MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 chromosome

Total Repeats: 11590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007908	CACT	2	8	694	701	25 %	25 %	0 %	50 %	89898823
2	NC_007908	TGAT	2	8	713	720	25 %	50 %	25 %	0 %	89898823
3	NC_007908	CGGC	2	8	1210	1217	0 %	0 %	50 %	50 %	89898823
4	NC_007908	TTGA	2	8	1737	1744	25 %	50 %	25 %	0 %	89898824
5	NC_007908	TGAT	2	8	2488	2495	25 %	50 %	25 %	0 %	89898824
6	NC_007908	TCAG	2	8	3053	3060	25 %	25 %	25 %	25 %	89898825
7	NC_007908	TGCA	2	8	3156	3163	25 %	25 %	25 %	25 %	89898825
8	NC_007908	TCAA	2	8	3174	3181	50 %	25 %	0 %	25 %	89898825
9	NC_007908	GCGT	2	8	3498	3505	0 %	25 %	50 %	25 %	89898825
10	NC_007908	GCGT	2	8	3561	3568	0 %	25 %	50 %	25 %	89898825
11	NC_007908	CACC	2	8	3751	3758	25 %	0 %	0 %	75 %	89898825
12	NC_007908	ACCG	2	8	5237	5244	25 %	0 %	25 %	50 %	89898825
13	NC_007908	AAAC	2	8	5865	5872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007908	CAAA	2	8	6076	6083	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007908	GCTG	2	8	6121	6128	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007908	CGCA	2	8	6362	6369	25 %	0 %	25 %	50 %	89898827
17	NC_007908	CCGA	2	8	6444	6451	25 %	0 %	25 %	50 %	89898827
18	NC_007908	TTGA	2	8	6714	6721	25 %	50 %	25 %	0 %	89898827
19	NC_007908	ACGC	2	8	7189	7196	25 %	0 %	25 %	50 %	89898827
20	NC_007908	TTTC	2	8	7715	7722	0 %	75 %	0 %	25 %	89898827
21	NC_007908	GGCA	2	8	7724	7731	25 %	0 %	50 %	25 %	89898827
22	NC_007908	TCGT	2	8	8137	8144	0 %	50 %	25 %	25 %	89898828
23	NC_007908	TTGA	2	8	8739	8746	25 %	50 %	25 %	0 %	89898829
24	NC_007908	AAGC	2	8	8811	8818	50 %	0 %	25 %	25 %	89898829
25	NC_007908	ATCG	2	8	9119	9126	25 %	25 %	25 %	25 %	89898829
26	NC_007908	TGCC	2	8	9977	9984	0 %	25 %	25 %	50 %	89898829
27	NC_007908	TGCG	2	8	10150	10157	0 %	25 %	50 %	25 %	89898829
28	NC_007908	CCGG	2	8	10602	10609	0 %	0 %	50 %	50 %	89898829
29	NC_007908	CACG	2	8	12367	12374	25 %	0 %	25 %	50 %	89898832
30	NC_007908	AATT	2	8	13656	13663	50 %	50 %	0 %	0 %	89898834
31	NC_007908	GCTG	2	8	13872	13879	0 %	25 %	50 %	25 %	89898834
32	NC_007908	CCAG	2	8	13893	13900	25 %	0 %	25 %	50 %	89898834
33	NC_007908	CAGC	2	8	14958	14965	25 %	0 %	25 %	50 %	89898835
34	NC_007908	AACC	2	8	15379	15386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007908	GTAC	2	8	15409	15416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007908	GTAC	2	8	15427	15434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007908	TCCA	3	12	15462	15473	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007908	CTAC	2	8	15497	15504	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007908	AAGC	2	8	15789	15796	50 %	0 %	25 %	25 %	89898836
40	NC_007908	TGGT	2	8	16081	16088	0 %	50 %	50 %	0 %	89898836
41	NC_007908	GCGT	2	8	16408	16415	0 %	25 %	50 %	25 %	89898836
42	NC_007908	TTGG	2	8	17515	17522	0 %	50 %	50 %	0 %	89898837
43	NC_007908	CAAA	2	8	18448	18455	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007908	TAAA	2	8	18528	18535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007908	TTCT	2	8	18856	18863	0 %	75 %	0 %	25 %	89898838
46	NC_007908	ACCG	2	8	19139	19146	25 %	0 %	25 %	50 %	89898838
47	NC_007908	TGAT	2	8	19743	19750	25 %	50 %	25 %	0 %	89898839
