MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_008043	ACT	2	6	503272	503277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078454
10003	NC_008043	CGCGGG	2	12	503291	503302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078454
10004	NC_008043	GACCTG	2	12	503309	503320	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99078454
10005	NC_008043	CTG	2	6	503334	503339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078454
10006	NC_008043	CAT	2	6	503348	503353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078454
10007	NC_008043	GAG	2	6	503391	503396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078454
10008	NC_008043	TGA	2	6	503461	503466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078454
10009	NC_008043	CG	4	8	503498	503505	0 %	0 %	50 %	50 %	99078454
10010	NC_008043	TTA	2	6	503510	503515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078454
10011	NC_008043	CCG	2	6	503525	503530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078454
10012	NC_008043	CG	3	6	503529	503534	0 %	0 %	50 %	50 %	99078454
10013	NC_008043	ATCT	2	8	503589	503596	25 %	50 %	0 %	25 %	99078454
10014	NC_008043	GCC	2	6	503621	503626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078454
10015	NC_008043	GC	4	8	503657	503664	0 %	0 %	50 %	50 %	99078454
10016	NC_008043	TCC	2	6	503733	503738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_008043	CT	3	6	503853	503858	0 %	50 %	0 %	50 %	99078455
10018	NC_008043	GAT	2	6	503949	503954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078455
10019	NC_008043	GC	3	6	503983	503988	0 %	0 %	50 %	50 %	99078455
10020	NC_008043	GC	3	6	504041	504046	0 %	0 %	50 %	50 %	99078455
10021	NC_008043	GGT	2	6	504062	504067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078455
10022	NC_008043	CTG	2	6	504084	504089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078455
10023	NC_008043	ATCTGC	2	12	504106	504117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	99078455
10024	NC_008043	GGT	2	6	504134	504139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078455
10025	NC_008043	AGC	2	6	504154	504159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078455
10026	NC_008043	CCG	2	6	504190	504195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078455
10027	NC_008043	GCGT	2	8	504236	504243	0 %	25 %	50 %	25 %	99078455
10028	NC_008043	CAC	3	9	504269	504277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078455
10029	NC_008043	GC	3	6	504336	504341	0 %	0 %	50 %	50 %	99078455
10030	NC_008043	GAT	2	6	504353	504358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078455
10031	NC_008043	GGC	2	6	504360	504365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078455
10032	NC_008043	TGA	2	6	504370	504375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078455
10033	NC_008043	CCT	2	6	504472	504477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078455
10034	NC_008043	CGC	2	6	504487	504492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078455
10035	NC_008043	TGG	2	6	504541	504546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078455
10036	NC_008043	TC	3	6	504578	504583	0 %	50 %	0 %	50 %	99078455
10037	NC_008043	CGAGA	2	10	504591	504600	40 %	0 %	40 %	20 %	99078455
10038	NC_008043	CG	3	6	504712	504717	0 %	0 %	50 %	50 %	99078455
10039	NC_008043	CTG	2	6	504726	504731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078455
10040	NC_008043	GGTG	2	8	504737	504744	0 %	25 %	75 %	0 %	99078455
10041	NC_008043	TGA	2	6	504797	504802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078455
10042	NC_008043	GGGC	2	8	504853	504860	0 %	0 %	75 %	25 %	99078455
10043	NC_008043	TGC	2	6	504874	504879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078455
10044	NC_008043	GTG	2	6	505032	505037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078455
10045	NC_008043	GCT	2	6	505047	505052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078455
10046	NC_008043	GGA	2	6	505097	505102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078455
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10049	NC_008043	GTG	2	6	505140	505145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078455
10050	NC_008043	TGGC	2	8	505156	505163	0 %	25 %	50 %	25 %	99078455
10051	NC_008043	GTTT	2	8	505237	505244	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_008043	TTC	2	6	505269	505274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_008043	TGG	2	6	505357	505362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_008043	GGGTG	2	10	505395	505404	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_008043	TGGTGT	2	12	505466	505477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_008043	T	7	7	505477	505483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_008043	CGG	2	6	505526	505531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_008043	GCG	2	6	505551	505556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_008043	GCT	2	6	505562	505567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_008043	GA	3	6	505599	505604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_008043	TTG	2	6	505693	505698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_008043	GAT	2	6	505781	505786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_008043	ACAG	2	8	505842	505849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_008043	AAT	2	6	505852	505857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_008043	GGATT	2	10	505913	505922	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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10069	NC_008043	GGC	2	6	506023	506028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_008043	CGAG	2	8	506048	506055	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10071	NC_008043	GCG	2	6	506069	506074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_008043	TGG	2	6	506206	506211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_008043	GAT	2	6	506255	506260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10076	NC_008043	GAT	2	6	506400	506405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10080	NC_008043	GA	3	6	506588	506593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_008043	GGA	2	6	506638	506643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_008043	GGC	2	6	506658	506663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_008043	GTC	2	6	506757	506762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10088	NC_008043	TCGTG	2	10	506997	507006	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10089	NC_008043	CAG	2	6	507056	507061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10091	NC_008043	AC	3	6	507152	507157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_008043	A	6	6	507191	507196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_008043	AC	3	6	507299	507304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10094	NC_008043	CGA	2	6	507336	507341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_008043	G	6	6	507358	507363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_008043	GGC	2	6	507366	507371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_008043	CCT	2	6	507440	507445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10098	NC_008043	GAT	2	6	507453	507458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_008043	AGA	2	6	507500	507505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_008043	CAAA	2	8	507510	507517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10101	NC_008043	GTCT	2	8	507579	507586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10102	NC_008043	GGT	2	6	507601	507606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_008043	TCC	2	6	507647	507652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10104	NC_008043	ATT	2	6	507663	507668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_008043	GTCA	2	8	507674	507681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10106	NC_008043	AGG	2	6	507769	507774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_008043	TCC	2	6	507787	507792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_008043	CCA	2	6	507799	