MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008043	AAG	2	6	274052	274057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078249
5502	NC_008043	CGT	2	6	274081	274086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078249
5503	NC_008043	CCG	3	9	274165	274173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078249
5504	NC_008043	CG	3	6	274261	274266	0 %	0 %	50 %	50 %	99078249
5505	NC_008043	GCA	2	6	274275	274280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078249
5506	NC_008043	CGGT	2	8	274349	274356	0 %	25 %	50 %	25 %	99078249
5507	NC_008043	GCCC	2	8	274499	274506	0 %	0 %	25 %	75 %	99078250
5508	NC_008043	CTG	2	6	274513	274518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078250
5509	NC_008043	GCC	2	6	274602	274607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078250
5510	NC_008043	CTCG	2	8	274653	274660	0 %	25 %	25 %	50 %	99078250
5511	NC_008043	ATC	2	6	274682	274687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078250
5512	NC_008043	CAAGAT	2	12	274722	274733	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	99078250
5513	NC_008043	TCA	2	6	274886	274891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078250
5514	NC_008043	GCC	2	6	274907	274912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078250
5515	NC_008043	GCG	2	6	274950	274955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078250
5516	NC_008043	ATC	2	6	274961	274966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078250
5517	NC_008043	GTT	2	6	275032	275037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078250
5518	NC_008043	TGG	2	6	275048	275053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078250
5519	NC_008043	GCG	2	6	275162	275167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078250
5520	NC_008043	AGG	2	6	275169	275174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078250
5521	NC_008043	TCT	2	6	275220	275225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078250
5522	NC_008043	GC	3	6	275248	275253	0 %	0 %	50 %	50 %	99078250
5523	NC_008043	GC	3	6	275275	275280	0 %	0 %	50 %	50 %	99078250
5524	NC_008043	CAT	2	6	275349	275354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078250
5525	NC_008043	AGCG	2	8	275365	275372	25 %	0 %	50 %	25 %	99078250
5526	NC_008043	GTT	2	6	275401	275406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078250
5527	NC_008043	CGG	2	6	275469	275474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078250
5528	NC_008043	CGAG	2	8	275496	275503	25 %	0 %	50 %	25 %	99078250
5529	NC_008043	TG	3	6	275527	275532	0 %	50 %	50 %	0 %	99078250
5530	NC_008043	TG	3	6	275576	275581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_008043	CTC	2	6	275798	275803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078251
5532	NC_008043	CGA	2	6	275804	275809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078251
5533	NC_008043	CAT	2	6	275876	275881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078251
5534	NC_008043	TCGC	2	8	275928	275935	0 %	25 %	25 %	50 %	99078251
5535	NC_008043	CGC	2	6	276012	276017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078251
5536	NC_008043	GC	4	8	276136	276143	0 %	0 %	50 %	50 %	99078251
5537	NC_008043	GGC	2	6	276186	276191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078251
5538	NC_008043	GTC	2	6	276294	276299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_008043	TCC	2	6	276314	276319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_008043	GGA	2	6	276337	276342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_008043	CAA	2	6	276353	276358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_008043	ACTG	2	8	276407	276414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_008043	CGG	2	6	276537	276542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_008043	TGA	2	6	276681	276686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078252
5545	NC_008043	TCG	2	6	276740	276745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078252
5546	NC_008043	ACA	2	6	276815	276820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078252
5547	NC_008043	GAA	3	9	276858	276866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078253
5548	NC_008043	TGG	2	6	276871	276876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078253
5549	NC_008043	TCG	2	6	276920	276925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078253
5550	NC_008043	GA	3	6	276941	276946	50 %	0 %	50 %	0 %	99078253
5551	NC_008043	CGA	2	6	276990	276995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078253
5552	NC_008043	ATGA	2	8	277014	277021	50 %	25 %	25 %	0 %	99078253
5553	NC_008043	AAG	2	6	277025	277030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078253
5554	NC_008043	GGC	2	6	277032	277037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078253
5555	NC_008043	CTT	2	6	277105	277110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_008043	TGA	2	6	277123	277128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_008043	TCA	3	9	277148	277156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_008043	CGA	2	6	277158	277163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_008043	CG	3	6	277250	277255	0 %	0 %	50 %	50 %	99078254
5560	NC_008043	ATT	2	6	277267	277272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078254
5561	NC_008043	CGT	2	6	277368	277373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078254
5562	NC_008043	GA	3	6	277409	277414	50 %	0 %	50 %	0 %	99078254
