MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008044	CTG	2	6	152528	152533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079979
3002	NC_008044	GATA	2	8	152547	152554	50 %	25 %	25 %	0 %	99079979
3003	NC_008044	AGC	2	6	152626	152631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079979
3004	NC_008044	CG	3	6	152634	152639	0 %	0 %	50 %	50 %	99079979
3005	NC_008044	AGC	2	6	152777	152782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079979
3006	NC_008044	TCG	2	6	152789	152794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079979
3007	NC_008044	TGG	2	6	152838	152843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079979
3008	NC_008044	CCG	2	6	152924	152929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079980
3009	NC_008044	TCG	2	6	152971	152976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079980
3010	NC_008044	CAAGCC	2	12	152997	153008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	99079980
3011	NC_008044	ATCA	2	8	153033	153040	50 %	25 %	0 %	25 %	99079980
3012	NC_008044	TCCC	2	8	153134	153141	0 %	25 %	0 %	75 %	99079980
3013	NC_008044	GC	3	6	153165	153170	0 %	0 %	50 %	50 %	99079980
3014	NC_008044	GCC	2	6	153229	153234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079980
3015	NC_008044	TGC	2	6	153248	153253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079980
3016	NC_008044	GC	3	6	153252	153257	0 %	0 %	50 %	50 %	99079980
3017	NC_008044	ATC	2	6	153273	153278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079980
3018	NC_008044	CCATGG	2	12	153406	153417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99079981
3019	NC_008044	CAA	2	6	153436	153441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079981
3020	NC_008044	CTC	2	6	153454	153459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079981
3021	NC_008044	CAAG	2	8	153520	153527	50 %	0 %	25 %	25 %	99079981
3022	NC_008044	CGA	2	6	153535	153540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079981
3023	NC_008044	CTT	2	6	153554	153559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079981
3024	NC_008044	GGC	2	6	153560	153565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079981
3025	NC_008044	CTC	2	6	153617	153622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079981
3026	NC_008044	GGT	2	6	153855	153860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079982
3027	NC_008044	CGG	2	6	153879	153884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079982
3028	NC_008044	CAC	2	6	153904	153909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079982
3029	NC_008044	CG	3	6	153910	153915	0 %	0 %	50 %	50 %	99079982
3030	NC_008044	AGT	2	6	153956	153961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079982
3031	NC_008044	CGA	2	6	153987	153992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079982
3032	NC_008044	AGA	2	6	154001	154006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079982
3033	NC_008044	TTCCCG	2	12	154051	154062	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	99079982
3034	NC_008044	T	6	6	154172	154177	0 %	100 %	0 %	0 %	99079982
3035	NC_008044	AAT	2	6	154296	154301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99079982
3036	NC_008044	T	6	6	154341	154346	0 %	100 %	0 %	0 %	99079982
3037	NC_008044	CTT	2	6	154350	154355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079982
3038	NC_008044	GCC	2	6	154408	154413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079982
3039	NC_008044	TCA	2	6	154442	154447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079982
3040	NC_008044	CAT	2	6	154524	154529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079982
3041	NC_008044	GTG	2	6	154538	154543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079982
3042	NC_008044	AAT	2	6	154564	154569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99079982
3043	NC_008044	TCAA	2	8	154655	154662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_008044	GTT	2	6	154665	154670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008044	GCG	2	6	154675	154680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_008044	GA	3	6	154704	154709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008044	GCG	2	6	154758	154763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_008044	GCA	2	6	154775	154780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_008044	GCC	2	6	154818	154823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079983
3050	NC_008044	GC	3	6	154840	154845	0 %	0 %	50 %	50 %	99079983
3051	NC_008044	TCC	2	6	154916	154921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079983
3052	NC_008044	CGC	2	6	154945	154950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079983
3053	NC_008044	GC	3	6	154960	154965	0 %	0 %	50 %	50 %	99079983
3054	NC_008044	GC	4	8	154967	154974	0 %	0 %	50 %	50 %	99079983
3055	NC_008044	TCA	2	6	154988	154993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079983
3056	NC_008044	ATC	2	6	154994	154999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079983
3057	NC_008044	GC	3	6	155000	155005	0 %	0 %	50 %	50 %	99079983
3058	NC_008044	CCG	2	6	155016	155021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079983
3059	NC_008044	GCG	2	6	155055	155060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079983
3060	NC_008044	GTC	2	6	155218	155223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079983
3061	NC_008044	CG	3	6	155257	155262	0 %	0 %	50 %	50 %	99079983
3062	NC_008044	TC	3	6	155275	155280	0 %	50 %	0 %	50 %	99079983
3063	NC_008044	TCC	2	6	155309	155314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079983
3064	NC_008044	GCC	2	6	155316	155321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079983
3065	NC_008044	AGGC	2	8	155333	155340	25 %	0 %	50 %	25 %	99079983
3066	NC_008044	CGT	2	6	155349	155354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079983
3067	NC_008044	TCC	2	6	155420	155425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079983
3068	NC_008044	CG	3	6	155447	155452	0 %	0 %	50 %	50 %	99079983
