MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008043	AG	3	6	198662	198667	50 %	0 %	50 %	0 %	99078181
4002	NC_008043	T	6	6	198684	198689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008043	GTGA	2	8	198715	198722	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008043	TGT	2	6	198746	198751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078182
4005	NC_008043	GCCGG	2	10	198780	198789	0 %	0 %	60 %	40 %	99078182
4006	NC_008043	GTTGG	2	10	198865	198874	0 %	40 %	60 %	0 %	99078182
4007	NC_008043	TGC	2	6	198984	198989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078182
4008	NC_008043	CGG	2	6	199087	199092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078182
4009	NC_008043	CAC	2	6	199097	199102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078182
4010	NC_008043	GCA	2	6	199168	199173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078182
4011	NC_008043	T	6	6	199241	199246	0 %	100 %	0 %	0 %	99078182
4012	NC_008043	GGC	2	6	199263	199268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078182
4013	NC_008043	AGAA	2	8	199340	199347	75 %	0 %	25 %	0 %	99078182
4014	NC_008043	TC	3	6	199355	199360	0 %	50 %	0 %	50 %	99078182
4015	NC_008043	GAA	2	6	199446	199451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078182
4016	NC_008043	GCCAA	2	10	199479	199488	40 %	0 %	20 %	40 %	99078182
4017	NC_008043	TGA	2	6	199623	199628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078183
4018	NC_008043	TCA	2	6	199643	199648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078183
4019	NC_008043	GA	3	6	199650	199655	50 %	0 %	50 %	0 %	99078183
4020	NC_008043	GT	3	6	199701	199706	0 %	50 %	50 %	0 %	99078183
4021	NC_008043	GAT	2	6	199732	199737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078183
4022	NC_008043	CAA	2	6	199756	199761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078183
4023	NC_008043	CAC	2	6	199795	199800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078183
4024	NC_008043	TCA	2	6	199881	199886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078183
4025	NC_008043	CATC	2	8	199896	199903	25 %	25 %	0 %	50 %	99078183
4026	NC_008043	CTG	2	6	200011	200016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078183
4027	NC_008043	CCT	2	6	200028	200033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078183
4028	NC_008043	ATTGC	2	10	200061	200070	20 %	40 %	20 %	20 %	99078183
4029	NC_008043	GGC	2	6	200111	200116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078184
4030	NC_008043	GAT	2	6	200117	200122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078184
4031	NC_008043	TCG	2	6	200167	200172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078184
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4033	NC_008043	TCA	2	6	200247	200252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078184
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4035	NC_008043	GGC	2	6	200307	200312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078184
4036	NC_008043	GC	3	6	200341	200346	0 %	0 %	50 %	50 %	99078184
4037	NC_008043	CAG	2	6	200387	200392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078184
4038	NC_008043	TCA	2	6	200424	200429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078184
4039	NC_008043	GAT	2	6	200447	200452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078184
4040	NC_008043	CGAC	2	8	200485	200492	25 %	0 %	25 %	50 %	99078184
4041	NC_008043	ACC	2	6	200493	200498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078184
4042	NC_008043	GAT	2	6	200531	200536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078184
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4045	NC_008043	GTCAG	2	10	200706	200715	20 %	20 %	40 %	20 %	99078184
4046	NC_008043	GCT	2	6	200862	200867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078184
4047	NC_008043	GC	3	6	201067	201072	0 %	0 %	50 %	50 %	99078184
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4049	NC_008043	CTG	2	6	201173	201178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078184
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4052	NC_008043	CT	3	6	201291	201296	0 %	50 %	0 %	50 %	99078184
4053	NC_008043	CGT	2	6	201320	201325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078184
4054	NC_008043	GCG	2	6	201420	201425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078184
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4056	NC_008043	CA	3	6	201487	201492	50 %	0 %	0 %	50 %	99078184
4057	NC_008043	GGTCAG	2	12	201545	201556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99078184
4058	NC_008043	GTC	2	6	201575	201580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078184
4059	NC_008043	AAC	2	6	201623	201628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078184
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4082	NC_008043	GTC	2	6	202533	202538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078185
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4085	NC_008043	TGC	2	6	202729	202734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078186
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4089	NC_008043	GC	3	6	202973	202978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_008043	CCT	2	6	203036	203041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_008043	CG	3	6	203042	203047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_008043	TGA	2	6	203124	203129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008043	GA	4	8	203128	203135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_008043	CT	3	6	203200	203205	0 %	50 %	0 %	50 %	99078187
