MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia bellii RML369-C chromosome

Total Repeats: 39896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007940	TAAA	2	8	18908	18915	75 %	25 %	0 %	0 %	91204835
502	NC_007940	TGCA	2	8	18917	18924	25 %	25 %	25 %	25 %	91204835
503	NC_007940	TAA	2	6	18952	18957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204835
504	NC_007940	AT	3	6	18970	18975	50 %	50 %	0 %	0 %	91204835
505	NC_007940	TAA	2	6	18991	18996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204835
506	NC_007940	T	7	7	18998	19004	0 %	100 %	0 %	0 %	91204835
507	NC_007940	GCG	2	6	19006	19011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91204835
508	NC_007940	A	6	6	19113	19118	100 %	0 %	0 %	0 %	91204835
509	NC_007940	TCC	2	6	19123	19128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91204835
510	NC_007940	AAC	2	6	19328	19333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204835
511	NC_007940	GCT	2	6	19434	19439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91204835
512	NC_007940	CCT	2	6	19479	19484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91204835
513	NC_007940	A	6	6	19518	19523	100 %	0 %	0 %	0 %	91204835
514	NC_007940	AAG	2	6	19534	19539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204835
515	NC_007940	T	8	8	19651	19658	0 %	100 %	0 %	0 %	91204835
516	NC_007940	T	7	7	19668	19674	0 %	100 %	0 %	0 %	91204836
517	NC_007940	T	8	8	19684	19691	0 %	100 %	0 %	0 %	91204836
518	NC_007940	AT	3	6	19696	19701	50 %	50 %	0 %	0 %	91204836
519	NC_007940	TAAA	2	8	19704	19711	75 %	25 %	0 %	0 %	91204836
520	NC_007940	ATT	3	9	19721	19729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204836
521	NC_007940	TGC	2	6	19780	19785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91204836
522	NC_007940	AAT	2	6	19868	19873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204836
523	NC_007940	ATAA	2	8	19898	19905	75 %	25 %	0 %	0 %	91204836
524	NC_007940	AGT	2	6	19938	19943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204836
525	NC_007940	GCA	2	6	19949	19954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91204836
526	NC_007940	CAG	2	6	19968	19973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91204836
527	NC_007940	T	6	6	20026	20031	0 %	100 %	0 %	0 %	91204836
528	NC_007940	GCT	2	6	20063	20068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91204836
529	NC_007940	CTA	2	6	20142	20147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204836
530	NC_007940	A	6	6	20188	20193	100 %	0 %	0 %	0 %	91204836
531	NC_007940	AGT	2	6	20245	20250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204836
532	NC_007940	AAT	3	9	20300	20308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204836
533	NC_007940	GAC	2	6	20331	20336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91204836
534	NC_007940	ATA	2	6	20359	20364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204836
535	NC_007940	AAC	2	6	20365	20370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204836
536	NC_007940	TAA	2	6	20377	20382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204836
537	NC_007940	TAC	2	6	20388	20393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204836
538	NC_007940	GAA	2	6	20395	20400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204836
539	NC_007940	A	6	6	20399	20404	100 %	0 %	0 %	0 %	91204836
540	NC_007940	A	6	6	20408	20413	100 %	0 %	0 %	0 %	91204836
541	NC_007940	ACT	3	9	20470	20478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204836
542	NC_007940	ACTAA	2	10	20480	20489	60 %	20 %	0 %	20 %	91204836
543	NC_007940	AACC	2	8	20495	20502	50 %	0 %	0 %	50 %	91204836
544	NC_007940	CAT	2	6	20529	20534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204836
545	NC_007940	TTTA	2	8	20565	20572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007940	ATCTT	2	10	20599	20608	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
547	NC_007940	A	6	6	20611	20616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007940	TTATA	2	10	20641	20650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_007940	ATA	2	6	20653	20658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007940	TTTG	2	8	20722	20729	0 %	75 %	25 %	0 %	91204837
551	NC_007940	ATA	2	6	20805	20810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204837
552	NC_007940	GAAG	2	8	20828	20835	50 %	0 %	50 %	0 %	91204837
553	NC_007940	A	7	7	20883	20889	100 %	0 %	0 %	0 %	91204837
554	NC_007940	A	6	6	20938	20943	100 %	0 %	0 %	0 %	91204837
555	NC_007940	TGG	2	6	20950	20955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91204837
556	NC_007940	AT	3	6	20958	20963	50 %	50 %	0 %	0 %	91204837
557	NC_007940	CTA	3	9	20964	20972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204837
558	NC_007940	TTC	2	6	20975	20980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91204837
559	NC_007940	ATT	2	6	20985	20990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204837
560	NC_007940	CAA	2	6	21117	21122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204837
561	NC_007940	GGT	2	6	21152	21157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91204837
562	NC_007940	GGTTA	2	10	21174	21183	20 %	40 %	40 %	0 %	91204837
563	NC_007940	AT	3	6	21193	21198	50 %	50 %	0 %	0 %	91204837
564	NC_007940	TAAGA	2	10	21220	21229	60 %	20 %	20 %	0 %	91204837
565	NC_007940	GAT	2	6	21278	21283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204837
566	NC_007940	TAA	2	6	21288	21293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204837
567	NC_007940	ATT	2	6	21312	21317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204837
