MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008044	CAGGC	2	10	53525	53534	20 %	0 %	40 %	40 %	99079891
1003	NC_008044	CG	3	6	53556	53561	0 %	0 %	50 %	50 %	99079891
1004	NC_008044	CG	3	6	53580	53585	0 %	0 %	50 %	50 %	99079891
1005	NC_008044	GCC	2	6	53597	53602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079891
1006	NC_008044	GGT	2	6	53707	53712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079891
1007	NC_008044	CGGGCG	2	12	53747	53758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079891
1008	NC_008044	TCA	2	6	53787	53792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079891
1009	NC_008044	TGC	2	6	53840	53845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_008044	GA	3	6	53950	53955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008044	GAA	2	6	53971	53976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079892
1012	NC_008044	TCG	2	6	53985	53990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079892
1013	NC_008044	GC	3	6	54088	54093	0 %	0 %	50 %	50 %	99079892
1014	NC_008044	GAAG	2	8	54094	54101	50 %	0 %	50 %	0 %	99079892
1015	NC_008044	ATC	2	6	54116	54121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079892
1016	NC_008044	GCC	2	6	54162	54167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079892
1017	NC_008044	GCAA	2	8	54174	54181	50 %	0 %	25 %	25 %	99079892
1018	NC_008044	GGA	2	6	54340	54345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079892
1019	NC_008044	CAA	2	6	54469	54474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079892
1020	NC_008044	GTG	2	6	54479	54484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079892
1021	NC_008044	CTG	2	6	54497	54502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079892
1022	NC_008044	GAC	2	6	54532	54537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079892
1023	NC_008044	GA	3	6	54701	54706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008044	TCC	2	6	54736	54741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_008044	T	6	6	54773	54778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008044	CGC	2	6	54826	54831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079893
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1031	NC_008044	TGA	2	6	55096	55101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079893
1032	NC_008044	ATC	2	6	55187	55192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079893
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1039	NC_008044	CGA	2	6	55465	55470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079893
1040	NC_008044	GC	3	6	55548	55553	0 %	0 %	50 %	50 %	99079893
1041	NC_008044	GCGG	2	8	55601	55608	0 %	0 %	75 %	25 %	99079893
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1043	NC_008044	GTT	2	6	55839	55844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079893
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1051	NC_008044	CG	3	6	56169	56174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_008044	GCT	2	6	56287	56292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079894
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1057	NC_008044	CGA	2	6	56557	56562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079894
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1061	NC_008044	TGG	2	6	56834	56839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079894
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1067	NC_008044	A	6	6	57073	57078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1070	NC_008044	GC	3	6	57145	57150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_008044	GCAA	2	8	57205	57212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1110	NC_008044	GC	3	6	59260	59265	0 %	0 %	50 %	50 %	99079898
1111	NC_008044	CCGCG	2	10	59294	59303	0 %	0 %	40 %	60 %	99079898
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1131	NC_008044	GC	3	6	60676	60681	0 %	0 %	50 %	50 %	99079899
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1238	NC_008044	CGGG	2	8	66292	66299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1239	NC_008044	TA	3	6	66340	66345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1246	NC_008044	TGG	3	9	66708	66716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079902
1247	NC_008044	GTG	2	6	66743	66748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079902
1248	NC_008044	GAT	2	6	66790	66795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079902
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