MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007766	CGT	2	6	220033	220038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360940
5002	NC_007766	CGA	2	6	220050	220055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360940
5003	NC_007766	TCT	2	6	220101	220106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360940
5004	NC_007766	CGA	2	6	220245	220250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360940
5005	NC_007766	CGA	2	6	220272	220277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360940
5006	NC_007766	CCA	2	6	220345	220350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360940
5007	NC_007766	CGA	2	6	220428	220433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360940
5008	NC_007766	GCCA	2	8	220500	220507	25 %	0 %	25 %	50 %	86360940
5009	NC_007766	CGA	2	6	220509	220514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360940
5010	NC_007766	CGG	2	6	220680	220685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_007766	GCC	2	6	220693	220698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_007766	GTC	2	6	220731	220736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360941
5013	NC_007766	CGG	2	6	220765	220770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
5014	NC_007766	GCG	2	6	220911	220916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
5015	NC_007766	GTC	2	6	220928	220933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360941
5016	NC_007766	GGTC	2	8	220939	220946	0 %	25 %	50 %	25 %	86360941
5017	NC_007766	GC	4	8	220974	220981	0 %	0 %	50 %	50 %	86360941
5018	NC_007766	GCT	2	6	221025	221030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360941
5019	NC_007766	CCG	2	6	221070	221075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360941
5020	NC_007766	CGG	2	6	221098	221103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
5021	NC_007766	TCA	2	6	221119	221124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360941
5022	NC_007766	GCATAG	2	12	221169	221180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86360941
5023	NC_007766	CG	3	6	221224	221229	0 %	0 %	50 %	50 %	86360941
5024	NC_007766	TTC	3	9	221231	221239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360941
5025	NC_007766	CGG	2	6	221258	221263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
5026	NC_007766	GCC	3	9	221304	221312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360941
5027	NC_007766	GTT	2	6	221318	221323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360941
5028	NC_007766	GCC	3	9	221357	221365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360941
5029	NC_007766	CGA	2	6	221366	221371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360941
5030	NC_007766	GGC	2	6	221514	221519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
5031	NC_007766	CCA	2	6	221590	221595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360941
5032	NC_007766	GAA	2	6	221633	221638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360941
5033	NC_007766	CTTC	2	8	221662	221669	0 %	50 %	0 %	50 %	86360941
5034	NC_007766	GCG	2	6	221695	221700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
5035	NC_007766	CGG	2	6	221743	221748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
5036	NC_007766	GCT	2	6	221780	221785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360941
5037	NC_007766	CGA	2	6	221786	221791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360941
5038	NC_007766	GCT	2	6	221845	221850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360941
5039	NC_007766	GGT	2	6	221876	221881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360941
5040	NC_007766	GGC	2	6	221885	221890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
5041	NC_007766	CGG	2	6	221902	221907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360941
5042	NC_007766	GCGATG	2	12	221922	221933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86360941
5043	NC_007766	TCC	2	6	221979	221984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_007766	ACA	2	6	222006	222011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_007766	GCC	2	6	222042	222047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_007766	ATC	2	6	222169	222174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_007766	ATTG	2	8	222217	222224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_007766	AGA	2	6	222234	222239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_007766	AGC	2	6	222268	222273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360942
5050	NC_007766	CGA	2	6	222286	222291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360942
5051	NC_007766	TGA	2	6	222433	222438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360942
5052	NC_007766	CCGATA	2	12	222505	222516	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86360942
5053	NC_007766	TCA	2	6	222520	222525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360942
5054	NC_007766	GAC	3	9	222546	222554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360942
5055	NC_007766	GCC	2	6	222586	222591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360942
5056	NC_007766	TCAC	2	8	222611	222618	25 %	25 %	0 %	50 %	86360942
5057	NC_007766	CCG	2	6	222776	222781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360942
5058	NC_007766	ATG	2	6	222885	222890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360942
5059	NC_007766	CGA	2	6	222908	222913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360942
5060	NC_007766	TCCT	2	8	222936	222943	0 %	50 %	0 %	50 %	86360942
5061	NC_007766	GA	3	6	222945	222950	50 %	0 %	50 %	0 %	86360942
5062	NC_007766	ACCG	2	8	222959	222966	25 %	0 %	25 %	50 %	86360942
5063	NC_007766	TCG	2	6	222970	222975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360942
5064	NC_007766	CGCT	2	8	223017	223024	0 %	25 %	25 %	50 %	86360942
