MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 4583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007958	CCTGA	2	10	515	524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007958	GCGCC	2	10	3786	3795	0 %	0 %	40 %	60 %	91974485
3	NC_007958	CGCGG	2	10	4236	4245	0 %	0 %	60 %	40 %	91974485
4	NC_007958	CGCGG	2	10	4267	4276	0 %	0 %	60 %	40 %	91974485
5	NC_007958	CGATT	2	10	4954	4963	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007958	TTCCG	2	10	5026	5035	0 %	40 %	20 %	40 %	91974486
7	NC_007958	GTGCT	2	10	5831	5840	0 %	40 %	40 %	20 %	91974486
8	NC_007958	CCGCG	2	10	5890	5899	0 %	0 %	40 %	60 %	91974486
9	NC_007958	CCGCC	2	10	6727	6736	0 %	0 %	20 %	80 %	91974486
10	NC_007958	CCCCG	2	10	7118	7127	0 %	0 %	20 %	80 %	91974486
11	NC_007958	CGATC	2	10	8537	8546	20 %	20 %	20 %	40 %	91974488
12	NC_007958	ATCGC	2	10	8732	8741	20 %	20 %	20 %	40 %	91974488
13	NC_007958	GCCCA	2	10	9114	9123	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_007958	GGCCA	2	10	11252	11261	20 %	0 %	40 %	40 %	91974491
15	NC_007958	GCGCT	2	10	11378	11387	0 %	20 %	40 %	40 %	91974491
16	NC_007958	CGAAC	2	10	11987	11996	40 %	0 %	20 %	40 %	91974492
17	NC_007958	CGCGG	2	10	12547	12556	0 %	0 %	60 %	40 %	91974493
18	NC_007958	TCGTT	2	10	13067	13076	0 %	60 %	20 %	20 %	91974494
19	NC_007958	CGCGC	2	10	14303	14312	0 %	0 %	40 %	60 %	91974494
20	NC_007958	TCCTG	2	10	23502	23511	0 %	40 %	20 %	40 %	91974499
21	NC_007958	CCGGC	2	10	23636	23645	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_007958	ATCCG	2	10	25474	25483	20 %	20 %	20 %	40 %	91974502
23	NC_007958	AGATG	2	10	27310	27319	40 %	20 %	40 %	0 %	91974502
24	NC_007958	CGCTG	2	10	31571	31580	0 %	20 %	40 %	40 %	91974507
25	NC_007958	CTGAT	2	10	31708	31717	20 %	40 %	20 %	20 %	91974507
26	NC_007958	GATGC	2	10	32534	32543	20 %	20 %	40 %	20 %	91974508
27	NC_007958	GACGG	2	10	33867	33876	20 %	0 %	60 %	20 %	91974509
28	NC_007958	GGCGA	2	10	34146	34155	20 %	0 %	60 %	20 %	91974509
29	NC_007958	TGGCC	2	10	37948	37957	0 %	20 %	40 %	40 %	91974512
30	NC_007958	CCGCT	2	10	38757	38766	0 %	20 %	20 %	60 %	91974513
31	NC_007958	TGTCG	2	10	39378	39387	0 %	40 %	40 %	20 %	91974514
32	NC_007958	GCGCG	2	10	39955	39964	0 %	0 %	60 %	40 %	91974515
33	NC_007958	CGACG	2	10	40141	40150	20 %	0 %	40 %	40 %	91974516
34	NC_007958	TCGGC	2	10	40791	40800	0 %	20 %	40 %	40 %	91974517
35	NC_007958	GCGAT	2	10	41602	41611	20 %	20 %	40 %	20 %	91974517
36	NC_007958	GATCC	2	10	44059	44068	20 %	20 %	20 %	40 %	91974518
37	NC_007958	GACGT	2	10	46506	46515	20 %	20 %	40 %	20 %	91974519
38	NC_007958	CGGCC	2	10	47606	47615	0 %	0 %	40 %	60 %	91974519
39	NC_007958	AGCCG	2	10	47719	47728	20 %	0 %	40 %	40 %	91974519
40	NC_007958	AGGCA	2	10	48888	48897	40 %	0 %	40 %	20 %	91974520
41	NC_007958	CAGTT	2	10	50544	50553	20 %	40 %	20 %	20 %	91974522
42	NC_007958	ACAGC	2	10	56323	56332	40 %	0 %	20 %	40 %	91974526
43	NC_007958	ATCGC	2	10	56646	56655	20 %	20 %	20 %	40 %	91974526
44	NC_007958	CGGAT	2	10	58573	58582	20 %	20 %	40 %	20 %	91974528
45	NC_007958	CGGTC	2	10	59211	59220	0 %	20 %	40 %	40 %	91974529
46	NC_007958	TGCGC	2	10	60328	60337	0 %	20 %	40 %	40 %	91974530
47	NC_007958	CGTCG	2	10	60836	60845	0 %	20 %	40 %	40 %	91974530
48	NC_007958	CCAGC	2	10	61745	61754	20 %	0 %	20 %	60 %	91974531
49	NC_007958	GCGTG	2	10	63045	63054	0 %	20 %	60 %	20 %	91974531
50	NC_007958	CGGCT	2	10	63085	63094	0 %	20 %	40 %	40 %	91974531
