MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_008044	GCT	2	6	2109108	2109113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081843
43002	NC_008044	ATC	2	6	2109172	2109177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081843
43003	NC_008044	CGC	2	6	2109178	2109183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081843
43004	NC_008044	CACCG	2	10	2109210	2109219	20 %	0 %	20 %	60 %	99081843
43005	NC_008044	GAT	2	6	2109241	2109246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081843
43006	NC_008044	GAA	2	6	2109253	2109258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081843
43007	NC_008044	CT	3	6	2109327	2109332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43008	NC_008044	CATC	2	8	2109347	2109354	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43009	NC_008044	CG	3	6	2109410	2109415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43010	NC_008044	TGT	2	6	2109473	2109478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43011	NC_008044	GC	4	8	2109504	2109511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43012	NC_008044	ATG	2	6	2109514	2109519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43013	NC_008044	ACA	2	6	2109527	2109532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43014	NC_008044	GCC	3	9	2109587	2109595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081844
43015	NC_008044	CGC	2	6	2109643	2109648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081844
43016	NC_008044	ACC	2	6	2109678	2109683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081844
43017	NC_008044	AAG	2	6	2109783	2109788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081844
43018	NC_008044	TGC	2	6	2109825	2109830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081844
43019	NC_008044	GCT	2	6	2109837	2109842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081844
43020	NC_008044	GCG	2	6	2109854	2109859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081844
43021	NC_008044	ATCC	2	8	2109896	2109903	25 %	25 %	0 %	50 %	99081844
43022	NC_008044	TCGGA	2	10	2109938	2109947	20 %	20 %	40 %	20 %	99081844
43023	NC_008044	GCC	2	6	2109986	2109991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081844
43024	NC_008044	GC	3	6	2110077	2110082	0 %	0 %	50 %	50 %	99081844
43025	NC_008044	CGC	2	6	2110176	2110181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081844
43026	NC_008044	CGG	2	6	2110236	2110241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081844
43027	NC_008044	CGA	2	6	2110360	2110365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081844
43028	NC_008044	GCT	2	6	2110405	2110410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081844
43029	NC_008044	GCC	2	6	2110436	2110441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081845
43030	NC_008044	CGT	2	6	2110483	2110488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081845
43031	NC_008044	GC	3	6	2110524	2110529	0 %	0 %	50 %	50 %	99081845
43032	NC_008044	CCAGC	2	10	2110585	2110594	20 %	0 %	20 %	60 %	99081845
43033	NC_008044	CAT	2	6	2110608	2110613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081845
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43035	NC_008044	CG	3	6	2110662	2110667	0 %	0 %	50 %	50 %	99081845
43036	NC_008044	AAG	2	6	2110777	2110782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081845
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43038	NC_008044	GC	3	6	2110800	2110805	0 %	0 %	50 %	50 %	99081845
43039	NC_008044	GCC	2	6	2110858	2110863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081845
43040	NC_008044	CCGC	2	8	2111100	2111107	0 %	0 %	25 %	75 %	99081845
43041	NC_008044	TC	3	6	2111115	2111120	0 %	50 %	0 %	50 %	99081845
43042	NC_008044	TCC	2	6	2111180	2111185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081845
43043	NC_008044	CTGA	2	8	2111200	2111207	25 %	25 %	25 %	25 %	99081845
43044	NC_008044	CCG	2	6	2111208	2111213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081845
43045	NC_008044	GCA	2	6	2111237	2111242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081845
43046	NC_008044	GAT	2	6	2111304	2111309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081845
43047	NC_008044	GTC	2	6	2111360	2111365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43048	NC_008044	GTG	2	6	2111376	2111381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43049	NC_008044	CTC	2	6	2111401	2111406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43050	NC_008044	ATGA	2	8	2111425	2111432	50 %	25 %	25 %	0 %	99081846
43051	NC_008044	C	6	6	2111443	2111448	0 %	0 %	0 %	100 %	99081846
43052	NC_008044	ATT	2	6	2111516	2111521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99081846
43053	NC_008044	TAC	2	6	2111527	2111532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081846
43054	NC_008044	CT	3	6	2111695	2111700	0 %	50 %	0 %	50 %	99081846
43055	NC_008044	GCC	2	6	2111729	2111734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081846
43056	NC_008044	CG	3	6	2111753	2111758	0 %	0 %	50 %	50 %	99081846
43057	NC_008044	GCG	2	6	2111902	2111907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081846
43058	NC_008044	CTT	2	6	2111949	2111954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081846
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43061	NC_008044	GGTGGC	2	12	2112126	2112137	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	99081846
43062	NC_008044	ATG	2	6	2112221	2112226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081846
