MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008044	GCT	2	6	272737	272742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080099
5502	NC_008044	TGA	2	6	272760	272765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080099
5503	NC_008044	GGC	2	6	272788	272793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080099
5504	NC_008044	GAA	2	6	272816	272821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080099
5505	NC_008044	TGG	2	6	272826	272831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080099
5506	NC_008044	ACC	2	6	272840	272845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080099
5507	NC_008044	CGA	2	6	272872	272877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080099
5508	NC_008044	CG	3	6	272887	272892	0 %	0 %	50 %	50 %	99080099
5509	NC_008044	CGA	2	6	272920	272925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080099
5510	NC_008044	ATC	2	6	272942	272947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080099
5511	NC_008044	GC	3	6	272993	272998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_008044	GCGTTT	2	12	273019	273030	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5513	NC_008044	GC	3	6	273086	273091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_008044	AG	3	6	273100	273105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_008044	CAT	2	6	273106	273111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080100
5516	NC_008044	GATT	2	8	273118	273125	25 %	50 %	25 %	0 %	99080100
5517	NC_008044	TGC	2	6	273151	273156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080100
5518	NC_008044	CGT	2	6	273201	273206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080100
5519	NC_008044	GAT	2	6	273224	273229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080100
5520	NC_008044	GAG	2	6	273251	273256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080100
5521	NC_008044	CCTG	2	8	273430	273437	0 %	25 %	25 %	50 %	99080100
5522	NC_008044	GGC	2	6	273440	273445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080100
5523	NC_008044	GCCA	2	8	273452	273459	25 %	0 %	25 %	50 %	99080100
5524	NC_008044	CAC	2	6	273487	273492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080100
5525	NC_008044	GAT	3	9	273550	273558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080100
5526	NC_008044	CCG	2	6	273566	273571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080100
5527	NC_008044	GCC	2	6	273585	273590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080100
5528	NC_008044	CG	3	6	273732	273737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_008044	T	6	6	273798	273803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_008044	GCG	2	6	273809	273814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080101
5531	NC_008044	TGG	2	6	273830	273835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080101
5532	NC_008044	CA	3	6	273897	273902	50 %	0 %	0 %	50 %	99080101
5533	NC_008044	CGCC	2	8	274004	274011	0 %	0 %	25 %	75 %	99080101
5534	NC_008044	GC	3	6	274035	274040	0 %	0 %	50 %	50 %	99080101
5535	NC_008044	GTG	2	6	274059	274064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080101
5536	NC_008044	GCT	2	6	274132	274137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080101
5537	NC_008044	GAGG	2	8	274149	274156	25 %	0 %	75 %	0 %	99080101
5538	NC_008044	CTCG	2	8	274157	274164	0 %	25 %	25 %	50 %	99080101
5539	NC_008044	GCC	2	6	274168	274173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080101
5540	NC_008044	GC	3	6	274203	274208	0 %	0 %	50 %	50 %	99080101
5541	NC_008044	CCG	2	6	274234	274239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080101
5542	NC_008044	GC	3	6	274318	274323	0 %	0 %	50 %	50 %	99080101
5543	NC_008044	GGT	2	6	274325	274330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080101
5544	NC_008044	CT	3	6	274355	274360	0 %	50 %	0 %	50 %	99080101
5545	NC_008044	ATGC	2	8	274473	274480	25 %	25 %	25 %	25 %	99080101
5546	NC_008044	CGC	2	6	274535	274540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080101
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5550	NC_008044	CCG	2	6	274768	274773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080101
5551	NC_008044	AAC	2	6	274774	274779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080101
5552	NC_008044	GCG	2	6	274812	274817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080101
5553	NC_008044	ATC	2	6	274836	274841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080101
5554	NC_008044	GCT	2	6	274845	274850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_008044	GAT	2	6	274881	274886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080102
5556	NC_008044	GGTT	2	8	274914	274921	0 %	50 %	50 %	0 %	99080102
5557	NC_008044	TTTC	2	8	274952	274959	0 %	75 %	0 %	25 %	99080102
5558	NC_008044	CTC	2	6	274971	274976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080102
5559	NC_008044	TCA	2	6	275008	275013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080102
5560	NC_008044	GCAGC	2	10	275037	275046	20 %	0 %	40 %	40 %	99080102
5561	NC_008044	GGT	2	6	275153	275158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080102
5562	NC_008044	GCT	2	6	275159	275164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080102
5563	NC_008044	AG	3	6	275227	275232	50 %	0 %	50 %	0 %	99080102
5564	NC_008044	CAT	2	6	275262	275267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080102
