MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 2495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008042	CCAT	2	8	106359	106366	25 %	25 %	0 %	50 %	99077987
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2003	NC_008042	TGA	2	6	106390	106395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077987
2004	NC_008042	GGC	2	6	106405	106410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077987
2005	NC_008042	CCA	2	6	106489	106494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077987
2006	NC_008042	CCA	2	6	106528	106533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077987
2007	NC_008042	GC	3	6	106543	106548	0 %	0 %	50 %	50 %	99077987
2008	NC_008042	GCC	2	6	106556	106561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077987
2009	NC_008042	TCA	2	6	106606	106611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077987
2010	NC_008042	GGT	2	6	106658	106663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077987
2011	NC_008042	ATGCCG	2	12	106671	106682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99077987
2012	NC_008042	GCA	4	12	106702	106713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077987
2013	NC_008042	GCG	2	6	106781	106786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077987
2014	NC_008042	CAGA	2	8	106841	106848	50 %	0 %	25 %	25 %	99077987
2015	NC_008042	CG	3	6	106852	106857	0 %	0 %	50 %	50 %	99077987
2016	NC_008042	GGC	2	6	106937	106942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077987
2017	NC_008042	GCG	2	6	107067	107072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077987
2018	NC_008042	TCA	2	6	107112	107117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077987
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2020	NC_008042	CG	3	6	107207	107212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2021	NC_008042	GCG	3	9	107221	107229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_008042	AGGC	2	8	107245	107252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2023	NC_008042	T	7	7	107269	107275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2128	NC_008042	GC	3	6	112389	112394	0 %	0 %	50 %	50 %	99077993
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2243	NC_008042	CCATC	2	10	117199	117208	20 %	20 %	0 %	60 %	99077998
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2249	NC_008042	GGC	2	6	117587	117592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077998
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2251	NC_008042	AAT	2	6	117688	117693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99077998
2252	NC_008042	ATC	2	6	117722	117727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077998
2253	NC_008042	ATGG	2	8	117734	117741	25 %	25 %	50 %	0 %	99077998
2254	NC_008042	ACC	2	6	117828	117833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077998
2255	NC_008042	TGT	2	6	117890	117895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077998
2256	NC_008042	ATG	2	6	118055	118060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077998
2257	NC_008042	CGG	2	6	118247	118252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077998
2258	NC_008042	A	6	6	118332	118337	100 %	0 %	0 %	0 %	99077998
2259	NC_008042	TGA	2	6	118341	118346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077998
2260	NC_008042	GGT	2	6	118378	118383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077999
2261	NC_008042	AGG	2	6	118479	118484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99077999
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2271	NC_008042	CAC	2	6	118974	118979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077999
2272	NC_008042	G	7	7	118990	118996	0 %	0 %	100 %	0 %	99077999
2273	NC_008042	CA	3	6	119043	119048	50 %	0 %	0 %	50 %	99077999
2274	NC_008042	GGCA	2	8	119113	119120	25 %	0 %	50 %	25 %	99077999
2275	NC_008042	CCA	2	6	119130	119135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077999
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2278	NC_008042	GC	3	6	119226	119231	0 %	0 %	50 %	50 %	99077999
2279	NC_008042	CAAGA	2	10	119252	119261	60 %	0 %	20 %	20 %	99077999
2280	NC_008042	CG	3	6	119284	119289	0 %	0 %	50 %	50 %	99077999
2281	NC_008042	AC	3	6	119313	119318	50 %	0 %	0 %	50 %	99077999
2282	NC_008042	CCG	2	6	119339	119344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077999
2283	NC_008042	CAA	2	6	119422	119427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077999
2284	NC_008042	CGGG	2	8	119483	119490	0 %	0 %	75 %	25 %	99077999
2285	NC_008042	CA	3	6	119502	119507	50 %	0 %	0 %	50 %	99077999
2286	NC_008042	CGT	2	6	119803	119808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078000
2287	NC_008042	ACC	2	6	119824	119829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078000
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2292	NC_008042	TGC	2	6	120033	120038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078000
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2295	NC_008042	AGA	2	6	120250	120255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078000
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2297	NC_008042	GCC	2	6	120337	120342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078000