48	NC_007908	GGGC	2	8	19813	19820	0 %	0 %	75 %	25 %	89898839
49	NC_007908	CCAC	2	8	20244	20251	25 %	0 %	0 %	75 %	89898839
50	NC_007908	CGGT	2	8	20702	20709	0 %	25 %	50 %	25 %	89898840
51	NC_007908	GAAG	2	8	21730	21737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007908	CTGG	2	8	21810	21817	0 %	25 %	50 %	25 %	89898841
53	NC_007908	CAGC	2	8	22447	22454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007908	TTCT	2	8	23042	23049	0 %	75 %	0 %	25 %	89898842
55	NC_007908	GATC	2	8	23566	23573	25 %	25 %	25 %	25 %	89898842
56	NC_007908	GTTT	2	8	23820	23827	0 %	75 %	25 %	0 %	89898843
57	NC_007908	TCAA	2	8	24150	24157	50 %	25 %	0 %	25 %	89898844
58	NC_007908	CGCC	2	8	24343	24350	0 %	0 %	25 %	75 %	89898844
59	NC_007908	TCGG	2	8	24549	24556	0 %	25 %	50 %	25 %	89898844
60	NC_007908	CCGA	2	8	25615	25622	25 %	0 %	25 %	50 %	89898846
61	NC_007908	ATTC	2	8	25851	25858	25 %	50 %	0 %	25 %	89898846
62	NC_007908	CTGG	2	8	25903	25910	0 %	25 %	50 %	25 %	89898846
63	NC_007908	GGCT	2	8	25948	25955	0 %	25 %	50 %	25 %	89898846
64	NC_007908	TGCC	2	8	26580	26587	0 %	25 %	25 %	50 %	89898846
65	NC_007908	GCCG	2	8	26610	26617	0 %	0 %	50 %	50 %	89898846
66	NC_007908	CCAT	2	8	26882	26889	25 %	25 %	0 %	50 %	89898846
67	NC_007908	TGGA	2	8	26998	27005	25 %	25 %	50 %	0 %	89898846
68	NC_007908	CGCC	2	8	27395	27402	0 %	0 %	25 %	75 %	89898846
69	NC_007908	ATGC	2	8	27466	27473	25 %	25 %	25 %	25 %	89898846
70	NC_007908	CAGC	2	8	27900	27907	25 %	0 %	25 %	50 %	89898847
71	NC_007908	CAAG	2	8	27969	27976	50 %	0 %	25 %	25 %	89898847
72	NC_007908	AATA	2	8	28025	28032	75 %	25 %	0 %	0 %	89898847
73	NC_007908	CCAC	2	8	28403	28410	25 %	0 %	0 %	75 %	89898847
74	NC_007908	AACA	2	8	29092	29099	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007908	AATC	2	8	29101	29108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007908	CCCG	2	8	29235	29242	0 %	0 %	25 %	75 %	89898849
77	NC_007908	GGGC	2	8	29621	29628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007908	CGTT	2	8	29633	29640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007908	CGGG	2	8	29744	29751	0 %	0 %	75 %	25 %	89898850
80	NC_007908	GGCG	2	8	29792	29799	0 %	0 %	75 %	25 %	89898850
81	NC_007908	TGTC	2	8	29915	29922	0 %	50 %	25 %	25 %	89898850
82	NC_007908	CAAT	2	8	30008	30015	50 %	25 %	0 %	25 %	89898850
83	NC_007908	GCAG	2	8	30815	30822	25 %	0 %	50 %	25 %	89898850
84	NC_007908	CACC	2	8	31166	31173	25 %	0 %	0 %	75 %	89898850
85	NC_007908	CGCC	2	8	31406	31413	0 %	0 %	25 %	75 %	89898850
86	NC_007908	GAGC	2	8	32208	32215	25 %	0 %	50 %	25 %	89898850
87	NC_007908	CACC	2	8	32321	32328	25 %	0 %	0 %	75 %	89898850
88	NC_007908	CACT	2	8	35289	35296	25 %	25 %	0 %	50 %	89898852
89	NC_007908	GCGA	2	8	36006	36013	25 %	0 %	50 %	25 %	89898853
90	NC_007908	CGCT	2	8	37368	37375	0 %	25 %	25 %	50 %	89898854
91	NC_007908	GGGC	2	8	37819	37826	0 %	0 %	75 %	25 %	89898854
92	NC_007908	TGCT	2	8	38295	38302	0 %	50 %	25 %	25 %	89898855
93	NC_007908	TCTT	2	8	38906	38913	0 %	75 %	0 %	25 %	89898857
94	NC_007908	TTGA	2	8	40630	40637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007908	GTAA	2	8	40809	40816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007908	TATT	2	8	41317	41324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007908	TGAT	2	8	41795	41802	25 %	50 %	25 %	0 %	89898859