43063	NC_008044	TCAG	2	8	2112287	2112294	25 %	25 %	25 %	25 %	99081846
43064	NC_008044	ACT	2	6	2112338	2112343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081846
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43069	NC_008044	GCCGC	2	10	2112455	2112464	0 %	0 %	40 %	60 %	99081846
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43077	NC_008044	GTGC	2	8	2112824	2112831	0 %	25 %	50 %	25 %	99081847
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43080	NC_008044	GTG	2	6	2112867	2112872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081847
43081	NC_008044	GCCT	2	8	2112906	2112913	0 %	25 %	25 %	50 %	99081847
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43084	NC_008044	CCGC	2	8	2112949	2112956	0 %	0 %	25 %	75 %	99081847
43085	NC_008044	GGC	2	6	2112990	2112995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081847
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43088	NC_008044	TGGC	2	8	2113220	2113227	0 %	25 %	50 %	25 %	99081847
43089	NC_008044	GC	3	6	2113226	2113231	0 %	0 %	50 %	50 %	99081847
43090	NC_008044	GGC	2	6	2113244	2113249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081847
43091	NC_008044	GCA	2	6	2113270	2113275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081847
43092	NC_008044	GCC	2	6	2113280	2113285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081847
43093	NC_008044	CTGAC	2	10	2113295	2113304	20 %	20 %	20 %	40 %	99081847
43094	NC_008044	GCCTC	2	10	2113312	2113321	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43095	NC_008044	GC	3	6	2113343	2113348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43096	NC_008044	CGC	2	6	2113355	2113360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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43098	NC_008044	CG	3	6	2113423	2113428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43099	NC_008044	CAC	2	6	2113473	2113478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081848
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43104	NC_008044	CCA	2	6	2113596	2113601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081848
43105	NC_008044	CCGCGC	2	12	2113665	2113676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081848
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43107	NC_008044	GC	4	8	2113891	2113898	0 %	0 %	50 %	50 %	99081848
43108	NC_008044	CTGG	2	8	2113926	2113933	0 %	25 %	50 %	25 %	99081848
43109	NC_008044	GAG	2	6	2113937	2113942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081848
43110	NC_008044	CT	3	6	2113973	2113978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43111	NC_008044	GAG	2	6	2114009	2114014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43112	NC_008044	ACC	2	6	2114024	2114029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081849
43113	NC_008044	CGCC	2	8	2114046	2114053	0 %	0 %	25 %	75 %	99081849
43114	NC_008044	GC	3	6	2114054	2114059	0 %	0 %	50 %	50 %	99081849
43115	NC_008044	GGCG	2	8	2114140	2114147	0 %	0 %	75 %	25 %	99081849
43116	NC_008044	CGC	2	6	2114190	2114195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081849
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43118	NC_008044	CG	3	6	2114325	2114330	0 %	0 %	50 %	50 %	99081849
43119	NC_008044	GC	3	6	2114380	2114385	0 %	0 %	50 %	50 %	99081849
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43121	NC_008044	GAT	3	9	2114470	2114478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081849
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43245	NC_008044	GCA	2	6	2120117	2120122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081857
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43481	NC_008044	GTC	2	6	2130699	2130704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081864
43482	NC_008044	GAT	2	6	2130705	2130710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081864
43483	NC_008044	CG	3	6	2130724	2130729	0 %	0 %	50 %	50 %	99081864
43484	NC_008044	GTC	2	6	2130741	2130746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081864
43485	NC_008044	CGC	2	6	2130753	2130758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081864
43486	NC_008044	CAG	2	6	2130774	2130779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081864
43487	NC_008044	TCG	2	6	2130790	2130795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081864
43488	NC_008044	CCA	2	6	2130827	2130832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081864
43489	NC_008044	CG	4	8	2130941	2130948	0 %	0 %	50 %	50 %	99081864
43490	NC_008044	TTG	2	6	2130952	2130957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081864
43491	NC_008044	GC	3	6	2130987	2130992	0 %	0 %	50 %	50 %	99081864
43492	NC_008044	GGT	2	6	2131023	2131028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081864
43493	NC_008044	GCCCGC	2	12	2131050	2131061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081864
43494	NC_008044	CGCGT	2	10	2131095	2131104	0 %	20 %	40 %	40 %	99081864
43495	NC_008044	CG	3	6	2131141	2131146	0 %	0 %	50 %	50 %	99081864
43496	NC_008044	GCGG	2	8	2131155	2131162	0 %	0 %	75 %	25 %	99081864
43497	NC_008044	ATG	2	6	2131166	2131171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081864
43498	NC_008044	GCG	2	6	2131209	2131214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43499	NC_008044	TGC	2	6	2131273	2131278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43500	NC_008044	TGT	2	6	2131284	2131289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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