MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 4567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007901	TGA	2	6	196183	196188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885916
3502	NC_007901	A	6	6	196242	196247	100 %	0 %	0 %	0 %	89885916
3503	NC_007901	GTC	2	6	196337	196342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885916
3504	NC_007901	CCG	3	9	196411	196419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885916
3505	NC_007901	CTT	2	6	196427	196432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885916
3506	NC_007901	GAACCA	2	12	196472	196483	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	89885916
3507	NC_007901	CAGC	2	8	196495	196502	25 %	0 %	25 %	50 %	89885916
3508	NC_007901	CCA	2	6	196516	196521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885916
3509	NC_007901	CCT	2	6	196540	196545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885916
3510	NC_007901	TCA	2	6	196569	196574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885916
3511	NC_007901	CAAA	2	8	196587	196594	75 %	0 %	0 %	25 %	89885916
3512	NC_007901	GGC	2	6	196604	196609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885916
3513	NC_007901	GCT	2	6	196730	196735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885916
3514	NC_007901	GC	3	6	196783	196788	0 %	0 %	50 %	50 %	89885916
3515	NC_007901	TCTG	2	8	196945	196952	0 %	50 %	25 %	25 %	89885916
3516	NC_007901	TC	3	6	196955	196960	0 %	50 %	0 %	50 %	89885916
3517	NC_007901	CT	3	6	196975	196980	0 %	50 %	0 %	50 %	89885916
3518	NC_007901	CCA	2	6	196983	196988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885916
3519	NC_007901	GAA	2	6	197095	197100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885916
3520	NC_007901	GGC	2	6	197120	197125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885916
3521	NC_007901	GCC	2	6	197127	197132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885916
3522	NC_007901	TGC	2	6	197273	197278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885916
3523	NC_007901	TC	3	6	197324	197329	0 %	50 %	0 %	50 %	89885916
3524	NC_007901	CGC	2	6	197360	197365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885916
3525	NC_007901	CTT	2	6	197408	197413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885916
3526	NC_007901	CAGC	2	8	197525	197532	25 %	0 %	25 %	50 %	89885916
3527	NC_007901	CCA	2	6	197581	197586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885916
3528	NC_007901	TCT	2	6	197683	197688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885916
3529	NC_007901	CAG	2	6	197752	197757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885916
3530	NC_007901	CGG	2	6	197783	197788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885916
3531	NC_007901	CAG	2	6	197804	197809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885916
3532	NC_007901	AGG	2	6	198023	198028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885916
3533	NC_007901	TCGC	2	8	198040	198047	0 %	25 %	25 %	50 %	89885916
3534	NC_007901	TGG	2	6	198056	198061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885916
3535	NC_007901	AGT	2	6	198105	198110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885916
3536	NC_007901	TGT	2	6	198356	198361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_007901	A	7	7	198463	198469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_007901	GTT	2	6	198490	198495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_007901	CAC	2	6	198577	198582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_007901	CCAG	2	8	198588	198595	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_007901	CAG	2	6	198641	198646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_007901	ACA	2	6	198659	198664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_007901	CGG	2	6	198739	198744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_007901	TTG	2	6	198755	198760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_007901	TA	3	6	198775	198780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_007901	CA	3	6	198946	198951	50 %	0 %	0 %	50 %	89885917
3547	NC_007901	AAAT	2	8	198973	198980	75 %	25 %	0 %	0 %	89885917
3548	NC_007901	AGGC	2	8	199008	199015	25 %	0 %	50 %	25 %	89885917
3549	NC_007901	CAA	2	6	199019	199024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885917
3550	NC_007901	TTG	2	6	199029	199034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885917
3551	NC_007901	TGA	2	6	199051	199056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885917
3552	NC_007901	GGC	2	6	199186	199191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885918
3553	NC_007901	AGCG	2	8	199210	199217	25 %	0 %	50 %	25 %	89885918
3554	NC_007901	ATG	2	6	199220	199225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885918
3555	NC_007901	ATC	2	6	199391	199396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885918
3556	NC_007901	GTC	2	6	199436	199441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885919
3557	NC_007901	ATG	2	6	199470	199475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885919
3558	NC_007901	GCC	2	6	199491	199496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885919
3559	NC_007901	TTG	2	6	199506	199511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885919
3560	NC_007901	ATC	2	6	199550	199555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885919
3561	NC_007901	GTG	2	6	199596	199601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885919
3562	NC_007901	CCAAC	2	10	199613	199622	40 %	0 %	0 %	60 %	89885919
3563	NC_007901	CAAC	2	8	199651	199658	50 %	0 %	0 %	50 %	89885919
3564	NC_007901	GCA	2	6	199691	199696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885919
3565	NC_007901	TCA	2	6	199721	199726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885919
