MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia bellii RML369-C chromosome

Total Repeats: 1486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007940	GTATT	2	10	176	185	20 %	60 %	20 %	0 %	91204816
2	NC_007940	ATATT	2	10	431	440	40 %	60 %	0 %	0 %	91204816
3	NC_007940	AAAGT	2	10	1033	1042	60 %	20 %	20 %	0 %	91204817
4	NC_007940	AACAG	2	10	1609	1618	60 %	0 %	20 %	20 %	91204818
5	NC_007940	TTGTT	2	10	2308	2317	0 %	80 %	20 %	0 %	91204819
6	NC_007940	TATTC	2	10	2874	2883	20 %	60 %	0 %	20 %	91204820
7	NC_007940	TTTAA	2	10	3780	3789	40 %	60 %	0 %	0 %	91204820
8	NC_007940	TAAAT	2	10	4817	4826	60 %	40 %	0 %	0 %	91204820
9	NC_007940	GTAGT	2	10	5158	5167	20 %	40 %	40 %	0 %	91204820
10	NC_007940	ATGCA	2	10	5817	5826	40 %	20 %	20 %	20 %	91204820
11	NC_007940	GCAAG	2	10	6481	6490	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007940	CAGAA	2	10	6588	6597	60 %	0 %	20 %	20 %	91204822
13	NC_007940	TTTCA	2	10	8431	8440	20 %	60 %	0 %	20 %	91204823
14	NC_007940	ATTAT	2	10	8673	8682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007940	ATTAT	2	10	9825	9834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007940	TTTAA	2	10	11847	11856	40 %	60 %	0 %	0 %	91204827
17	NC_007940	ATCTA	2	10	14196	14205	40 %	40 %	0 %	20 %	91204830
18	NC_007940	TACTC	2	10	15312	15321	20 %	40 %	0 %	40 %	91204831
19	NC_007940	TTGGG	2	10	16183	16192	0 %	40 %	60 %	0 %	91204832
20	NC_007940	AAATA	2	10	16414	16423	80 %	20 %	0 %	0 %	91204832
21	NC_007940	ACTTA	2	10	17284	17293	40 %	40 %	0 %	20 %	91204832
22	NC_007940	ATATA	2	10	17587	17596	60 %	40 %	0 %	0 %	91204833
23	NC_007940	ACTAA	2	10	20480	20489	60 %	20 %	0 %	20 %	91204836
24	NC_007940	ATCTT	2	10	20599	20608	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007940	TTATA	2	10	20641	20650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007940	GGTTA	2	10	21174	21183	20 %	40 %	40 %	0 %	91204837
27	NC_007940	TAAGA	2	10	21220	21229	60 %	20 %	20 %	0 %	91204837
28	NC_007940	AAGAA	2	10	21609	21618	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007940	ATATA	2	10	21623	21632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007940	CAAAA	2	10	22222	22231	80 %	0 %	0 %	20 %	91204838
31	NC_007940	AAAGC	2	10	22428	22437	60 %	0 %	20 %	20 %	91204838
32	NC_007940	TTTAA	2	10	22791	22800	40 %	60 %	0 %	0 %	91204838
33	NC_007940	TATGG	2	10	23852	23861	20 %	40 %	40 %	0 %	91204839
34	NC_007940	TAAAC	2	10	26992	27001	60 %	20 %	0 %	20 %	91204843
35	NC_007940	ATTTA	2	10	27508	27517	40 %	60 %	0 %	0 %	91204843
36	NC_007940	GATGA	2	10	30664	30673	40 %	20 %	40 %	0 %	91204845
37	NC_007940	CTTAT	2	10	30773	30782	20 %	60 %	0 %	20 %	91204845
38	NC_007940	AACTC	2	10	31348	31357	40 %	20 %	0 %	40 %	91204846
39	NC_007940	AATTT	2	10	31999	32008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007940	GTATG	2	10	34472	34481	20 %	40 %	40 %	0 %	91204849
41	NC_007940	GAGTA	2	10	35487	35496	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007940	TATTT	2	10	36081	36090	20 %	80 %	0 %	0 %	91204850
43	NC_007940	TATAA	2	10	38624	38633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007940	TAATT	2	10	39348	39357	40 %	60 %	0 %	0 %	91204853
45	NC_007940	TAATT	2	10	39543	39552	40 %	60 %	0 %	0 %	91204853
46	NC_007940	ATAAA	2	10	40052	40061	80 %	20 %	0 %	0 %	91204853
47	NC_007940	ATTTT	2	10	40463	40472	20 %	80 %	0 %	0 %	91204853
