MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 407

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	CG	3	6	883	888	0 %	0 %	50 %	50 %	89885733
2	NC_007901	GT	4	8	1472	1479	0 %	50 %	50 %	0 %	89885733
3	NC_007901	AG	3	6	1596	1601	50 %	0 %	50 %	0 %	89885733
4	NC_007901	TG	3	6	2470	2475	0 %	50 %	50 %	0 %	89885734
5	NC_007901	GC	3	6	2714	2719	0 %	0 %	50 %	50 %	89885734
6	NC_007901	CT	3	6	3332	3337	0 %	50 %	0 %	50 %	89885735
7	NC_007901	TC	3	6	4315	4320	0 %	50 %	0 %	50 %	89885736
8	NC_007901	GC	3	6	4412	4417	0 %	0 %	50 %	50 %	89885736
9	NC_007901	TG	3	6	7763	7768	0 %	50 %	50 %	0 %	89885739
10	NC_007901	CT	3	6	8557	8562	0 %	50 %	0 %	50 %	89885740
11	NC_007901	GT	3	6	9334	9339	0 %	50 %	50 %	0 %	89885741
12	NC_007901	GC	3	6	9551	9556	0 %	0 %	50 %	50 %	89885741
13	NC_007901	GT	3	6	9762	9767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007901	TG	3	6	10277	10282	0 %	50 %	50 %	0 %	89885742
15	NC_007901	GC	4	8	10437	10444	0 %	0 %	50 %	50 %	89885742
16	NC_007901	CG	3	6	10644	10649	0 %	0 %	50 %	50 %	89885742
17	NC_007901	CA	3	6	11846	11851	50 %	0 %	0 %	50 %	89885742
18	NC_007901	CG	3	6	13382	13387	0 %	0 %	50 %	50 %	89885745
19	NC_007901	AG	3	6	14740	14745	50 %	0 %	50 %	0 %	89885745
20	NC_007901	TC	3	6	14978	14983	0 %	50 %	0 %	50 %	89885746
21	NC_007901	GC	3	6	15040	15045	0 %	0 %	50 %	50 %	89885746
22	NC_007901	TC	3	6	15136	15141	0 %	50 %	0 %	50 %	89885746
23	NC_007901	TC	3	6	15685	15690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007901	AC	3	6	16850	16855	50 %	0 %	0 %	50 %	89885747
25	NC_007901	AT	3	6	18468	18473	50 %	50 %	0 %	0 %	89885748
26	NC_007901	GA	3	6	18856	18861	50 %	0 %	50 %	0 %	89885749
27	NC_007901	GC	4	8	20398	20405	0 %	0 %	50 %	50 %	89885751
28	NC_007901	GC	3	6	21507	21512	0 %	0 %	50 %	50 %	89885753
29	NC_007901	CA	3	6	21644	21649	50 %	0 %	0 %	50 %	89885753
30	NC_007901	CG	3	6	21705	21710	0 %	0 %	50 %	50 %	89885753
31	NC_007901	AT	3	6	21778	21783	50 %	50 %	0 %	0 %	89885753
32	NC_007901	TA	3	6	22185	22190	50 %	50 %	0 %	0 %	89885753
33	NC_007901	CG	3	6	22335	22340	0 %	0 %	50 %	50 %	89885753
34	NC_007901	TC	3	6	22448	22453	0 %	50 %	0 %	50 %	89885753
35	NC_007901	GT	3	6	22753	22758	0 %	50 %	50 %	0 %	89885753
36	NC_007901	CT	3	6	23479	23484	0 %	50 %	0 %	50 %	89885754
37	NC_007901	GC	3	6	24374	24379	0 %	0 %	50 %	50 %	89885754
38	NC_007901	CA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007901	GC	3	6	26299	26304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007901	CG	3	6	27108	27113	0 %	0 %	50 %	50 %	89885757
41	NC_007901	CG	3	6	27378	27383	0 %	0 %	50 %	50 %	89885758
42	NC_007901	GC	3	6	27510	27515	0 %	0 %	50 %	50 %	89885758
43	NC_007901	TC	3	6	29084	29089	0 %	50 %	0 %	50 %	89885760
44	NC_007901	AC	3	6	29167	29172	50 %	0 %	0 %	50 %	89885760
45	NC_007901	GA	3	6	29538	29543	50 %	0 %	50 %	0 %	89885760
46	NC_007901	TG	3	6	30360	30365	0 %	50 %	50 %	0 %	89885760
47	NC_007901	CG	3	6	30546	30551	0 %	0 %	50 %	50 %	89885760
48	NC_007901	CG	3	6	31936	31941	0 %	0 %	50 %	50 %	89885761
49	NC_007901	AC	5	10	32788	32797	50 %	0 %	0 %	50 %	89885762
50	NC_007901	TC	3	6	32935	32940	0 %	50 %	0 %	50 %	89885762
