MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 chromosome

Total Repeats: 3603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007908	TGGAT	2	10	203	212	20 %	40 %	40 %	0 %	89898823
2	NC_007908	ACCAC	2	10	1313	1322	40 %	0 %	0 %	60 %	89898823
3	NC_007908	ACAAG	2	10	1535	1544	60 %	0 %	20 %	20 %	89898824
4	NC_007908	CTTCG	2	10	2051	2060	0 %	40 %	20 %	40 %	89898824
5	NC_007908	CCAAG	2	10	2180	2189	40 %	0 %	20 %	40 %	89898824
6	NC_007908	TGAGC	2	10	3475	3484	20 %	20 %	40 %	20 %	89898825
7	NC_007908	GCGCT	2	10	4751	4760	0 %	20 %	40 %	40 %	89898825
8	NC_007908	CAACT	2	10	6537	6546	40 %	20 %	0 %	40 %	89898827
9	NC_007908	CCTGG	2	10	8286	8295	0 %	20 %	40 %	40 %	89898828
10	NC_007908	AGGCC	2	10	11211	11220	20 %	0 %	40 %	40 %	89898830
11	NC_007908	CAACG	2	10	12539	12548	40 %	0 %	20 %	40 %	89898832
12	NC_007908	AGTTA	2	10	13396	13405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007908	GGTTG	2	10	17802	17811	0 %	40 %	60 %	0 %	89898837
14	NC_007908	GGGCC	2	10	18193	18202	0 %	0 %	60 %	40 %	89898837
15	NC_007908	CATGC	2	10	18725	18734	20 %	20 %	20 %	40 %	89898838
16	NC_007908	CGTGA	2	10	20564	20573	20 %	20 %	40 %	20 %	89898839
17	NC_007908	CCGGC	2	10	23609	23618	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_007908	GCGCC	2	10	24487	24496	0 %	0 %	40 %	60 %	89898844
19	NC_007908	CGGCG	2	10	26307	26316	0 %	0 %	60 %	40 %	89898846
20	NC_007908	GGCGC	2	10	27084	27093	0 %	0 %	60 %	40 %	89898846
21	NC_007908	CCGCT	2	10	29697	29706	0 %	20 %	20 %	60 %	89898850
22	NC_007908	GTTGC	2	10	30171	30180	0 %	40 %	40 %	20 %	89898850
23	NC_007908	AGCGT	2	10	30946	30955	20 %	20 %	40 %	20 %	89898850
24	NC_007908	GTGGC	2	10	31961	31970	0 %	20 %	60 %	20 %	89898850
25	NC_007908	CGCTG	2	10	32702	32711	0 %	20 %	40 %	40 %	89898850
26	NC_007908	CGCTG	2	10	33749	33758	0 %	20 %	40 %	40 %	89898851
27	NC_007908	TGGCC	2	10	36197	36206	0 %	20 %	40 %	40 %	89898853
28	NC_007908	GGCCG	2	10	40073	40082	0 %	0 %	60 %	40 %	89898858
29	NC_007908	TTTTG	2	10	40859	40868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007908	AGCCC	2	10	41370	41379	20 %	0 %	20 %	60 %	89898859
31	NC_007908	GCGCT	2	10	42826	42835	0 %	20 %	40 %	40 %	89898860
32	NC_007908	CCCAG	2	10	45003	45012	20 %	0 %	20 %	60 %	89898862
33	NC_007908	CGGCG	2	10	46591	46600	0 %	0 %	60 %	40 %	89898865
34	NC_007908	GGCCG	2	10	52205	52214	0 %	0 %	60 %	40 %	89898871
35	NC_007908	CGGGC	2	10	57008	57017	0 %	0 %	60 %	40 %	89898875
36	NC_007908	GACCC	3	15	58045	58059	20 %	0 %	20 %	60 %	89898877
37	NC_007908	CCGGA	2	10	58304	58313	20 %	0 %	40 %	40 %	89898877
38	NC_007908	CGACC	2	10	59361	59370	20 %	0 %	20 %	60 %	89898878
39	NC_007908	GCAGG	2	10	60357	60366	20 %	0 %	60 %	20 %	89898879
40	NC_007908	ATGCC	2	10	61542	61551	20 %	20 %	20 %	40 %	89898881
41	NC_007908	CCCAT	2	10	62800	62809	20 %	20 %	0 %	60 %	89898881
42	NC_007908	CCGGT	2	10	62875	62884	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007908	ATTCC	2	10	64059	64068	20 %	40 %	0 %	40 %	89898883
44	NC_007908	CGCGG	2	10	64738	64747	0 %	0 %	60 %	40 %	89898884
45	NC_007908	GGGCA	2	10	68954	68963	20 %	0 %	60 %	20 %	89898888
46	NC_007908	GCCCA	2	10	69678	69687	20 %	0 %	20 %	60 %	89898888
