MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 2495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008042	TGA	2	6	24118	24123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008042	G	6	6	24155	24160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008042	TGTT	2	8	24205	24212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008042	GC	3	6	24216	24221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_008042	GTT	2	6	24223	24228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008042	TCA	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008042	GT	3	6	24276	24281	0 %	50 %	50 %	0 %	99077913
508	NC_008042	GGA	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99077913
509	NC_008042	GTA	2	6	24340	24345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077913
510	NC_008042	CTTC	2	8	24366	24373	0 %	50 %	0 %	50 %	99077913
511	NC_008042	GAA	2	6	24439	24444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077913
512	NC_008042	TCG	2	6	24578	24583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077913
513	NC_008042	T	6	6	24653	24658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008042	TGCTT	2	10	24664	24673	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
515	NC_008042	ATG	2	6	24778	24783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008042	TTTG	2	8	24786	24793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008042	CTG	2	6	24797	24802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008042	TAA	2	6	24906	24911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008042	CTT	2	6	24943	24948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008042	T	7	7	24947	24953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008042	TCC	2	6	24961	24966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_008042	GT	3	6	24996	25001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008042	TTGG	2	8	25002	25009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008042	TGT	2	6	25067	25072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008042	GAT	2	6	25205	25210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077914
526	NC_008042	GTC	2	6	25211	25216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077914
527	NC_008042	ACTG	2	8	25334	25341	25 %	25 %	25 %	25 %	99077914
528	NC_008042	ATC	2	6	25343	25348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077914
529	NC_008042	ACA	2	6	25374	25379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077914
530	NC_008042	TGG	2	6	25401	25406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077914
531	NC_008042	GCA	2	6	25422	25427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077914
532	NC_008042	ACC	2	6	25486	25491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077914
533	NC_008042	GAT	2	6	25501	25506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077914
534	NC_008042	TAA	2	6	25624	25629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99077914
535	NC_008042	GAC	2	6	25724	25729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077914
536	NC_008042	AAC	2	6	25805	25810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077914
537	NC_008042	AAG	2	6	25893	25898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077914
538	NC_008042	GACA	2	8	25934	25941	50 %	0 %	25 %	25 %	99077914
539	NC_008042	AAG	2	6	25998	26003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077914
540	NC_008042	AAG	2	6	26019	26024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077914
541	NC_008042	CGA	2	6	26071	26076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077914
542	NC_008042	ACA	2	6	26250	26255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077914
543	NC_008042	AG	3	6	26308	26313	50 %	0 %	50 %	0 %	99077914
544	NC_008042	TCAA	2	8	26355	26362	50 %	25 %	0 %	25 %	99077914
545	NC_008042	TTG	2	6	26396	26401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077914
546	NC_008042	GCTGA	2	10	26470	26479	20 %	20 %	40 %	20 %	99077914
547	NC_008042	CAA	2	6	26503	26508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077914
548	NC_008042	CGA	2	6	26626	26631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008042	AAG	2	6	26755	26760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008042	AG	3	6	26759	26764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008042	GCAG	2	8	26766	26773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_008042	TGA	2	6	26791	26796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008042	ACC	2	6	26824	26829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_008042	TTC	2	6	26846	26851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_008042	GAT	2	6	26888	26893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008042	GA	3	6	26908	26913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008042	CCG	2	6	26946	26951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_008042	TG	3	6	26967	26972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008042	CTTT	2	8	27017	27024	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_008042	CGC	2	6	27035	27040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_008042	TG	3	6	27059	27064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008042	GA	3	6	27113	27118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008042	AT	3	6	27192	27197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008042	GAT	2	6	27224	27229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008042	TGC	2	6	27305	27310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_008042	AAC	2	6	27398	27403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008042	GA	3	6	27451	27456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008042	CAG	2	6	27493	27498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008042	GGCAG	2	10	27501	27510	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
