MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008044	GATC	2	8	225364	225371	25 %	25 %	25 %	25 %	99080048
4502	NC_008044	CCA	2	6	225383	225388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080048
4503	NC_008044	ATG	2	6	225389	225394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080048
4504	NC_008044	CGG	2	6	225446	225451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080048
4505	NC_008044	TC	3	6	225502	225507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_008044	CCA	2	6	225552	225557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_008044	AAG	2	6	225609	225614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_008044	TGA	2	6	225623	225628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080049
4509	NC_008044	CGGG	2	8	225674	225681	0 %	0 %	75 %	25 %	99080049
4510	NC_008044	GC	4	8	225706	225713	0 %	0 %	50 %	50 %	99080049
4511	NC_008044	CCT	2	6	225717	225722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080049
4512	NC_008044	ACC	2	6	225748	225753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080049
4513	NC_008044	AGG	2	6	225779	225784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080049
4514	NC_008044	ATC	2	6	225811	225816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080049
4515	NC_008044	GGC	2	6	225899	225904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080049
4516	NC_008044	GGC	2	6	225958	225963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080049
4517	NC_008044	TGC	2	6	226128	226133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080049
4518	NC_008044	TCT	2	6	226281	226286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080050
4519	NC_008044	A	6	6	226334	226339	100 %	0 %	0 %	0 %	99080050
4520	NC_008044	AGC	2	6	226341	226346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080050
4521	NC_008044	CGA	2	6	226389	226394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080050
4522	NC_008044	GC	3	6	226414	226419	0 %	0 %	50 %	50 %	99080050
4523	NC_008044	TCT	2	6	226478	226483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080050
4524	NC_008044	TTTC	2	8	226519	226526	0 %	75 %	0 %	25 %	99080050
4525	NC_008044	CGA	2	6	226594	226599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080050
4526	NC_008044	CTG	2	6	226643	226648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080050
4527	NC_008044	CTGG	2	8	226681	226688	0 %	25 %	50 %	25 %	99080050
4528	NC_008044	GC	3	6	226733	226738	0 %	0 %	50 %	50 %	99080050
4529	NC_008044	GATGC	2	10	226805	226814	20 %	20 %	40 %	20 %	99080050
4530	NC_008044	CGG	3	9	226881	226889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080050
4531	NC_008044	TGC	2	6	226900	226905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080050
4532	NC_008044	GT	3	6	226970	226975	0 %	50 %	50 %	0 %	99080051
4533	NC_008044	CG	4	8	227131	227138	0 %	0 %	50 %	50 %	99080051
4534	NC_008044	GGCGC	2	10	227163	227172	0 %	0 %	60 %	40 %	99080051
4535	NC_008044	GAC	2	6	227196	227201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080051
4536	NC_008044	CCA	2	6	227228	227233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080051
4537	NC_008044	GC	4	8	227279	227286	0 %	0 %	50 %	50 %	99080051
4538	NC_008044	TTC	2	6	227298	227303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080051
4539	NC_008044	ATG	2	6	227323	227328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080051
4540	NC_008044	AG	3	6	227351	227356	50 %	0 %	50 %	0 %	99080051
4541	NC_008044	GCG	2	6	227398	227403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080051
4542	NC_008044	CAG	2	6	227430	227435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080051
4543	NC_008044	GC	3	6	227503	227508	0 %	0 %	50 %	50 %	99080051
4544	NC_008044	GAG	2	6	227514	227519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080051
4545	NC_008044	GAC	2	6	227552	227557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080051
4546	NC_008044	GC	3	6	227568	227573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_008044	GGT	2	6	227597	227602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_008044	GACA	2	8	227645	227652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_008044	GC	3	6	227732	227737	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4550	NC_008044	TGC	2	6	227749	227754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080052
4551	NC_008044	GTGC	2	8	227888	227895	0 %	25 %	50 %	25 %	99080052
4552	NC_008044	CCG	2	6	227915	227920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080052
4553	NC_008044	GC	3	6	228002	228007	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4554	NC_008044	GGT	2	6	228095	228100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080052
4555	NC_008044	G	6	6	228131	228136	0 %	0 %	100 %	0 %	99080052
4556	NC_008044	GAA	2	6	228240	228245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080052
4557	NC_008044	CGG	2	6	228275	228280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080052
4558	NC_008044	GCG	2	6	228306	228311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080052
4559	NC_008044	GCC	2	6	228318	228323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080052
4560	NC_008044	CG	3	6	228325	228330	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4561	NC_008044	ATC	2	6	228351	228356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080052
4562	NC_008044	CG	3	6	228447	228452	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4563	NC_008044	GC	3	6	228476	228481	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4564	NC_008044	CTG	2	6	228531	228536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080052
4565	NC_008044	GCC	2	6	228571	228576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_008044	GCG	2	6	228593	228598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_008044	CGG	2	6	228623	228628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080053
4568	NC_008044	GCT	2	6	228743	228748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080053
4569	NC_008044	CGG	2	6	228755	228760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080053
4570	NC_008044	GTC	2	6	228975	228980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080053
4571	NC_008044	CGG	2	6	228996	229001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080053
4572	NC_008044	CGG	2	6	229043	229048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080053
4573	NC_008044	GA	3	6	229079	229084	50 %	0 %	50 %	0 %	99080053
4574	NC_008044	G	6	6	229091	229096	0 %	0 %	100 %	0 %	99080053
4575	NC_008044	ATG	2	6	229105	229110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080053
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4577	NC_008044	GAA	2	6	229252	229257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080054
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4579	NC_008044	AGC	2	6	229331	229336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080054
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4582	NC_008044	GCG	2	6	229422	229427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080054
4583	NC_008044	GAG	2	6	229432	229437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080054
4584	NC_008044	CG	3	6	229460	229465	0 %	0 %	50 %	50 %	99080054
4585	NC_008044	TGA	2	6	229544	229549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080054
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4588	NC_008044	AGG	2	6	229691	229696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080054
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4590	NC_008044	GAT	2	6	229798	229803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080054
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4592	NC_008044	GCG	2	6	229942	229947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080054
4593	NC_008044	GC	3	6	229975	229980	0 %	0 %	50 %	50 %	99080054
4594	NC_008044	GC	3	6	230039	230044	0 %	0 %	50 %	50 %	99080054
4595	NC_008044	GTC	2	6	230065	230070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080054
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4600	NC_008044	CCGC	2	8	230395	230402	0 %	0 %	25 %	75 %	99080055
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4604	NC_008044	GCC	3	9	230608	230616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080055
4605	NC_008044	CCG	2	6	230676	230681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080055
4606	NC_008044	A	6	6	230693	230698	100 %	0 %	0 %	0 %	99080055
4607	NC_008044	GTT	2	6	230728	230733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080055
4608	NC_008044	T	6	6	230968	230973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_008044	AGC	2	6	230989	230994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_008044	GCC	2	6	231075	231080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_008044	TGA	2	6	231107	231112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080056
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4613	NC_008044	CGG	2	6	231143	231148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080056
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4617	NC_008044	GCA	2	6	231260	231265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080056
4618	NC_008044	GC	3	6	231277	231282	0 %	0 %	50 %	50 %	99080056
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4622	NC_008044	ACTG	2	8	231483	231490	25 %	25 %	25 %	25 %	99080056
4623	NC_008044	CG	4	8	231528	231535	0 %	0 %	50 %	50 %	99080056
4624	NC_008044	AGC	2	6	231536	231541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080056
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4626	NC_008044	CGG	3	9	231558	231566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080056
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4628	NC_008044	A	6	6	231647	231652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4749	NC_008044	CAG	2	6	237489	237494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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