MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008044	GCG	2	6	101894	101899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079937
2003	NC_008044	CATC	2	8	101916	101923	25 %	25 %	0 %	50 %	99079937
2004	NC_008044	GTG	2	6	101941	101946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079937
2005	NC_008044	GGC	2	6	102036	102041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079937
2006	NC_008044	AGG	2	6	102053	102058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079937
2007	NC_008044	CTT	2	6	102114	102119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079937
2008	NC_008044	GCGCG	2	10	102120	102129	0 %	0 %	60 %	40 %	99079937
2009	NC_008044	GGC	2	6	102130	102135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079937
2010	NC_008044	TGA	2	6	102249	102254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079937
2011	NC_008044	ACCA	2	8	102281	102288	50 %	0 %	0 %	50 %	99079937
2012	NC_008044	CGGGG	2	10	102313	102322	0 %	0 %	80 %	20 %	99079937
2013	NC_008044	CAGC	2	8	102485	102492	25 %	0 %	25 %	50 %	99079938
2014	NC_008044	CCA	2	6	102555	102560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079938
2015	NC_008044	ATC	2	6	102618	102623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079938
2016	NC_008044	CT	3	6	102654	102659	0 %	50 %	0 %	50 %	99079938
2017	NC_008044	TGA	2	6	102676	102681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079938
2018	NC_008044	CAT	2	6	102695	102700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079938
2019	NC_008044	ATC	2	6	102705	102710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079938
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2021	NC_008044	CCG	2	6	102934	102939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079938
2022	NC_008044	CGG	2	6	102955	102960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079938
2023	NC_008044	GC	4	8	102985	102992	0 %	0 %	50 %	50 %	99079938
2024	NC_008044	CGG	3	9	102994	103002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079938
2025	NC_008044	GA	3	6	103062	103067	50 %	0 %	50 %	0 %	99079938
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2027	NC_008044	ATC	2	6	103127	103132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079938
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2029	NC_008044	CTT	2	6	103196	103201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079938
2030	NC_008044	GCG	2	6	103232	103237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079938
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2032	NC_008044	CTTGGC	2	12	103352	103363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079938
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2034	NC_008044	TCT	2	6	103404	103409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079938
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2037	NC_008044	AAT	2	6	103548	103553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_008044	GA	3	6	103600	103605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2041	NC_008044	TGC	2	6	103756	103761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079939
2042	NC_008044	GGC	2	6	103772	103777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079939
2043	NC_008044	CG	3	6	103865	103870	0 %	0 %	50 %	50 %	99079939
2044	NC_008044	GGA	2	6	103912	103917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079939
2045	NC_008044	CTT	2	6	103918	103923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079939
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2055	NC_008044	TGA	2	6	104597	104602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079939
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2108	NC_008044	TGA	2	6	106872	106877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079942
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2119	NC_008044	GAT	2	6	107341	107346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079942
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2124	NC_008044	CG	3	6	107716	107721	0 %	0 %	50 %	50 %	99079943
2125	NC_008044	GGT	2	6	107776	107781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079943
2126	NC_008044	TGG	2	6	107866	107871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079943
2127	NC_008044	GGC	2	6	108036	108041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079943
2128	NC_008044	GGC	2	6	108095	108100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079943
2129	NC_008044	T	6	6	108164	108169	0 %	100 %	0 %	0 %	99079943
2130	NC_008044	ACCG	2	8	108200	108207	25 %	0 %	25 %	50 %	99079943
2131	NC_008044	CG	3	6	108423	108428	0 %	0 %	50 %	50 %	99079943
2132	NC_008044	CG	3	6	108471	108476	0 %	0 %	50 %	50 %	99079943
2133	NC_008044	GCGG	2	8	108547	108554	0 %	0 %	75 %	25 %	99079943
2134	NC_008044	CGG	3	9	108588	108596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079943
2135	NC_008044	TGG	2	6	108624	108629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079943
2136	NC_008044	GC	3	6	108683	108688	0 %	0 %	50 %	50 %	99079943
2137	NC_008044	GGCC	2	8	108727	108734	0 %	0 %	50 %	50 %	99079943
2138	NC_008044	GGCG	2	8	108754	108761	0 %	0 %	75 %	25 %	99079943
2139	NC_008044	GCG	2	6	108863	108868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079943
2140	NC_008044	TGC	2	6	108901	108906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079943
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2142	NC_008044	GAG	2	6	108986	108991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079943
2143	NC_008044	C	6	6	108998	109003	0 %	0 %	0 %	100 %	99079943
2144	NC_008044	ATC	2	6	109055	109060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079943
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2148	NC_008044	ATC	2	6	109187	109192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079943
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2150	NC_008044	CTG	2	6	109220	109225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079943
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2153	NC_008044	GC	3	6	109394	109399	0 %	0 %	50 %	50 %	99079943
2154	NC_008044	GCG	2	6	109461	109466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079943
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2157	NC_008044	CCGC	2	8	109726	109733	0 %	0 %	25 %	75 %	99079944
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2161	NC_008044	GCAGAT	2	12	109853	109864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99079944
2162	NC_008044	GC	3	6	109881	109886	0 %	0 %	50 %	50 %	99079944
2163	NC_008044	GC	4	8	109944	109951	0 %	0 %	50 %	50 %	99079944
2164	NC_008044	AC	3	6	110204	110209	50 %	0 %	0 %	50 %	99079944
2165	NC_008044	CG	3	6	110226	110231	0 %	0 %	50 %	50 %	99079944
2166	NC_008044	CCCG	2	8	110255	110262	0 %	0 %	25 %	75 %	99079944
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2171	NC_008044	AT	3	6	110402	110407	50 %	50 %	0 %	0 %	99079944
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2180	NC_008044	TCG	2	6	110931	110936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079945
