MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 2342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008043	CG	4	8	1000	1007	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
2	NC_008043	CG	3	6	1052	1057	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
3	NC_008043	CT	3	6	1373	1378	0 %	50 %	0 %	50 %	99078011
4	NC_008043	GC	3	6	1461	1466	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
5	NC_008043	GC	3	6	1500	1505	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
6	NC_008043	GC	3	6	1706	1711	0 %	0 %	50 %	50 %	99078011
7	NC_008043	GC	3	6	1937	1942	0 %	0 %	50 %	50 %	99078012
8	NC_008043	GA	3	6	2002	2007	50 %	0 %	50 %	0 %	99078012
9	NC_008043	AG	3	6	2578	2583	50 %	0 %	50 %	0 %	99078012
10	NC_008043	CG	3	6	3041	3046	0 %	0 %	50 %	50 %	99078013
11	NC_008043	CG	3	6	3585	3590	0 %	0 %	50 %	50 %	99078014
12	NC_008043	CT	3	6	3716	3721	0 %	50 %	0 %	50 %	99078014
13	NC_008043	GC	3	6	3891	3896	0 %	0 %	50 %	50 %	99078014
14	NC_008043	GC	3	6	4107	4112	0 %	0 %	50 %	50 %	99078014
15	NC_008043	GC	3	6	4320	4325	0 %	0 %	50 %	50 %	99078014
16	NC_008043	TC	3	6	4476	4481	0 %	50 %	0 %	50 %	99078015
17	NC_008043	TG	3	6	4499	4504	0 %	50 %	50 %	0 %	99078015
18	NC_008043	GC	3	6	4524	4529	0 %	0 %	50 %	50 %	99078015
19	NC_008043	GC	3	6	4582	4587	0 %	0 %	50 %	50 %	99078015
20	NC_008043	GC	3	6	4778	4783	0 %	0 %	50 %	50 %	99078015
21	NC_008043	CG	3	6	4843	4848	0 %	0 %	50 %	50 %	99078015
22	NC_008043	TC	4	8	5302	5309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008043	GT	3	6	5339	5344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008043	GC	3	6	5627	5632	0 %	0 %	50 %	50 %	99078016
25	NC_008043	GC	3	6	5729	5734	0 %	0 %	50 %	50 %	99078016
26	NC_008043	GC	3	6	5993	5998	0 %	0 %	50 %	50 %	99078016
27	NC_008043	GC	3	6	6261	6266	0 %	0 %	50 %	50 %	99078017
28	NC_008043	CT	3	6	6655	6660	0 %	50 %	0 %	50 %	99078017
29	NC_008043	CG	3	6	7303	7308	0 %	0 %	50 %	50 %	99078018
30	NC_008043	GC	3	6	7815	7820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008043	GC	3	6	8942	8947	0 %	0 %	50 %	50 %	99078019
32	NC_008043	GC	3	6	9039	9044	0 %	0 %	50 %	50 %	99078019
33	NC_008043	GC	3	6	10838	10843	0 %	0 %	50 %	50 %	99078019
34	NC_008043	GC	3	6	10889	10894	0 %	0 %	50 %	50 %	99078019
35	NC_008043	CG	3	6	11261	11266	0 %	0 %	50 %	50 %	99078020
36	NC_008043	CG	3	6	11432	11437	0 %	0 %	50 %	50 %	99078020
37	NC_008043	GC	3	6	12350	12355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008043	CG	3	6	12430	12435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008043	CG	3	6	12706	12711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008043	CA	3	6	13035	13040	50 %	0 %	0 %	50 %	99078021
41	NC_008043	CG	3	6	13198	13203	0 %	0 %	50 %	50 %	99078021
42	NC_008043	CT	3	6	13515	13520	0 %	50 %	0 %	50 %	99078022
43	NC_008043	CG	3	6	14095	14100	0 %	0 %	50 %	50 %	99078022
44	NC_008043	GC	3	6	14275	14280	0 %	0 %	50 %	50 %	99078022
45	NC_008043	GC	3	6	14541	14546	0 %	0 %	50 %	50 %	99078022
46	NC_008043	CT	3	6	14643	14648	0 %	50 %	0 %	50 %	99078023
47	NC_008043	CG	3	6	14960	14965	0 %	0 %	50 %	50 %	99078023
48	NC_008043	GC	3	6	15513	15518	0 %	0 %	50 %	50 %	99078024
49	NC_008043	CG	5	10	15658	15667	0 %	0 %	50 %	50 %	99078024
50	NC_008043	CG	3	6	15714	15719	0 %	0 %	50 %	50 %	99078024
51	NC_008043	GC	3	6	15971	15976	0 %	0 %	50 %	50 %	99078025
