MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 4567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007901	GT	3	6	253746	253751	0 %	50 %	50 %	0 %	89885977
4502	NC_007901	GATC	2	8	253818	253825	25 %	25 %	25 %	25 %	89885977
4503	NC_007901	ACT	2	6	253855	253860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885977
4504	NC_007901	C	7	7	253990	253996	0 %	0 %	0 %	100 %	89885977
4505	NC_007901	GTA	2	6	254074	254079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885977
4506	NC_007901	CA	3	6	254101	254106	50 %	0 %	0 %	50 %	89885977
4507	NC_007901	CCA	2	6	254108	254113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885977
4508	NC_007901	GGC	2	6	254296	254301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885977
4509	NC_007901	CGC	2	6	254360	254365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885977
4510	NC_007901	GCG	2	6	254443	254448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885977
4511	NC_007901	TCAGT	2	10	254501	254510	20 %	40 %	20 %	20 %	89885978
4512	NC_007901	CAGGC	2	10	254535	254544	20 %	0 %	40 %	40 %	89885978
4513	NC_007901	CTG	2	6	254703	254708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885978
4514	NC_007901	ATC	2	6	254716	254721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885978
4515	NC_007901	CATT	2	8	254747	254754	25 %	50 %	0 %	25 %	89885978
4516	NC_007901	GAAC	2	8	254762	254769	50 %	0 %	25 %	25 %	89885978
4517	NC_007901	GGC	2	6	254841	254846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885978
4518	NC_007901	TGG	2	6	254918	254923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885978
4519	NC_007901	ACA	2	6	254926	254931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885978
4520	NC_007901	GCG	2	6	254947	254952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885978
4521	NC_007901	CGAT	2	8	255044	255051	25 %	25 %	25 %	25 %	89885978
4522	NC_007901	CTT	2	6	255090	255095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885978
4523	NC_007901	ATT	2	6	255153	255158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89885978
4524	NC_007901	TGG	2	6	255182	255187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885978
4525	NC_007901	AGC	2	6	255220	255225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885978
4526	NC_007901	CTT	2	6	255293	255298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885978
4527	NC_007901	CAC	2	6	255362	255367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885978
4528	NC_007901	CCGC	2	8	255430	255437	0 %	0 %	25 %	75 %	89885978
4529	NC_007901	TTTCA	2	10	255483	255492	20 %	60 %	0 %	20 %	89885978
4530	NC_007901	CAG	2	6	255501	255506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885978
4531	NC_007901	CGT	2	6	255524	255529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885978
4532	NC_007901	TCT	2	6	255647	255652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885978
4533	NC_007901	ATG	2	6	255655	255660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885978
4534	NC_007901	ATC	2	6	255664	255669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885978
4535	NC_007901	TC	4	8	255680	255687	0 %	50 %	0 %	50 %	89885978
4536	NC_007901	GAA	2	6	255730	255735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_007901	CTG	2	6	255782	255787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885979
4538	NC_007901	CCA	2	6	255821	255826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885979
4539	NC_007901	ACC	2	6	255843	255848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885979
4540	NC_007901	TGC	2	6	255900	255905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885979
4541	NC_007901	CCA	2	6	255923	255928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885979
4542	NC_007901	GCG	2	6	256051	256056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885979
4543	NC_007901	TTG	2	6	256096	256101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885979
4544	NC_007901	GAT	2	6	256254	256259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885979
4545	NC_007901	CAC	2	6	256266	256271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885979
4546	NC_007901	GTTT	2	8	256297	256304	0 %	75 %	25 %	0 %	89885979
4547	NC_007901	TTTG	2	8	256305	256312	0 %	75 %	25 %	0 %	89885979
4548	NC_007901	CT	3	6	256334	256339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_007901	TTG	2	6	256416	256421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885980
4550	NC_007901	ATC	3	9	256430	256438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885980
4551	NC_007901	GAC	3	9	256447	256455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885980
4552	NC_007901	GCG	2	6	256460	256465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885980
4553	NC_007901	GC	3	6	256507	256512	0 %	0 %	50 %	50 %	89885980
4554	NC_007901	TTC	2	6	256567	256572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885980
4555	NC_007901	ATCA	2	8	256606	256613	50 %	25 %	0 %	25 %	89885980
4556	NC_007901	AT	3	6	256688	256693	50 %	50 %	0 %	0 %	89885980
4557	NC_007901	ACA	2	6	256788	256793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885980
4558	NC_007901	CAA	2	6	256885	256890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885980
4559	NC_007901	CCA	2	6	256893	256898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885980
4560	NC_007901	TCTG	2	8	256986	256993	0 %	50 %	25 %	25 %	89885980
4561	NC_007901	CGCCA	2	10	257029	257038	20 %	0 %	20 %	60 %	89885980
4562	NC_007901	CAA	2	6	257106	257111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885980
4563	NC_007901	CAT	2	6	257166	257171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885980
4564	NC_007901	GCT	2	6	257331	257336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885980
4565	NC_007901	GACT	2	8	257345	257352	25 %	25 %	25 %	25 %	89885980
4566	NC_007901	TCC	2	6	257375	257380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885980
4567	NC_007901	ATTT	2	8	257428	257435	25 %	75 %	0 %	0 %	89885980

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.