MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008043	GGA	2	6	172587	172592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078165
3502	NC_008043	GA	3	6	172608	172613	50 %	0 %	50 %	0 %	99078165
3503	NC_008043	ACG	2	6	172633	172638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078165
3504	NC_008043	TG	3	6	172641	172646	0 %	50 %	50 %	0 %	99078165
3505	NC_008043	TGC	2	6	172723	172728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078165
3506	NC_008043	CGGG	2	8	172747	172754	0 %	0 %	75 %	25 %	99078165
3507	NC_008043	TTCG	2	8	172820	172827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_008043	TGTC	2	8	172923	172930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_008043	CACGT	2	10	172981	172990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3510	NC_008043	TGT	2	6	173042	173047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_008043	ATTTG	2	10	173056	173065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_008043	GCT	2	6	173125	173130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_008043	GTT	2	6	173140	173145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_008043	TGTTT	2	10	173146	173155	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008043	T	7	7	173153	173159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_008043	AG	3	6	173164	173169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_008043	ATTT	2	8	173171	173178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008043	TTA	2	6	173185	173190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_008043	CCA	2	6	173299	173304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_008043	ATGT	2	8	173413	173420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_008043	TGA	2	6	173450	173455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_008043	TCA	3	9	173459	173467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_008043	GTTTT	2	10	173507	173516	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008043	GATCA	2	10	173547	173556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3525	NC_008043	TGC	2	6	173595	173600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_008043	GTG	2	6	173624	173629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_008043	G	6	6	173664	173669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_008043	CCA	2	6	173747	173752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_008043	CTC	2	6	173791	173796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_008043	ACG	2	6	173840	173845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_008043	GATGA	2	10	173916	173925	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_008043	ACC	2	6	174035	174040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_008043	CAGG	2	8	174091	174098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_008043	CG	3	6	174150	174155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_008043	AGG	2	6	174171	174176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_008043	GGT	2	6	174258	174263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_008043	ACC	2	6	174311	174316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_008043	GTA	2	6	174355	174360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_008043	CAATT	2	10	174413	174422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3540	NC_008043	GCC	2	6	174528	174533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_008043	CCT	2	6	174566	174571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_008043	CGT	2	6	174610	174615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_008043	TAA	2	6	174644	174649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_008043	CCT	2	6	174704	174709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_008043	TC	3	6	174756	174761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_008043	GCCC	2	8	174847	174854	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3547	NC_008043	AAC	2	6	174870	174875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_008043	TCC	2	6	174893	174898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_008043	TC	3	6	175017	175022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_008043	TCA	2	6	175045	175050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_008043	TC	3	6	175064	175069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_008043	TCC	2	6	175110	175115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_008043	AGG	2	6	175135	175140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_008043	TCGGCT	2	12	175190	175201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_008043	CGC	2	6	175227	175232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_008043	GCT	2	6	175282	175287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_008043	CCT	2	6	175298	175303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_008043	GTT	2	6	175305	175310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_008043	GTT	2	6	175372	175377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_008043	GT	3	6	175409	175414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_008043	C	6	6	175497	175502	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3562	NC_008043	TCG	2	6	175865	175870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_008043	GGT	2	6	175940	175945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_008043	TCA	2	6	176061	176066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_008043	TCGC	2	8	176085	176092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_008043	CTA	2	6	176095	176100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_008043	TCC	2	6	176124	176129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_008043	TAA	2	6	176186	176191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_008043	AGC	2	6	176214	176219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_008043	TAT	2	6	176232	176237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008043	CCA	2	6	176355	176360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_008043	TGATC	2	10	176378	176387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3573	NC_008043	CTT	2	6	176549	176554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_008043	GAAGA	2	10	176578	176587	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_008043	ACTTG	2	10	176624	176633	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3576	NC_008043	ACT	2	6	176638	176643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_008043	GGA	2	6	176750	176755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_008043	GTT	2	6	176764	176769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_008043	TC	3	6	176776	176781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_008043	ACC	2	6	176836	176841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_008043	CG	3	6	176842	176847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_008043	TGG	2	6	176932	176937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_008043	AGG	2	6	176943	176948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_008043	CCT	2	6	176962	176967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_008043	TGAC	2	8	177055	177062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_008043	TAA	2	6	177067	177072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_008043	TGG	2	6	177073	177078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_008043	GAG	2	6	177082	177087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_008043	ACC	2	6	177130	177135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_008043	CAGA	2	8	177149	177156	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_008043	TGATG	2	10	177206	177215	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_008043	TTTG	2	8	177219	177226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_008043	TCT	2	6	177231	177236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3598	NC_008043	C	6	6	177374	177379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3599	NC_008043	CGT	2	6	177394	177399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3601	NC_008043	T	6	6	177541	177546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008043	GT	3	6	177580	177585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008043	TCC	2	6	177631	177636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_008043	CTG	2	6	177676	177681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_008043	CACGA	2	10	177731	177740	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3606	NC_008043	GAC	2	6	177744	177749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_008043	GCA	2	6	177756	177761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_008043	TC	3	6	177794	177799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_008043	GT	3	6	177949	177954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_008043	CGA	2	6	177974	177979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3612	NC_008043	TCC	2	6	178094	178099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_008043	CT	3	6	178143	178148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_008043	CG	3	6	178228	178233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_008043	AAC	2	6	178254	178259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_008043	GCT	2	6	178284	178289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_008043	ATC	2	6	178332	178337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_008043	TCA	2	6	178370	178375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_008043	CTG	2	6	178427	178432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_008043	ATC	2	6	178477	178482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3622	NC_008043	CCG	2	6	178662	178667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_008043	GCC	2	6	178709	178714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_008043	CGTT	2	8	178717	178724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_008043	AGC	2	6	178754	178759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_008043	GCT	2	6	178764	178769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_008043	AATCC	2	10	178815	178824	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3628	NC_008043	ATT	2	6	178880	178885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_008043	CTGT	2	8	178888	178895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_008043	ATC	2	6	178951	178956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_008043	CAA	2	6	179039	179044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_008043	TC	3	6	179133	179138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3633	NC_008043	CAG	2	6	179169	179174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3635	NC_008043	GCC	2	6	179205	179210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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