MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 145725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_007778	CGCC	2	8	146543	146550	0 %	0 %	25 %	75 %	86747261
4003	NC_007778	CGA	2	6	146561	146566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747261
4004	NC_007778	AGC	2	6	146595	146600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747261
4005	NC_007778	TGA	2	6	146621	146626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747261
4006	NC_007778	GAC	2	6	146643	146648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747261
4007	NC_007778	GCT	2	6	146664	146669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_007778	CTT	2	6	146786	146791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_007778	CGG	2	6	147027	147032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747262
4010	NC_007778	ATC	2	6	147061	147066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747262
4011	NC_007778	CGGC	2	8	147084	147091	0 %	0 %	50 %	50 %	86747262
4012	NC_007778	GGATGC	2	12	147101	147112	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86747262
4013	NC_007778	CGC	2	6	147129	147134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747262
4014	NC_007778	AGC	2	6	147176	147181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747262
4015	NC_007778	GCAGC	2	10	147210	147219	20 %	0 %	40 %	40 %	86747262
4016	NC_007778	GAA	2	6	147243	147248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86747262
4017	NC_007778	GGC	2	6	147279	147284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747262
4018	NC_007778	CGA	2	6	147291	147296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747262
4019	NC_007778	CG	3	6	147309	147314	0 %	0 %	50 %	50 %	86747262
4020	NC_007778	CCG	2	6	147356	147361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747262
4021	NC_007778	CG	3	6	147441	147446	0 %	0 %	50 %	50 %	86747262
4022	NC_007778	CAA	2	6	147471	147476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747262
4023	NC_007778	CGA	2	6	147501	147506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747262
4024	NC_007778	TGC	2	6	147539	147544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747262
4025	NC_007778	CGC	2	6	147547	147552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747262
4026	NC_007778	GC	3	6	147562	147567	0 %	0 %	50 %	50 %	86747262
4027	NC_007778	CGA	2	6	147570	147575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747262
4028	NC_007778	ATG	2	6	147580	147585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747262
4029	NC_007778	GC	3	6	147593	147598	0 %	0 %	50 %	50 %	86747262
4030	NC_007778	TCA	2	6	147629	147634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747262
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4032	NC_007778	CG	3	6	147678	147683	0 %	0 %	50 %	50 %	86747262
4033	NC_007778	CGT	2	6	147711	147716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747262
4034	NC_007778	GC	3	6	147770	147775	0 %	0 %	50 %	50 %	86747262
4035	NC_007778	GCCA	2	8	147790	147797	25 %	0 %	25 %	50 %	86747262
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4043	NC_007778	CGGCT	2	10	148006	148015	0 %	20 %	40 %	40 %	86747262
4044	NC_007778	GTG	2	6	148018	148023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747262
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4046	NC_007778	TGC	2	6	148070	148075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747262
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4050	NC_007778	TCGGGC	2	12	148118	148129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86747262
4051	NC_007778	TCGC	2	8	148134	148141	0 %	25 %	25 %	50 %	86747262
4052	NC_007778	TGC	2	6	148163	148168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747262
4053	NC_007778	GC	3	6	148173	148178	0 %	0 %	50 %	50 %	86747262
4054	NC_007778	CTG	2	6	148195	148200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747262
4055	NC_007778	CG	3	6	148229	148234	0 %	0 %	50 %	50 %	86747262
4056	NC_007778	GCA	2	6	148241	148246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747262
4057	NC_007778	ACT	2	6	148250	148255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747262
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4059	NC_007778	CGGCT	2	10	148378	148387	0 %	20 %	40 %	40 %	86747262
4060	NC_007778	ACCG	2	8	148402	148409	25 %	0 %	25 %	50 %	86747262
4061	NC_007778	GAA	2	6	148458	148463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86747262
4062	NC_007778	TGC	2	6	148469	148474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4103	NC_007778	CGG	2	6	149701	149706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747264
4104	NC_007778	GTCG	2	8	149774	149781	0 %	25 %	50 %	25 %	86747264
4105	NC_007778	TCG	2	6	149784	149789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747264
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4111	NC_007778	GC	3	6	150017	150022	0 %	0 %	50 %	50 %	86747264
4112	NC_007778	CCG	2	6	150082	150087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747264
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4121	NC_007778	CGAGG	2	10	150380	150389	20 %	0 %	60 %	20 %	86747264
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4370	NC_007778	GATC	2	8	159159	159166	25 %	25 %	25 %	25 %	86747273
4371	NC_007778	GCCG	2	8	159168	159175	0 %	0 %	50 %	50 %	86747273
4372	NC_007778	CCG	2	6	159209	159214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747273
4373	NC_007778	GCG	2	6	159248	159253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747273
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4399	NC_007778	TCG	2	6	160051	160056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747274
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4491	NC_007778	CCG	2	6	163023	163028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747275
4492	NC_007778	GCT	3	9	163039	163047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4493	NC_007778	GGT	2	6	163048	163053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747275
4494	NC_007778	GC	5	10	163058	163067	0 %	0 %	50 %	50 %	86747275
4495	NC_007778	TCT	2	6	163101	163106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86747275
4496	NC_007778	GCG	2	6	163128	163133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747275
4497	NC_007778	GTC	2	6	163151	163156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4498	NC_007778	TCA	2	6	163167	163172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747275
4499	NC_007778	AGC	2	6	163209	163214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747275
4500	NC_007778	CTG	2	6	163235	163240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747275

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