MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008044	TGT	2	6	26588	26593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079867
502	NC_008044	GAC	2	6	26661	26666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079867
503	NC_008044	TCT	2	6	26708	26713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_008044	GGC	2	6	26919	26924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079868
505	NC_008044	TGC	2	6	26974	26979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079868
506	NC_008044	GCC	2	6	27088	27093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079868
507	NC_008044	CCA	2	6	27311	27316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079868
508	NC_008044	GCG	2	6	27451	27456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008044	TTG	2	6	27524	27529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008044	TTTTA	2	10	27559	27568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008044	GC	3	6	27608	27613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_008044	GGA	2	6	27624	27629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008044	GC	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	99079869
514	NC_008044	GGC	2	6	27692	27697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079869
515	NC_008044	GCG	2	6	27719	27724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079869
516	NC_008044	TC	3	6	27732	27737	0 %	50 %	0 %	50 %	99079869
517	NC_008044	GCT	2	6	27953	27958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079869
518	NC_008044	GC	3	6	28178	28183	0 %	0 %	50 %	50 %	99079869
519	NC_008044	CGG	2	6	28261	28266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079869
520	NC_008044	GC	3	6	28273	28278	0 %	0 %	50 %	50 %	99079869
521	NC_008044	GAGGGG	2	12	28376	28387	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	99079869
522	NC_008044	CTG	2	6	28455	28460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079869
523	NC_008044	T	6	6	28621	28626	0 %	100 %	0 %	0 %	99079869
524	NC_008044	ACGC	2	8	28645	28652	25 %	0 %	25 %	50 %	99079869
525	NC_008044	ATG	2	6	28659	28664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079869
526	NC_008044	CGT	2	6	28791	28796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079869
527	NC_008044	CTG	2	6	28805	28810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079869
528	NC_008044	GGC	2	6	28820	28825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079869
529	NC_008044	GC	4	8	28969	28976	0 %	0 %	50 %	50 %	99079869
530	NC_008044	TC	3	6	28983	28988	0 %	50 %	0 %	50 %	99079869
531	NC_008044	CG	3	6	29048	29053	0 %	0 %	50 %	50 %	99079869
532	NC_008044	CATGA	2	10	29077	29086	40 %	20 %	20 %	20 %	99079869
533	NC_008044	T	7	7	29094	29100	0 %	100 %	0 %	0 %	99079870
534	NC_008044	CGA	2	6	29172	29177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079870
535	NC_008044	TG	3	6	29241	29246	0 %	50 %	50 %	0 %	99079870
536	NC_008044	TGG	2	6	29265	29270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079870
537	NC_008044	CGC	2	6	29310	29315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079870
538	NC_008044	GCT	2	6	29352	29357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079870
539	NC_008044	CTA	2	6	29367	29372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079870
540	NC_008044	AC	3	6	29423	29428	50 %	0 %	0 %	50 %	99079870
541	NC_008044	TCG	2	6	29444	29449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079870
542	NC_008044	ACT	2	6	29450	29455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079870
543	NC_008044	CTC	2	6	29488	29493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079870
544	NC_008044	CGG	2	6	29576	29581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079870
545	NC_008044	CGA	2	6	29582	29587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079870
546	NC_008044	CCAC	2	8	29606	29613	25 %	0 %	0 %	75 %	99079870
547	NC_008044	GCG	2	6	29621	29626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079870
548	NC_008044	TGG	2	6	29723	29728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079870
549	NC_008044	ACG	2	6	29813	29818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079870
550	NC_008044	TCGA	2	8	29959	29966	25 %	25 %	25 %	25 %	99079870
551	NC_008044	CAA	2	6	30015	30020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079870
552	NC_008044	CGG	2	6	30150	30155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079870
553	NC_008044	GGC	2	6	30183	30188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079870
554	NC_008044	ACCG	2	8	30229	30236	25 %	0 %	25 %	50 %	99079870
555	NC_008044	TGA	2	6	30294	30299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079870
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557	NC_008044	TCA	2	6	30374	30379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079870
558	NC_008044	TGAA	2	8	30391	30398	50 %	25 %	25 %	0 %	99079870
559	NC_008044	GAAG	2	8	30444	30451	50 %	0 %	50 %	0 %	99079871
560	NC_008044	GGA	2	6	30525	30530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079871
561	NC_008044	CAG	2	6	30563	30568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079871
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563	NC_008044	GGCA	2	8	30649	30656	25 %	0 %	50 %	25 %	99079871
564	NC_008044	CCT	2	6	30690	30695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079871
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566	NC_008044	GGT	2	6	30793	30798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079871
567	NC_008044	ATT	2	6	30911	30916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99079871
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569	NC_008044	GTG	2	6	31108	31113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079871
570	NC_008044	TGA	2	6	31116	31121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079871
571	NC_008044	AGC	2	6	31136	31141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079871
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573	NC_008044	GC	3	6	31202	31207	0 %	0 %	50 %	50 %	99079871
574	NC_008044	GGA	2	6	31391	31396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079871
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578	NC_008044	TCA	2	6	31580	31585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079872
579	NC_008044	G	6	6	31631	31636	0 %	0 %	100 %	0 %	99079872
580	NC_008044	ACC	2	6	31771	31776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079872
581	NC_008044	ATC	2	6	31780	31785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079872
582	NC_008044	TGA	2	6	31832	31837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079872
583	NC_008044	CGC	2	6	31844	31849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079872
584	NC_008044	ATT	2	6	31894	31899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99079872
585	NC_008044	CGGG	2	8	31948	31955	0 %	0 %	75 %	25 %	99079872
586	NC_008044	CGCGG	2	10	31970	31979	0 %	0 %	60 %	40 %	99079872
587	NC_008044	GC	3	6	32093	32098	0 %	0 %	50 %	50 %	99079872
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590	NC_008044	CGGGC	2	10	32261	32270	0 %	0 %	60 %	40 %	99079872
591	NC_008044	GC	3	6	32277	32282	0 %	0 %	50 %	50 %	99079872
592	NC_008044	GGA	2	6	32333	32338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079872
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596	NC_008044	GC	3	6	32543	32548	0 %	0 %	50 %	50 %	99079872
597	NC_008044	TTG	2	6	32611	32616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079872
598	NC_008044	CTT	2	6	32618	32623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079872
599	NC_008044	GCA	2	6	32757	32762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079873
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601	NC_008044	CTT	2	6	32811	32816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079873
602	NC_008044	ATC	2	6	32858	32863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079873
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604	NC_008044	CAG	2	6	33157	33162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079873
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608	NC_008044	CAG	2	6	33249	33254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079873
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620	NC_008044	CAG	2	6	33919	33924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079873
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626	NC_008044	AAG	2	6	34213	34218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079873
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629	NC_008044	TGGA	2	8	34397	34404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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