47	NC_007908	AGCCC	2	10	71588	71597	20 %	0 %	20 %	60 %	89898891
48	NC_007908	TCATT	2	10	74006	74015	20 %	60 %	0 %	20 %	89898895
49	NC_007908	GGCCT	2	10	74886	74895	0 %	20 %	40 %	40 %	89898896
50	NC_007908	CAGAA	2	10	75269	75278	60 %	0 %	20 %	20 %	89898897
51	NC_007908	AGACC	2	10	75773	75782	40 %	0 %	20 %	40 %	89898897
52	NC_007908	CCGGG	2	10	77172	77181	0 %	0 %	60 %	40 %	89898899
53	NC_007908	CGCAA	2	10	79414	79423	40 %	0 %	20 %	40 %	89898901
54	NC_007908	TTGCC	2	10	79572	79581	0 %	40 %	20 %	40 %	89898901
55	NC_007908	TCAGC	2	10	79627	79636	20 %	20 %	20 %	40 %	89898901
56	NC_007908	GATCG	2	10	79694	79703	20 %	20 %	40 %	20 %	89898901
57	NC_007908	AGGGT	2	10	80363	80372	20 %	20 %	60 %	0 %	89898901
58	NC_007908	GGGAA	2	10	81497	81506	40 %	0 %	60 %	0 %	89898902
59	NC_007908	TTTGA	2	10	81575	81584	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007908	GCGCC	2	10	87241	87250	0 %	0 %	40 %	60 %	89898907
61	NC_007908	GCACC	2	10	87766	87775	20 %	0 %	20 %	60 %	89898907
62	NC_007908	TGATG	2	10	88806	88815	20 %	40 %	40 %	0 %	89898909
63	NC_007908	GCCCA	2	10	89915	89924	20 %	0 %	20 %	60 %	89898909
64	NC_007908	GGTTT	2	10	90200	90209	0 %	60 %	40 %	0 %	89898909
65	NC_007908	TGCGC	2	10	91566	91575	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007908	CAAGC	2	10	94876	94885	40 %	0 %	20 %	40 %	89898913
67	NC_007908	GCGCC	2	10	95038	95047	0 %	0 %	40 %	60 %	89898914
68	NC_007908	AAGGC	2	10	95298	95307	40 %	0 %	40 %	20 %	89898914
69	NC_007908	TGGTG	2	10	97658	97667	0 %	40 %	60 %	0 %	89898915
70	NC_007908	CTTTT	2	10	99919	99928	0 %	80 %	0 %	20 %	89898918
71	NC_007908	GTCGA	2	10	101332	101341	20 %	20 %	40 %	20 %	89898919
72	NC_007908	ATTGA	2	10	107716	107725	40 %	40 %	20 %	0 %	89898925
73	NC_007908	TGGCC	2	10	110434	110443	0 %	20 %	40 %	40 %	89898928
74	NC_007908	GGCCG	2	10	110481	110490	0 %	0 %	60 %	40 %	89898928
75	NC_007908	GGCGG	2	10	111079	111088	0 %	0 %	80 %	20 %	89898929
76	NC_007908	AGAAA	2	10	113557	113566	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007908	TGCTG	2	10	114375	114384	0 %	40 %	40 %	20 %	89898933
78	NC_007908	AAAAG	2	10	114397	114406	80 %	0 %	20 %	0 %	89898933
79	NC_007908	GGCCT	2	10	115755	115764	0 %	20 %	40 %	40 %	89898935
80	NC_007908	CGCCT	2	10	115784	115793	0 %	20 %	20 %	60 %	89898935
81	NC_007908	TGGTG	2	10	115872	115881	0 %	40 %	60 %	0 %	89898935
82	NC_007908	GGCGC	2	10	116669	116678	0 %	0 %	60 %	40 %	89898935
83	NC_007908	GGCGT	2	10	118791	118800	0 %	20 %	60 %	20 %	89898937
84	NC_007908	GCCGC	2	10	119028	119037	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_007908	TGGCG	2	10	119490	119499	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007908	GCGCG	2	10	120303	120312	0 %	0 %	60 %	40 %	89898938
87	NC_007908	CGGCC	2	10	120360	120369	0 %	0 %	40 %	60 %	89898938
88	NC_007908	GTGCG	2	10	121800	121809	0 %	20 %	60 %	20 %	89898939
89	NC_007908	GGCGC	2	10	122500	122509	0 %	0 %	60 %	40 %	89898940
90	NC_007908	TGCGC	2	10	128055	128064	0 %	20 %	40 %	40 %	89898945
91	NC_007908	CCGGA	2	10	128263	128272	20 %	0 %	40 %	40 %	89898945
92	NC_007908	TCTGC	2	10	130431	130440	0 %	40 %	20 %	40 %	89898946
93	NC_007908	CAATT	2	10	130634	130643	40 %	40 %	0 %	20 %	89898947