52	NC_008043	CG	3	6	16307	16312	0 %	0 %	50 %	50 %	99078025
53	NC_008043	CG	3	6	16341	16346	0 %	0 %	50 %	50 %	99078025
54	NC_008043	GC	3	6	16796	16801	0 %	0 %	50 %	50 %	99078025
55	NC_008043	AG	3	6	16882	16887	50 %	0 %	50 %	0 %	99078025
56	NC_008043	GC	3	6	17267	17272	0 %	0 %	50 %	50 %	99078026
57	NC_008043	GC	3	6	17706	17711	0 %	0 %	50 %	50 %	99078027
58	NC_008043	TG	3	6	18450	18455	0 %	50 %	50 %	0 %	99078027
59	NC_008043	CG	3	6	18929	18934	0 %	0 %	50 %	50 %	99078027
60	NC_008043	CT	3	6	19217	19222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008043	GC	3	6	19416	19421	0 %	0 %	50 %	50 %	99078028
62	NC_008043	TG	3	6	19479	19484	0 %	50 %	50 %	0 %	99078028
63	NC_008043	GC	3	6	20044	20049	0 %	0 %	50 %	50 %	99078028
64	NC_008043	CG	3	6	20483	20488	0 %	0 %	50 %	50 %	99078029
65	NC_008043	CG	3	6	20590	20595	0 %	0 %	50 %	50 %	99078029
66	NC_008043	GC	3	6	21248	21253	0 %	0 %	50 %	50 %	99078029
67	NC_008043	GC	3	6	21389	21394	0 %	0 %	50 %	50 %	99078029
68	NC_008043	GC	3	6	21746	21751	0 %	0 %	50 %	50 %	99078030
69	NC_008043	CG	3	6	22159	22164	0 %	0 %	50 %	50 %	99078030
70	NC_008043	CG	3	6	22295	22300	0 %	0 %	50 %	50 %	99078030
71	NC_008043	CG	4	8	22519	22526	0 %	0 %	50 %	50 %	99078030
72	NC_008043	GC	3	6	22919	22924	0 %	0 %	50 %	50 %	99078031
73	NC_008043	AC	3	6	23240	23245	50 %	0 %	0 %	50 %	99078031
74	NC_008043	CG	3	6	23280	23285	0 %	0 %	50 %	50 %	99078031
75	NC_008043	GC	4	8	23349	23356	0 %	0 %	50 %	50 %	99078031
76	NC_008043	CG	3	6	23508	23513	0 %	0 %	50 %	50 %	99078031
77	NC_008043	AG	3	6	24411	24416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008043	TA	3	6	24456	24461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008043	CG	3	6	24935	24940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008043	CG	3	6	25173	25178	0 %	0 %	50 %	50 %	99078034
81	NC_008043	GC	3	6	25330	25335	0 %	0 %	50 %	50 %	99078035
82	NC_008043	CG	3	6	26051	26056	0 %	0 %	50 %	50 %	99078036
83	NC_008043	GC	3	6	26440	26445	0 %	0 %	50 %	50 %	99078036
84	NC_008043	CG	3	6	26923	26928	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
85	NC_008043	GC	3	6	27186	27191	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
86	NC_008043	GC	4	8	27451	27458	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
87	NC_008043	GC	3	6	27873	27878	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
88	NC_008043	CT	3	6	28524	28529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008043	CG	3	6	28779	28784	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
90	NC_008043	GC	3	6	29204	29209	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
91	NC_008043	CG	4	8	29371	29378	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
92	NC_008043	CG	3	6	29668	29673	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
93	NC_008043	TG	3	6	29732	29737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008043	GC	4	8	30019	30026	0 %	0 %	50 %	50 %	99078039
95	NC_008043	GC	3	6	30482	30487	0 %	0 %	50 %	50 %	99078039
96	NC_008043	GC	4	8	30660	30667	0 %	0 %	50 %	50 %	99078040
97	NC_008043	CG	3	6	30873	30878	0 %	0 %	50 %	50 %	99078040
98	NC_008043	CA	3	6	30935	30940	50 %	0 %	0 %	50 %	99078040
99	NC_008043	GC	3	6	31250	31255	0 %	0 %	50 %	50 %	99078041
100	NC_008043	CG	4	8	31462	31469	0 %	0 %	50 %	50 %	99078041
