MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008148	ACG	2	6	144852	144857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802993
4502	NC_008148	TCC	2	6	144938	144943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_008148	TGT	2	6	145074	145079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_008148	GA	3	6	145158	145163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_008148	GTT	2	6	145168	145173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_008148	GCG	2	6	145179	145184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802994
4507	NC_008148	CGG	2	6	145198	145203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802994
4508	NC_008148	GGC	2	6	145218	145223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802994
4509	NC_008148	CGC	2	6	145259	145264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802994
4510	NC_008148	GAG	2	6	145279	145284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802994
4511	NC_008148	CAC	2	6	145312	145317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802994
4512	NC_008148	GAC	2	6	145330	145335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802994
4513	NC_008148	GCT	2	6	145380	145385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802994
4514	NC_008148	GGAGG	2	10	145386	145395	20 %	0 %	80 %	0 %	108802994
4515	NC_008148	GAG	2	6	145405	145410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802994
4516	NC_008148	CCG	2	6	145446	145451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802994
4517	NC_008148	TGC	2	6	145460	145465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802994
4518	NC_008148	CTGCGG	2	12	145528	145539	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108802994
4519	NC_008148	GGA	3	9	145569	145577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802994
4520	NC_008148	GGT	2	6	145617	145622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802994
4521	NC_008148	CTT	2	6	145623	145628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802994
4522	NC_008148	AGG	2	6	145654	145659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802994
4523	NC_008148	CG	3	6	145674	145679	0 %	0 %	50 %	50 %	108802994
4524	NC_008148	GCCG	2	8	145693	145700	0 %	0 %	50 %	50 %	108802994
4525	NC_008148	CCT	2	6	145721	145726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_008148	CGC	2	6	145740	145745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_008148	CGG	2	6	145813	145818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_008148	CGC	2	6	145858	145863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_008148	CAGC	2	8	145864	145871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_008148	GCGG	2	8	145926	145933	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_008148	CGC	2	6	145947	145952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_008148	CCGGG	2	10	145980	145989	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4533	NC_008148	AGC	2	6	145997	146002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_008148	AT	3	6	146021	146026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_008148	GA	3	6	146040	146045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_008148	AGG	2	6	146046	146051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_008148	GAG	2	6	146097	146102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802995
4538	NC_008148	GC	3	6	146118	146123	0 %	0 %	50 %	50 %	108802995
4539	NC_008148	TCG	3	9	146131	146139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802995
4540	NC_008148	AGG	2	6	146164	146169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802995
4541	NC_008148	GCTC	2	8	146173	146180	0 %	25 %	25 %	50 %	108802995
4542	NC_008148	AGG	2	6	146217	146222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802995
4543	NC_008148	CTC	2	6	146223	146228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802995
4544	NC_008148	GTC	2	6	146256	146261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802995
4545	NC_008148	ACG	2	6	146401	146406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802995
4546	NC_008148	GCAC	2	8	146416	146423	25 %	0 %	25 %	50 %	108802995
4547	NC_008148	TCC	2	6	146434	146439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802995
4548	NC_008148	G	6	6	146446	146451	0 %	0 %	100 %	0 %	108802995
4549	NC_008148	GCG	2	6	146514	146519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802995
4550	NC_008148	GGT	2	6	146534	146539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802995
4551	NC_008148	GGA	2	6	146620	146625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802995
4552	NC_008148	GGA	2	6	146678	146683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802995
4553	NC_008148	GCC	2	6	146685	146690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802995
4554	NC_008148	GAG	2	6	146738	146743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_008148	GATC	2	8	146755	146762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_008148	GA	3	6	146764	146769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_008148	AG	3	6	146778	146783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_008148	GGGAA	2	10	146815	146824	40 %	0 %	60 %	0 %	108802996
4559	NC_008148	GCG	2	6	146860	146865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802996
4560	NC_008148	GAG	2	6	146931	146936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802996
4561	NC_008148	CGG	2	6	146944	146949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802996
4562	NC_008148	G	6	6	146996	147001	0 %	0 %	100 %	0 %	108802996
4563	NC_008148	C	6	6	147005	147010	0 %	0 %	0 %	100 %	108802996
4564	NC_008148	CCACCT	2	12	147031	147042	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	108802996
4565	NC_008148	GAG	2	6	147045	147050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802996
4566	NC_008148	CGA	2	6	147113	147118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802996
4567	NC_008148	CCCG	2	8	147247	147254	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4568	NC_008148	GGT	2	6	147292	147297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802997
4569	NC_008148	CTC	2	6	147304	147309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802997
4570	NC_008148	CTC	3	9	147331	147339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802997
4571	NC_008148	TCG	2	6	147377	147382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802997
4572	NC_008148	GGC	2	6	147454	147459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802997
4573	NC_008148	GAT	2	6	147478	147483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802997
4574	NC_008148	CCG	2	6	147582	147587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802997
4575	NC_008148	AGA	2	6	147603	147608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802997
4576	NC_008148	GGC	2	6	147640	147645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802997
