MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 308

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008042	GA	3	6	13	18	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008042	CA	3	6	164	169	50 %	0 %	0 %	50 %	99077903
3	NC_008042	AC	3	6	994	999	50 %	0 %	0 %	50 %	99077903
4	NC_008042	TC	3	6	1013	1018	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
5	NC_008042	CT	3	6	1065	1070	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
6	NC_008042	GC	3	6	1494	1499	0 %	0 %	50 %	50 %	99077903
7	NC_008042	TC	3	6	3335	3340	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
8	NC_008042	CT	3	6	3351	3356	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
9	NC_008042	AC	3	6	4114	4119	50 %	0 %	0 %	50 %	99077903
10	NC_008042	CG	3	6	5154	5159	0 %	0 %	50 %	50 %	99077903
11	NC_008042	AG	3	6	5356	5361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008042	CG	3	6	5518	5523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008042	GT	3	6	5682	5687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008042	CG	3	6	6507	6512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008042	AG	3	6	6611	6616	50 %	0 %	50 %	0 %	99077904
16	NC_008042	CG	3	6	7628	7633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008042	CG	3	6	7872	7877	0 %	0 %	50 %	50 %	99077905
18	NC_008042	GC	3	6	8061	8066	0 %	0 %	50 %	50 %	99077905
19	NC_008042	AG	3	6	8372	8377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008042	CG	3	6	9358	9363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008042	TC	3	6	9964	9969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008042	TC	3	6	10225	10230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008042	TC	3	6	10272	10277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008042	GT	3	6	10617	10622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008042	TC	3	6	11928	11933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008042	CG	3	6	11994	11999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008042	GT	3	6	12584	12589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008042	GT	3	6	12731	12736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008042	TC	3	6	12945	12950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008042	GT	3	6	13100	13105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008042	CT	3	6	13294	13299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008042	CG	3	6	13379	13384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008042	TC	3	6	14284	14289	0 %	50 %	0 %	50 %	99077906
34	NC_008042	AG	3	6	14546	14551	50 %	0 %	50 %	0 %	99077906
35	NC_008042	GC	3	6	15341	15346	0 %	0 %	50 %	50 %	99077907
36	NC_008042	GC	3	6	15736	15741	0 %	0 %	50 %	50 %	99077907
37	NC_008042	GC	3	6	16233	16238	0 %	0 %	50 %	50 %	99077908
38	NC_008042	GC	3	6	16283	16288	0 %	0 %	50 %	50 %	99077908
39	NC_008042	GC	3	6	16523	16528	0 %	0 %	50 %	50 %	99077908
40	NC_008042	CA	3	6	16904	16909	50 %	0 %	0 %	50 %	99077908
41	NC_008042	GC	3	6	17140	17145	0 %	0 %	50 %	50 %	99077908
42	NC_008042	CG	3	6	17737	17742	0 %	0 %	50 %	50 %	99077909
43	NC_008042	GC	3	6	17766	17771	0 %	0 %	50 %	50 %	99077909
44	NC_008042	GC	3	6	18455	18460	0 %	0 %	50 %	50 %	99077909
45	NC_008042	GC	3	6	19416	19421	0 %	0 %	50 %	50 %	99077910
46	NC_008042	GC	3	6	19655	19660	0 %	0 %	50 %	50 %	99077910
47	NC_008042	GC	4	8	19848	19855	0 %	0 %	50 %	50 %	99077910
48	NC_008042	GA	3	6	19901	19906	50 %	0 %	50 %	0 %	99077910
49	NC_008042	GC	3	6	20525	20530	0 %	0 %	50 %	50 %	99077911
50	NC_008042	CG	3	6	21128	21133	0 %	0 %	50 %	50 %	99077911
51	NC_008042	GC	3	6	21545	21550	0 %	0 %	50 %	50 %	99077911
52	NC_008042	CG	4	8	21842	21849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008042	CG	3	6	22073	22078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008042	AT	4	8	22229	22236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008042	CG	4	8	22348	22355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008042	GC	3	6	23130	23135	0 %	0 %	50 %	50 %	99077912
