GGT	2	6	50995	51000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802905
1553	NC_008148	CTC	2	6	51004	51009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802905
1554	NC_008148	GGA	3	9	51010	51018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802905
1555	NC_008148	CGC	2	6	51034	51039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802905
1556	NC_008148	CCA	2	6	51052	51057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802905
1557	NC_008148	GCC	2	6	51068	51073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802905
1558	NC_008148	GAG	2	6	51074	51079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802905
1559	NC_008148	GTG	2	6	51182	51187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802905
1560	NC_008148	G	7	7	51211	51217	0 %	0 %	100 %	0 %	108802905
1561	NC_008148	CTCCGG	2	12	51269	51280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108802905
1562	NC_008148	CGG	2	6	51336	51341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802905
1563	NC_008148	CTG	2	6	51380	51385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802905
1564	NC_008148	GGA	2	6	51443	51448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802906
1565	NC_008148	CTC	2	6	51472	51477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802906
1566	NC_008148	GTC	2	6	51496	51501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802906
1567	NC_008148	GGC	2	6	51534	51539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802906
1568	NC_008148	AGG	2	6	51542	51547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802906
1569	NC_008148	TGG	2	6	51578	51583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802906
1570	NC_008148	CCG	2	6	51623	51628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802906
1571	NC_008148	AGG	2	6	51674	51679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802906
1572	NC_008148	CGG	2	6	51696	51701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802906
1573	NC_008148	CGG	2	6	51783	51788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802906
1574	NC_008148	CGG	2	6	51825	51830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802906
1575	NC_008148	CGCCC	2	10	51876	51885	0 %	0 %	20 %	80 %	108802906
1576	NC_008148	GGCCGG	2	12	51909	51920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802906
1577	NC_008148	TGC	2	6	51962	51967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802906
1578	NC_008148	AAG	2	6	51997	52002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802906
1579	NC_008148	GTG	2	6	52057	52062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802906
1580	NC_008148	GCTG	2	8	52067	52074	0 %	25 %	50 %	25 %	108802906
1581	NC_008148	GAG	2	6	52180	52185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802906
1582	NC_008148	AGG	2	6	52241	52246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802906
1583	NC_008148	G	6	6	52291	52296	0 %	0 %	100 %	0 %	108802906
1584	NC_008148	AGG	2	6	52307	52312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802906
1585	NC_008148	CCGGG	2	10	52313	52322	0 %	0 %	60 %	40 %	108802906
1586	NC_008148	CGG	2	6	52323	52328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802906
1587	NC_008148	GCG	2	6	52336	52341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1588	NC_008148	CGA	2	6	52370	52375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1589	NC_008148	GCG	2	6	52376	52381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1590	NC_008148	CGCC	2	8	52389	52396	0 %	0 %	25 %	75 %	108802907
1591	NC_008148	GCCG	2	8	52400	52407	0 %	0 %	50 %	50 %	108802907
1592	NC_008148	GGC	3	9	52475	52483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1593	NC_008148	GGT	2	6	52508	52513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802907
1594	NC_008148	GCTC	2	8	52567	52574	0 %	25 %	25 %	50 %	108802907
1595	NC_008148	CG	3	6	52584	52589	0 %	0 %	50 %	50 %	108802907
1596	NC_008148	G	6	6	52589	52594	0 %	0 %	100 %	0 %	108802907
1597	NC_008148	GAG	2	6	52602	52607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1598	NC_008148	GCA	2	6	52627	52632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1599	NC_008148	TCT	2	6	52633	52638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802907
1600	NC_008148	CGG	2	6	52656	52661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1601	NC_008148	CTC	2	6	52689	52694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802907
1602	NC_008148	CGGG	2	8	52709	52716	0 %	0 %	75 %	25 %	108802907
1603	NC_008148	CGG	2	6	52721	52726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1604	NC_008148	TCT	2	6	52735	52740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802907
1605	NC_008148	CCT	2	6	52747	52752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802907
1606	NC_008148	CCCT	2	8	52755	52762	0 %	25 %	0 %	75 %	108802907
1607	NC_008148	CGG	2	6	52875	52880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802907
1608	NC_008148	CTG	2	6	52893	52898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1609	NC_008148	GGA	2	6	52910	52915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1610	NC_008148	G	6	6	53071	53076	0 %	0 %	100 %	0 %	108802907
1611	NC_008148	GAG	2	6	53085	53090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1612	NC_008148	ATG	2	6	53124	53129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802907
1613	NC_008148	GCT	2	6	53132	53137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1614	NC_008148	GCC	2	6	53156	53161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802907
1615	NC_008148	CGA	2	6	53189	53194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802907
1616	NC_008148	GAAGGT	2	12	53195	53206	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	108802907
1617	NC_008148	GGA	2	6	53231	53236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1618	NC_008148	GGA	2	6	53243	53248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1619	NC_008148	GAG	2	6	53292	53297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1620	NC_008148	GAG	3	9	53313	53321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1621	NC_008148	AAG	2	6	53433	53438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802907
1622	NC_008148	CGC	2	6	53492	53497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802907
1623	NC_008148	GAG	2	6	53538	53543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
1624	NC_008148	TACGG	2	10	53619	53628	20 %	20 %	40 %	20 %	108802907
1625	NC_008148	GGA	2	6	53636	53641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802907
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1983	NC_008148	CGC	3	9	65289	65297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802918
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1988	NC_008148	GA	3	6	65379	65384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1989	NC_008148	CTC	2	6	65388	65393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1990	NC_008148	GCCC	2	8	65409	65416	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1991	NC_008148	GAG	2	6	65475	65480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1992	NC_008148	CGG	2	6	65517	65522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802919
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1998	NC_008148	GGGAG	2	10	65769	65778	20 %	0 %	80 %	0 %	108802919
1999	NC_008148	GCG	2	6	65781	65786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802919
2000	NC_008148	CGC	2	6	65808	65813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802919

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