MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 105510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007925	CAA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007925	CGT	2	6	87	92	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007925	CGG	3	9	170	178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007925	GAC	2	6	411	416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007925	GCG	2	6	434	439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007925	GCT	2	6	470	475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007925	CGA	2	6	532	537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007925	CCG	2	6	641	646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007925	GCC	2	6	692	697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007925	CAT	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007925	ATT	2	6	930	935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90421529
12	NC_007925	GCT	2	6	951	956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
13	NC_007925	GCC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
14	NC_007925	CGG	2	6	1135	1140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421529
15	NC_007925	CGC	2	6	1143	1148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
16	NC_007925	GCA	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421529
17	NC_007925	GCC	2	6	1233	1238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
18	NC_007925	GCG	2	6	1239	1244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421529
19	NC_007925	CTG	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
20	NC_007925	CCG	2	6	1365	1370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
21	NC_007925	TCG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
22	NC_007925	CGA	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421529
23	NC_007925	GGT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421529
24	NC_007925	CGC	2	6	1555	1560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
25	NC_007925	GCC	2	6	1567	1572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
26	NC_007925	CGA	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421529
27	NC_007925	CGG	2	6	1618	1623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421529
28	NC_007925	TCG	3	9	1626	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
29	NC_007925	GTG	2	6	1919	1924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421529
30	NC_007925	CGC	2	6	1967	1972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421529
31	NC_007925	CGG	2	6	2062	2067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421529
32	NC_007925	CGA	2	6	2140	2145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421529
33	NC_007925	CTG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421529
34	NC_007925	CGC	2	6	2216	2221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007925	GGC	2	6	2260	2265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007925	ACG	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007925	ATG	2	6	2443	2448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007925	GCG	2	6	2540	2545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421530
39	NC_007925	TGC	3	9	2572	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421530
40	NC_007925	CGG	2	6	2647	2652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421530
41	NC_007925	CGG	2	6	2663	2668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421530
42	NC_007925	CCA	2	6	2671	2676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421530
43	NC_007925	CGC	2	6	2834	2839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
44	NC_007925	CCG	3	9	2869	2877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
45	NC_007925	CTA	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421530
46	NC_007925	GCG	3	9	2976	2984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421530
47	NC_007925	GCC	2	6	3051	3056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
48	NC_007925	GCC	2	6	3126	3131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
49	NC_007925	GTG	2	6	3180	3185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421530
50	NC_007925	AAC	2	6	3243	3248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421530
51	NC_007925	GTC	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421530
52	NC_007925	AAG	2	6	3270	3275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90421530
53	NC_007925	CGC	2	6	3473	3478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421530
54	NC_007925	CAG	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007925	GCG	2	6	3841	3846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
56	NC_007925	CGT	2	6	3848	3853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421531
57	NC_007925	TGG	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421531
58	NC_007925	TGT	2	6	3910	3915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90421531
59	NC_007925	CGA	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421531
60	NC_007925	CCG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
61	NC_007925	GCC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
62	NC_007925	GGC	3	9	4106	4114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
63	NC_007925	ATC	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421531
64	NC_007925	GCG	3	9	4187	4195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
65	NC_007925	TTC	2	6	4197	4202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421531
66	NC_007925	GCT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421531
67	NC_007925	AGC	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421531
68	NC_007925	CCG	2	6	4339	4344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
69	NC_007925	GGC	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
70	NC_007925	GCG	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
71	NC_007925	CGC	2	6	4394	4399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
72	NC_007925	CGC	3	9	4547	4555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
73	NC_007925	GAA	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90421531
74	NC_007925	GCT	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421531
75	NC_007925	CGC	2	6	4714	4719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
76	NC_007925	CGA	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421531
77	NC_007925	GGT	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421531
78	NC_007925	CGC	2	6	4761	4766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
79	NC_007925	TCG	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421531
80	NC_007925	GGC	2	6	4854	4859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
81	NC_007925	CGC	2	6	4891	4896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421531
82	NC_007925	CGG	2	6	4898	4903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421531
83	NC_007925	GCA	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007925	TGG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007925	CCT	2	6	5116	5121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90421532
86	NC_007925	CAG	2	6	5126	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
87	NC_007925	GGC	2	6	5159	5164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421532
88	NC_007925	GCG	2	6	5194	5199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421532
89	NC_007925	ACG	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
90	NC_007925	TCG	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421532
91	NC_007925	CGT	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421532
92	NC_007925	CGT	2	6	5365	5370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421532
93	NC_007925	CAC	2	6	5411	5416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421532
94	NC_007925	CGA	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
95	NC_007925	CCA	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421532
96	NC_007925	CAA	2	6	5477	5482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421532
97	NC_007925	ACG	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
98	NC_007925	CCA	2	6	5557	5562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421532
99	NC_007925	CGG	3	9	5570	5578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421532
100	NC_007925	TCA	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421532
101	NC_007925	CAA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421532
102	NC_007925	CGA	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
103	NC_007925	CGG	3	9	5774	5782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421532
104	NC_007925	CAA	2	6	5783	5788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421532
105	NC_007925	ACG	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
106	NC_007925	CAA	2	6	5885	5890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421532
107	NC_007925	ACG	2	6	5938	5943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
108	NC_007925	TCA	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421532
109	NC_007925	CCA	2	6	5965	5970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421532
110	NC_007925	ACG	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
111	NC_007925	TCA	2	6	5995	6000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421532
112	NC_007925	CCA	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421532
113	NC_007925	ACG	2	6	6040	6045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
114	NC_007925	TCA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421532
115	NC_007925	CCG	2	6	6052	6057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421532
116	NC_007925	CCA	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421532
117	NC_007925	CGG	2	6	6077	6082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421532
118	NC_007925	CGA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421532
119	NC_007925	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421532
120	NC_007925	CGG	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007925	TTG	2	6	6498	6503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007925	CAC	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421533
123	NC_007925	GGT	2	6	6772	6777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421533
124	NC_007925	CGA	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421533
125	NC_007925	GGT	2	6	6826	6831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421533
126	NC_007925	CGA	2	6	6862	6867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421533
127	NC_007925	CGG	2	6	6912	6917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421533
128	NC_007925	TCA	2	6	6924	6929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421533
129	NC_007925	CGG	2	6	6946	6951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421533
130	NC_007925	CGG	2	6	6982	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421533
131	NC_007925	GGT	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421533
132	NC_007925	TGG	3	9	7107	7115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421533
133	NC_007925	GAG	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90421533
134	NC_007925	ATG	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421533
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263	NC_007925	GTG	2	6	13753	13758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90421537
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293	NC_007925	TCA	2	6	15434	15439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421539
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341	NC_007925	ACC	2	6	18179	18184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421543
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369	NC_007925	GCA	2	6	19482	19487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
370	NC_007925	CCG	2	6	19492	19497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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374	NC_007925	GCC	2	6	19761	19766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421544
375	NC_007925	TCG	2	6	19842	19847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421544
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377	NC_007925	GCG	2	6	19978	19983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421544
378	NC_007925	CGC	2	6	20123	20128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421544
379	NC_007925	CAC	2	6	20129	20134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421544
380	NC_007925	CCG	2	6	20142	20147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421544
381	NC_007925	TCG	2	6	20262	20267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421544
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