94	NC_007908	CAGCG	2	10	132833	132842	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007908	TGTGC	2	10	134215	134224	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007908	ATTTT	2	10	135156	135165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007908	CAAAT	2	10	135255	135264	60 %	20 %	0 %	20 %	89898951
98	NC_007908	TGGCG	2	10	136051	136060	0 %	20 %	60 %	20 %	89898951
99	NC_007908	CATCG	2	10	136147	136156	20 %	20 %	20 %	40 %	89898951
100	NC_007908	GGCCG	2	10	137554	137563	0 %	0 %	60 %	40 %	89898952
101	NC_007908	CGGAG	2	10	137711	137720	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007908	AGGCC	2	10	137737	137746	20 %	0 %	40 %	40 %	89898953
103	NC_007908	GCGTC	2	10	137755	137764	0 %	20 %	40 %	40 %	89898953
104	NC_007908	TGCAC	2	10	139406	139415	20 %	20 %	20 %	40 %	89898955
105	NC_007908	GCGCG	2	10	140572	140581	0 %	0 %	60 %	40 %	89898956
106	NC_007908	CACCG	2	10	141734	141743	20 %	0 %	20 %	60 %	89898958
107	NC_007908	TGCGC	2	10	142741	142750	0 %	20 %	40 %	40 %	89898959
108	NC_007908	CGCAG	2	10	142930	142939	20 %	0 %	40 %	40 %	89898959
109	NC_007908	CGGGG	2	10	143140	143149	0 %	0 %	80 %	20 %	89898959
110	NC_007908	GCCGA	2	10	143703	143712	20 %	0 %	40 %	40 %	89898960
111	NC_007908	CGCGG	2	10	143815	143824	0 %	0 %	60 %	40 %	89898960
112	NC_007908	GCAGC	2	10	143901	143910	20 %	0 %	40 %	40 %	89898960
113	NC_007908	TGCGC	2	10	144178	144187	0 %	20 %	40 %	40 %	89898961
114	NC_007908	CTCGC	2	10	144447	144456	0 %	20 %	20 %	60 %	89898961
115	NC_007908	CGGCG	2	10	144935	144944	0 %	0 %	60 %	40 %	89898961
116	NC_007908	GGCCA	2	10	147344	147353	20 %	0 %	40 %	40 %	89898964
117	NC_007908	GCGCA	2	10	147974	147983	20 %	0 %	40 %	40 %	89898965
118	NC_007908	CGGGG	2	10	148759	148768	0 %	0 %	80 %	20 %	89898966
119	NC_007908	TGGGC	2	10	150038	150047	0 %	20 %	60 %	20 %	89898968
120	NC_007908	CCCGC	2	10	150101	150110	0 %	0 %	20 %	80 %	89898968
121	NC_007908	AGCGC	2	10	151474	151483	20 %	0 %	40 %	40 %	89898970
122	NC_007908	CAGGC	2	10	152470	152479	20 %	0 %	40 %	40 %	89898971
123	NC_007908	CCAGC	2	10	153572	153581	20 %	0 %	20 %	60 %	89898973
124	NC_007908	TGAAA	2	10	154152	154161	60 %	20 %	20 %	0 %	89898974
125	NC_007908	GGAAG	2	10	155592	155601	40 %	0 %	60 %	0 %	89898975
126	NC_007908	CTGAG	2	10	155741	155750	20 %	20 %	40 %	20 %	89898975
127	NC_007908	CCGCA	2	10	158068	158077	20 %	0 %	20 %	60 %	89898977
128	NC_007908	GCTCA	2	10	158710	158719	20 %	20 %	20 %	40 %	89898977
129	NC_007908	AGGCC	2	10	159197	159206	20 %	0 %	40 %	40 %	89898978
130	NC_007908	GACGC	2	10	160565	160574	20 %	0 %	40 %	40 %	89898979
131	NC_007908	GCGCT	2	10	162733	162742	0 %	20 %	40 %	40 %	89898982
132	NC_007908	GCGCG	2	10	162825	162834	0 %	0 %	60 %	40 %	89898982
133	NC_007908	GGTTT	2	10	164500	164509	0 %	60 %	40 %	0 %	89898984
134	NC_007908	CACAC	2	10	166080	166089	40 %	0 %	0 %	60 %	89898985
135	NC_007908	GCGCC	2	10	167142	167151	0 %	0 %	40 %	60 %	89898985
136	NC_007908	AGTGA	2	10	169135	169144	40 %	20 %	40 %	0 %	89898987
137	NC_007908	AGGTC	2	10	169450	169459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007908	GTGGC	2	10	170853	170862	0 %	20 %	60 %	20 %	89898988
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