MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 145725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007778	GCG	2	6	109516	109521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747228
3002	NC_007778	GAT	2	6	109523	109528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747228
3003	NC_007778	CGG	2	6	109586	109591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747228
3004	NC_007778	GCC	2	6	109601	109606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747228
3005	NC_007778	GTC	2	6	109678	109683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747228
3006	NC_007778	GCC	3	9	109690	109698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747228
3007	NC_007778	CAT	2	6	109794	109799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747228
3008	NC_007778	CAC	2	6	109800	109805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747228
3009	NC_007778	AAC	2	6	109828	109833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747228
3010	NC_007778	GCC	2	6	109886	109891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747228
3011	NC_007778	GCG	2	6	109899	109904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747228
3012	NC_007778	GCC	2	6	109948	109953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747229
3013	NC_007778	CAG	2	6	109955	109960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3014	NC_007778	TGT	2	6	110008	110013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86747229
3015	NC_007778	GGC	2	6	110036	110041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747229
3016	NC_007778	GGC	2	6	110102	110107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747229
3017	NC_007778	ACC	2	6	110127	110132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747229
3018	NC_007778	GCCG	2	8	110156	110163	0 %	0 %	50 %	50 %	86747229
3019	NC_007778	ACTG	2	8	110250	110257	25 %	25 %	25 %	25 %	86747229
3020	NC_007778	GTC	2	6	110264	110269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3021	NC_007778	GGT	2	6	110288	110293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747229
3022	NC_007778	GCCAA	2	10	110325	110334	40 %	0 %	20 %	40 %	86747229
3023	NC_007778	TGC	2	6	110361	110366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3024	NC_007778	GAC	2	6	110375	110380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3025	NC_007778	GC	3	6	110402	110407	0 %	0 %	50 %	50 %	86747229
3026	NC_007778	GTT	2	6	110414	110419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86747229
3027	NC_007778	CGCC	2	8	110457	110464	0 %	0 %	25 %	75 %	86747229
3028	NC_007778	CCG	2	6	110550	110555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747229
3029	NC_007778	CGT	2	6	110633	110638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3030	NC_007778	GAA	2	6	110640	110645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86747229
3031	NC_007778	GCC	2	6	110717	110722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747229
3032	NC_007778	CGAC	2	8	110854	110861	25 %	0 %	25 %	50 %	86747229
3033	NC_007778	CCG	2	6	110868	110873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747229
3034	NC_007778	ATT	2	6	110882	110887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86747229
3035	NC_007778	CTG	3	9	110990	110998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3036	NC_007778	TGC	2	6	111022	111027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3037	NC_007778	GGT	2	6	111041	111046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747229
3038	NC_007778	TCC	2	6	111063	111068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86747229
3039	NC_007778	TGC	2	6	111181	111186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3040	NC_007778	TCG	2	6	111222	111227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3041	NC_007778	GCG	2	6	111244	111249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747229
3042	NC_007778	CAGGT	2	10	111300	111309	20 %	20 %	40 %	20 %	86747229
3043	NC_007778	GGTC	2	8	111310	111317	0 %	25 %	50 %	25 %	86747229
3044	NC_007778	CGG	2	6	111331	111336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747229
3045	NC_007778	TTG	2	6	111423	111428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86747229
3046	NC_007778	ACC	2	6	111434	111439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747229
3047	NC_007778	GCT	2	6	111514	111519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3048	NC_007778	GCC	2	6	111539	111544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747229
3049	NC_007778	TCA	2	6	111673	111678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747229
3050	NC_007778	CGC	2	6	111718	111723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747229
3051	NC_007778	TGA	2	6	111820	111825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747229
3052	NC_007778	GCG	2	6	111850	111855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747229
3053	NC_007778	GGC	2	6	111865	111870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747229
3054	NC_007778	CGG	2	6	111919	111924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747229
3055	NC_007778	GCA	2	6	111936	111941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3056	NC_007778	GGCG	2	8	111951	111958	0 %	0 %	75 %	25 %	86747229
3057	NC_007778	CGA	2	6	111989	111994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3058	NC_007778	GCCG	2	8	111995	112002	0 %	0 %	50 %	50 %	86747229
3059	NC_007778	CG	4	8	112013	112020	0 %	0 %	50 %	50 %	86747229
3060	NC_007778	CG	3	6	112032	112037	0 %	0 %	50 %	50 %	86747229
3061	NC_007778	CG	3	6	112069	112074	0 %	0 %	50 %	50 %	86747229
3062	NC_007778	CAG	2	6	112106	112111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3063	NC_007778	GGA	2	6	112127	112132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86747229