48	NC_007940	ATTTA	2	10	41688	41697	40 %	60 %	0 %	0 %	91204853
49	NC_007940	GTTTA	2	10	43123	43132	20 %	60 %	20 %	0 %	91204854
50	NC_007940	AGATT	2	10	43450	43459	40 %	40 %	20 %	0 %	91204855
51	NC_007940	TAATA	2	10	48513	48522	60 %	40 %	0 %	0 %	91204860
52	NC_007940	CTGCT	2	10	49887	49896	0 %	40 %	20 %	40 %	91204862
53	NC_007940	ACAAG	2	10	50416	50425	60 %	0 %	20 %	20 %	91204862
54	NC_007940	TAAAA	2	10	52926	52935	80 %	20 %	0 %	0 %	91204866
55	NC_007940	ATTAT	2	10	55986	55995	40 %	60 %	0 %	0 %	91204870
56	NC_007940	GAAAA	2	10	56070	56079	80 %	0 %	20 %	0 %	91204870
57	NC_007940	AAAAC	2	10	59303	59312	80 %	0 %	0 %	20 %	91204872
58	NC_007940	AAATG	2	10	59986	59995	60 %	20 %	20 %	0 %	91204872
59	NC_007940	ATGGA	2	10	60448	60457	40 %	20 %	40 %	0 %	91204872
60	NC_007940	AAATA	2	10	61035	61044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007940	CTTTT	2	10	63909	63918	0 %	80 %	0 %	20 %	91204878
62	NC_007940	TTTTA	2	10	65172	65181	20 %	80 %	0 %	0 %	91204880
63	NC_007940	TTTAT	2	10	65821	65830	20 %	80 %	0 %	0 %	91204880
64	NC_007940	TATAA	2	10	67233	67242	60 %	40 %	0 %	0 %	91204881
65	NC_007940	TTATC	2	10	68695	68704	20 %	60 %	0 %	20 %	91204882
66	NC_007940	ATATT	2	10	68959	68968	40 %	60 %	0 %	0 %	91204882
67	NC_007940	TTCTT	2	10	69508	69517	0 %	80 %	0 %	20 %	91204883
68	NC_007940	TTTTA	2	10	70250	70259	20 %	80 %	0 %	0 %	91204884
69	NC_007940	ATTAT	2	10	71471	71480	40 %	60 %	0 %	0 %	91204885
70	NC_007940	TGGTA	2	10	72282	72291	20 %	40 %	40 %	0 %	91204886
71	NC_007940	CTTGG	2	10	73454	73463	0 %	40 %	40 %	20 %	91204886
72	NC_007940	TTAAA	2	10	74795	74804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007940	ATTTT	2	10	75181	75190	20 %	80 %	0 %	0 %	91204887
74	NC_007940	AGGAA	2	10	75833	75842	60 %	0 %	40 %	0 %	91204888
75	NC_007940	TATCT	2	10	80136	80145	20 %	60 %	0 %	20 %	91204890
76	NC_007940	ACGAT	2	10	80539	80548	40 %	20 %	20 %	20 %	91204890
77	NC_007940	TTGAT	2	10	80675	80684	20 %	60 %	20 %	0 %	91204890
78	NC_007940	AGTTT	2	10	80884	80893	20 %	60 %	20 %	0 %	91204890
79	NC_007940	AGTAA	2	10	81715	81724	60 %	20 %	20 %	0 %	91204891
80	NC_007940	TAAAA	2	10	82485	82494	80 %	20 %	0 %	0 %	91204891
81	NC_007940	GTAAT	2	10	82955	82964	40 %	40 %	20 %	0 %	91204891
82	NC_007940	TTTAA	2	10	83726	83735	40 %	60 %	0 %	0 %	91204892
83	NC_007940	CTAAT	2	10	85834	85843	40 %	40 %	0 %	20 %	91204894
84	NC_007940	GTAAA	2	10	85864	85873	60 %	20 %	20 %	0 %	91204894
85	NC_007940	TTTTA	2	10	88817	88826	20 %	80 %	0 %	0 %	91204895
86	NC_007940	CGTTC	2	10	89790	89799	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_007940	CTTGC	2	10	91015	91024	0 %	40 %	20 %	40 %	91204896
88	NC_007940	CTTTA	2	10	91507	91516	20 %	60 %	0 %	20 %	91204896
89	NC_007940	ATTTT	2	10	92955	92964	20 %	80 %	0 %	0 %	91204896
90	NC_007940	TAATT	2	10	95490	95499	40 %	60 %	0 %	0 %	91204899
91	NC_007940	TAAAT	2	10	96489	96498	60 %	40 %	0 %	0 %	91204899
92	NC_007940	TTATT	2	10	97473	97482	20 %	80 %	0 %	0 %	91204900
93	NC_007940	CTTTC	2	10	98304	98313	0 %	60 %	0 %	40 %	91204902
94	NC_007940	ACTAG	2	10	99284	99293	40 %	20 %	20 %	20 %	91204902
95	NC_007940	TTACT	2	10	99604	99613	20 %	60 %	0 %	20 %	91204902
96	NC_007940	TTTAT	2	10	99691	99700	20 %	80 %	0 %	0 %	91204902
97	NC_007940	GAATA	2	10	100615	100624	60 %	20 %	20 %	0 %	91204903
