MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007766	CAA	2	6	21544	21549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360755
502	NC_007766	ACG	2	6	21560	21565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360755
503	NC_007766	ATACA	2	10	21592	21601	60 %	20 %	0 %	20 %	86360755
504	NC_007766	TCA	2	6	21650	21655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360755
505	NC_007766	CTT	2	6	21697	21702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360755
506	NC_007766	GTC	2	6	21810	21815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_007766	GCA	2	6	21843	21848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_007766	CTT	2	6	21891	21896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_007766	GGC	3	9	21936	21944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_007766	GGC	2	6	22068	22073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_007766	CGC	2	6	22092	22097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_007766	TCT	2	6	22103	22108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_007766	TG	3	6	22237	22242	0 %	50 %	50 %	0 %	86360756
514	NC_007766	TCA	2	6	22247	22252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360756
515	NC_007766	TC	3	6	22339	22344	0 %	50 %	0 %	50 %	86360756
516	NC_007766	TC	3	6	22413	22418	0 %	50 %	0 %	50 %	86360756
517	NC_007766	CGC	3	9	22496	22504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_007766	TCC	2	6	22505	22510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_007766	CAG	2	6	22568	22573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_007766	TCA	2	6	22609	22614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_007766	CCT	2	6	22633	22638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_007766	AAG	2	6	22671	22676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007766	CAC	2	6	22737	22742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_007766	CGC	2	6	22796	22801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_007766	CGT	2	6	22814	22819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_007766	TTC	2	6	22839	22844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_007766	CTC	3	9	22872	22880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_007766	GCC	2	6	22970	22975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_007766	TCC	2	6	23070	23075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_007766	ACC	2	6	23076	23081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_007766	CCT	2	6	23082	23087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_007766	CGC	2	6	23128	23133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_007766	CGC	2	6	23136	23141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_007766	TCG	2	6	23155	23160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_007766	CCT	2	6	23210	23215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_007766	CGC	2	6	23471	23476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360757
537	NC_007766	GCG	2	6	23560	23565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360757
538	NC_007766	GAG	2	6	23622	23627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360757
539	NC_007766	TGG	2	6	23733	23738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007766	CTC	3	9	23758	23766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_007766	GCT	2	6	23797	23802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_007766	AGG	2	6	23846	23851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007766	CT	3	6	23867	23872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_007766	CGC	2	6	24020	24025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_007766	TCAA	2	8	24043	24050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_007766	GC	3	6	24056	24061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_007766	GCT	2	6	24064	24069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_007766	GCA	2	6	24106	24111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_007766	GCC	2	6	24112	24117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_007766	TCA	2	6	24120	24125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_007766	TCG	2	6	24143	24148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_007766	CA	3	6	24152	24157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_007766	CCT	2	6	24281	24286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_007766	CAC	2	6	24303	24308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_007766	GCG	2	6	24415	24420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_007766	CGG	2	6	24425	24430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_007766	CTT	3	9	24510	24518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_007766	TCG	2	6	24559	24564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007766	CAG	2	6	24593	24598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_007766	AGAC	2	8	24609	24616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_007766	ATTC	2	8	24627	24634	25 %	50 %	0 %	25 %	86360758
562	NC_007766	GA	3	6	24675	24680	50 %	0 %	50 %	0 %	86360758
563	NC_007766	GCT	2	6	24690	24695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360758
564	NC_007766	CAA	2	6	24726	24731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360758
565	NC_007766	GAC	3	9	24751	24759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360758
566	NC_007766	AT	3	6	24792	24797	50 %	50 %	0 %	0 %	86360758
567	NC_007766	TCG	2	6	24830	24835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360758
568	NC_007766	CCT	2	6	24844	24849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360758
569	NC_007766	ATTTC	2	10	24857	24866	20 %	60 %	0 %	20 %	86360758
570	NC_007766	TGA	2	6	24888	24893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360758
571	NC_007766	GCA	2	6	24896	24901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360758
572	NC_007766	CAG	2	6	24913	24918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360758
573	NC_007766	GCT	2	6	24948	24953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360758
574	NC_007766	CGA	2	6	24975	24980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360758
575	NC_007766	GGA	2	6	24981	24986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360758
576	NC_007766	AGA	2	6	25066	25071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360758
577	NC_007766	CGG	2	6	25130	25135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360758
578	NC_007766	AAGC	2	8	25136	25143	50 %	0 %	25 %	25 %	86360758
579	NC_007766	GCA	2	6	25144	25149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360758
580	NC_007766	TCGGT	2	10	25190	25199	0 %	40 %	40 %	20 %	86360758
581	NC_007766	ACC	2	6	25230	25235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360758
