MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008043	A	6	6	24470	24475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008043	CCGC	2	8	24511	24518	0 %	0 %	25 %	75 %	99078033
503	NC_008043	GAT	2	6	24602	24607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078033
504	NC_008043	AGC	2	6	24620	24625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078033
505	NC_008043	TGCG	2	8	24750	24757	0 %	25 %	50 %	25 %	99078033
506	NC_008043	GCC	2	6	24860	24865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078033
507	NC_008043	TGG	2	6	24875	24880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008043	GCA	2	6	24901	24906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008043	CG	3	6	24935	24940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_008043	TCCG	2	8	24955	24962	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
511	NC_008043	CCCAT	2	10	25039	25048	20 %	20 %	0 %	60 %	99078034
512	NC_008043	GCG	2	6	25151	25156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078034
513	NC_008043	CG	3	6	25173	25178	0 %	0 %	50 %	50 %	99078034
514	NC_008043	ATC	2	6	25212	25217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078034
515	NC_008043	CCA	2	6	25274	25279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078035
516	NC_008043	TTC	2	6	25305	25310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078035
517	NC_008043	GC	3	6	25330	25335	0 %	0 %	50 %	50 %	99078035
518	NC_008043	CCG	2	6	25381	25386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078035
519	NC_008043	TCG	2	6	25390	25395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078035
520	NC_008043	CCGC	2	8	25465	25472	0 %	0 %	25 %	75 %	99078035
521	NC_008043	TGG	2	6	25691	25696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078035
522	NC_008043	CATC	2	8	25706	25713	25 %	25 %	0 %	50 %	99078035
523	NC_008043	GCG	2	6	25762	25767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078036
524	NC_008043	TCA	2	6	25784	25789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078036
525	NC_008043	CTG	2	6	25914	25919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078036
526	NC_008043	CG	3	6	26051	26056	0 %	0 %	50 %	50 %	99078036
527	NC_008043	GCC	2	6	26060	26065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078036
528	NC_008043	GTC	2	6	26182	26187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078036
529	NC_008043	CGCC	2	8	26249	26256	0 %	0 %	25 %	75 %	99078036
530	NC_008043	ATA	2	6	26386	26391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99078036
531	NC_008043	GC	3	6	26440	26445	0 %	0 %	50 %	50 %	99078036
532	NC_008043	GGT	2	6	26464	26469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078036
533	NC_008043	ACCA	2	8	26499	26506	50 %	0 %	0 %	50 %	99078036
534	NC_008043	GAT	2	6	26526	26531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078036
535	NC_008043	GGTG	2	8	26532	26539	0 %	25 %	75 %	0 %	99078036
536	NC_008043	ACG	2	6	26540	26545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078036
537	NC_008043	ACC	2	6	26563	26568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078036
538	NC_008043	GCT	2	6	26586	26591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078036
539	NC_008043	CGGCAG	2	12	26692	26703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	99078036
540	NC_008043	TCGCC	2	10	26736	26745	0 %	20 %	20 %	60 %	99078036
541	NC_008043	GCGG	2	8	26750	26757	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
542	NC_008043	CTC	2	6	26758	26763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_008043	CTG	2	6	26819	26824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078037
544	NC_008043	CGC	2	6	26841	26846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078037
545	NC_008043	TGC	2	6	26878	26883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078037
546	NC_008043	GCA	2	6	26885	26890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078037
547	NC_008043	CG	3	6	26923	26928	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
548	NC_008043	GCC	2	6	26950	26955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078037
549	NC_008043	GAT	2	6	26957	26962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078037
550	NC_008043	C	7	7	26967	26973	0 %	0 %	0 %	100 %	99078037
551	NC_008043	CCA	2	6	27038	27043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078037
552	NC_008043	CGGG	2	8	27111	27118	0 %	0 %	75 %	25 %	99078037
553	NC_008043	TCG	2	6	27142	27147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078037
554	NC_008043	CAT	2	6	27177	27182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078037
555	NC_008043	GC	3	6	27186	27191	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
556	NC_008043	GCGCC	2	10	27263	27272	0 %	0 %	40 %	60 %	99078037
557	NC_008043	GCC	2	6	27294	27299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078037
558	NC_008043	GCC	2	6	27376	27381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078037
559	NC_008043	ATG	2	6	27445	27450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078037
560	NC_008043	GC	4	8	27451	27458	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
561	NC_008043	GCC	2	6	27528	27533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078037
562	NC_008043	GTT	2	6	27639	27644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078037
563	NC_008043	CAT	2	6	27645	27650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078037
564	NC_008043	CGC	2	6	27660	27665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078037