568	NC_007940	TA	3	6	21333	21338	50 %	50 %	0 %	0 %	91204837
569	NC_007940	TAG	2	6	21348	21353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204837
570	NC_007940	TAG	2	6	21393	21398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204837
571	NC_007940	TATAGG	2	12	21403	21414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204837
572	NC_007940	TTTTAA	2	12	21422	21433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204837
573	NC_007940	CGA	2	6	21445	21450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_007940	ATA	2	6	21516	21521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007940	A	6	6	21521	21526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007940	AAGAA	2	10	21609	21618	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007940	ATATA	2	10	21623	21632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_007940	AG	3	6	21661	21666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_007940	TA	3	6	21678	21683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_007940	TAG	2	6	21726	21731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_007940	TCA	2	6	21749	21754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_007940	GTA	2	6	21906	21911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204838
583	NC_007940	TTA	2	6	21973	21978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204838
584	NC_007940	ATA	2	6	21982	21987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204838
585	NC_007940	CT	3	6	22004	22009	0 %	50 %	0 %	50 %	91204838
586	NC_007940	ACA	2	6	22023	22028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204838
587	NC_007940	GTA	2	6	22077	22082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204838
588	NC_007940	GAGC	2	8	22185	22192	25 %	0 %	50 %	25 %	91204838
589	NC_007940	CAAAA	2	10	22222	22231	80 %	0 %	0 %	20 %	91204838
590	NC_007940	ATT	2	6	22238	22243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204838
591	NC_007940	ACA	2	6	22304	22309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204838
592	NC_007940	ATC	2	6	22409	22414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204838
593	NC_007940	AAAGC	2	10	22428	22437	60 %	0 %	20 %	20 %	91204838
594	NC_007940	TTA	2	6	22488	22493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204838
595	NC_007940	ATT	2	6	22496	22501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204838
596	NC_007940	TGC	2	6	22640	22645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91204838
597	NC_007940	ATT	2	6	22752	22757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204838
598	NC_007940	TCT	2	6	22784	22789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91204838
599	NC_007940	TTTAA	2	10	22791	22800	40 %	60 %	0 %	0 %	91204838
600	NC_007940	TGA	2	6	22809	22814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204838
601	NC_007940	CAA	2	6	22842	22847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_007940	TGC	2	6	22848	22853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_007940	AGA	2	6	22865	22870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_007940	ATAA	2	8	22889	22896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_007940	ATT	2	6	22930	22935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204839
606	NC_007940	TCA	2	6	22982	22987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204839
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608	NC_007940	CTTT	2	8	23052	23059	0 %	75 %	0 %	25 %	91204839
609	NC_007940	CTA	2	6	23094	23099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204839
610	NC_007940	ATA	2	6	23114	23119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204839
611	NC_007940	TTG	2	6	23187	23192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91204839
612	NC_007940	TGC	2	6	23197	23202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91204839
613	NC_007940	ATT	2	6	23336	23341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204839
614	NC_007940	T	6	6	23344	23349	0 %	100 %	0 %	0 %	91204839
615	NC_007940	AGC	2	6	23372	23377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91204839
616	NC_007940	ATGT	2	8	23403	23410	25 %	50 %	25 %	0 %	91204839
617	NC_007940	ACA	2	6	23417	23422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204839
618	NC_007940	ATT	2	6	23425	23430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204839
619	NC_007940	TTAT	2	8	23447	23454	25 %	75 %	0 %	0 %	91204839
620	NC_007940	AT	3	6	23466	23471	50 %	50 %	0 %	0 %	91204839
621	NC_007940	TAA	2	6	23484	23489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204839
622	NC_007940	TAA	2	6	23520	23525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204839
623	NC_007940	GGT	2	6	23534	23539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91204839
624	NC_007940	GCA	3	9	23588	23596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91204839
625	NC_007940	TTG	2	6	23624	23629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91204839
626	NC_007940	ATT	2	6	23630	23635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204839
627	NC_007940	GTA	2	6	23652	23657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204839
628	NC_007940	TA	3	6	23675	23680	50 %	50 %	0 %	0 %	91204839
629	NC_007940	GAT	3	9	23765	23773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204839
630	NC_007940	AAGC	2	8	23784	23791	50 %	0 %	25 %	25 %	91204839
631	NC_007940	GCA	2	6	23804	23809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91204839
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633	NC_007940	TATGG	2	10	23852	23861	20 %	40 %	40 %	0 %	91204839
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