MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008043	CA	3	6	808348	808353	50 %	0 %	0 %	50 %	99078721
16002	NC_008043	ACG	2	6	808383	808388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078721
16003	NC_008043	TGA	2	6	808412	808417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078721
16004	NC_008043	CCCG	2	8	808449	808456	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16005	NC_008043	GCA	2	6	808495	808500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_008043	GC	3	6	808557	808562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16007	NC_008043	GC	3	6	808570	808575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16008	NC_008043	GTG	2	6	808594	808599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_008043	TGC	2	6	808610	808615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_008043	CGG	2	6	808622	808627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16011	NC_008043	CATC	2	8	808701	808708	25 %	25 %	0 %	50 %	99078722
16012	NC_008043	GC	5	10	808807	808816	0 %	0 %	50 %	50 %	99078722
16013	NC_008043	CGC	2	6	808826	808831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078722
16014	NC_008043	TTTC	2	8	808837	808844	0 %	75 %	0 %	25 %	99078722
16015	NC_008043	GCCC	2	8	808891	808898	0 %	0 %	25 %	75 %	99078722
16016	NC_008043	GGC	2	6	808948	808953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078722
16017	NC_008043	CGC	2	6	809103	809108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078722
16018	NC_008043	GCC	2	6	809138	809143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078722
16019	NC_008043	GCT	2	6	809153	809158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078722
16020	NC_008043	ATC	2	6	809173	809178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078722
16021	NC_008043	CTG	2	6	809215	809220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078722
16022	NC_008043	CG	3	6	809270	809275	0 %	0 %	50 %	50 %	99078722
16023	NC_008043	CAC	2	6	809338	809343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078722
16024	NC_008043	TCT	2	6	809513	809518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078722
16025	NC_008043	ACG	2	6	809525	809530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078722
16026	NC_008043	TCC	2	6	809596	809601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078722
16027	NC_008043	GCG	2	6	809618	809623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078722
16028	NC_008043	CCT	2	6	809628	809633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078722
16029	NC_008043	CCG	2	6	809691	809696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078722
16030	NC_008043	CCG	2	6	809781	809786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078722
16031	NC_008043	GCA	2	6	809811	809816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078722
16032	NC_008043	GGCAA	2	10	809858	809867	40 %	0 %	40 %	20 %	99078722
16033	NC_008043	GCG	2	6	809886	809891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078722
16034	NC_008043	GGGTCA	2	12	809892	809903	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99078722
16035	NC_008043	CAATG	2	10	809940	809949	40 %	20 %	20 %	20 %	99078723
16036	NC_008043	GTGA	2	8	810067	810074	25 %	25 %	50 %	0 %	99078723
16037	NC_008043	G	6	6	810137	810142	0 %	0 %	100 %	0 %	99078723
16038	NC_008043	CGC	2	6	810151	810156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078723
16039	NC_008043	CAT	2	6	810180	810185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078723
16040	NC_008043	CCGA	2	8	810196	810203	25 %	0 %	25 %	50 %	99078723
16041	NC_008043	CAG	2	6	810223	810228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078723
16042	NC_008043	GCG	2	6	810297	810302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078723
16043	NC_008043	GCCCT	2	10	810354	810363	0 %	20 %	20 %	60 %	99078723
16044	NC_008043	GTT	2	6	810408	810413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078723
16045	NC_008043	CA	3	6	810645	810650	50 %	0 %	0 %	50 %	99078723
16046	NC_008043	GCC	2	6	810693	810698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078723
16047	NC_008043	GCG	2	6	810814	810819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078724
16048	NC_008043	GTC	2	6	810848	810853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078724
16049	NC_008043	TGGGG	2	10	810901	810910	0 %	20 %	80 %	0 %	99078724
16050	NC_008043	AGGG	2	8	810975	810982	25 %	0 %	75 %	0 %	99078724
16051	NC_008043	TCA	2	6	810984	810989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078724
16052	NC_008043	ATG	2	6	811008	811013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078724
16053	NC_008043	CG	3	6	811058	811063	0 %	0 %	50 %	50 %	99078724