51	NC_007901	AG	3	6	33108	33113	50 %	0 %	50 %	0 %	89885763
52	NC_007901	CG	3	6	34125	34130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007901	CT	3	6	34781	34786	0 %	50 %	0 %	50 %	89885764
54	NC_007901	CG	3	6	35047	35052	0 %	0 %	50 %	50 %	89885765
55	NC_007901	GT	3	6	36050	36055	0 %	50 %	50 %	0 %	89885766
56	NC_007901	AC	3	6	37034	37039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007901	AT	3	6	37170	37175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007901	TC	3	6	37347	37352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007901	CG	3	6	37640	37645	0 %	0 %	50 %	50 %	89885767
60	NC_007901	GC	3	6	38845	38850	0 %	0 %	50 %	50 %	89885768
61	NC_007901	CG	3	6	39845	39850	0 %	0 %	50 %	50 %	89885768
62	NC_007901	GC	3	6	40712	40717	0 %	0 %	50 %	50 %	89885769
63	NC_007901	CG	3	6	40825	40830	0 %	0 %	50 %	50 %	89885769
64	NC_007901	CA	3	6	40953	40958	50 %	0 %	0 %	50 %	89885769
65	NC_007901	TC	3	6	45327	45332	0 %	50 %	0 %	50 %	89885773
66	NC_007901	AT	3	6	45645	45650	50 %	50 %	0 %	0 %	89885773
67	NC_007901	TC	3	6	46739	46744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007901	GC	3	6	48229	48234	0 %	0 %	50 %	50 %	89885776
69	NC_007901	AC	4	8	48630	48637	50 %	0 %	0 %	50 %	89885776
70	NC_007901	CA	3	6	49061	49066	50 %	0 %	0 %	50 %	89885776
71	NC_007901	CA	3	6	49363	49368	50 %	0 %	0 %	50 %	89885777
72	NC_007901	AC	3	6	49718	49723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007901	GC	3	6	51162	51167	0 %	0 %	50 %	50 %	89885778
74	NC_007901	AC	3	6	51187	51192	50 %	0 %	0 %	50 %	89885778
75	NC_007901	GC	3	6	51312	51317	0 %	0 %	50 %	50 %	89885778
76	NC_007901	GC	3	6	51928	51933	0 %	0 %	50 %	50 %	89885778
77	NC_007901	TG	3	6	53812	53817	0 %	50 %	50 %	0 %	89885780
78	NC_007901	GC	3	6	55149	55154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007901	AC	3	6	56327	56332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007901	GT	3	6	56340	56345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007901	CG	3	6	56654	56659	0 %	0 %	50 %	50 %	89885781
82	NC_007901	CT	3	6	56850	56855	0 %	50 %	0 %	50 %	89885781
83	NC_007901	CA	3	6	57087	57092	50 %	0 %	0 %	50 %	89885781
84	NC_007901	GC	3	6	58545	58550	0 %	0 %	50 %	50 %	89885781
85	NC_007901	GC	3	6	59449	59454	0 %	0 %	50 %	50 %	89885781
86	NC_007901	TC	3	6	59732	59737	0 %	50 %	0 %	50 %	89885781
87	NC_007901	AT	3	6	59743	59748	50 %	50 %	0 %	0 %	89885781
88	NC_007901	CG	3	6	60185	60190	0 %	0 %	50 %	50 %	89885781
89	NC_007901	GC	3	6	62824	62829	0 %	0 %	50 %	50 %	89885782
90	NC_007901	GC	3	6	62969	62974	0 %	0 %	50 %	50 %	89885782
91	NC_007901	GT	3	6	63057	63062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007901	CG	3	6	64975	64980	0 %	0 %	50 %	50 %	89885784
93	NC_007901	GT	3	6	65180	65185	0 %	50 %	50 %	0 %	89885784
94	NC_007901	GC	3	6	65802	65807	0 %	0 %	50 %	50 %	89885785
95	NC_007901	CG	3	6	66222	66227	0 %	0 %	50 %	50 %	89885785
96	NC_007901	TC	3	6	67983	67988	0 %	50 %	0 %	50 %	89885789
97	NC_007901	CG	3	6	68742	68747	0 %	0 %	50 %	50 %	89885790
98	NC_007901	CA	3	6	69369	69374	50 %	0 %	0 %	50 %	89885791