101	NC_008043	GC	5	10	31651	31660	0 %	0 %	50 %	50 %	99078041
102	NC_008043	CG	3	6	32361	32366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008043	GC	3	6	32667	32672	0 %	0 %	50 %	50 %	99078043
104	NC_008043	CG	3	6	32839	32844	0 %	0 %	50 %	50 %	99078043
105	NC_008043	GC	4	8	32987	32994	0 %	0 %	50 %	50 %	99078043
106	NC_008043	GC	4	8	33355	33362	0 %	0 %	50 %	50 %	99078043
107	NC_008043	GC	3	6	33920	33925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008043	GC	3	6	34239	34244	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
109	NC_008043	GC	4	8	34282	34289	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
110	NC_008043	GC	3	6	34362	34367	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
111	NC_008043	GC	4	8	36324	36331	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
112	NC_008043	CT	3	6	36541	36546	0 %	50 %	0 %	50 %	99078044
113	NC_008043	CT	3	6	36574	36579	0 %	50 %	0 %	50 %	99078044
114	NC_008043	GC	3	6	36583	36588	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
115	NC_008043	CG	3	6	37056	37061	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
116	NC_008043	GC	3	6	37122	37127	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
117	NC_008043	GC	3	6	37257	37262	0 %	0 %	50 %	50 %	99078044
118	NC_008043	GC	3	6	37366	37371	0 %	0 %	50 %	50 %	99078045
119	NC_008043	GC	3	6	38310	38315	0 %	0 %	50 %	50 %	99078046
120	NC_008043	GC	3	6	38486	38491	0 %	0 %	50 %	50 %	99078046
121	NC_008043	AG	3	6	38738	38743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008043	AT	3	6	39127	39132	50 %	50 %	0 %	0 %	99078047
123	NC_008043	GC	3	6	40198	40203	0 %	0 %	50 %	50 %	99078048
124	NC_008043	GC	3	6	40265	40270	0 %	0 %	50 %	50 %	99078048
125	NC_008043	GC	3	6	40664	40669	0 %	0 %	50 %	50 %	99078048
126	NC_008043	GC	4	8	40739	40746	0 %	0 %	50 %	50 %	99078049
127	NC_008043	GC	3	6	40814	40819	0 %	0 %	50 %	50 %	99078049
128	NC_008043	GC	3	6	40998	41003	0 %	0 %	50 %	50 %	99078049
129	NC_008043	GC	3	6	41245	41250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008043	TG	3	6	41267	41272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008043	GC	4	8	41713	41720	0 %	0 %	50 %	50 %	99078050
132	NC_008043	CG	3	6	41871	41876	0 %	0 %	50 %	50 %	99078050
133	NC_008043	CT	3	6	41936	41941	0 %	50 %	0 %	50 %	99078050
134	NC_008043	CG	5	10	42088	42097	0 %	0 %	50 %	50 %	99078050
135	NC_008043	CA	3	6	42299	42304	50 %	0 %	0 %	50 %	99078050
136	NC_008043	TC	3	6	43173	43178	0 %	50 %	0 %	50 %	99078051
137	NC_008043	AC	3	6	43442	43447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008043	GC	3	6	44089	44094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008043	CT	3	6	44410	44415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008043	GC	4	8	44744	44751	0 %	0 %	50 %	50 %	99078054
141	NC_008043	AT	3	6	45134	45139	50 %	50 %	0 %	0 %	99078054
142	NC_008043	CG	3	6	45439	45444	0 %	0 %	50 %	50 %	99078054
143	NC_008043	CG	3	6	45867	45872	0 %	0 %	50 %	50 %	99078054
144	NC_008043	GC	3	6	46012	46017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008043	GC	3	6	46267	46272	0 %	0 %	50 %	50 %	99078055
146	NC_008043	CG	3	6	46307	46312	0 %	0 %	50 %	50 %	99078055
147	NC_008043	GC	3	6	46410	46415	0 %	0 %	50 %	50 %	99078055
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