4577	NC_008148	GACGGC	2	12	147724	147735	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108802997
4578	NC_008148	CG	3	6	147748	147753	0 %	0 %	50 %	50 %	108802997
4579	NC_008148	CTGCTC	2	12	147757	147768	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	108802997
4580	NC_008148	CTCGC	2	10	147770	147779	0 %	20 %	20 %	60 %	108802997
4581	NC_008148	CCA	2	6	147846	147851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802997
4582	NC_008148	TGG	2	6	147861	147866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802997
4583	NC_008148	CCG	2	6	147876	147881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802997
4584	NC_008148	GCC	2	6	147904	147909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802997
4585	NC_008148	CGG	2	6	147945	147950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802997
4586	NC_008148	CAG	2	6	147982	147987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802997
4587	NC_008148	TCA	2	6	148014	148019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802997
4588	NC_008148	AGA	2	6	148023	148028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802997
4589	NC_008148	CGA	2	6	148047	148052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802997
4590	NC_008148	CGG	2	6	148119	148124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802997
4591	NC_008148	GAC	2	6	148153	148158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802997
4592	NC_008148	GCG	2	6	148188	148193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802997
4593	NC_008148	GGA	2	6	148194	148199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802997
4594	NC_008148	CAG	2	6	148303	148308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802997
4595	NC_008148	GGT	2	6	148333	148338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802997
4596	NC_008148	CCA	2	6	148341	148346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802997
4597	NC_008148	TCA	2	6	148371	148376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802997
4598	NC_008148	GAT	2	6	148384	148389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802997
4599	NC_008148	CCA	2	6	148446	148451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802997
4600	NC_008148	TGG	2	6	148485	148490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802997
4601	NC_008148	GCC	3	9	148496	148504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802997
4602	NC_008148	CGA	2	6	148584	148589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802997
4603	NC_008148	GCA	3	9	148590	148598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802997
4604	NC_008148	CCA	2	6	148599	148604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802997
4605	NC_008148	GCC	2	6	148688	148693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802997
4606	NC_008148	CGC	2	6	148743	148748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802997
4607	NC_008148	GTG	2	6	148759	148764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802997
4608	NC_008148	TTG	2	6	148775	148780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108802997
4609	NC_008148	CGG	2	6	148781	148786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802997
4610	NC_008148	ATG	2	6	148820	148825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802997
4611	NC_008148	GAA	2	6	148831	148836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802997
4612	NC_008148	CGG	2	6	148883	148888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802998
4613	NC_008148	GGC	2	6	148892	148897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802998
4614	NC_008148	GTG	2	6	149035	149040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802998
4615	NC_008148	AGA	2	6	149069	149074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802998
4616	NC_008148	GAA	2	6	149079	149084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802998
4617	NC_008148	T	6	6	149109	149114	0 %	100 %	0 %	0 %	108802998
4618	NC_008148	AAG	2	6	149179	149184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802998
4619	NC_008148	CTT	2	6	149202	149207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_008148	TCT	2	6	149208	149213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_008148	CCTC	2	8	149214	149221	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4622	NC_008148	TC	3	6	149220	149225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_008148	TCG	2	6	149229	149234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_008148	AGA	3	9	149253	149261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4753	NC_008148	TCCA	2	8	154697	154704	25 %	25 %	0 %	50 %	108803002
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4856	NC_008148	GGC	2	6	157975	157980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803004
4857	NC_008148	CTG	2	6	157987	157992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4858	NC_008148	AGCGGC	2	12	158003	158014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803004
4859	NC_008148	GC	3	6	158072	158077	0 %	0 %	50 %	50 %	108803004
4860	NC_008148	CTC	2	6	158086	158091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803004
4861	NC_008148	GGCG	2	8	158092	158099	0 %	0 %	75 %	25 %	108803004
4862	NC_008148	GCT	2	6	158112	158117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803004
4863	NC_008148	C	7	7	158166	158172	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4864	NC_008148	ATGC	2	8	158209	158216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4865	NC_008148	GC	3	6	158227	158232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4866	NC_008148	TCT	2	6	158239	158244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803005
4867	NC_008148	GCG	2	6	158256	158261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
4868	NC_008148	GGC	2	6	158271	158276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
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4870	NC_008148	GCG	2	6	158370	158375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803005
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4894	NC_008148	CGG	2	6	159142	159147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4993	NC_008148	G	6	6	162168	162173	0 %	0 %	100 %	0 %	108803009
4994	NC_008148	CCG	2	6	162184	162189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803009
4995	NC_008148	GTG	2	6	162201	162206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803009
4996	NC_008148	ACG	2	6	162253	162258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803009
4997	NC_008148	CATCTC	2	12	162260	162271	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	108803009
4998	NC_008148	G	6	6	162280	162285	0 %	0 %	100 %	0 %	108803009
4999	NC_008148	CCA	2	6	162446	162451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803009
5000	NC_008148	C	6	6	162467	162472	0 %	0 %	0 %	100 %	108803009

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