MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 1672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008042	CAA	2	6	31	36	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077903
2	NC_008042	AGC	2	6	108	113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
3	NC_008042	CGG	2	6	119	124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
4	NC_008042	GAG	2	6	294	299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99077903
5	NC_008042	CTT	2	6	320	325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99077903
6	NC_008042	TCG	2	6	411	416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
7	NC_008042	AAC	2	6	417	422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077903
8	NC_008042	GCC	2	6	551	556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
9	NC_008042	CGG	2	6	575	580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
10	NC_008042	CGC	3	9	611	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
11	NC_008042	CGA	2	6	812	817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
12	NC_008042	ACG	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
13	NC_008042	ACG	2	6	943	948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
14	NC_008042	GCA	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
15	NC_008042	CGG	2	6	1115	1120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
16	NC_008042	ACC	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
17	NC_008042	TGG	2	6	1162	1167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
18	NC_008042	CGA	2	6	1255	1260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
19	NC_008042	GTG	2	6	1401	1406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
20	NC_008042	CGA	2	6	1430	1435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
21	NC_008042	TGG	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
22	NC_008042	CGG	2	6	1541	1546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
23	NC_008042	CAC	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
24	NC_008042	CGA	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
25	NC_008042	TGC	2	6	1787	1792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
26	NC_008042	ACG	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
27	NC_008042	CGG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
28	NC_008042	GCG	2	6	1876	1881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
29	NC_008042	ACA	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077903
30	NC_008042	CAC	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
31	NC_008042	GCG	2	6	2124	2129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
32	NC_008042	TCG	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
33	NC_008042	CCG	2	6	2188	2193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
34	NC_008042	GGT	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
35	NC_008042	GAT	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
36	NC_008042	CGG	2	6	2296	2301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
37	NC_008042	ATG	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
38	NC_008042	ATT	2	6	2349	2354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99077903
39	NC_008042	GCG	3	9	2359	2367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
40	NC_008042	CGG	2	6	2429	2434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
41	NC_008042	GCG	2	6	2458	2463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
42	NC_008042	ACG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
43	NC_008042	TAG	2	6	2527	2532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
44	NC_008042	CAG	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
45	NC_008042	ACG	2	6	2722	2727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
46	NC_008042	TGG	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
47	NC_008042	CCA	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
48	NC_008042	CAA	2	6	3062	3067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077903
49	NC_008042	TCG	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
50	NC_008042	GGC	2	6	3413	3418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
51	NC_008042	GGC	2	6	3426	3431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
52	NC_008042	GCC	2	6	3546	3551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
53	NC_008042	ATG	2	6	3556	3561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
54	NC_008042	CCG	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
55	NC_008042	CGC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
56	NC_008042	CAT	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077903
57	NC_008042	CGG	2	6	3851	3856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
58	NC_008042	GCC	2	6	3873	3878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
59	NC_008042	GAT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
60	NC_008042	CAC	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
61	NC_008042	CTG	2	6	3943	3948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
62	NC_008042	CGC	2	6	3974	3979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
63	NC_008042	GCC	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
64	NC_008042	GGC	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
65	NC_008042	TCA	2	6	4096	4101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077903
66	NC_008042	TGC	2	6	4282	4287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
67	NC_008042	GAT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
68	NC_008042	CAC	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
69	NC_008042	ATC	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077903
70	NC_008042	CGT	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
71	NC_008042	GCG	2	6	4585	4590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
72	NC_008042	GAT	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
73	NC_008042	ACC	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
74	NC_008042	CGG	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
75	NC_008042	TGA	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
76	NC_008042	CGG	2	6	4712	4717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
77	NC_008042	CGG	2	6	4739	4744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
78	NC_008042	CAT	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077903
79	NC_008042	ACG	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
80	NC_008042	GCC	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
81	NC_008042	TGC	2	6	5056	5061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
82	NC_008042	GGA	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99077903
83	NC_008042	GAT	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
84	NC_008042	CGA	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
