MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 4567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007901	GCC	2	6	26814	26819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885757
502	NC_007901	CTT	2	6	26839	26844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885757
503	NC_007901	GGA	2	6	26871	26876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885757
504	NC_007901	AGG	2	6	26912	26917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885757
505	NC_007901	ACA	2	6	26951	26956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885757
506	NC_007901	TTGCT	2	10	26998	27007	0 %	60 %	20 %	20 %	89885757
507	NC_007901	TGT	2	6	27051	27056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885757
508	NC_007901	CAAAG	2	10	27064	27073	60 %	0 %	20 %	20 %	89885757
509	NC_007901	CAT	2	6	27090	27095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885757
510	NC_007901	CG	3	6	27108	27113	0 %	0 %	50 %	50 %	89885757
511	NC_007901	GTTTT	2	10	27219	27228	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
512	NC_007901	T	6	6	27225	27230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_007901	GCTT	2	8	27242	27249	0 %	50 %	25 %	25 %	89885758
514	NC_007901	TCT	2	6	27324	27329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885758
515	NC_007901	CG	3	6	27378	27383	0 %	0 %	50 %	50 %	89885758
516	NC_007901	CAG	2	6	27476	27481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885758
517	NC_007901	ATC	2	6	27497	27502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885758
518	NC_007901	GC	3	6	27510	27515	0 %	0 %	50 %	50 %	89885758
519	NC_007901	TCG	2	6	27542	27547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885758
520	NC_007901	AGG	2	6	27573	27578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885758
521	NC_007901	ATGCG	2	10	27809	27818	20 %	20 %	40 %	20 %	89885758
522	NC_007901	CGGGG	2	10	27942	27951	0 %	0 %	80 %	20 %	89885758
523	NC_007901	TTG	2	6	27971	27976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885758
524	NC_007901	TCA	2	6	27977	27982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885758
525	NC_007901	ATC	2	6	28021	28026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885758
526	NC_007901	CGCT	2	8	28076	28083	0 %	25 %	25 %	50 %	89885758
527	NC_007901	CTT	2	6	28120	28125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885758
528	NC_007901	GTCCA	2	10	28198	28207	20 %	20 %	20 %	40 %	89885758
529	NC_007901	CTC	2	6	28275	28280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885759
530	NC_007901	TTG	2	6	28490	28495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885759
531	NC_007901	TCT	2	6	28500	28505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885759
532	NC_007901	GCT	2	6	28535	28540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885759
533	NC_007901	ACC	2	6	28585	28590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885759
534	NC_007901	TTGC	2	8	28644	28651	0 %	50 %	25 %	25 %	89885759
535	NC_007901	TAA	2	6	28890	28895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007901	CGA	2	6	28927	28932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_007901	CGC	2	6	28943	28948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_007901	TCCCC	2	10	28993	29002	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
539	NC_007901	AGGG	2	8	29007	29014	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007901	GAA	2	6	29027	29032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007901	TTCT	2	8	29040	29047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_007901	TC	3	6	29084	29089	0 %	50 %	0 %	50 %	89885760
543	NC_007901	GAT	2	6	29095	29100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885760
544	NC_007901	AC	3	6	29167	29172	50 %	0 %	0 %	50 %	89885760
545	NC_007901	CAATGC	2	12	29173	29184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89885760
546	NC_007901	CAC	2	6	29267	29272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885760
547	NC_007901	C	7	7	29345	29351	0 %	0 %	0 %	100 %	89885760
548	NC_007901	AGGCA	2	10	29379	29388	40 %	0 %	40 %	20 %	89885760
549	NC_007901	CAT	2	6	29473	29478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885760
550	NC_007901	AAG	2	6	29493	29498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885760
551	NC_007901	GA	3	6	29538	29543	50 %	0 %	50 %	0 %	89885760
552	NC_007901	CAG	2	6	29552	29557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
553	NC_007901	CAT	2	6	29726	29731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885760
554	NC_007901	C	6	6	29765	29770	0 %	0 %	0 %	100 %	89885760
555	NC_007901	CTG	2	6	29805	29810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885760
556	NC_007901	GCC	2	6	29921	29926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885760
557	NC_007901	TTC	2	6	29948	29953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885760
558	NC_007901	TCA	2	6	30039	30044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885760
559	NC_007901	CCGT	2	8	30069	30076	0 %	25 %	25 %	50 %	89885760
560	NC_007901	GCCCT	2	10	30125	30134	0 %	20 %	20 %	60 %	89885760
561	NC_007901	CAG	2	6	30157	30162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
562	NC_007901	C	6	6	30174	30179	0 %	0 %	0 %	100 %	89885760
563	NC_007901	GCT	2	6	30184	30189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885760
564	NC_007901	GGTCC	2	10	30190	30199	0 %	20 %	40 %	40 %	89885760
565	NC_007901	TTG	2	6	30201	30206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885760
566	NC_007901	CCA	2	6	30259	30264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885760
