MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 2495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008042	AGC	2	6	50360	50365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077932
1002	NC_008042	CAA	2	6	50422	50427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077932
1003	NC_008042	AAGCG	2	10	50636	50645	40 %	0 %	40 %	20 %	99077932
1004	NC_008042	ATT	2	6	50672	50677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99077932
1005	NC_008042	GT	3	6	50687	50692	0 %	50 %	50 %	0 %	99077932
1006	NC_008042	GGA	2	6	50771	50776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99077932
1007	NC_008042	GAC	2	6	50810	50815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077932
1008	NC_008042	GAC	2	6	50871	50876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077932
1009	NC_008042	GAA	2	6	50937	50942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077932
1010	NC_008042	GCA	2	6	50967	50972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077932
1011	NC_008042	CCG	2	6	50992	50997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077932
1012	NC_008042	GCG	2	6	51000	51005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077932
1013	NC_008042	AGA	2	6	51008	51013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077932
1014	NC_008042	AAG	2	6	51049	51054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077932
1015	NC_008042	CGA	2	6	51101	51106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077932
1016	NC_008042	TGC	2	6	51155	51160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077932
1017	NC_008042	CGA	2	6	51164	51169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077932
1018	NC_008042	TCTA	2	8	51217	51224	25 %	50 %	0 %	25 %	99077932
1019	NC_008042	CAA	2	6	51230	51235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077932
1020	NC_008042	TGGC	2	8	51295	51302	0 %	25 %	50 %	25 %	99077932
1021	NC_008042	TA	3	6	51305	51310	50 %	50 %	0 %	0 %	99077932
1022	NC_008042	AGT	2	6	51457	51462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077932
1023	NC_008042	TGA	2	6	51651	51656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008042	GTC	2	6	51662	51667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_008042	GCT	2	6	51708	51713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_008042	CTAA	2	8	51809	51816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_008042	GCC	2	6	51866	51871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_008042	GC	3	6	52178	52183	0 %	0 %	50 %	50 %	99077933
1029	NC_008042	GCA	2	6	52211	52216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077933
1030	NC_008042	GACG	2	8	52342	52349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_008042	GC	3	6	52356	52361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_008042	TAG	2	6	52372	52377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008042	CGAAC	2	10	52411	52420	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1034	NC_008042	A	7	7	52437	52443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008042	TGAA	2	8	52482	52489	50 %	25 %	25 %	0 %	99077934
1036	NC_008042	TTC	2	6	52548	52553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99077934
1037	NC_008042	TTG	2	6	52554	52559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077934
1038	NC_008042	TGC	2	6	52615	52620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077934
1039	NC_008042	TGG	2	6	52636	52641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077934
1040	NC_008042	TGC	2	6	52722	52727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077934
1041	NC_008042	AAGC	2	8	52766	52773	50 %	0 %	25 %	25 %	99077934
1042	NC_008042	CAA	2	6	52804	52809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077934
1043	NC_008042	TACC	2	8	52828	52835	25 %	25 %	0 %	50 %	99077934
1044	NC_008042	GTG	2	6	52844	52849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077934
1045	NC_008042	ACG	2	6	52898	52903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077934
1046	NC_008042	CTGG	2	8	52942	52949	0 %	25 %	50 %	25 %	99077934
1047	NC_008042	TCA	2	6	53004	53009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077934
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1049	NC_008042	GAA	2	6	53119	53124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077935
1050	NC_008042	GTCG	2	8	53248	53255	0 %	25 %	50 %	25 %	99077935
1051	NC_008042	GGC	2	6	53303	53308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077935
1052	NC_008042	CGCTTG	2	12	53310	53321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077935
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1058	NC_008042	GGA	2	6	53671	53676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99077935
1059	NC_008042	CG	3	6	53680	53685	0 %	0 %	50 %	50 %	99077935
1060	NC_008042	GCA	2	6	53698	53703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077935
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1062	NC_008042	CAGCG	2	10	53825	53834	20 %	0 %	40 %	40 %	99077935
1063	NC_008042	GTT	2	6	53839	53844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077935
1064	NC_008042	TGG	2	6	53880	53885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077935
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1089	NC_008042	GC	3	6	55190	55195	0 %	0 %	50 %	50 %	99077937
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1104	NC_008042	CGC	2	6	56333	56338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077939
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1110	NC_008042	CGG	2	6	56517	56522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077939
1111	NC_008042	CTG	2	6	56658	56663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077940
1112	NC_008042	CGG	2	6	56668	56673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077940
1113	NC_008042	CGA	2	6	56693	56698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077940
1114	NC_008042	GCA	2	6	56755	56760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077940
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1116	NC_008042	GGGT	2	8	56876	56883	0 %	25 %	75 %	0 %	99077940
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1119	NC_008042	GC	3	6	56927	56932	0 %	0 %	50 %	50 %	99077940
1120	NC_008042	GAC	2	6	56964	56969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077940
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1122	NC_008042	TGCA	2	8	57036	57043	25 %	25 %	25 %	25 %	99077940
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1125	NC_008042	CAT	2	6	57350	57355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077940
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1129	NC_008042	CGG	2	6	57691	57696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077941
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