MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_008044	TTC	2	6	79452	79457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079917
1503	NC_008044	TCG	2	6	79483	79488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079917
1504	NC_008044	TCCAGC	2	12	79503	79514	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99079917
1505	NC_008044	GCCA	2	8	79527	79534	25 %	0 %	25 %	50 %	99079917
1506	NC_008044	TG	3	6	79598	79603	0 %	50 %	50 %	0 %	99079917
1507	NC_008044	CG	3	6	79605	79610	0 %	0 %	50 %	50 %	99079917
1508	NC_008044	GCC	2	6	79637	79642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079917
1509	NC_008044	GC	3	6	79689	79694	0 %	0 %	50 %	50 %	99079917
1510	NC_008044	TCA	2	6	79713	79718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079917
1511	NC_008044	ACG	2	6	79737	79742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079917
1512	NC_008044	TCT	2	6	79867	79872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079917
1513	NC_008044	ATA	2	6	79892	79897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99079917
1514	NC_008044	CTGC	2	8	79946	79953	0 %	25 %	25 %	50 %	99079917
1515	NC_008044	GCGT	2	8	80073	80080	0 %	25 %	50 %	25 %	99079918
1516	NC_008044	GC	3	6	80157	80162	0 %	0 %	50 %	50 %	99079918
1517	NC_008044	CAG	2	6	80166	80171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079918
1518	NC_008044	GCC	2	6	80290	80295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079918
1519	NC_008044	CG	3	6	80308	80313	0 %	0 %	50 %	50 %	99079918
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1521	NC_008044	GTC	2	6	80397	80402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079918
1522	NC_008044	CGC	2	6	80454	80459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079918
1523	NC_008044	GCG	2	6	80460	80465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079918
1524	NC_008044	GCC	2	6	80515	80520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079918
1525	NC_008044	CG	3	6	80522	80527	0 %	0 %	50 %	50 %	99079918
1526	NC_008044	TGC	2	6	80555	80560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079918
1527	NC_008044	GCC	2	6	80638	80643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079918
1528	NC_008044	CAG	2	6	80871	80876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079918
1529	NC_008044	GCA	2	6	80882	80887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079918
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1531	NC_008044	A	6	6	80969	80974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008044	TCAGA	2	10	81008	81017	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1535	NC_008044	CGA	2	6	81058	81063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079919
1536	NC_008044	TTCACT	2	12	81138	81149	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	99079919
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1539	NC_008044	GGC	2	6	81187	81192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079919
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1541	NC_008044	CGA	2	6	81262	81267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079919
1542	NC_008044	CTT	2	6	81298	81303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079919
1543	NC_008044	CGT	3	9	81385	81393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079919
1544	NC_008044	CGA	2	6	81421	81426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079919
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1554	NC_008044	GGA	2	6	81845	81850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079919
1555	NC_008044	GTCG	2	8	81902	81909	0 %	25 %	50 %	25 %	99079919
1556	NC_008044	GC	4	8	81931	81938	0 %	0 %	50 %	50 %	99079919
1557	NC_008044	ACG	2	6	81965	81970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079919
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1559	NC_008044	TCG	2	6	82080	82085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079919
1560	NC_008044	CAC	2	6	82103	82108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079919
1561	NC_008044	CAC	2	6	82123	82128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079919
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1564	NC_008044	GCG	2	6	82217	82222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079919
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1598	NC_008044	GCC	2	6	83239	83244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_008044	TCTT	2	8	83258	83265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1601	NC_008044	AGAA	2	8	83327	83334	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1611	NC_008044	GGGC	2	8	83743	83750	0 %	0 %	75 %	25 %	99079921
1612	NC_008044	TA	3	6	83822	83827	50 %	50 %	0 %	0 %	99079921
1613	NC_008044	CG	3	6	83830	83835	0 %	0 %	50 %	50 %	99079921
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1617	NC_008044	CCAC	2	8	83932	83939	25 %	0 %	0 %	75 %	99079921
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1622	NC_008044	TCT	2	6	84351	84356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079921
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