4095	NC_008043	GCT	2	6	203253	203258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078187
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4097	NC_008043	ATCG	2	8	203337	203344	25 %	25 %	25 %	25 %	99078187
4098	NC_008043	GC	3	6	203388	203393	0 %	0 %	50 %	50 %	99078187
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4107	NC_008043	GAC	2	6	203692	203697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078187
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4109	NC_008043	CGC	2	6	203742	203747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078187
4110	NC_008043	TCG	2	6	203855	203860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078187
4111	NC_008043	CAG	2	6	203862	203867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078187
4112	NC_008043	TGGT	2	8	203876	203883	0 %	50 %	50 %	0 %	99078187
4113	NC_008043	GAGT	2	8	203948	203955	25 %	25 %	50 %	0 %	99078187
4114	NC_008043	TGT	2	6	203967	203972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078187
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4118	NC_008043	GCGG	2	8	204057	204064	0 %	0 %	75 %	25 %	99078187
4119	NC_008043	CGT	2	6	204117	204122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078187
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4121	NC_008043	CGA	2	6	204186	204191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078187
4122	NC_008043	TGG	2	6	204274	204279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078187
4123	NC_008043	GC	4	8	204317	204324	0 %	0 %	50 %	50 %	99078187
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4125	NC_008043	GC	3	6	204435	204440	0 %	0 %	50 %	50 %	99078187
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4251	NC_008043	CGA	2	6	210703	210708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078193
4252	NC_008043	TGG	2	6	210758	210763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078193
4253	NC_008043	GAA	2	6	210798	210803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078193
4254	NC_008043	CTT	2	6	210809	210814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078193
4255	NC_008043	GCCGA	2	10	210856	210865	20 %	0 %	40 %	40 %	99078193
4256	NC_008043	AGA	2	6	210932	210937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078193
4257	NC_008043	GCA	2	6	210968	210973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078193
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4261	NC_008043	CGT	2	6	211188	211193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078193
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4263	NC_008043	GCAG	2	8	211222	211229	25 %	0 %	50 %	25 %	99078193
4264	NC_008043	CAG	2	6	211266	211271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078193
4265	NC_008043	CATG	2	8	211276	211283	25 %	25 %	25 %	25 %	99078193
4266	NC_008043	CTT	2	6	211291	211296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078193
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4269	NC_008043	CG	3	6	211350	211355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4270	NC_008043	CTT	2	6	211409	211414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078194
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4275	NC_008043	CCG	2	6	211735	211740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078194
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4297	NC_008043	CTC	2	6	212694	212699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4298	NC_008043	CG	3	6	212786	212791	0 %	0 %	50 %	50 %	99078195
4299	NC_008043	CG	3	6	212813	212818	0 %	0 %	50 %	50 %	99078195
4300	NC_008043	CGC	2	6	212922	212927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078195
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4312	NC_008043	GCCC	2	8	213377	213384	0 %	0 %	25 %	75 %	99078195
4313	NC_008043	TGC	2	6	213398	213403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078195
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4322	NC_008043	CGC	2	6	214012	214017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4358	NC_008043	CTG	2	6	216542	216547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4359	NC_008043	TCC	3	9	216572	216580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4360	NC_008043	TCCG	2	8	216657	216664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4361	NC_008043	GTT	2	6	216736	216741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4362	NC_008043	CATG	2	8	216781	216788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4363	NC_008043	GC	3	6	216847	216852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4364	NC_008043	GGA	2	6	216954	216959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_008043	A	6	6	216967	216972	100 %	0 %	0 %	0 %	99078198
4366	NC_008043	CTTTGC	2	12	217005	217016	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	99078198
4367	NC_008043	CGC	2	6	217063	217068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078198
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4370	NC_008043	ACC	2	6	217328	217333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078198
4371	NC_008043	GCT	2	6	217371	217376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078198
4372	NC_008043	CAATA	2	10	217396	217405	60 %	20 %	0 %	20 %	99078198
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4374	NC_008043	TGA	2	6	217428	217433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078198
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4500	NC_008043	GGC	2	6	223991	223996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078203

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