5563	NC_008043	TCT	2	6	277472	277477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_008043	GAA	2	6	277507	277512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_008043	GGA	2	6	277514	277519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_008043	T	6	6	277558	277563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008043	AG	3	6	277589	277594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_008043	CGCA	2	8	277596	277603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_008043	CGT	2	6	277680	277685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_008043	CAA	2	6	277759	277764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_008043	GCT	2	6	277786	277791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_008043	CAT	2	6	277890	277895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078255
5573	NC_008043	CCAT	2	8	278021	278028	25 %	25 %	0 %	50 %	99078255
5574	NC_008043	GGA	2	6	278131	278136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078255
5575	NC_008043	GTC	2	6	278173	278178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078255
5576	NC_008043	GAG	2	6	278242	278247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078255
5577	NC_008043	TCA	3	9	278309	278317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078255
5578	NC_008043	GA	3	6	278358	278363	50 %	0 %	50 %	0 %	99078255
5579	NC_008043	C	6	6	278383	278388	0 %	0 %	0 %	100 %	99078255
5580	NC_008043	GC	3	6	278395	278400	0 %	0 %	50 %	50 %	99078255
5581	NC_008043	CTG	2	6	278416	278421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078255
5582	NC_008043	CGG	2	6	278451	278456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078255
5583	NC_008043	CCG	2	6	278508	278513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078255
5584	NC_008043	AAC	2	6	278578	278583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078255
5585	NC_008043	ATC	2	6	278599	278604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078255
5586	NC_008043	ATC	2	6	278626	278631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078255
5587	NC_008043	GCGG	2	8	278671	278678	0 %	0 %	75 %	25 %	99078255
5588	NC_008043	CTG	2	6	278833	278838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078255
5589	NC_008043	CGG	2	6	278988	278993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078255
5590	NC_008043	GCC	2	6	279323	279328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078255
5591	NC_008043	CAT	2	6	279334	279339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078255
5592	NC_008043	CAG	2	6	279352	279357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078255
5593	NC_008043	GGGTC	2	10	279396	279405	0 %	20 %	60 %	20 %	99078255
5594	NC_008043	C	6	6	279423	279428	0 %	0 %	0 %	100 %	99078255
5595	NC_008043	GCC	2	6	279461	279466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078255
5596	NC_008043	TAA	3	9	279468	279476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99078255
5597	NC_008043	T	6	6	279506	279511	0 %	100 %	0 %	0 %	99078255
5598	NC_008043	ATC	2	6	279548	279553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078255
5599	NC_008043	A	6	6	279583	279588	100 %	0 %	0 %	0 %	99078255
5600	NC_008043	TGGT	2	8	279674	279681	0 %	50 %	50 %	0 %	99078255
5601	NC_008043	GCG	2	6	279739	279744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078255
5602	NC_008043	A	6	6	279778	279783	100 %	0 %	0 %	0 %	99078255
5603	NC_008043	GCACGA	2	12	279798	279809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078255
5604	NC_008043	GCC	2	6	279821	279826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078255
5605	NC_008043	CCA	2	6	279889	279894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078255
5606	NC_008043	CGC	2	6	279901	279906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078255
5607	NC_008043	ACC	2	6	279980	279985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078255
5608	NC_008043	AGC	3	9	279994	280002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078255
5609	NC_008043	ACCT	2	8	280046	280053	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_008043	GT	3	6	280065	280070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_008043	AC	3	6	280252	280257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_008043	CATC	2	8	280356	280363	25 %	25 %	0 %	50 %	99078256
5613	NC_008043	TCT	2	6	280376	280381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078256
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5615	NC_008043	TCG	2	6	280541	280546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078256
5616	NC_008043	GC	4	8	280639	280646	0 %	0 %	50 %	50 %	99078256
5617	NC_008043	ACCC	2	8	280919	280926	25 %	0 %	0 %	75 %	99078256
5618	NC_008043	CTGG	2	8	281018	281025	0 %	25 %	50 %	25 %	99078256
5619	NC_008043	AAC	2	6	281047	281052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078256
5620	NC_008043	GCA	2	6	281076	281081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078256
5621	NC_008043	CGT	2	6	281084	281089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078256
5622	NC_008043	ATCAA	2	10	281177	281186	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5623	NC_008043	CGCT	2	8	281193	281200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_008043	AGC	2	6	281203	281208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_008043	T	6	6	281223	281228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_008043	GATG	2	8	281233	281240	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_008043	GC	3	6	281300	281305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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