570	NC_008042	GCC	2	6	27608	27613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_008042	TCC	2	6	27645	27650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_008042	GC	3	6	27660	27665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_008042	TCCC	2	8	27669	27676	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
574	NC_008042	CCA	2	6	27709	27714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_008042	CAG	2	6	27776	27781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_008042	GAAG	2	8	27783	27790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008042	GCCC	2	8	27791	27798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
578	NC_008042	AGG	2	6	27839	27844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008042	ATC	2	6	27897	27902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077915
580	NC_008042	GCC	2	6	27923	27928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077915
581	NC_008042	GTG	2	6	28128	28133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077915
582	NC_008042	CCG	2	6	28237	28242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077915
583	NC_008042	CTTT	2	8	28306	28313	0 %	75 %	0 %	25 %	99077915
584	NC_008042	GC	3	6	28324	28329	0 %	0 %	50 %	50 %	99077915
585	NC_008042	CG	3	6	28351	28356	0 %	0 %	50 %	50 %	99077915
586	NC_008042	CTA	2	6	28358	28363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077915
587	NC_008042	GACC	2	8	28373	28380	25 %	0 %	25 %	50 %	99077915
588	NC_008042	GCC	2	6	28391	28396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077915
589	NC_008042	CAA	2	6	28468	28473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077915
590	NC_008042	GCC	2	6	28599	28604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077915
591	NC_008042	GAAG	2	8	28631	28638	50 %	0 %	50 %	0 %	99077915
592	NC_008042	CG	3	6	28644	28649	0 %	0 %	50 %	50 %	99077915
593	NC_008042	GCC	2	6	28725	28730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077915
594	NC_008042	CCG	2	6	28746	28751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_008042	GGT	2	6	28814	28819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008042	CGG	2	6	28835	28840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008042	CCG	2	6	28857	28862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_008042	CTG	2	6	28919	28924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008042	GCA	2	6	28980	28985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_008042	CG	3	6	28986	28991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_008042	TCC	2	6	28998	29003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_008042	TCA	2	6	29078	29083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008042	A	6	6	29101	29106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008042	GGC	2	6	29107	29112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008042	GCC	2	6	29123	29128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_008042	GCC	2	6	29330	29335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077916
607	NC_008042	CAC	2	6	29359	29364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077916
608	NC_008042	GTT	2	6	29402	29407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077916
609	NC_008042	GC	4	8	29430	29437	0 %	0 %	50 %	50 %	99077916
610	NC_008042	CCGC	2	8	29460	29467	0 %	0 %	25 %	75 %	99077916
611	NC_008042	GCG	2	6	29564	29569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077916
612	NC_008042	CG	3	6	29579	29584	0 %	0 %	50 %	50 %	99077916
613	NC_008042	CG	3	6	29639	29644	0 %	0 %	50 %	50 %	99077916
614	NC_008042	TTG	3	9	29658	29666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077916
615	NC_008042	CGT	2	6	29704	29709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077916
616	NC_008042	TC	3	6	29737	29742	0 %	50 %	0 %	50 %	99077916
617	NC_008042	CAAC	2	8	29785	29792	50 %	0 %	0 %	50 %	99077916
618	NC_008042	TGC	2	6	29845	29850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077916
619	NC_008042	TGGCG	2	10	29861	29870	0 %	20 %	60 %	20 %	99077916
620	NC_008042	CCATCA	2	12	29878	29889	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	99077916
621	NC_008042	AAG	2	6	29960	29965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077916
622	NC_008042	CTTTT	2	10	30010	30019	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
623	NC_008042	GCG	2	6	30143	30148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077917
624	NC_008042	TGT	2	6	30181	30186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99077917
625	NC_008042	CG	3	6	30395	30400	0 %	0 %	50 %	50 %	99077917
626	NC_008042	GCG	2	6	30441	30446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077917
627	NC_008042	CCT	2	6	30508	30513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_008042	CAC	2	6	30597	30602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077918
629	NC_008042	TCG	2	6	30664	30669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077918
630	NC_008042	CCA	2	6	30685	30690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077918
631	NC_008042	GAT	2	6	30768	30773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077918
632	NC_008042	ACG	2	6	30799	30804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077918
633	NC_008042	GCA	2	6	30824	30829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077918
634	NC_008042	CCA	2	6	30941	30946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077918
635	NC_008042	CGG	2	6	30962	30967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077918
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637	NC_008042	GAT	2	6	31008	31013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077918
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