MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008044	AAG	2	6	248561	248566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080075
5002	NC_008044	CGA	2	6	248572	248577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5003	NC_008044	GCT	2	6	248593	248598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5004	NC_008044	CGTTC	2	10	248599	248608	0 %	40 %	20 %	40 %	99080075
5005	NC_008044	ATC	2	6	248642	248647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080075
5006	NC_008044	GAA	2	6	248651	248656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080075
5007	NC_008044	CGA	2	6	248683	248688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5008	NC_008044	CAT	2	6	248719	248724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080075
5009	NC_008044	GCT	2	6	248743	248748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5010	NC_008044	TCGACA	2	12	248778	248789	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99080075
5011	NC_008044	GCC	2	6	248893	248898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080075
5012	NC_008044	T	6	6	248936	248941	0 %	100 %	0 %	0 %	99080075
5013	NC_008044	AGA	2	6	249037	249042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080075
5014	NC_008044	TCG	2	6	249045	249050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5015	NC_008044	TGG	2	6	249066	249071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080075
5016	NC_008044	GAC	2	6	249098	249103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5017	NC_008044	ACC	2	6	249108	249113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080075
5018	NC_008044	CCG	2	6	249121	249126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080075
5019	NC_008044	GC	3	6	249187	249192	0 %	0 %	50 %	50 %	99080075
5020	NC_008044	GCT	2	6	249263	249268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5021	NC_008044	CTC	2	6	249292	249297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080075
5022	NC_008044	TC	3	6	249358	249363	0 %	50 %	0 %	50 %	99080075
5023	NC_008044	GGT	2	6	249377	249382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080075
5024	NC_008044	GTG	2	6	249548	249553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080075
5025	NC_008044	GGAC	2	8	249556	249563	25 %	0 %	50 %	25 %	99080075
5026	NC_008044	ACG	3	9	249789	249797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5027	NC_008044	GCT	2	6	249844	249849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5028	NC_008044	GC	3	6	249850	249855	0 %	0 %	50 %	50 %	99080075
5029	NC_008044	GC	3	6	249896	249901	0 %	0 %	50 %	50 %	99080075
5030	NC_008044	GCG	2	6	249911	249916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080075
5031	NC_008044	GC	3	6	249928	249933	0 %	0 %	50 %	50 %	99080075
5032	NC_008044	CG	3	6	250234	250239	0 %	0 %	50 %	50 %	99080075
5033	NC_008044	GAC	2	6	250241	250246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5034	NC_008044	CGC	2	6	250282	250287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080075
5035	NC_008044	GAA	2	6	250343	250348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080075
5036	NC_008044	CGA	2	6	250363	250368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
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5038	NC_008044	GAA	2	6	250460	250465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080075
5039	NC_008044	GC	3	6	250474	250479	0 %	0 %	50 %	50 %	99080075
5040	NC_008044	CGTG	2	8	250504	250511	0 %	25 %	50 %	25 %	99080075
5041	NC_008044	TGT	2	6	250549	250554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080075
5042	NC_008044	GAA	2	6	250619	250624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080075
5043	NC_008044	GAC	2	6	250649	250654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5044	NC_008044	CGA	2	6	250759	250764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
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5046	NC_008044	GTG	2	6	250798	250803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080075
5047	NC_008044	TGCT	2	8	250806	250813	0 %	50 %	25 %	25 %	99080075
5048	NC_008044	GAA	2	6	250817	250822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080075
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5053	NC_008044	TC	3	6	251037	251042	0 %	50 %	0 %	50 %	99080075
5054	NC_008044	GTG	2	6	251045	251050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080075
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5056	NC_008044	CGA	2	6	251194	251199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5057	NC_008044	CGC	2	6	251216	251221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080075
5058	NC_008044	GATGC	2	10	251246	251255	20 %	20 %	40 %	20 %	99080075
5059	NC_008044	GCT	2	6	251324	251329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080075
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5062	NC_008044	ACG	2	6	251397	251402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080075
5063	NC_008044	GC	3	6	251410	251415	0 %	0 %	50 %	50 %	99080075
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5071	NC_008044	AAG	2	6	251793	251798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080075
5072	NC_008044	CGGCCT	2	12	251803	251814	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	99080075
5073	NC_008044	GAG	2	6	251843	251848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080075
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5079	NC_008044	CTGA	2	8	252361	252368	25 %	25 %	25 %	25 %	99080076
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5088	NC_008044	GAT	2	6	252621	252626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080076
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5101	NC_008044	GC	3	6	253351	253356	0 %	0 %	50 %	50 %	99080076
5102	NC_008044	TGA	2	6	253361	253366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080076
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5107	NC_008044	CGA	2	6	253578	253583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080076
5108	NC_008044	TGC	2	6	253646	253651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080076