5065	NC_007766	GAC	2	6	223065	223070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360942
5066	NC_007766	TGC	2	6	223136	223141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360942
5067	NC_007766	CGC	2	6	223187	223192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360942
5068	NC_007766	GAG	2	6	223194	223199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360942
5069	NC_007766	GCC	2	6	223247	223252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360942
5070	NC_007766	GGC	2	6	223263	223268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_007766	GCC	2	6	223294	223299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_007766	CCA	2	6	223389	223394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360943
5073	NC_007766	GCC	2	6	223475	223480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360943
5074	NC_007766	TCC	2	6	223496	223501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360943
5075	NC_007766	ACG	3	9	223602	223610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5076	NC_007766	GGC	2	6	223736	223741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360943
5077	NC_007766	CCA	2	6	223755	223760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360943
5078	NC_007766	GTTCAA	2	12	223867	223878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	86360943
5079	NC_007766	CAG	2	6	223964	223969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5080	NC_007766	TCG	2	6	223980	223985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5081	NC_007766	GCA	2	6	223987	223992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5082	NC_007766	AGC	2	6	224007	224012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5083	NC_007766	TTC	2	6	224021	224026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360943
5084	NC_007766	TCG	2	6	224106	224111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5085	NC_007766	GCC	2	6	224115	224120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360943
5086	NC_007766	GCG	2	6	224242	224247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360943
5087	NC_007766	CGG	2	6	224292	224297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360943
5088	NC_007766	GCC	2	6	224365	224370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360943
5089	NC_007766	GC	3	6	224397	224402	0 %	0 %	50 %	50 %	86360943
5090	NC_007766	TCG	2	6	224460	224465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5091	NC_007766	CAG	2	6	224477	224482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5092	NC_007766	TGC	2	6	224563	224568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5093	NC_007766	CAT	2	6	224570	224575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360943
5094	NC_007766	CTG	3	9	224597	224605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5095	NC_007766	GCC	3	9	224632	224640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360943
5096	NC_007766	CGT	2	6	224648	224653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360943
5097	NC_007766	CCA	2	6	224706	224711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_007766	ACG	2	6	224789	224794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_007766	CGT	2	6	224796	224801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_007766	GC	3	6	224820	224825	0 %	0 %	50 %	50 %	86360944
5101	NC_007766	CTC	2	6	224830	224835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360944
5102	NC_007766	CTT	2	6	224840	224845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360944
5103	NC_007766	ATCG	2	8	224884	224891	25 %	25 %	25 %	25 %	86360944
5104	NC_007766	GCT	2	6	224934	224939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360944
5105	NC_007766	ATC	2	6	224949	224954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360944
5106	NC_007766	CCG	2	6	224986	224991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360944
5107	NC_007766	TCT	2	6	225007	225012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360944
5108	NC_007766	TCG	2	6	225013	225018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360944
5109	NC_007766	TCG	2	6	225045	225050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360944
5110	NC_007766	TGCG	2	8	225061	225068	0 %	25 %	50 %	25 %	86360944
5111	NC_007766	GAT	2	6	225089	225094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360944
5112	NC_007766	CCAG	2	8	225133	225140	25 %	0 %	25 %	50 %	86360944
5113	NC_007766	CGG	3	9	225141	225149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360944
5114	NC_007766	TGA	2	6	225178	225183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360944
5115	NC_007766	GCC	2	6	225228	225233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360944
5116	NC_007766	GCC	2	6	225249	225254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360944
5117	NC_007766	ATG	2	6	225255	225260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360944
5118	NC_007766	CGCGA	2	10	225291	225300	20 %	0 %	40 %	40 %	86360944
5119	NC_007766	GC	4	8	225304	225311	0 %	0 %	50 %	50 %	86360944
5120	NC_007766	GA	3	6	225321	225326	50 %	0 %	50 %	0 %	86360944
5121	NC_007766	GAC	2	6	225359	225364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360944
5122	NC_007766	CTG	2	6	225503	225508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360944
5123	NC_007766	CGA	2	6	225529	225534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360944
5124	NC_007766	AGG	2	6	225580	225585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360944
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5126	NC_007766	CGC	2	6	225626	225631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360944
5127	NC_007766	CCCG	2	8	225651	225658	0 %	0 %	25 %	75 %	86360944
5128	NC_007766	TCT	2	6	225664	225669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360944