5565	NC_008044	GCT	2	6	275283	275288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080102
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5567	NC_008044	TGTGG	2	10	275504	275513	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_008044	CTG	2	6	275569	275574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_008044	GAC	2	6	275702	275707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_008044	CCA	2	6	275713	275718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_008044	CCA	2	6	275733	275738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_008044	AAGGA	2	10	275758	275767	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_008044	CGA	2	6	275822	275827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080103
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5583	NC_008044	CAT	2	6	276164	276169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080104
5584	NC_008044	GC	3	6	276175	276180	0 %	0 %	50 %	50 %	99080104
5585	NC_008044	AAACG	2	10	276190	276199	60 %	0 %	20 %	20 %	99080104
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5597	NC_008044	GAA	2	6	276645	276650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080105
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5603	NC_008044	AAG	2	6	276751	276756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080106
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5611	NC_008044	GT	3	6	277365	277370	0 %	50 %	50 %	0 %	99080107
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5615	NC_008044	AAG	2	6	277607	277612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080108
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5618	NC_008044	TAC	2	6	277793	277798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080108
5619	NC_008044	GA	3	6	277885	277890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_008044	GC	3	6	277984	277989	0 %	0 %	50 %	50 %	99080109
5621	NC_008044	TGC	2	6	278004	278009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080109
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5625	NC_008044	GT	3	6	278193	278198	0 %	50 %	50 %	0 %	99080109
5626	NC_008044	ACGC	2	8	278238	278245	25 %	0 %	25 %	50 %	99080109
5627	NC_008044	TGG	2	6	278257	278262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080109
5628	NC_008044	TCT	2	6	278280	278285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080109
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5633	NC_008044	CG	3	6	278463	278468	0 %	0 %	50 %	50 %	99080110
5634	NC_008044	GC	4	8	278479	278486	0 %	0 %	50 %	50 %	99080110
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5643	NC_008044	AAG	3	9	278825	278833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080110
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5645	NC_008044	GTC	2	6	278924	278929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080111
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5653	NC_008044	GAT	2	6	279280	279285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_008044	CAT	2	6	279356	279361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5658	NC_008044	GCTTCG	2	12	279490	279501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080112
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5678	NC_008044	CAA	2	6	280267	280272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5679	NC_008044	ACA	2	6	280313	280318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5680	NC_008044	CCTC	2	8	280491	280498	0 %	25 %	0 %	75 %	99080114
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5682	NC_008044	TCC	3	9	280616	280624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5683	NC_008044	TTG	2	6	280675	280680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5684	NC_008044	G	7	7	280684	280690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5685	NC_008044	GAG	2	6	280704	280709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5692	NC_008044	TCCGC	2	10	280981	280990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5693	NC_008044	CTG	2	6	281014	281019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5733	NC_008044	CAA	2	6	282895	282900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080116
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5748	NC_008044	GC	4	8	283489	283496	0 %	0 %	50 %	50 %	99080117
5749	NC_008044	TAC	2	6	283537	283542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080117
5750	NC_008044	AAG	2	6	283543	283548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080117
5751	NC_008044	CGC	2	6	283553	283558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080117
5752	NC_008044	CGA	2	6	283617	283622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080117
5753	NC_008044	TGTTT	2	10	283721	283730	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5754	NC_008044	GCAGG	2	10	283736	283745	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5755	NC_008044	AG	3	6	283762	283767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5756	NC_008044	GC	3	6	283768	283773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5757	NC_008044	GCG	2	6	283803	283808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5758	NC_008044	CTG	2	6	283920	283925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5759	NC_008044	A	6	6	284019	284024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5760	NC_008044	CGT	2	6	284194	284199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080118