57	NC_008042	CG	3	6	23187	23192	0 %	0 %	50 %	50 %	99077912
58	NC_008042	TG	3	6	23497	23502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008042	CT	3	6	23732	23737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008042	TC	3	6	23985	23990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008042	GC	3	6	24216	24221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008042	GT	3	6	24276	24281	0 %	50 %	50 %	0 %	99077913
63	NC_008042	GT	3	6	24996	25001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008042	AG	3	6	26308	26313	50 %	0 %	50 %	0 %	99077914
65	NC_008042	AG	3	6	26759	26764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008042	GA	3	6	26908	26913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008042	TG	3	6	26967	26972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008042	TG	3	6	27059	27064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008042	GA	3	6	27113	27118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008042	AT	3	6	27192	27197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008042	GA	3	6	27451	27456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008042	GC	3	6	27660	27665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008042	GC	3	6	28324	28329	0 %	0 %	50 %	50 %	99077915
74	NC_008042	CG	3	6	28351	28356	0 %	0 %	50 %	50 %	99077915
75	NC_008042	CG	3	6	28644	28649	0 %	0 %	50 %	50 %	99077915
76	NC_008042	CG	3	6	28986	28991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008042	GC	4	8	29430	29437	0 %	0 %	50 %	50 %	99077916
78	NC_008042	CG	3	6	29579	29584	0 %	0 %	50 %	50 %	99077916
79	NC_008042	CG	3	6	29639	29644	0 %	0 %	50 %	50 %	99077916
80	NC_008042	TC	3	6	29737	29742	0 %	50 %	0 %	50 %	99077916
81	NC_008042	CG	3	6	30395	30400	0 %	0 %	50 %	50 %	99077917
82	NC_008042	GC	3	6	31034	31039	0 %	0 %	50 %	50 %	99077918
83	NC_008042	GA	3	6	31189	31194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008042	TC	3	6	31351	31356	0 %	50 %	0 %	50 %	99077919
85	NC_008042	GC	3	6	31471	31476	0 %	0 %	50 %	50 %	99077919
86	NC_008042	GC	3	6	31525	31530	0 %	0 %	50 %	50 %	99077919
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88	NC_008042	TG	3	6	34873	34878	0 %	50 %	50 %	0 %	99077921
89	NC_008042	TG	3	6	37031	37036	0 %	50 %	50 %	0 %	99077923
90	NC_008042	TC	3	6	37415	37420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008042	CA	3	6	37681	37686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008042	GT	3	6	39068	39073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008042	GC	3	6	39490	39495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008042	GC	3	6	39552	39557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008042	GT	3	6	40714	40719	0 %	50 %	50 %	0 %	99077927
96	NC_008042	GC	3	6	41343	41348	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
97	NC_008042	CG	3	6	42041	42046	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
98	NC_008042	CG	3	6	42079	42084	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
99	NC_008042	GC	3	6	42097	42102	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
100	NC_008042	CG	3	6	42189	42194	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
101	NC_008042	GC	3	6	42403	42408	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
102	NC_008042	TC	3	6	42516	42521	0 %	50 %	0 %	50 %	99077928
103	NC_008042	GC	3	6	42535	42540	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
104	NC_008042	GC	3	6	42577	42582	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
105	NC_008042	CG	3	6	42670	42675	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
106	NC_008042	GC	3	6	42804	42809	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