582	NC_007766	CAC	2	6	25254	25259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360759
583	NC_007766	CCGC	2	8	25292	25299	0 %	0 %	25 %	75 %	86360759
584	NC_007766	CGA	2	6	25412	25417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360759
585	NC_007766	TGG	2	6	25418	25423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360759
586	NC_007766	GGT	2	6	25428	25433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360759
587	NC_007766	TCC	2	6	25502	25507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360759
588	NC_007766	GC	3	6	25529	25534	0 %	0 %	50 %	50 %	86360759
589	NC_007766	GCT	2	6	25537	25542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360759
590	NC_007766	CAGC	2	8	25569	25576	25 %	0 %	25 %	50 %	86360759
591	NC_007766	GAT	2	6	25602	25607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360759
592	NC_007766	GCA	2	6	25817	25822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360759
593	NC_007766	ACG	3	9	25921	25929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360759
594	NC_007766	TCG	2	6	25933	25938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360759
595	NC_007766	CGG	2	6	25966	25971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360759
596	NC_007766	GCTT	2	8	26004	26011	0 %	50 %	25 %	25 %	86360759
597	NC_007766	TCT	2	6	26042	26047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360759
598	NC_007766	CTG	2	6	26100	26105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360759
599	NC_007766	TCG	2	6	26131	26136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360759
600	NC_007766	GAC	2	6	26151	26156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360759
601	NC_007766	GAT	2	6	26160	26165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360759
602	NC_007766	CCT	2	6	26199	26204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360760
603	NC_007766	TCG	2	6	26259	26264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360760
604	NC_007766	CCGA	2	8	26318	26325	25 %	0 %	25 %	50 %	86360760
605	NC_007766	TCA	2	6	26370	26375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360760
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611	NC_007766	AGC	2	6	26729	26734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360760
612	NC_007766	CGA	2	6	26805	26810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360760
613	NC_007766	CCT	2	6	26832	26837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360760
614	NC_007766	GC	3	6	26861	26866	0 %	0 %	50 %	50 %	86360760
615	NC_007766	CGAT	2	8	26882	26889	25 %	25 %	25 %	25 %	86360760
616	NC_007766	TCC	2	6	26915	26920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360760
617	NC_007766	GCC	2	6	26963	26968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360760
618	NC_007766	GCG	2	6	26971	26976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360760
619	NC_007766	GCACGA	2	12	27078	27089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360760
620	NC_007766	GA	3	6	27088	27093	50 %	0 %	50 %	0 %	86360760
621	NC_007766	TGA	2	6	27189	27194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360760
622	NC_007766	CTCG	2	8	27240	27247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_007766	GAA	2	6	27252	27257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_007766	AACT	2	8	27286	27293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_007766	ACA	2	6	27342	27347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360761
626	NC_007766	TGC	2	6	27424	27429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360761
627	NC_007766	GC	3	6	27445	27450	0 %	0 %	50 %	50 %	86360761
628	NC_007766	CGG	2	6	27476	27481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360761
629	NC_007766	GCG	2	6	27519	27524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360761
630	NC_007766	ACG	2	6	27582	27587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360761
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632	NC_007766	CGA	2	6	27653	27658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360761
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760	NC_007766	GAGGG	2	10	33010	33019	20 %	0 %	80 %	0 %	86360766
761	NC_007766	TGC	2	6	33033	33038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360766
762	NC_007766	GCG	2	6	33042	33047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360766
763	NC_007766	ATCTGC	2	12	33104	33115	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86360766
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772	NC_007766	GCG	2	6	33404	33409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360766
773	NC_007766	CGG	2	6	33412	33417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360766
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786	NC_007766	CGG	2	6	34122	34127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360766
787	NC_007766	GCA	2	6	34133	34138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360767
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792	NC_007766	TGC	2	6	34267	34272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360767
793	NC_007766	TGT	2	6	34298	34303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360767
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830	NC_007766	CGA	2	6	35721	35726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360768
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838	NC_007766	TGA	2	6	36123	36128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360768
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868	NC_007766	ATGCCG	2	12	37501	37512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360769
869	NC_007766	ATG	2	6	37564	37569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360769
870	NC_007766	GAT	2	6	37599	37604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360769
871	NC_007766	TCA	2	6	37607	37612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360769
872	NC_007766	CCGCG	2	10	37655	37664	0 %	0 %	40 %	60 %	86360769
873	NC_007766	GC	3	6	37681	37686	0 %	0 %	50 %	50 %	86360769
874	NC_007766	CGA	2	6	37694	37699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360769
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880	NC_007766	GCG	2	6	37881	37886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360770
881	NC_007766	GGC	2	6	37895	37900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360770
882	NC_007766	CATCGA	2	12	38056	38067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86360770
883	NC_007766	CGC	2	6	38072	38077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360770
884	NC_007766	GC	3	6	38076	38081	0 %	0 %	50 %	50 %	86360770
885	NC_007766	CGA	2	6	38098	38103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360770
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