3069	NC_008044	CTC	2	6	155485	155490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079983
3070	NC_008044	CG	4	8	155571	155578	0 %	0 %	50 %	50 %	99079983
3071	NC_008044	GC	4	8	155581	155588	0 %	0 %	50 %	50 %	99079983
3072	NC_008044	ACA	2	6	155625	155630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079983
3073	NC_008044	GC	3	6	155663	155668	0 %	0 %	50 %	50 %	99079983
3074	NC_008044	TCC	2	6	155701	155706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079983
3075	NC_008044	ATC	2	6	155779	155784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079983
3076	NC_008044	CGA	3	9	155812	155820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079983
3077	NC_008044	GA	3	6	155819	155824	50 %	0 %	50 %	0 %	99079983
3078	NC_008044	GCC	2	6	155834	155839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079983
3079	NC_008044	CCT	2	6	155844	155849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079983
3080	NC_008044	TCG	2	6	155879	155884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079983
3081	NC_008044	AGA	2	6	155927	155932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079983
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3083	NC_008044	CCG	2	6	156046	156051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079983
3084	NC_008044	CGG	2	6	156078	156083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079983
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3086	NC_008044	CT	3	6	156158	156163	0 %	50 %	0 %	50 %	99079983
3087	NC_008044	AGA	2	6	156167	156172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079983
3088	NC_008044	GTT	2	6	156205	156210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079983
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3090	NC_008044	TGT	2	6	156280	156285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_008044	AAG	2	6	156305	156310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_008044	TGG	2	6	156361	156366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079984
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3094	NC_008044	GGA	2	6	156512	156517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079984
3095	NC_008044	CG	3	6	156547	156552	0 %	0 %	50 %	50 %	99079984
3096	NC_008044	CGCA	2	8	156638	156645	25 %	0 %	25 %	50 %	99079984
3097	NC_008044	AAG	2	6	156659	156664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008044	GAT	2	6	156689	156694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_008044	GAT	2	6	156875	156880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079985
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3102	NC_008044	CAT	2	6	157097	157102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079985
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3104	NC_008044	GCAGC	2	10	157125	157134	20 %	0 %	40 %	40 %	99079985
3105	NC_008044	GAAA	2	8	157247	157254	75 %	0 %	25 %	0 %	99079985
3106	NC_008044	CTG	2	6	157305	157310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079985
3107	NC_008044	CGA	2	6	157316	157321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079985
3108	NC_008044	ATC	3	9	157326	157334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079985
3109	NC_008044	TCGGT	2	10	157360	157369	0 %	40 %	40 %	20 %	99079985
3110	NC_008044	TGG	2	6	157444	157449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079985
3111	NC_008044	GCA	2	6	157451	157456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079985
3112	NC_008044	GCG	2	6	157504	157509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079985
3113	NC_008044	T	6	6	157563	157568	0 %	100 %	0 %	0 %	99079985
3114	NC_008044	ACT	2	6	157840	157845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079985
3115	NC_008044	CG	3	6	157863	157868	0 %	0 %	50 %	50 %	99079985
3116	NC_008044	GGC	2	6	157959	157964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079985
3117	NC_008044	ACC	2	6	157978	157983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079985
3118	NC_008044	GAA	2	6	158055	158060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079985
3119	NC_008044	CGG	2	6	158129	158134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079985
3120	NC_008044	TCCG	2	8	158191	158198	0 %	25 %	25 %	50 %	99079985
3121	NC_008044	CCT	2	6	158219	158224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079985
3122	NC_008044	CG	3	6	158246	158251	0 %	0 %	50 %	50 %	99079985
3123	NC_008044	AGA	2	6	158294	158299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079985
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3125	NC_008044	TGG	2	6	158467	158472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079985
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3138	NC_008044	CTG	2	6	158932	158937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079985
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3239	NC_008044	GC	3	6	163474	163479	0 %	0 %	50 %	50 %	99079990
3240	NC_008044	CTC	2	6	163489	163494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079990
3241	NC_008044	CG	4	8	163554	163561	0 %	0 %	50 %	50 %	99079990
3242	NC_008044	CGG	2	6	163601	163606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079990
3243	NC_008044	GAGGTC	2	12	163639	163650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99079990
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3245	NC_008044	ATC	2	6	163718	163723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079990
3246	NC_008044	G	6	6	163784	163789	0 %	0 %	100 %	0 %	99079990
3247	NC_008044	TGAG	2	8	163805	163812	25 %	25 %	50 %	0 %	99079990
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3249	NC_008044	TCG	2	6	164141	164146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079990
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3499	NC_008044	CCA	2	6	175520	175525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080000
3500	NC_008044	CTT	2	6	175587	175592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080000

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