5761	NC_008044	GAAC	2	8	284202	284209	50 %	0 %	25 %	25 %	99080118
5762	NC_008044	CGT	2	6	284278	284283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080118
5763	NC_008044	GCT	2	6	284321	284326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080118
5764	NC_008044	AAG	3	9	284425	284433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080118
5765	NC_008044	AGGG	2	8	284436	284443	25 %	0 %	75 %	0 %	99080118
5766	NC_008044	CTC	2	6	284524	284529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080119
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5768	NC_008044	TCC	2	6	284585	284590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080119
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5770	NC_008044	TCGAGG	2	12	284697	284708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99080119
5771	NC_008044	GC	4	8	284743	284750	0 %	0 %	50 %	50 %	99080119
5772	NC_008044	CA	3	6	284802	284807	50 %	0 %	0 %	50 %	99080119
5773	NC_008044	GCC	2	6	284814	284819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080119
5774	NC_008044	GCC	2	6	284829	284834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080119
5775	NC_008044	TGA	2	6	285104	285109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080120
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5777	NC_008044	TCC	2	6	285169	285174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080120
5778	NC_008044	CAT	2	6	285204	285209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080120
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5780	NC_008044	CGA	2	6	285363	285368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080120
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5782	NC_008044	AAG	2	6	285493	285498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080120
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5784	NC_008044	CGA	2	6	285654	285659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080120
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5789	NC_008044	ACA	2	6	285929	285934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080120
5790	NC_008044	G	6	6	285991	285996	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5791	NC_008044	AGC	2	6	286060	286065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5793	NC_008044	CGC	2	6	286140	286145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080121
5794	NC_008044	TGGC	2	8	286189	286196	0 %	25 %	50 %	25 %	99080121
5795	NC_008044	CGAACA	2	12	286205	286216	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	99080121
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5802	NC_008044	CGAAGA	2	12	286529	286540	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	99080121
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5806	NC_008044	TTGG	2	8	286790	286797	0 %	50 %	50 %	0 %	99080122
5807	NC_008044	GGCAA	3	15	286838	286852	40 %	0 %	40 %	20 %	99080122
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5809	NC_008044	TGC	2	6	286948	286953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080122
5810	NC_008044	TCT	3	9	287001	287009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080122
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5812	NC_008044	ATG	2	6	287118	287123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080122
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5814	NC_008044	TC	3	6	287306	287311	0 %	50 %	0 %	50 %	99080122
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5823	NC_008044	CGG	2	6	287825	287830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080123
5824	NC_008044	CA	3	6	287854	287859	50 %	0 %	0 %	50 %	99080123
5825	NC_008044	AGC	2	6	287860	287865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080123
5826	NC_008044	GCATAA	2	12	287875	287886	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	99080123
5827	NC_008044	G	6	6	287907	287912	0 %	0 %	100 %	0 %	99080123
5828	NC_008044	GC	3	6	287949	287954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5829	NC_008044	GTC	2	6	287993	287998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5830	NC_008044	CG	3	6	288014	288019	0 %	0 %	50 %	50 %	99080124
5831	NC_008044	GCTTT	2	10	288071	288080	0 %	60 %	20 %	20 %	99080124
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5850	NC_008044	C	6	6	288994	288999	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5851	NC_008044	GGC	2	6	289000	289005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5860	NC_008044	T	6	6	289250	289255	0 %	100 %	0 %	0 %	99080125
5861	NC_008044	GTG	2	6	289328	289333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080125
5862	NC_008044	TGC	2	6	289402	289407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080125
5863	NC_008044	GCGGG	2	10	289428	289437	0 %	0 %	80 %	20 %	99080125
5864	NC_008044	CGG	2	6	289467	289472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080125
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5870	NC_008044	CGA	2	6	289714	289719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080125
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5872	NC_008044	GC	3	6	289740	289745	0 %	0 %	50 %	50 %	99080126
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6000	NC_008044	CGG	2	6	295521	295526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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