98	NC_007908	AGCG	2	8	42315	42322	25 %	0 %	50 %	25 %	89898859
99	NC_007908	CGCC	2	8	42660	42667	0 %	0 %	25 %	75 %	89898859
100	NC_007908	GCCA	2	8	43410	43417	25 %	0 %	25 %	50 %	89898861
101	NC_007908	CATG	2	8	44241	44248	25 %	25 %	25 %	25 %	89898862
102	NC_007908	CGAC	2	8	44553	44560	25 %	0 %	25 %	50 %	89898862
103	NC_007908	GTGA	2	8	44729	44736	25 %	25 %	50 %	0 %	89898862
104	NC_007908	GTCG	2	8	44788	44795	0 %	25 %	50 %	25 %	89898862
105	NC_007908	CCAG	2	8	44949	44956	25 %	0 %	25 %	50 %	89898862
106	NC_007908	AGGA	2	8	44960	44967	50 %	0 %	50 %	0 %	89898862
107	NC_007908	GCCG	2	8	45114	45121	0 %	0 %	50 %	50 %	89898862
108	NC_007908	CCAC	2	8	45626	45633	25 %	0 %	0 %	75 %	89898862
109	NC_007908	GTCG	2	8	46916	46923	0 %	25 %	50 %	25 %	89898865
110	NC_007908	ATTC	2	8	47060	47067	25 %	50 %	0 %	25 %	89898865
111	NC_007908	TGGG	2	8	49034	49041	0 %	25 %	75 %	0 %	89898868
112	NC_007908	CGCC	2	8	49204	49211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_007908	TGGC	2	8	49592	49599	0 %	25 %	50 %	25 %	89898869
114	NC_007908	CAGC	2	8	49733	49740	25 %	0 %	25 %	50 %	89898869
115	NC_007908	GGCC	2	8	49781	49788	0 %	0 %	50 %	50 %	89898869
116	NC_007908	ACCG	2	8	51560	51567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007908	CATC	2	8	51834	51841	25 %	25 %	0 %	50 %	89898871
118	NC_007908	CGGC	2	8	52149	52156	0 %	0 %	50 %	50 %	89898871
119	NC_007908	CCCG	2	8	52219	52226	0 %	0 %	25 %	75 %	89898871
120	NC_007908	GCAC	2	8	52458	52465	25 %	0 %	25 %	50 %	89898871
121	NC_007908	GCTC	2	8	53166	53173	0 %	25 %	25 %	50 %	89898871
122	NC_007908	GCAG	2	8	53930	53937	25 %	0 %	50 %	25 %	89898872
123	NC_007908	CTGG	2	8	54258	54265	0 %	25 %	50 %	25 %	89898872
124	NC_007908	CCTG	2	8	54303	54310	0 %	25 %	25 %	50 %	89898872
125	NC_007908	ACTC	2	8	54629	54636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007908	GCAC	2	8	54645	54652	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007908	GCCC	2	8	55047	55054	0 %	0 %	25 %	75 %	89898873
128	NC_007908	CTGC	2	8	55750	55757	0 %	25 %	25 %	50 %	89898874
129	NC_007908	CACC	2	8	55789	55796	25 %	0 %	0 %	75 %	89898874
130	NC_007908	CCGA	2	8	55823	55830	25 %	0 %	25 %	50 %	89898874
131	NC_007908	GGCG	2	8	56746	56753	0 %	0 %	75 %	25 %	89898875
132	NC_007908	GCTG	2	8	57302	57309	0 %	25 %	50 %	25 %	89898876
133	NC_007908	CTGC	2	8	57549	57556	0 %	25 %	25 %	50 %	89898876
134	NC_007908	TGGT	2	8	57825	57832	0 %	50 %	50 %	0 %	89898876
135	NC_007908	CAGG	2	8	58864	58871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007908	GCCG	2	8	59935	59942	0 %	0 %	50 %	50 %	89898878
137	NC_007908	CGGC	2	8	60056	60063	0 %	0 %	50 %	50 %	89898878
138	NC_007908	CCGG	2	8	60592	60599	0 %	0 %	50 %	50 %	89898879
139	NC_007908	CCAG	2	8	60935	60942	25 %	0 %	25 %	50 %	89898880
140	NC_007908	CCAG	2	8	61027	61034	25 %	0 %	25 %	50 %	89898880
141	NC_007908	TGAC	2	8	61527	61534	25 %	25 %	25 %	25 %	89898881
142	NC_007908	GGCG	2	8	62230	62237	0 %	0 %	75 %	25 %	89898881
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144	NC_007908	GCCA	2	8	63276	63283	25 %	0 %	25 %	50 %	89898882
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