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5131	NC_007766	CGGAG	2	10	225791	225800	20 %	0 %	60 %	20 %	86360944
5132	NC_007766	GC	3	6	225818	225823	0 %	0 %	50 %	50 %	86360944
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5143	NC_007766	AGG	2	6	226551	226556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360945
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5145	NC_007766	ACCC	2	8	226644	226651	25 %	0 %	0 %	75 %	86360945
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5148	NC_007766	TCG	2	6	226730	226735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360945
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5150	NC_007766	CGT	2	6	226778	226783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360945
5151	NC_007766	GCC	2	6	226817	226822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360945
5152	NC_007766	GCCGAT	2	12	226843	226854	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360945
5153	NC_007766	GGA	2	6	226907	226912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360945
5154	NC_007766	TGC	2	6	226928	226933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360945
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5157	NC_007766	TCA	2	6	227330	227335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5158	NC_007766	GTTCG	2	10	227355	227364	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5161	NC_007766	ACC	2	6	227543	227548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360946
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5181	NC_007766	CGA	2	6	228330	228335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360946
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5191	NC_007766	AGCA	2	8	228611	228618	50 %	0 %	25 %	25 %	86360947
5192	NC_007766	ATC	2	6	228732	228737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360947
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5195	NC_007766	ACC	2	6	228870	228875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360947
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5202	NC_007766	CCG	2	6	229161	229166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360947
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5222	NC_007766	CGC	2	6	230192	230197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5223	NC_007766	GAT	2	6	230264	230269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360948
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5226	NC_007766	GCT	2	6	230371	230376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360948
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5229	NC_007766	CGC	2	6	230410	230415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360948
5230	NC_007766	GATCG	2	10	230423	230432	20 %	20 %	40 %	20 %	86360948
5231	NC_007766	CGA	2	6	230443	230448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360948
5232	NC_007766	GCGTG	2	10	230495	230504	0 %	20 %	60 %	20 %	86360948
5233	NC_007766	CCA	2	6	230548	230553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360948
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5235	NC_007766	GC	3	6	230577	230582	0 %	0 %	50 %	50 %	86360948
5236	NC_007766	TCG	2	6	230595	230600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360948
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5240	NC_007766	GCC	2	6	230745	230750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360948
5241	NC_007766	GCG	2	6	230803	230808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360948
5242	NC_007766	GTCG	2	8	230816	230823	0 %	25 %	50 %	25 %	86360948
5243	NC_007766	AG	3	6	230827	230832	50 %	0 %	50 %	0 %	86360948
5244	NC_007766	GCT	2	6	230938	230943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360948
5245	NC_007766	CTT	2	6	231011	231016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360948
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5250	NC_007766	GC	3	6	231231	231236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5360	NC_007766	GGGC	2	8	236463	236470	0 %	0 %	75 %	25 %	86360952
5361	NC_007766	TC	3	6	236479	236484	0 %	50 %	0 %	50 %	86360952
5362	NC_007766	TCAT	2	8	236490	236497	25 %	50 %	0 %	25 %	86360952
5363	NC_007766	CGA	2	6	236512	236517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360952
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5365	NC_007766	GCG	2	6	236559	236564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360952
5366	NC_007766	CGA	2	6	236692	236697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360952
5367	NC_007766	GC	4	8	236704	236711	0 %	0 %	50 %	50 %	86360952
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5369	NC_007766	GGC	2	6	236778	236783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360952
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5453	NC_007766	GCG	2	6	240026	240031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5462	NC_007766	GGAAC	2	10	240646	240655	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5476	NC_007766	TTGC	2	8	241348	241355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5477	NC_007766	TTACGA	2	12	241574	241585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	86360958
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5485	NC_007766	TCC	2	6	241930	241935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360958
5486	NC_007766	TGC	2	6	241984	241989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360958
5487	NC_007766	GCTG	2	8	242060	242067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5488	NC_007766	CGG	2	6	242076	242081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5489	NC_007766	CGC	2	6	242149	242154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360959
5490	NC_007766	TCC	3	9	242173	242181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360959
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