MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008148	GGT	2	6	17158	17163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802872
502	NC_008148	GCC	2	6	17168	17173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802872
503	NC_008148	TCC	2	6	17216	17221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802872
504	NC_008148	G	6	6	17222	17227	0 %	0 %	100 %	0 %	108802872
505	NC_008148	GCG	2	6	17257	17262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802872
506	NC_008148	GCG	2	6	17272	17277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802872
507	NC_008148	TGG	2	6	17280	17285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802872
508	NC_008148	GGA	2	6	17307	17312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802872
509	NC_008148	CAA	2	6	17326	17331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802872
510	NC_008148	AGG	2	6	17430	17435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802872
511	NC_008148	ATC	2	6	17465	17470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802872
512	NC_008148	CGA	2	6	17526	17531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802872
513	NC_008148	CGGC	2	8	17580	17587	0 %	0 %	50 %	50 %	108802872
514	NC_008148	GGC	2	6	17673	17678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802872
515	NC_008148	C	6	6	17689	17694	0 %	0 %	0 %	100 %	108802872
516	NC_008148	GCC	2	6	17723	17728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802872
517	NC_008148	CG	3	6	17739	17744	0 %	0 %	50 %	50 %	108802872
518	NC_008148	GCC	2	6	17780	17785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802872
519	NC_008148	GCG	2	6	17804	17809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802872
520	NC_008148	GAG	2	6	17860	17865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802873
521	NC_008148	GCG	2	6	17866	17871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802873
522	NC_008148	GCG	2	6	17883	17888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802873
523	NC_008148	GAG	2	6	17896	17901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802873
524	NC_008148	GGA	2	6	17934	17939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802873
525	NC_008148	CG	3	6	17997	18002	0 %	0 %	50 %	50 %	108802873
526	NC_008148	CGGG	2	8	18004	18011	0 %	0 %	75 %	25 %	108802873
527	NC_008148	CGG	2	6	18023	18028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802873
528	NC_008148	GGA	2	6	18036	18041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802873
529	NC_008148	GAG	2	6	18070	18075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802873
530	NC_008148	CGG	2	6	18080	18085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802873
531	NC_008148	TGC	2	6	18095	18100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802873
532	NC_008148	GCC	2	6	18106	18111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802873
533	NC_008148	CGA	2	6	18120	18125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802873
534	NC_008148	GAG	2	6	18139	18144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802873
535	NC_008148	CGG	3	9	18203	18211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802873
536	NC_008148	GAG	2	6	18214	18219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802873
537	NC_008148	GGA	2	6	18309	18314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802873
538	NC_008148	G	7	7	18345	18351	0 %	0 %	100 %	0 %	108802873
539	NC_008148	CGC	2	6	18363	18368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802873
540	NC_008148	GAG	2	6	18387	18392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802873
541	NC_008148	CCGC	2	8	18516	18523	0 %	0 %	25 %	75 %	108802874
542	NC_008148	AGG	2	6	18531	18536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802874
543	NC_008148	GCC	3	9	18561	18569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802874
544	NC_008148	CCG	2	6	18697	18702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802874
545	NC_008148	CCCCGG	2	12	18718	18729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802874
546	NC_008148	CGG	2	6	18737	18742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802874
547	NC_008148	CGG	2	6	18787	18792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802874
548	NC_008148	CCG	2	6	18834	18839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
549	NC_008148	GCG	2	6	18889	18894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
550	NC_008148	GAT	2	6	18913	18918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802875
551	NC_008148	GCG	2	6	18924	18929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
552	NC_008148	CAG	2	6	18949	18954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
553	NC_008148	CTC	2	6	18955	18960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
554	NC_008148	GCG	2	6	18974	18979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
555	NC_008148	GCT	2	6	19003	19008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
556	NC_008148	AGG	3	9	19038	19046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802875
557	NC_008148	GGA	2	6	19059	19064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802875
558	NC_008148	GCTC	2	8	19077	19084	0 %	25 %	25 %	50 %	108802875
559	NC_008148	CGG	3	9	19094	19102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
560	NC_008148	CGCCC	2	10	19114	19123	0 %	0 %	20 %	80 %	108802875
561	NC_008148	GAT	2	6	19144	19149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802875
562	NC_008148	GTC	2	6	19186	19191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
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564	NC_008148	TGC	2	6	19244	19249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
565	NC_008148	GCT	2	6	19272	19277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802875
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583	NC_008148	GGT	2	6	19854	19859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802875
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591	NC_008148	CGGA	2	8	20093	20100	25 %	0 %	50 %	25 %	108802875
592	NC_008148	GCCG	2	8	20120	20127	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
593	NC_008148	CGGC	2	8	20128	20135	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
594	NC_008148	G	6	6	20142	20147	0 %	0 %	100 %	0 %	108802875
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597	NC_008148	GC	3	6	20176	20181	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
598	NC_008148	GCC	2	6	20196	20201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
599	NC_008148	CAG	2	6	20257	20262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
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608	NC_008148	CG	4	8	20557	20564	0 %	0 %	50 %	50 %	108802875
609	NC_008148	CTC	2	6	20569	20574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
610	NC_008148	TCC	2	6	20600	20605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
611	NC_008148	CGCT	2	8	20606	20613	0 %	25 %	25 %	50 %	108802875
612	NC_008148	CAG	2	6	20617	20622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
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619	NC_008148	CTC	2	6	20758	20763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
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622	NC_008148	CT	3	6	20786	20791	0 %	50 %	0 %	50 %	108802875
623	NC_008148	GCC	2	6	20840	20845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
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628	NC_008148	CCA	2	6	20943	20948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802875
629	NC_008148	CGC	2	6	20971	20976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
630	NC_008148	GCA	2	6	21009	21014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
631	NC_008148	CGG	2	6	21032	21037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802875
632	NC_008148	AGC	2	6	21068	21073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802875
633	NC_008148	CCT	2	6	21075	21080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802875
634	NC_008148	GCC	3	9	21141	21149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802875
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638	NC_008148	CCT	2	6	21252	21257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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749	NC_008148	G	7	7	24542	24548	0 %	0 %	100 %	0 %	108802878
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751	NC_008148	TGT	2	6	24622	24627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108802878
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878	NC_008148	GA	3	6	28944	28949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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