3064	NC_007778	CAG	2	6	112133	112138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747229
3065	NC_007778	CCCG	2	8	112266	112273	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3066	NC_007778	ACGA	2	8	112292	112299	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_007778	CGC	2	6	112334	112339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_007778	CGC	2	6	112380	112385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_007778	CG	4	8	112418	112425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_007778	CCCG	2	8	112508	112515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3071	NC_007778	CCG	2	6	112554	112559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_007778	CGAGA	2	10	112591	112600	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3073	NC_007778	CTG	2	6	112716	112721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_007778	GC	3	6	112748	112753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_007778	TGA	2	6	112786	112791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_007778	T	6	6	112818	112823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_007778	T	6	6	112889	112894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_007778	CG	3	6	112905	112910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_007778	CAGGCA	2	12	112914	112925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_007778	GCG	2	6	112930	112935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_007778	ACC	2	6	113063	113068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747230
3083	NC_007778	TCG	2	6	113070	113075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747230
3084	NC_007778	GCT	2	6	113080	113085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747230
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3086	NC_007778	CGAGCG	2	12	113152	113163	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86747230
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3088	NC_007778	GAC	2	6	113204	113209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747230
3089	NC_007778	TCG	2	6	113223	113228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747230
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3091	NC_007778	CGC	2	6	113308	113313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747230
3092	NC_007778	TCG	2	6	113379	113384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747230
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3094	NC_007778	GTC	2	6	113426	113431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747230
3095	NC_007778	CGC	2	6	113452	113457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747230
3096	NC_007778	CGA	2	6	113470	113475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747230
3097	NC_007778	CGC	2	6	113595	113600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747230
3098	NC_007778	CGG	2	6	113601	113606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747230
3099	NC_007778	GAA	2	6	113609	113614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86747230
3100	NC_007778	CAT	2	6	113668	113673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747230
3101	NC_007778	CCGG	2	8	113676	113683	0 %	0 %	50 %	50 %	86747230
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3103	NC_007778	GTCG	2	8	113884	113891	0 %	25 %	50 %	25 %	86747230
3104	NC_007778	CGAT	2	8	113913	113920	25 %	25 %	25 %	25 %	86747230
3105	NC_007778	CCG	2	6	113921	113926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747230
3106	NC_007778	CAA	2	6	113950	113955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747230
3107	NC_007778	CGC	2	6	113958	113963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747230
3108	NC_007778	GCC	2	6	113994	113999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747230
3109	NC_007778	CTG	2	6	114014	114019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747230
3110	NC_007778	CGT	2	6	114049	114054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747230
3111	NC_007778	GCC	2	6	114059	114064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747230
3112	NC_007778	CG	3	6	114165	114170	0 %	0 %	50 %	50 %	86747230
3113	NC_007778	CGA	2	6	114184	114189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747230
3114	NC_007778	GTCGAC	2	12	114227	114238	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86747230
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3118	NC_007778	GAT	2	6	114289	114294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747230
3119	NC_007778	CGG	2	6	114310	114315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747230
3120	NC_007778	TGA	2	6	114378	114383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747230
3121	NC_007778	GCC	2	6	114456	114461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747230
3122	NC_007778	GAT	3	9	114538	114546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86747230
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3124	NC_007778	AGC	2	6	114633	114638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747230
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3495	NC_007778	ATC	2	6	128210	128215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747244
3496	NC_007778	GCTG	2	8	128223	128230	0 %	25 %	50 %	25 %	86747244
3497	NC_007778	GGC	2	6	128252	128257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747244
3498	NC_007778	GCGCC	2	10	128310	128319	0 %	0 %	40 %	60 %	86747244
3499	NC_007778	CGC	2	6	128328	128333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747244
3500	NC_007778	CGC	2	6	128394	128399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747244

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