MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008043	GCT	2	6	299898	299903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078272
6002	NC_008043	CAGG	2	8	299964	299971	25 %	0 %	50 %	25 %	99078272
6003	NC_008043	GGC	2	6	300104	300109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078272
6004	NC_008043	GGC	2	6	300139	300144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078272
6005	NC_008043	CGG	2	6	300183	300188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078272
6006	NC_008043	CCG	2	6	300203	300208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078272
6007	NC_008043	GGT	2	6	300252	300257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078272
6008	NC_008043	CGA	2	6	300327	300332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078272
6009	NC_008043	CGC	2	6	300377	300382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078272
6010	NC_008043	TCG	2	6	300407	300412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078272
6011	NC_008043	AACA	2	8	300472	300479	75 %	0 %	0 %	25 %	99078272
6012	NC_008043	GCGCTG	2	12	300517	300528	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	99078272
6013	NC_008043	ACC	2	6	300536	300541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078272
6014	NC_008043	GCC	2	6	300614	300619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078273
6015	NC_008043	GGC	2	6	300632	300637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078273
6016	NC_008043	CGC	2	6	300682	300687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078273
6017	NC_008043	AGC	2	6	300700	300705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078273
6018	NC_008043	GGT	2	6	300721	300726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078273
6019	NC_008043	GC	3	6	300756	300761	0 %	0 %	50 %	50 %	99078273
6020	NC_008043	TCG	2	6	300766	300771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078273
6021	NC_008043	GTG	2	6	300824	300829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078273
6022	NC_008043	GCG	2	6	300852	300857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078273
6023	NC_008043	TGCC	2	8	300953	300960	0 %	25 %	25 %	50 %	99078273
6024	NC_008043	TGA	2	6	301014	301019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078273
6025	NC_008043	GAT	2	6	301054	301059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078273
6026	NC_008043	AAG	2	6	301134	301139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078273
6027	NC_008043	G	6	6	301188	301193	0 %	0 %	100 %	0 %	99078273
6028	NC_008043	CAA	2	6	301228	301233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078273
6029	NC_008043	GGC	2	6	301313	301318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078273
6030	NC_008043	CCA	2	6	301371	301376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078273
6031	NC_008043	GC	3	6	301393	301398	0 %	0 %	50 %	50 %	99078273
6032	NC_008043	TCG	2	6	301431	301436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078273
6033	NC_008043	GGC	2	6	301486	301491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078273
6034	NC_008043	CAG	2	6	301558	301563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_008043	ATC	2	6	301566	301571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_008043	GGT	3	9	301572	301580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_008043	CGACCC	2	12	301640	301651	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_008043	TCGC	2	8	301694	301701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_008043	ATC	2	6	301872	301877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_008043	GC	5	10	301924	301933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_008043	TCT	2	6	301964	301969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_008043	TGG	2	6	301984	301989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_008043	CTG	2	6	302022	302027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_008043	GCT	2	6	302090	302095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_008043	CAC	2	6	302144	302149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_008043	CGA	2	6	302159	302164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_008043	GCGG	2	8	302229	302236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_008043	GATG	2	8	302303	302310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_008043	GAG	2	6	302325	302330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_008043	CG	3	6	302385	302390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_008043	CGA	2	6	302405	302410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_008043	ATG	2	6	302424	302429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008043	CG	3	6	302430	302435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_008043	GAA	2	6	302438	302443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008043	TCA	2	6	302467	302472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_008043	GCC	2	6	302530	302535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_008043	CGAC	2	8	302608	302615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_008043	CGC	2	6	302654	302659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_008043	TGC	2	6	302746	302751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_008043	GGC	2	6	302810	302815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_008043	GCT	2	6	302828	302833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_008043	CG	4	8	302852	302859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_008043	GCC	2	6	302907	302912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_008043	CTGCCG	2	12	302925	302936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_008043	TCC	2	6	303024	303029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_008043	ACACC	2	10	303078	303087	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6067	NC_008043	AAC	2	6	303093	303098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_008043	CGG	2	6	303109	303114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_008043	ACCA	2	8	303132	303139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_008043	GGA	2	6	303148	303153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_008043	AAC	2	6	303167	303172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078274