51	NC_007958	CAGCG	2	10	65234	65243	20 %	0 %	40 %	40 %	91974534
52	NC_007958	CGGCG	2	10	65898	65907	0 %	0 %	60 %	40 %	91974535
53	NC_007958	CGGCG	2	10	66574	66583	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007958	TCATA	2	10	67156	67165	40 %	40 %	0 %	20 %	91974536
55	NC_007958	ATCGC	2	10	67305	67314	20 %	20 %	20 %	40 %	91974536
56	NC_007958	CGGGC	2	10	67904	67913	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_007958	CGCTT	2	10	68815	68824	0 %	40 %	20 %	40 %	91974538
58	NC_007958	CCTCA	2	10	68992	69001	20 %	20 %	0 %	60 %	91974538
59	NC_007958	GCCTT	2	10	70222	70231	0 %	40 %	20 %	40 %	91974541
60	NC_007958	GGGCT	2	10	70298	70307	0 %	20 %	60 %	20 %	91974541
61	NC_007958	CGATG	2	10	70385	70394	20 %	20 %	40 %	20 %	91974541
62	NC_007958	ACGCG	2	10	71028	71037	20 %	0 %	40 %	40 %	91974542
63	NC_007958	CGACC	2	10	75005	75014	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_007958	GCCGA	2	10	75784	75793	20 %	0 %	40 %	40 %	91974546
65	NC_007958	TTCGG	2	10	76147	76156	0 %	40 %	40 %	20 %	91974546
66	NC_007958	GAGCA	2	10	77417	77426	40 %	0 %	40 %	20 %	91974547
67	NC_007958	CGGTG	2	10	77938	77947	0 %	20 %	60 %	20 %	91974547
68	NC_007958	ATCGG	2	10	78522	78531	20 %	20 %	40 %	20 %	91974547
69	NC_007958	GATAT	2	10	79219	79228	40 %	40 %	20 %	0 %	91974548
70	NC_007958	GCACG	2	10	80498	80507	20 %	0 %	40 %	40 %	91974548
71	NC_007958	ATCAA	2	10	81130	81139	60 %	20 %	0 %	20 %	91974548
72	NC_007958	GCGCC	2	10	84113	84122	0 %	0 %	40 %	60 %	91974550
73	NC_007958	GATCA	2	10	84164	84173	40 %	20 %	20 %	20 %	91974550
74	NC_007958	CGGGT	2	10	84284	84293	0 %	20 %	60 %	20 %	91974550
75	NC_007958	TCGCG	2	10	86439	86448	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_007958	GGGCC	2	10	87042	87051	0 %	0 %	60 %	40 %	91974552
77	NC_007958	CGCTG	2	10	88959	88968	0 %	20 %	40 %	40 %	91974555
78	NC_007958	CAGGC	2	10	89410	89419	20 %	0 %	40 %	40 %	91974555
79	NC_007958	TCGTC	2	10	91988	91997	0 %	40 %	20 %	40 %	91974558
80	NC_007958	CGCGG	2	10	92421	92430	0 %	0 %	60 %	40 %	91974559
81	NC_007958	CGAGC	2	10	92624	92633	20 %	0 %	40 %	40 %	91974559
82	NC_007958	GCCGT	2	10	93977	93986	0 %	20 %	40 %	40 %	91974560
83	NC_007958	CGAAA	2	10	94251	94260	60 %	0 %	20 %	20 %	91974560
84	NC_007958	CAGCG	2	10	94773	94782	20 %	0 %	40 %	40 %	91974561
85	NC_007958	GCGCG	2	10	95000	95009	0 %	0 %	60 %	40 %	91974561
86	NC_007958	GGCGC	2	10	97343	97352	0 %	0 %	60 %	40 %	91974564
87	NC_007958	GGCGG	2	10	97546	97555	0 %	0 %	80 %	20 %	91974564
88	NC_007958	CCGAA	2	10	98248	98257	40 %	0 %	20 %	40 %	91974564
89	NC_007958	ATCGG	2	10	99250	99259	20 %	20 %	40 %	20 %	91974565
90	NC_007958	CGCGC	2	10	99418	99427	0 %	0 %	40 %	60 %	91974565
91	NC_007958	ACGCC	2	10	100104	100113	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_007958	CGCGG	2	10	100939	100948	0 %	0 %	60 %	40 %	91974567
93	NC_007958	GCGCG	2	10	101083	101092	0 %	0 %	60 %	40 %	91974567
94	NC_007958	CCGCG	2	10	104539	104548	0 %	0 %	40 %	60 %	91974571
95	NC_007958	CGGCG	2	10	104734	104743	0 %	0 %	60 %	40 %	91974571
96	NC_007958	CGGCG	2	10	104761	104770	0 %	0 %	60 %	40 %	91974571
97	NC_007958	CGACC	2	10	105738	105747	20 %	0 %	20 %	60 %	91974572
98	NC_007958	TGCGA	2	10	105829	105838	20 %	20 %	40 %	20 %	91974572
99	NC_007958	CCACA	2	10	106630	106639	40 %	0 %	0 %	60 %	91974573
100	NC_007958	CGATC	2	10	107005	107014	20 %	20 %	20 %	40 %	91974573