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5110	NC_008044	CTG	2	6	253690	253695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080076
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5112	NC_008044	TCT	2	6	253763	253768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080076
5113	NC_008044	GAC	2	6	253831	253836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080076
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5116	NC_008044	CAG	2	6	253903	253908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080076
5117	NC_008044	ACA	2	6	253943	253948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080076
5118	NC_008044	ATG	2	6	253996	254001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080076
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5120	NC_008044	CGG	2	6	254012	254017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080076
5121	NC_008044	ATG	2	6	254065	254070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080076
5122	NC_008044	CAT	2	6	254154	254159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080076
5123	NC_008044	AAG	2	6	254186	254191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080076
5124	NC_008044	CCAC	2	8	254219	254226	25 %	0 %	0 %	75 %	99080076
5125	NC_008044	CGT	2	6	254287	254292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080076
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5127	NC_008044	GGC	2	6	254424	254429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080076
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5129	NC_008044	CAT	2	6	254643	254648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080076
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5131	NC_008044	CAG	2	6	254728	254733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080076
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5142	NC_008044	AGA	2	6	255224	255229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080076
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5150	NC_008044	CAT	2	6	255516	255521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080076
5151	NC_008044	CAT	2	6	255555	255560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080076
5152	NC_008044	CGA	2	6	255591	255596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080076
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5226	NC_008044	CG	3	6	258887	258892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5227	NC_008044	T	6	6	258960	258965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5246	NC_008044	CGT	2	6	259785	259790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080081
5247	NC_008044	GCTG	2	8	259807	259814	0 %	25 %	50 %	25 %	99080081
5248	NC_008044	GAA	2	6	259851	259856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080081
5249	NC_008044	CTC	2	6	259872	259877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080081
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5251	NC_008044	CAA	2	6	259943	259948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080081
5252	NC_008044	GAC	2	6	260063	260068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080082
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5255	NC_008044	TGGA	2	8	260148	260155	25 %	25 %	50 %	0 %	99080082
5256	NC_008044	GCAGGA	2	12	260156	260167	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	99080082
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5258	NC_008044	CAT	2	6	260261	260266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080082
5259	NC_008044	AAACCG	2	12	260371	260382	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	99080082
5260	NC_008044	CAA	2	6	260429	260434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080082
5261	NC_008044	CTT	2	6	260456	260461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080082
5262	NC_008044	CG	3	6	260499	260504	0 %	0 %	50 %	50 %	99080082
5263	NC_008044	GAA	2	6	260652	260657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080082
5264	NC_008044	GAT	2	6	260669	260674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080082
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5266	NC_008044	CTG	2	6	260760	260765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080082
5267	NC_008044	GGT	2	6	260805	260810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080082
5268	NC_008044	CTT	2	6	260841	260846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080082
5269	NC_008044	CGA	2	6	260912	260917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080082
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5271	NC_008044	GAC	3	9	260949	260957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080082
5272	NC_008044	CCA	2	6	261070	261075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080082
5273	NC_008044	AAGA	2	8	261081	261088	75 %	0 %	25 %	0 %	99080082
5274	NC_008044	ATG	4	12	261102	261113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080082
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5276	NC_008044	GAG	2	6	261129	261134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080082
5277	NC_008044	GAA	2	6	261138	261143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080082
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5280	NC_008044	GGT	2	6	261224	261229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080082
5281	NC_008044	TGC	2	6	261329	261334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080082
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5284	NC_008044	GGT	2	6	261540	261545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080082
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5288	NC_008044	ACG	2	6	261754	261759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080082
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5293	NC_008044	CGT	2	6	261915	261920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080082
5294	NC_008044	CG	3	6	261943	261948	0 %	0 %	50 %	50 %	99080082
5295	NC_008044	CG	3	6	262032	262037	0 %	0 %	50 %	50 %	99080082