567	NC_007901	GCA	2	6	30268	30273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
568	NC_007901	CGG	2	6	30298	30303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885760
569	NC_007901	CAG	2	6	30341	30346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
570	NC_007901	TGATC	2	10	30349	30358	20 %	40 %	20 %	20 %	89885760
571	NC_007901	TG	3	6	30360	30365	0 %	50 %	50 %	0 %	89885760
572	NC_007901	GGC	2	6	30386	30391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885760
573	NC_007901	GAA	2	6	30446	30451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885760
574	NC_007901	CCT	2	6	30490	30495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885760
575	NC_007901	ATGA	2	8	30499	30506	50 %	25 %	25 %	0 %	89885760
576	NC_007901	CGT	2	6	30508	30513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885760
577	NC_007901	ACA	2	6	30514	30519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885760
578	NC_007901	CG	3	6	30546	30551	0 %	0 %	50 %	50 %	89885760
579	NC_007901	TGCG	2	8	30570	30577	0 %	25 %	50 %	25 %	89885760
580	NC_007901	TCC	2	6	30591	30596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885760
581	NC_007901	ACG	2	6	30609	30614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885760
582	NC_007901	GAT	2	6	30719	30724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885760
583	NC_007901	TCA	2	6	30738	30743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885760
584	NC_007901	GCC	2	6	30790	30795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885760
585	NC_007901	CGT	2	6	30812	30817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885760
586	NC_007901	TTG	2	6	30852	30857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885760
587	NC_007901	CCG	2	6	30936	30941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885761
588	NC_007901	CCT	2	6	30984	30989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885761
589	NC_007901	GCC	2	6	31135	31140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885761
590	NC_007901	CCTT	2	8	31174	31181	0 %	50 %	0 %	50 %	89885761
591	NC_007901	CAA	2	6	31225	31230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885761
592	NC_007901	GAA	2	6	31252	31257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885761
593	NC_007901	GAC	2	6	31309	31314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885761
594	NC_007901	TTG	2	6	31364	31369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885761
595	NC_007901	TCG	2	6	31466	31471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885761
596	NC_007901	TGC	2	6	31479	31484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885761
597	NC_007901	CAT	2	6	31486	31491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885761
598	NC_007901	ATG	2	6	31547	31552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885761
599	NC_007901	ATG	2	6	31613	31618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885761
600	NC_007901	TGT	2	6	31659	31664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885761
601	NC_007901	ACC	2	6	31765	31770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885761
602	NC_007901	ATCA	2	8	31849	31856	50 %	25 %	0 %	25 %	89885761
603	NC_007901	G	6	6	31888	31893	0 %	0 %	100 %	0 %	89885761
604	NC_007901	CG	3	6	31936	31941	0 %	0 %	50 %	50 %	89885761
605	NC_007901	ACC	2	6	31976	31981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885761
606	NC_007901	GTTT	2	8	32001	32008	0 %	75 %	25 %	0 %	89885761
607	NC_007901	AAG	2	6	32040	32045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_007901	GTG	2	6	32069	32074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007901	CGA	2	6	32122	32127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_007901	TGCCTT	2	12	32151	32162	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_007901	GCC	2	6	32236	32241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_007901	CGA	2	6	32264	32269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_007901	CGGGT	2	10	32398	32407	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
614	NC_007901	GCT	2	6	32423	32428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_007901	AAC	2	6	32469	32474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_007901	AAGG	2	8	32550	32557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_007901	AC	5	10	32788	32797	50 %	0 %	0 %	50 %	89885762
618	NC_007901	GTC	2	6	32868	32873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885762
619	NC_007901	GTC	2	6	32897	32902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885762
620	NC_007901	TC	3	6	32935	32940	0 %	50 %	0 %	50 %	89885762
621	NC_007901	TAC	2	6	33002	33007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885762
622	NC_007901	TCA	2	6	33013	33018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885762
623	NC_007901	CAC	2	6	33076	33081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885763
624	NC_007901	AG	3	6	33108	33113	50 %	0 %	50 %	0 %	89885763
625	NC_007901	ATT	2	6	33143	33148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89885763
626	NC_007901	AAC	2	6	33156	33161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885763
627	NC_007901	C	6	6	33175	33180	0 %	0 %	0 %	100 %	89885763
628	NC_007901	ATTGG	2	10	33251	33260	20 %	40 %	40 %	0 %	89885763
629	NC_007901	CAT	2	6	33263	33268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885763
630	NC_007901	CCA	2	6	33286	33291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885763
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632	NC_007901	GCA	2	6	33366	33371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885763
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