101	NC_007958	GCCGA	2	10	107344	107353	20 %	0 %	40 %	40 %	91974574
102	NC_007958	GCGCC	2	10	107394	107403	0 %	0 %	40 %	60 %	91974574
103	NC_007958	GGCGC	2	10	108613	108622	0 %	0 %	60 %	40 %	91974576
104	NC_007958	CGGCG	2	10	109470	109479	0 %	0 %	60 %	40 %	91974577
105	NC_007958	TTCGC	2	10	110380	110389	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007958	GCGCA	2	10	112934	112943	20 %	0 %	40 %	40 %	91974580
107	NC_007958	CCAGC	2	10	113321	113330	20 %	0 %	20 %	60 %	91974580
108	NC_007958	GCCGC	2	10	114391	114400	0 %	0 %	40 %	60 %	91974580
109	NC_007958	CGACG	2	10	114988	114997	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007958	GCCGC	2	10	115111	115120	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_007958	AGGTC	2	10	115530	115539	20 %	20 %	40 %	20 %	91974581
112	NC_007958	CGTGC	2	10	115750	115759	0 %	20 %	40 %	40 %	91974581
113	NC_007958	CGGCG	2	10	116754	116763	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_007958	GCAGC	2	10	118517	118526	20 %	0 %	40 %	40 %	91974583
115	NC_007958	GCCTC	2	10	118688	118697	0 %	20 %	20 %	60 %	91974584
116	NC_007958	TCGCA	2	10	120702	120711	20 %	20 %	20 %	40 %	91974586
117	NC_007958	ACCGC	2	10	122922	122931	20 %	0 %	20 %	60 %	91974590
118	NC_007958	GCTGC	2	10	123059	123068	0 %	20 %	40 %	40 %	91974590
119	NC_007958	GCGAC	2	10	127241	127250	20 %	0 %	40 %	40 %	91974595
120	NC_007958	CCGGA	2	10	127859	127868	20 %	0 %	40 %	40 %	91974596
121	NC_007958	GGGTG	2	10	128523	128532	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007958	CACCC	2	10	128563	128572	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
123	NC_007958	GCGCG	2	10	129739	129748	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_007958	CCTAC	2	10	130241	130250	20 %	20 %	0 %	60 %	91974598
125	NC_007958	GCCAC	2	10	130324	130333	20 %	0 %	20 %	60 %	91974598
126	NC_007958	CCGCA	2	10	130382	130391	20 %	0 %	20 %	60 %	91974598
127	NC_007958	CGGCT	2	10	130803	130812	0 %	20 %	40 %	40 %	91974598
128	NC_007958	CCGCG	2	10	131861	131870	0 %	0 %	40 %	60 %	91974598
129	NC_007958	CGGCG	2	10	133242	133251	0 %	0 %	60 %	40 %	91974599
130	NC_007958	GCGAC	2	10	134154	134163	20 %	0 %	40 %	40 %	91974600
131	NC_007958	CGTCC	2	10	135488	135497	0 %	20 %	20 %	60 %	91974601
132	NC_007958	TCGCG	2	10	136147	136156	0 %	20 %	40 %	40 %	91974601
133	NC_007958	CCGCG	2	10	137924	137933	0 %	0 %	40 %	60 %	91974601
134	NC_007958	TGCAC	2	10	138838	138847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_007958	CCGAC	2	10	139611	139620	20 %	0 %	20 %	60 %	91974603
136	NC_007958	CCCCG	2	10	140790	140799	0 %	0 %	20 %	80 %	91974604
137	NC_007958	CGCGG	2	10	142143	142152	0 %	0 %	60 %	40 %	91974606
138	NC_007958	GCGCC	2	10	143366	143375	0 %	0 %	40 %	60 %	91974606
139	NC_007958	TGGGG	2	10	143832	143841	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_007958	CGGCG	2	10	274051	274060	0 %	0 %	60 %	40 %	91974717
264	NC_007958	CCGGA	2	10	274553	274562	20 %	0 %	40 %	40 %	91974717
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268	NC_007958	GCGCC	2	10	278684	278693	0 %	0 %	40 %	60 %	91974721
269	NC_007958	AGCCG	2	10	280094	280103	20 %	0 %	40 %	40 %	91974723
270	NC_007958	GCCGC	2	10	282422	282431	0 %	0 %	40 %	60 %	91974725
271	NC_007958	GCGAC	2	10	282899	282908	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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