16054	NC_008043	GTCG	2	8	811076	811083	0 %	25 %	50 %	25 %	99078724
16055	NC_008043	CTGG	2	8	811084	811091	0 %	25 %	50 %	25 %	99078724
16056	NC_008043	CG	3	6	811143	811148	0 %	0 %	50 %	50 %	99078724
16057	NC_008043	GTT	2	6	811190	811195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078724
16058	NC_008043	TCA	2	6	811222	811227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078724
16059	NC_008043	CGT	2	6	811317	811322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078725
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16062	NC_008043	TCG	2	6	811379	811384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078725
16063	NC_008043	C	6	6	811439	811444	0 %	0 %	0 %	100 %	99078725
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16070	NC_008043	ACC	2	6	811825	811830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078725
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16084	NC_008043	CG	3	6	812364	812369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16085	NC_008043	GC	3	6	812394	812399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16089	NC_008043	CAGA	2	8	812500	812507	50 %	0 %	25 %	25 %	99078727
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16091	NC_008043	CAT	2	6	812614	812619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078727
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16094	NC_008043	GCC	3	9	812681	812689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078727
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16097	NC_008043	CAT	2	6	812908	812913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078727
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16099	NC_008043	CAC	3	9	813001	813009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078727
16100	NC_008043	CGT	2	6	813048	813053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078727
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16102	NC_008043	CTC	2	6	813169	813174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078727
16103	NC_008043	ACC	2	6	813176	813181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078727
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16105	NC_008043	GC	3	6	813399	813404	0 %	0 %	50 %	50 %	99078728
16106	NC_008043	GGCTC	2	10	813512	813521	0 %	20 %	40 %	40 %	99078728
16107	NC_008043	AC	3	6	813550	813555	50 %	0 %	0 %	50 %	99078728
16108	NC_008043	C	6	6	813645	813650	0 %	0 %	0 %	100 %	99078728
16109	NC_008043	CGC	2	6	813667	813672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078728
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16113	NC_008043	GGACT	2	10	813851	813860	20 %	20 %	40 %	20 %	99078728
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16120	NC_008043	GCA	2	6	814058	814063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078728
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16124	NC_008043	TGCA	2	8	814380	814387	25 %	25 %	25 %	25 %	99078729
16125	NC_008043	ATGT	2	8	814402	814409	25 %	50 %	25 %	0 %	99078729
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16128	NC_008043	GTA	2	6	814623	814628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078730
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16244	NC_008043	GGC	2	6	821338	821343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078737
16245	NC_008043	CGC	2	6	821369	821374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078737
16246	NC_008043	ACG	2	6	821384	821389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078737
16247	NC_008043	GC	3	6	821441	821446	0 %	0 %	50 %	50 %	99078737
16248	NC_008043	GCG	2	6	821457	821462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078737
16249	NC_008043	AGCGC	2	10	821464	821473	20 %	0 %	40 %	40 %	99078737
16250	NC_008043	TTGGCG	2	12	821474	821485	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	99078737
16251	NC_008043	CG	3	6	821484	821489	0 %	0 %	50 %	50 %	99078737
16252	NC_008043	TGA	2	6	821521	821526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078737
16253	NC_008043	CAGC	2	8	821532	821539	25 %	0 %	25 %	50 %	99078737
16254	NC_008043	ATC	2	6	821606	821611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078737
16255	NC_008043	GAT	2	6	821651	821656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078737
16256	NC_008043	GTG	2	6	821657	821662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078737
16257	NC_008043	CTTT	2	8	821706	821713	0 %	75 %	0 %	25 %	99078737
16258	NC_008043	GCG	2	6	821732	821737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078737
16259	NC_008043	ATT	2	6	821742	821747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078737

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