98	NC_007940	AAATG	2	10	103150	103159	60 %	20 %	20 %	0 %	91204905
99	NC_007940	TAAAA	2	10	103803	103812	80 %	20 %	0 %	0 %	91204906
100	NC_007940	GCTAA	2	10	104110	104119	40 %	20 %	20 %	20 %	91204906
101	NC_007940	AAGAT	2	10	104883	104892	60 %	20 %	20 %	0 %	91204907
102	NC_007940	TGCTT	2	10	105774	105783	0 %	60 %	20 %	20 %	91204908
103	NC_007940	TGAAA	2	10	105858	105867	60 %	20 %	20 %	0 %	91204908
104	NC_007940	GCAAT	2	10	107240	107249	40 %	20 %	20 %	20 %	91204910
105	NC_007940	ATTAT	2	10	109807	109816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007940	CTTAT	2	10	110010	110019	20 %	60 %	0 %	20 %	91204912
107	NC_007940	AGTCA	2	10	110274	110283	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007940	CAAAA	2	10	110654	110663	80 %	0 %	0 %	20 %	91204913
109	NC_007940	TAGTT	2	10	111084	111093	20 %	60 %	20 %	0 %	91204913
110	NC_007940	TATTT	2	10	114278	114287	20 %	80 %	0 %	0 %	91204915
111	NC_007940	ATGAA	2	10	114406	114415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007940	TGCGT	2	10	116834	116843	0 %	40 %	40 %	20 %	91204917
113	NC_007940	ATAAA	2	10	119313	119322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007940	AAAGC	2	10	119803	119812	60 %	0 %	20 %	20 %	91204920
115	NC_007940	GTAAT	2	10	120098	120107	40 %	40 %	20 %	0 %	91204920
116	NC_007940	ATTTT	2	10	121234	121243	20 %	80 %	0 %	0 %	91204921
117	NC_007940	ATAGA	2	10	124011	124020	60 %	20 %	20 %	0 %	91204923
118	NC_007940	CATTT	2	10	124521	124530	20 %	60 %	0 %	20 %	91204923
119	NC_007940	GTTTC	2	10	126634	126643	0 %	60 %	20 %	20 %	91204924
120	NC_007940	TCACT	2	10	126946	126955	20 %	40 %	0 %	40 %	91204924
121	NC_007940	ATTAT	2	10	127092	127101	40 %	60 %	0 %	0 %	91204924
122	NC_007940	ATTAT	2	10	128210	128219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007940	TGATC	2	10	128553	128562	20 %	40 %	20 %	20 %	91204926
124	NC_007940	ATTAT	2	10	129942	129951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007940	TTTTA	2	10	130320	130329	20 %	80 %	0 %	0 %	91204927
126	NC_007940	GTAAA	2	10	130419	130428	60 %	20 %	20 %	0 %	91204927
127	NC_007940	ATTAT	2	10	131107	131116	40 %	60 %	0 %	0 %	91204927
128	NC_007940	TTGTA	2	10	131380	131389	20 %	60 %	20 %	0 %	91204928
129	NC_007940	TGATT	2	10	131445	131454	20 %	60 %	20 %	0 %	91204928
130	NC_007940	ATCGC	2	10	133913	133922	20 %	20 %	20 %	40 %	91204929
131	NC_007940	TTTGG	2	10	136353	136362	0 %	60 %	40 %	0 %	91204932
132	NC_007940	ATTTT	2	10	137145	137154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007940	GGCAA	2	10	137998	138007	40 %	0 %	40 %	20 %	91204933
134	NC_007940	CGCTC	2	10	138329	138338	0 %	20 %	20 %	60 %	91204934
135	NC_007940	AATTA	2	10	139004	139013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007940	CAAAT	2	10	139042	139051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007940	TAACA	2	10	140591	140600	60 %	20 %	0 %	20 %	91204938
138	NC_007940	GATCA	2	10	140826	140835	40 %	20 %	20 %	20 %	91204938
139	NC_007940	TAAAT	2	10	142452	142461	60 %	40 %	0 %	0 %	91204939
140	NC_007940	TAAGC	2	10	142761	142770	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_007940	TTATA	2	10	278827	278836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_007940	ATATA	2	10	297613	297622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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