507804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_008043	CG	3	6	507889	507894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_008043	GGT	2	6	507895	507900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_008043	AG	3	6	507954	507959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_008043	CAA	2	6	507966	507971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_008043	TCC	2	6	507981	507986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_008043	TGCC	2	8	508076	508083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_008043	AGT	2	6	508093	508098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_008043	CAAGT	2	10	508103	508112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10117	NC_008043	TTC	2	6	508148	508153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_008043	AAG	2	6	508182	508187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_008043	GATCA	2	10	508349	508358	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10120	NC_008043	TGG	2	6	508376	508381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_008043	ATA	2	6	508499	508504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_008043	TGC	2	6	508516	508521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_008043	TTA	2	6	508545	508550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_008043	GGA	2	6	508607	508612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_008043	TAG	2	6	508636	508641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_008043	GCGA	2	8	508644	508651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10127	NC_008043	TGA	2	6	508670	508675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_008043	GGA	2	6	508786	508791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_008043	CGA	2	6	508866	508871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_008043	G	6	6	509234	509239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_008043	AC	3	6	509322	509327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10132	NC_008043	AAC	2	6	509359	509364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_008043	AGG	2	6	509433	509438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_008043	AGC	2	6	509449	509454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_008043	GCG	2	6	509504	509509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10136	NC_008043	AGCCGA	2	12	509535	509546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10137	NC_008043	CTC	2	6	509594	509599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10138	NC_008043	GGA	2	6	509621	509626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_008043	GA	3	6	509667	509672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_008043	ATG	2	6	509685	509690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_008043	GA	3	6	509714	509719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_008043	AGG	2	6	509837	509842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_008043	GTT	2	6	509861	509866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_008043	GGGC	2	8	509882	509889	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10145	NC_008043	GA	3	6	509975	509980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_008043	AGG	2	6	510027	510032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10147	NC_008043	TTA	2	6	510087	510092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10148	NC_008043	GAC	2	6	510120	510125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10149	NC_008043	AGG	2	6	510165	510170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10150	NC_008043	CGG	2	6	510202	510207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10151	NC_008043	AATTG	2	10	510314	510323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_008043	TAC	2	6	510376	510381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10153	NC_008043	GGT	2	6	510420	510425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_008043	ACC	2	6	510473	510478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10155	NC_008043	CCT	2	6	510560	510565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10156	NC_008043	GC	3	6	510580	510585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10157	NC_008043	GCCT	2	8	510637	510644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10158	NC_008043	GGT	2	6	510696	510701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10159	NC_008043	CTCAT	2	10	510810	510819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10160	NC_008043	CGT	2	6	510891	510896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10161	NC_008043	GAG	2	6	510940	510945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_008043	TGG	2	6	510984	510989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_008043	C	6	6	511067	511072	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10164	NC_008043	ACC	2	6	511105	511110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10165	NC_008043	GCA	2	6	511136	511141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10166	NC_008043	TGATC	2	10	511180	511189	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10167	NC_008043	AAAAC	2	10	511220	511229	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10168	NC_008043	TGA	3	9	511269	511277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10169	NC_008043	ATC	2	6	511280	511285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10171	NC_008043	TGG	2	6	511432	511437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10172	NC_008043	TAA	2	6	511546	511551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10173	NC_008043	AAAT	2	8	511558	511565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10174	NC_008043	CT	3	6	511567	511572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10175	NC_008043	A	7	7	511577	511583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10179	NC_008043	ACA	2	6	511689	511694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10180	NC_008043	AAC	2	6	511742	511747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10181	NC_008043	CGT	2	6	511871	511876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078456
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10185	NC_008043	CG	3	6	512323	512328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10186	NC_008043	GCGCG	2	10	512339	512348	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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10188	NC_008043	AGC	2	6	512367	512372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10240	NC_008043	CGGG	2	8	515684	515691	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10241	NC_008043	CCCG	2	8	515701	515708	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10242	NC_008043	AT	3	6	515742	515747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_008043	CGG	2	6	515775	515780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10244	NC_008043	GA	3	6	515801	515806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_008043	C	6	6	515828	515833	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10246	NC_008043	GC	3	6	515843	515848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10247	NC_008043	TTG	2	6	515896	515901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_008043	GTT	2	6	515910	515915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078460
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10251	NC_008043	GCT	3	9	516075	516083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078460
10252	NC_008043	CTTG	2	8	516087	516094	0 %	50 %	25 %	25 %	99078460
10253	NC_008043	TTC	2	6	516172	516177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078460
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10255	NC_008043	T	6	6	516265	516270	0 %	100 %	0 %	0 %	99078460
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10480	NC_008043	TCAG	2	8	526678	526685	25 %	25 %	25 %	25 %	99078469
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10499	NC_008043	TTC	2	6	527665	527670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078469
10500	NC_008043	GCCA	2	8	527678	527685	25 %	0 %	25 %	50 %	99078469

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