99	NC_007901	GC	3	6	70371	70376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007901	AT	3	6	70918	70923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007901	TC	3	6	71292	71297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007901	TG	3	6	71612	71617	0 %	50 %	50 %	0 %	89885793
103	NC_007901	CT	3	6	73745	73750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007901	CA	3	6	74376	74381	50 %	0 %	0 %	50 %	89885797
105	NC_007901	GT	3	6	74875	74880	0 %	50 %	50 %	0 %	89885797
106	NC_007901	CG	3	6	74993	74998	0 %	0 %	50 %	50 %	89885797
107	NC_007901	GC	3	6	75177	75182	0 %	0 %	50 %	50 %	89885797
108	NC_007901	CT	3	6	76419	76424	0 %	50 %	0 %	50 %	89885798
109	NC_007901	GC	3	6	76553	76558	0 %	0 %	50 %	50 %	89885798
110	NC_007901	GC	3	6	76972	76977	0 %	0 %	50 %	50 %	89885798
111	NC_007901	TG	3	6	78077	78082	0 %	50 %	50 %	0 %	89885799
112	NC_007901	CG	3	6	78152	78157	0 %	0 %	50 %	50 %	89885799
113	NC_007901	GT	3	6	79035	79040	0 %	50 %	50 %	0 %	89885800
114	NC_007901	GC	3	6	79257	79262	0 %	0 %	50 %	50 %	89885800
115	NC_007901	TC	3	6	79443	79448	0 %	50 %	0 %	50 %	89885800
116	NC_007901	GT	3	6	80513	80518	0 %	50 %	50 %	0 %	89885802
117	NC_007901	AT	3	6	81184	81189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007901	AG	3	6	81713	81718	50 %	0 %	50 %	0 %	89885804
119	NC_007901	GC	3	6	82267	82272	0 %	0 %	50 %	50 %	89885804
120	NC_007901	CG	3	6	82594	82599	0 %	0 %	50 %	50 %	89885804
121	NC_007901	GA	3	6	82726	82731	50 %	0 %	50 %	0 %	89885804
122	NC_007901	CG	3	6	83438	83443	0 %	0 %	50 %	50 %	89885805
123	NC_007901	CG	3	6	84308	84313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007901	AC	3	6	84539	84544	50 %	0 %	0 %	50 %	89885807
125	NC_007901	CA	3	6	84699	84704	50 %	0 %	0 %	50 %	89885807
126	NC_007901	CT	3	6	84788	84793	0 %	50 %	0 %	50 %	89885807
127	NC_007901	GC	3	6	85511	85516	0 %	0 %	50 %	50 %	89885808
128	NC_007901	GT	3	6	86103	86108	0 %	50 %	50 %	0 %	89885808
129	NC_007901	TC	3	6	86408	86413	0 %	50 %	0 %	50 %	89885809
130	NC_007901	TG	3	6	87095	87100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007901	AG	3	6	87147	87152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007901	CG	3	6	87872	87877	0 %	0 %	50 %	50 %	89885811
133	NC_007901	CG	3	6	87899	87904	0 %	0 %	50 %	50 %	89885811
134	NC_007901	GT	3	6	88754	88759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007901	CG	4	8	89310	89317	0 %	0 %	50 %	50 %	89885813
136	NC_007901	AC	3	6	89417	89422	50 %	0 %	0 %	50 %	89885813
137	NC_007901	GC	3	6	90057	90062	0 %	0 %	50 %	50 %	89885813
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139	NC_007901	GC	3	6	92455	92460	0 %	0 %	50 %	50 %	89885813
140	NC_007901	GC	3	6	92818	92823	0 %	0 %	50 %	50 %	89885814
141	NC_007901	CG	3	6	93237	93242	0 %	0 %	50 %	50 %	89885814
142	NC_007901	GC	3	6	93766	93771	0 %	0 %	50 %	50 %	89885814
143	NC_007901	GA	3	6	93940	93945	50 %	0 %	50 %	0 %	89885815
144	NC_007901	AG	3	6	94658	94663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007901	GC	3	6	95347	95352	0 %	0 %	50 %	50 %	89885817
146	NC_007901	CA	3	6	96730	96735	50 %	0 %	0 %	50 %	89885819
147	NC_007901	TG	3	6	97236	97241	0 %	50 %	50 %	0 %	89885820
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.