5296	NC_008044	GCC	3	9	262136	262144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5297	NC_008044	CTCC	2	8	262149	262156	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5298	NC_008044	AGG	2	6	262167	262172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5299	NC_008044	CAT	2	6	262174	262179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080083
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5305	NC_008044	CTG	2	6	262523	262528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080083
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5315	NC_008044	GCGTG	2	10	262867	262876	0 %	20 %	60 %	20 %	99080083
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5318	NC_008044	GCT	2	6	262960	262965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080083
5319	NC_008044	ACA	2	6	262986	262991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080083
5320	NC_008044	CTG	2	6	263000	263005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080083
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5322	NC_008044	CAC	2	6	263170	263175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080083
5323	NC_008044	GGC	2	6	263306	263311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080083
5324	NC_008044	AG	3	6	263392	263397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5325	NC_008044	T	6	6	263418	263423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5326	NC_008044	GCG	2	6	263600	263605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080084
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5329	NC_008044	TATTG	2	10	263656	263665	20 %	60 %	20 %	0 %	99080084
5330	NC_008044	ATG	2	6	263698	263703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080084
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5332	NC_008044	TG	3	6	263739	263744	0 %	50 %	50 %	0 %	99080084
5333	NC_008044	TGG	2	6	263770	263775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080084
5334	NC_008044	GGC	2	6	263825	263830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080084
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5336	NC_008044	GCG	2	6	263896	263901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080084
5337	NC_008044	TC	3	6	263911	263916	0 %	50 %	0 %	50 %	99080084
5338	NC_008044	GTG	2	6	263973	263978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080084
5339	NC_008044	GGCG	2	8	264046	264053	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5340	NC_008044	GCT	2	6	264112	264117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5341	NC_008044	GC	4	8	264124	264131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5342	NC_008044	AAT	2	6	264177	264182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5343	NC_008044	GAC	2	6	264197	264202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5344	NC_008044	GCG	2	6	264203	264208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5345	NC_008044	AGT	2	6	264258	264263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5346	NC_008044	CAA	2	6	264268	264273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5347	NC_008044	AGA	2	6	264362	264367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5348	NC_008044	CGAGAG	2	12	264384	264395	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5349	NC_008044	CAT	2	6	264399	264404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5350	NC_008044	ATT	2	6	264506	264511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080085
5351	NC_008044	GCA	2	6	264525	264530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080085
5352	NC_008044	GAA	2	6	264611	264616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080085
5353	NC_008044	GCG	2	6	264645	264650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080085
5354	NC_008044	CCA	2	6	264754	264759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5355	NC_008044	TGA	2	6	264894	264899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_008044	CTC	2	6	264909	264914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5357	NC_008044	CA	3	6	265009	265014	50 %	0 %	0 %	50 %	99080086
5358	NC_008044	TCT	2	6	265162	265167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080086
5359	NC_008044	TCG	2	6	265173	265178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080086
5360	NC_008044	TGA	2	6	265206	265211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080086
5361	NC_008044	GCT	2	6	265223	265228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080086
5362	NC_008044	TAT	2	6	265291	265296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080087
5363	NC_008044	A	7	7	265300	265306	100 %	0 %	0 %	0 %	99080087
5364	NC_008044	CCG	2	6	265572	265577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080087
5365	NC_008044	CGG	2	6	265663	265668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080087
5366	NC_008044	TC	3	6	265695	265700	0 %	50 %	0 %	50 %	99080087
5367	NC_008044	AAG	2	6	265757	265762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080087
5368	NC_008044	ACC	2	6	265793	265798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080087
5369	NC_008044	TGGTC	2	10	265834	265843	0 %	40 %	40 %	20 %	99080087
5370	NC_008044	TCA	2	6	265845	265850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080087
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5485	NC_008044	G	6	6	271634	271639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_008044	T	6	6	271641	271646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5487	NC_008044	CGT	2	6	271827	271832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5493	NC_008044	TGC	2	6	272213	272218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5494	NC_008044	AG	3	6	272232	272237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_008044	GCC	2	6	272312	272317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080099
5496	NC_008044	TTG	2	6	272327	272332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080099
5497	NC_008044	CGGG	2	8	272417	272424	0 %	0 %	75 %	25 %	99080099
5498	NC_008044	CAC	2	6	272506	272511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080099
5499	NC_008044	CG	3	6	272623	272628	0 %	0 %	50 %	50 %	99080099
5500	NC_008044	GAA	2	6	272678	272683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080099

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