6072	NC_008043	TGG	2	6	303186	303191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078274
6073	NC_008043	CTT	2	6	303202	303207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078274
6074	NC_008043	T	6	6	303257	303262	0 %	100 %	0 %	0 %	99078274
6075	NC_008043	GC	3	6	303316	303321	0 %	0 %	50 %	50 %	99078274
6076	NC_008043	GCT	2	6	303358	303363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078274
6077	NC_008043	TTC	2	6	303377	303382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078274
6078	NC_008043	GAC	2	6	303431	303436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078274
6079	NC_008043	TCT	2	6	303531	303536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078274
6080	NC_008043	ATGGAC	2	12	303599	303610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99078274
6081	NC_008043	GC	3	6	303616	303621	0 %	0 %	50 %	50 %	99078274
6082	NC_008043	TTC	2	6	303644	303649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078274
6083	NC_008043	ACCCTG	2	12	303905	303916	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99078274
6084	NC_008043	GCTCT	2	10	304025	304034	0 %	40 %	20 %	40 %	99078274
6085	NC_008043	TTC	2	6	304076	304081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078274
6086	NC_008043	GAA	2	6	304142	304147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078274
6087	NC_008043	TCT	2	6	304179	304184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078274
6088	NC_008043	GTG	2	6	304192	304197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078274
6089	NC_008043	TGG	2	6	304215	304220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078274
6090	NC_008043	CG	3	6	304231	304236	0 %	0 %	50 %	50 %	99078274
6091	NC_008043	TCT	3	9	304302	304310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078274
6092	NC_008043	CGG	2	6	304324	304329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078274
6093	NC_008043	GGC	2	6	304379	304384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078274
6094	NC_008043	CAT	2	6	304390	304395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078274
6095	NC_008043	GCT	2	6	304504	304509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078274
6096	NC_008043	TCC	2	6	304634	304639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_008043	GAT	2	6	304692	304697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_008043	CTCC	2	8	304698	304705	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6099	NC_008043	GGC	2	6	304786	304791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078275
6100	NC_008043	CTT	3	9	304801	304809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078275
6101	NC_008043	CA	3	6	304847	304852	50 %	0 %	0 %	50 %	99078275
6102	NC_008043	CTG	2	6	304859	304864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078275
6103	NC_008043	C	7	7	304948	304954	0 %	0 %	0 %	100 %	99078275
6104	NC_008043	GTC	2	6	305011	305016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078275
6105	NC_008043	CTT	2	6	305096	305101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078275
6106	NC_008043	TTG	2	6	305142	305147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078275
6107	NC_008043	GTCA	2	8	305156	305163	25 %	25 %	25 %	25 %	99078275
6108	NC_008043	GCA	2	6	305182	305187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078275
6109	NC_008043	TGA	2	6	305194	305199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078275
6110	NC_008043	GCT	2	6	305212	305217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078275
6111	NC_008043	GTC	2	6	305282	305287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078275
6112	NC_008043	C	6	6	305290	305295	0 %	0 %	0 %	100 %	99078275
6113	NC_008043	GAC	2	6	305327	305332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078275
6114	NC_008043	GGT	2	6	305350	305355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078275
6115	NC_008043	CTA	2	6	305419	305424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078275
6116	NC_008043	CGAC	2	8	305463	305470	25 %	0 %	25 %	50 %	99078275
6117	NC_008043	CT	3	6	305486	305491	0 %	50 %	0 %	50 %	99078275
6118	NC_008043	GAA	2	6	305495	305500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078275
6119	NC_008043	GGT	2	6	305524	305529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078275
6120	NC_008043	CAA	2	6	305534	305539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078275
6121	NC_008043	GATC	2	8	305554	305561	25 %	25 %	25 %	25 %	99078275
6122	NC_008043	TGA	2	6	305569	305574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078275
6123	NC_008043	TTC	2	6	305627	305632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078275
6124	NC_008043	CT	3	6	305658	305663	0 %	50 %	0 %	50 %	99078275
6125	NC_008043	CTT	2	6	305720	305725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078275
6126	NC_008043	GCA	2	6	305750	305755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078275
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