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2189	NC_008044	GCC	2	6	111205	111210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079945
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2200	NC_008044	TGT	2	6	111747	111752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079945
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2202	NC_008044	ATT	2	6	112001	112006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99079945
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2205	NC_008044	AGG	2	6	112211	112216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2231	NC_008044	CGG	2	6	113663	113668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079947
2232	NC_008044	CGT	2	6	113699	113704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079947
2233	NC_008044	GTT	2	6	113776	113781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2234	NC_008044	GGCCC	2	10	113837	113846	0 %	0 %	40 %	60 %	99079948
2235	NC_008044	GACGGG	2	12	114023	114034	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	99079948
2236	NC_008044	GC	3	6	114086	114091	0 %	0 %	50 %	50 %	99079948
2237	NC_008044	GGGC	2	8	114132	114139	0 %	0 %	75 %	25 %	99079948
2238	NC_008044	CCG	2	6	114189	114194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079948
2239	NC_008044	CGC	2	6	114394	114399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079948
2240	NC_008044	GCT	2	6	114400	114405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079948
2241	NC_008044	CAG	2	6	114430	114435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079948
2242	NC_008044	GGC	2	6	114464	114469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079948
2243	NC_008044	CGGA	2	8	114481	114488	25 %	0 %	50 %	25 %	99079948
2244	NC_008044	CCA	2	6	114490	114495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079948
2245	NC_008044	CGC	2	6	114520	114525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079948
2246	NC_008044	GCA	2	6	114541	114546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079948
2247	NC_008044	ATG	2	6	114588	114593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079948
2248	NC_008044	CGT	2	6	114616	114621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079948
2249	NC_008044	GAT	2	6	114644	114649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079948
2250	NC_008044	GCT	3	9	114734	114742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079948
2251	NC_008044	TTC	2	6	114743	114748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079948
2252	NC_008044	GC	3	6	114884	114889	0 %	0 %	50 %	50 %	99079949
2253	NC_008044	CG	4	8	114906	114913	0 %	0 %	50 %	50 %	99079949
2254	NC_008044	GGC	2	6	115078	115083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079949
2255	NC_008044	AGG	2	6	115119	115124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079949
2256	NC_008044	CATG	2	8	115173	115180	25 %	25 %	25 %	25 %	99079949
2257	NC_008044	GC	3	6	115213	115218	0 %	0 %	50 %	50 %	99079949
2258	NC_008044	GCC	2	6	115306	115311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079949
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2261	NC_008044	CTG	2	6	115372	115377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079949
2262	NC_008044	CCT	2	6	115422	115427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079949
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2274	NC_008044	GAT	2	6	115941	115946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079950
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2276	NC_008044	TGGCC	2	10	116123	116132	0 %	20 %	40 %	40 %	99079950
2277	NC_008044	GC	3	6	116160	116165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2278	NC_008044	AGGGG	2	10	116192	116201	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2279	NC_008044	TGTT	2	8	116231	116238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2280	NC_008044	C	6	6	116389	116394	0 %	0 %	0 %	100 %	99079951
2281	NC_008044	AGG	2	6	116403	116408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079951
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2283	NC_008044	CGGG	2	8	116454	116461	0 %	0 %	75 %	25 %	99079951
2284	NC_008044	TGT	2	6	116552	116557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_008044	CCG	2	6	116558	116563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2286	NC_008044	GCA	2	6	116579	116584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2288	NC_008044	CATC	2	8	116702	116709	25 %	25 %	0 %	50 %	99079952
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2292	NC_008044	CG	3	6	116927	116932	0 %	0 %	50 %	50 %	99079952
2293	NC_008044	GC	3	6	116958	116963	0 %	0 %	50 %	50 %	99079952
2294	NC_008044	GTC	2	6	117000	117005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079952
2295	NC_008044	GAT	3	9	117057	117065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079952
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2331	NC_008044	TCA	2	6	118985	118990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079953
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2336	NC_008044	ATC	2	6	119339	119344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2338	NC_008044	GAG	2	6	119453	119458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2353	NC_008044	AGCTC	2	10	119995	120004	20 %	20 %	20 %	40 %	99079954
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2360	NC_008044	TGA	2	6	120355	120360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079954
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2362	NC_008044	TCA	2	6	120401	120406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079954
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2364	NC_008044	CGG	2	6	120431	120436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079954
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2367	NC_008044	CGCT	2	8	120600	120607	0 %	25 %	25 %	50 %	99079954
2368	NC_008044	CAGA	2	8	120636	120643	50 %	0 %	25 %	25 %	99079954
2369	NC_008044	GC	3	6	120683	120688	0 %	0 %	50 %	50 %	99079954
2370	NC_008044	CGA	2	6	120731	120736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079954
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2372	NC_008044	ATC	2	6	120882	120887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079954
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2374	NC_008044	TG	3	6	121014	121019	0 %	50 %	50 %	0 %	99079954
2375	NC_008044	CGG	2	6	121042	121047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079954
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2379	NC_008044	GTG	2	6	121206	121211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079954
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2497	NC_008044	TGG	2	6	126633	126638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079960
2498	NC_008044	GCG	2	6	126659	126664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079960
2499	NC_008044	AAC	2	6	126668	126673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079960
2500	NC_008044	GGC	2	6	126753	126758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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