2298	NC_008042	CAGG	2	8	120348	120355	25 %	0 %	50 %	25 %	99078000
2299	NC_008042	CGC	2	6	120393	120398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078000
2300	NC_008042	CAT	3	9	120449	120457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078000
2301	NC_008042	AC	3	6	120488	120493	50 %	0 %	0 %	50 %	99078000
2302	NC_008042	ATGTC	2	10	120553	120562	20 %	40 %	20 %	20 %	99078000
2303	NC_008042	CAGCG	2	10	120613	120622	20 %	0 %	40 %	40 %	99078000
2304	NC_008042	TAGG	2	8	120699	120706	25 %	25 %	50 %	0 %	99078000
2305	NC_008042	CCT	2	6	120728	120733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078000
2306	NC_008042	GC	3	6	120748	120753	0 %	0 %	50 %	50 %	99078000
2307	NC_008042	GTT	2	6	120849	120854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078000
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2309	NC_008042	TCG	2	6	120958	120963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078000
2310	NC_008042	AAC	2	6	121024	121029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078000
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2315	NC_008042	GATAC	2	10	121230	121239	40 %	20 %	20 %	20 %	99078000
2316	NC_008042	TTAG	2	8	121249	121256	25 %	50 %	25 %	0 %	99078000
2317	NC_008042	TTG	2	6	121304	121309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078000
2318	NC_008042	CGG	2	6	121335	121340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078000
2319	NC_008042	GCC	2	6	121350	121355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078000
2320	NC_008042	TTG	2	6	121368	121373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078000
2321	NC_008042	GGGC	2	8	121890	121897	0 %	0 %	75 %	25 %	99078000
2322	NC_008042	TCC	2	6	122023	122028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078000
2323	NC_008042	AT	3	6	122036	122041	50 %	50 %	0 %	0 %	99078000
2324	NC_008042	GGC	2	6	122051	122056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078000
2325	NC_008042	TGG	2	6	122081	122086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078000
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2330	NC_008042	CGA	2	6	122431	122436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078001
2331	NC_008042	CAG	2	6	122438	122443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078001
2332	NC_008042	AGG	2	6	122460	122465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078001
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2334	NC_008042	GCC	2	6	122522	122527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078001
2335	NC_008042	ATC	2	6	122565	122570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078001
2336	NC_008042	AGT	2	6	122585	122590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078001
2337	NC_008042	CTG	2	6	122677	122682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078001
2338	NC_008042	GAT	2	6	122717	122722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078001
2339	NC_008042	GCC	2	6	122723	122728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078001
2340	NC_008042	ATCACG	2	12	122730	122741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99078001
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2342	NC_008042	CCA	2	6	122776	122781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078001
2343	NC_008042	GCCGC	2	10	122819	122828	0 %	0 %	40 %	60 %	99078001
2344	NC_008042	ATC	2	6	122850	122855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078001
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2353	NC_008042	CAT	2	6	123104	123109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078001
2354	NC_008042	GC	3	6	123136	123141	0 %	0 %	50 %	50 %	99078001
2355	NC_008042	ATG	2	6	123207	123212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078001
2356	NC_008042	A	6	6	123227	123232	100 %	0 %	0 %	0 %	99078001
2357	NC_008042	TGC	2	6	123276	123281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078001
2358	NC_008042	ACA	2	6	123316	123321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078001
2359	NC_008042	GGT	2	6	123332	123337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078001
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2362	NC_008042	CGC	2	6	123429	123434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2363	NC_008042	ACC	2	6	123448	123453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078002
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2367	NC_008042	GCCC	2	8	123713	123720	0 %	0 %	25 %	75 %	99078002
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2369	NC_008042	CCAA	2	8	123785	123792	50 %	0 %	0 %	50 %	99078002
2370	NC_008042	TGA	2	6	123864	123869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078002
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2372	NC_008042	TCG	2	6	123906	123911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078002
2373	NC_008042	GAG	2	6	123925	123930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078002
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2375	NC_008042	CTC	2	6	123999	124004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2377	NC_008042	AAAT	2	8	124074	124081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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