3566	NC_007901	GT	3	6	199815	199820	0 %	50 %	50 %	0 %	89885920
3567	NC_007901	GCATG	2	10	199847	199856	20 %	20 %	40 %	20 %	89885920
3568	NC_007901	CCA	2	6	199882	199887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885920
3569	NC_007901	CAC	2	6	199913	199918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885920
3570	NC_007901	GTC	2	6	199960	199965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885920
3571	NC_007901	CGTCC	2	10	199989	199998	0 %	20 %	20 %	60 %	89885920
3572	NC_007901	ATAG	2	8	200034	200041	50 %	25 %	25 %	0 %	89885920
3573	NC_007901	GT	3	6	200117	200122	0 %	50 %	50 %	0 %	89885920
3574	NC_007901	GTT	2	6	200126	200131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885920
3575	NC_007901	CTTC	2	8	200146	200153	0 %	50 %	0 %	50 %	89885920
3576	NC_007901	GGT	2	6	200165	200170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885920
3577	NC_007901	TCA	2	6	200231	200236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_007901	GT	3	6	200325	200330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_007901	CGC	2	6	200433	200438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885921
3580	NC_007901	TCT	2	6	200447	200452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885921
3581	NC_007901	GTATCA	2	12	200489	200500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89885921
3582	NC_007901	GCG	2	6	200528	200533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885921
3583	NC_007901	GTG	2	6	200574	200579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885921
3584	NC_007901	ACA	2	6	200708	200713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885922
3585	NC_007901	CTC	2	6	200784	200789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885922
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3587	NC_007901	CAA	2	6	200898	200903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885922
3588	NC_007901	CT	3	6	200982	200987	0 %	50 %	0 %	50 %	89885922
3589	NC_007901	AT	3	6	201029	201034	50 %	50 %	0 %	0 %	89885922
3590	NC_007901	ACT	2	6	201038	201043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885923
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3592	NC_007901	TTA	2	6	201078	201083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89885923
3593	NC_007901	TCGC	2	8	201207	201214	0 %	25 %	25 %	50 %	89885923
3594	NC_007901	TTCT	2	8	201218	201225	0 %	75 %	0 %	25 %	89885923
3595	NC_007901	TCT	2	6	201310	201315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885923
3596	NC_007901	AAC	2	6	201332	201337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885923
3597	NC_007901	TCA	2	6	201381	201386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885923
3598	NC_007901	CAA	2	6	201413	201418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885923
3599	NC_007901	TCG	2	6	201450	201455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885923
3600	NC_007901	TTC	2	6	201476	201481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885923
3601	NC_007901	CAG	2	6	201490	201495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885923
3602	NC_007901	GTT	2	6	201536	201541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885923
3603	NC_007901	GCT	2	6	201570	201575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885923
3604	NC_007901	CAAT	2	8	201619	201626	50 %	25 %	0 %	25 %	89885923
3605	NC_007901	T	6	6	201706	201711	0 %	100 %	0 %	0 %	89885923
3606	NC_007901	AGA	2	6	201756	201761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885923
3607	NC_007901	CAA	2	6	201787	201792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885923
3608	NC_007901	CAAA	2	8	201817	201824	75 %	0 %	0 %	25 %	89885923
3609	NC_007901	CTA	2	6	201847	201852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885923
3610	NC_007901	GAA	2	6	201857	201862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885923
3611	NC_007901	TCA	3	9	201996	202004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885923
3612	NC_007901	GGAA	2	8	202146	202153	50 %	0 %	50 %	0 %	89885923
3613	NC_007901	CT	3	6	202261	202266	0 %	50 %	0 %	50 %	89885923
3614	NC_007901	TCCT	2	8	202281	202288	0 %	50 %	0 %	50 %	89885923
3615	NC_007901	T	6	6	202378	202383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_007901	GTT	2	6	202386	202391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_007901	GC	3	6	202424	202429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_007901	AGC	2	6	202470	202475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885924
3619	NC_007901	GAC	2	6	202508	202513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885924
3620	NC_007901	GCC	2	6	202578	202583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885924
3621	NC_007901	GTT	2	6	202744	202749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885925
3622	NC_007901	GAAC	2	8	202762	202769	50 %	0 %	25 %	25 %	89885925
3623	NC_007901	TGG	2	6	202781	202786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885925
3624	NC_007901	TTC	2	6	202806	202811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885925
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3882	NC_007901	TGC	2	6	219361	219366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885952
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3884	NC_007901	GGGT	2	8	219381	219388	0 %	25 %	75 %	0 %	89885952
3885	NC_007901	GGC	2	6	219411	219416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885952
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3902	NC_007901	TGA	2	6	220147	220152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885953
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3999	NC_007901	ATGA	2	8	225362	225369	50 %	25 %	25 %	0 %	89885957
4000	NC_007901	CAA	2	6	225373	225378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885957

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