107	NC_008042	GA	3	6	43037	43042	50 %	0 %	50 %	0 %	99077928
108	NC_008042	CG	3	6	43197	43202	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
109	NC_008042	CG	3	6	43393	43398	0 %	0 %	50 %	50 %	99077928
110	NC_008042	GC	3	6	43737	43742	0 %	0 %	50 %	50 %	99077929
111	NC_008042	CG	3	6	43818	43823	0 %	0 %	50 %	50 %	99077929
112	NC_008042	GC	3	6	43974	43979	0 %	0 %	50 %	50 %	99077929
113	NC_008042	CG	3	6	44090	44095	0 %	0 %	50 %	50 %	99077929
114	NC_008042	CG	3	6	44288	44293	0 %	0 %	50 %	50 %	99077929
115	NC_008042	GC	3	6	45131	45136	0 %	0 %	50 %	50 %	99077929
116	NC_008042	CG	3	6	45338	45343	0 %	0 %	50 %	50 %	99077929
117	NC_008042	TG	3	6	45457	45462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008042	CG	3	6	45499	45504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008042	CG	3	6	46355	46360	0 %	0 %	50 %	50 %	99077930
120	NC_008042	CG	3	6	46470	46475	0 %	0 %	50 %	50 %	99077930
121	NC_008042	AC	3	6	46614	46619	50 %	0 %	0 %	50 %	99077930
122	NC_008042	GC	3	6	46706	46711	0 %	0 %	50 %	50 %	99077930
123	NC_008042	GT	3	6	47423	47428	0 %	50 %	50 %	0 %	99077930
124	NC_008042	AT	3	6	47585	47590	50 %	50 %	0 %	0 %	99077930
125	NC_008042	AG	4	8	47722	47729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008042	AG	3	6	47967	47972	50 %	0 %	50 %	0 %	99077931
127	NC_008042	GC	3	6	48290	48295	0 %	0 %	50 %	50 %	99077931
128	NC_008042	CA	3	6	48527	48532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008042	CA	3	6	48578	48583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008042	CG	3	6	48859	48864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008042	CG	3	6	48933	48938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008042	AC	3	6	49429	49434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008042	GT	3	6	50687	50692	0 %	50 %	50 %	0 %	99077932
134	NC_008042	TA	3	6	51305	51310	50 %	50 %	0 %	0 %	99077932
135	NC_008042	GC	3	6	52178	52183	0 %	0 %	50 %	50 %	99077933
136	NC_008042	GC	3	6	52356	52361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008042	CG	3	6	53680	53685	0 %	0 %	50 %	50 %	99077935
138	NC_008042	CG	3	6	54608	54613	0 %	0 %	50 %	50 %	99077936
139	NC_008042	GC	3	6	54657	54662	0 %	0 %	50 %	50 %	99077936
140	NC_008042	GC	4	8	55164	55171	0 %	0 %	50 %	50 %	99077937
141	NC_008042	GC	3	6	55190	55195	0 %	0 %	50 %	50 %	99077937
142	NC_008042	CG	3	6	55289	55294	0 %	0 %	50 %	50 %	99077937
143	NC_008042	TG	3	6	55713	55718	0 %	50 %	50 %	0 %	99077938
144	NC_008042	GC	3	6	56927	56932	0 %	0 %	50 %	50 %	99077940
145	NC_008042	CT	3	6	57030	57035	0 %	50 %	0 %	50 %	99077940
146	NC_008042	GT	3	6	58229	58234	0 %	50 %	50 %	0 %	99077941
147	NC_008042	GC	4	8	58346	58353	0 %	0 %	50 %	50 %	99077941
148	NC_008042	CG	3	6	58905	58910	0 %	0 %	50 %	50 %	99077942
149	NC_008042	CG	4	8	60047	60054	0 %	0 %	50 %	50 %	99077943
150	NC_008042	GC	3	6	60529	60534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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296	NC_008042	TC	3	6	126084	126089	0 %	50 %	0 %	50 %	99078004
297	NC_008042	AT	3	6	126583	126588	50 %	50 %	0 %	0 %	99078004
298	NC_008042	CG	3	6	126965	126970	0 %	0 %	50 %	50 %	99078004
299	NC_008042	GC	3	6	127380	127385	0 %	0 %	50 %	50 %	99078005
300	NC_008042	GC	4	8	127624	127631	0 %	0 %	50 %	50 %	99078005
301	NC_008042	CT	3	6	127905	127910	0 %	50 %	0 %	50 %	99078006
302	NC_008042	TG	3	6	128106	128111	0 %	50 %	50 %	0 %	99078006
303	NC_008042	AG	3	6	128364	128369	50 %	0 %	50 %	0 %	99078006
304	NC_008042	GC	3	6	128706	128711	0 %	0 %	50 %	50 %	99078006
305	NC_008042	CA	3	6	128712	128717	50 %	0 %	0 %	50 %	99078006
306	NC_008042	TC	3	6	130602	130607	0 %	50 %	0 %	50 %	99078008
307	NC_008042	GC	3	6	130717	130722	0 %	0 %	50 %	50 %	99078008
308	NC_008042	GC	3	6	130905	130910	0 %	0 %	50 %	50 %	99078008

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.