85	NC_008042	TGG	2	6	5342	5347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008042	TGA	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008042	CGT	2	6	5469	5474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008042	TGC	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008042	GCA	2	6	5572	5577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008042	CGG	2	6	5596	5601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008042	CCG	2	6	5709	5714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008042	TGC	2	6	5735	5740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008042	AGC	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008042	CAC	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008042	GCA	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008042	AGA	2	6	6388	6393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008042	CAT	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008042	GAA	2	6	6629	6634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077904
99	NC_008042	AGC	2	6	6809	6814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
100	NC_008042	GAC	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
101	NC_008042	GAC	2	6	6953	6958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
102	NC_008042	GGC	2	6	6960	6965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077904
103	NC_008042	ACA	2	6	6993	6998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077904
104	NC_008042	ATT	2	6	7007	7012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99077904
105	NC_008042	CGA	2	6	7069	7074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
106	NC_008042	GGC	2	6	7124	7129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077904
107	NC_008042	AGC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
108	NC_008042	GCA	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
109	NC_008042	GCC	2	6	7476	7481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077904
110	NC_008042	AAG	2	6	7538	7543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077904
111	NC_008042	CCT	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008042	CGT	2	6	7694	7699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008042	CCA	2	6	7728	7733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008042	CTA	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008042	ACA	2	6	7784	7789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077905
116	NC_008042	TGG	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077905
117	NC_008042	CGG	2	6	7981	7986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077905
118	NC_008042	ACG	2	6	8000	8005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077905
119	NC_008042	TGA	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077905
120	NC_008042	GCT	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008042	GTT	2	6	8348	8353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008042	TTA	2	6	8393	8398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008042	CCA	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008042	TGA	2	6	8658	8663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008042	TCA	3	9	8667	8675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008042	TGC	2	6	8803	8808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008042	GTG	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008042	CCA	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_008042	CTC	2	6	8999	9004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008042	ACG	2	6	9048	9053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008042	ACC	2	6	9243	9248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008042	AGG	2	6	9379	9384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008042	GGT	2	6	9466	9471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008042	ACC	2	6	9519	9524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008042	GTA	2	6	9563	9568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008042	GCC	2	6	9736	9741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_008042	CCT	2	6	9774	9779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008042	CGT	2	6	9818	9823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008042	TAA	2	6	9852	9857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008042	CCT	2	6	9912	9917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_008042	AAC	2	6	10078	10083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008042	TCC	2	6	10101	10106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008042	TCA	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008042	TCC	2	6	10318	10323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_008042	AGG	2	6	10343	10348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008042	CGC	2	6	10435	10440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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148	NC_008042	CCT	2	6	10506	10511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_008042	GTT	2	6	10513	10518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008042	GTT	2	6	10580	10585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008042	TCG	2	6	11073	11078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008042	GGT	2	6	11148	11153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008042	TCA	2	6	11269	11274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008042	CTA	2	6	11303	11308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_008042	TCC	2	6	11332	11337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_008042	AGC	2	6	11422	11427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_008042	TAT	2	6	11440	11445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008042	CCA	2	6	11563	11568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_008042	CTT	2	6	11701	11706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_008042	ACT	2	6	11790	11795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_008042	GGA	2	6	11902	11907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008042	GTT	2	6	11916	11921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008042	ACC	2	6	11988	11993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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166	NC_008042	AGG	2	6	12095	12100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_008042	CCT	2	6	12114	12119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_008042	TAA	2	6	12219	12224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_008042	TGG	2	6	12225	12230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008042	GAG	2	6	12234	12239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008042	ACC	2	6	12282	12287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_008042	TCT	2	6	12383	12388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_008042	CAT	2	6	12429	12434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_008042	AGG	2	6	12443	12448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_008042	CTG	2	6	12827	12832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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398	NC_008042	GCC	2	6	29330	29335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077916
399	NC_008042	CAC	2	6	29359	29364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077916
400	NC_008042	GTT	2	6	29402	29407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077916
401	NC_008042	GCG	2	6	29564	29569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077916
402	NC_008042	TTG	3	9	29658	29666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077916
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