565	NC_008043	GCC	2	6	27669	27674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078037
566	NC_008043	AGCC	2	8	27691	27698	25 %	0 %	25 %	50 %	99078037
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568	NC_008043	GC	3	6	27873	27878	0 %	0 %	50 %	50 %	99078037
569	NC_008043	TCT	2	6	27935	27940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078037
570	NC_008043	GTG	2	6	28098	28103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078037
571	NC_008043	TCA	2	6	28130	28135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078037
572	NC_008043	AGGC	2	8	28156	28163	25 %	0 %	50 %	25 %	99078037
573	NC_008043	CAT	2	6	28170	28175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078037
574	NC_008043	GTG	2	6	28189	28194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078037
575	NC_008043	GCC	2	6	28251	28256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078037
576	NC_008043	CAC	2	6	28302	28307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078037
577	NC_008043	CGGG	2	8	28321	28328	0 %	0 %	75 %	25 %	99078037
578	NC_008043	CCA	2	6	28339	28344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078037
579	NC_008043	TCA	2	6	28403	28408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078037
580	NC_008043	TCG	2	6	28411	28416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078037
581	NC_008043	CTG	2	6	28467	28472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078037
582	NC_008043	CAG	2	6	28473	28478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078037
583	NC_008043	CT	3	6	28524	28529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_008043	CTTGC	2	10	28558	28567	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
585	NC_008043	TCA	2	6	28665	28670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008043	GCA	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078038
587	NC_008043	CG	3	6	28779	28784	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
588	NC_008043	CCGA	2	8	28821	28828	25 %	0 %	25 %	50 %	99078038
589	NC_008043	CCA	2	6	28855	28860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078038
590	NC_008043	GGC	2	6	28865	28870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078038
591	NC_008043	CCA	2	6	28888	28893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078038
592	NC_008043	CGC	2	6	28943	28948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078038
593	NC_008043	GGCCC	2	10	29002	29011	0 %	0 %	40 %	60 %	99078038
594	NC_008043	TGC	2	6	29023	29028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078038
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596	NC_008043	CCG	2	6	29191	29196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078038
597	NC_008043	GC	3	6	29204	29209	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
598	NC_008043	CGC	2	6	29228	29233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078038
599	NC_008043	CCA	2	6	29272	29277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078038
600	NC_008043	TCC	2	6	29305	29310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078038
601	NC_008043	CGGG	2	8	29317	29324	0 %	0 %	75 %	25 %	99078038
602	NC_008043	GCT	2	6	29328	29333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078038
603	NC_008043	TGA	2	6	29365	29370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078038
604	NC_008043	CG	4	8	29371	29378	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
605	NC_008043	TCCG	2	8	29436	29443	0 %	25 %	25 %	50 %	99078038
606	NC_008043	GGC	3	9	29540	29548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078038
607	NC_008043	GCGCC	2	10	29651	29660	0 %	0 %	40 %	60 %	99078038
608	NC_008043	CG	3	6	29668	29673	0 %	0 %	50 %	50 %	99078038
609	NC_008043	TG	3	6	29732	29737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_008043	ATG	2	6	29817	29822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078039
612	NC_008043	AAACCC	2	12	29859	29870	50 %	0 %	0 %	50 %	99078039
613	NC_008043	GCA	2	6	29877	29882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078039
614	NC_008043	CGC	2	6	29887	29892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078039
615	NC_008043	GC	4	8	30019	30026	0 %	0 %	50 %	50 %	99078039
616	NC_008043	CAGG	2	8	30048	30055	25 %	0 %	50 %	25 %	99078039
617	NC_008043	TGA	2	6	30064	30069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078039
618	NC_008043	GGGCC	2	10	30122	30131	0 %	0 %	60 %	40 %	99078039
619	NC_008043	C	6	6	30215	30220	0 %	0 %	0 %	100 %	99078039
620	NC_008043	CGG	2	6	30241	30246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078039
621	NC_008043	TCT	2	6	30470	30475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078039
622	NC_008043	GC	3	6	30482	30487	0 %	0 %	50 %	50 %	99078039
623	NC_008043	CTCA	2	8	30527	30534	25 %	25 %	0 %	50 %	99078040
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625	NC_008043	GC	4	8	30660	30667	0 %	0 %	50 %	50 %	99078040
626	NC_008043	GCT	2	6	30674	30679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078040
627	NC_008043	TGG	2	6	30700	30705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078040
628	NC_008043	AGA	2	6	30731	30736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078040
629	NC_008043	GCG	2	6	30820	30825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078040
630	NC_008043	CG	3	6	30873	30878	0 %	0 %	50 %	50 %	99078040
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632	NC_008043	TCA	2	6	30931	30936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078040
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